MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 37167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017621	ACTT	2	8	243451	243458	25 %	50 %	0 %	25 %	386585418
4002	NC_017621	ACC	2	6	243483	243488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585418
4003	NC_017621	AGC	3	9	243516	243524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585418
4004	NC_017621	TCA	2	6	243608	243613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585418
4005	NC_017621	TGG	2	6	243630	243635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585418
4006	NC_017621	TTG	2	6	243716	243721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585418
4007	NC_017621	TGG	2	6	243726	243731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585418
4008	NC_017621	AAC	2	6	243795	243800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585418
4009	NC_017621	AAGG	2	8	243808	243815	50 %	0 %	50 %	0 %	386585418
4010	NC_017621	CAT	2	6	243855	243860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585418
4011	NC_017621	T	6	6	244323	244328	0 %	100 %	0 %	0 %	386585419
4012	NC_017621	TAT	2	6	244346	244351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585419
4013	NC_017621	ATT	3	9	244359	244367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585419
4014	NC_017621	CAT	2	6	244436	244441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585419
4015	NC_017621	TTC	2	6	244474	244479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585419
4016	NC_017621	GAG	2	6	244480	244485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585419
4017	NC_017621	CAA	2	6	244646	244651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585419
4018	NC_017621	ATG	2	6	244657	244662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585419
4019	NC_017621	TGG	2	6	244675	244680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585419
4020	NC_017621	CAC	2	6	244801	244806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585419
4021	NC_017621	AGG	2	6	244891	244896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585419
4022	NC_017621	ATG	2	6	244900	244905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585419
4023	NC_017621	AAAGA	2	10	244926	244935	80 %	0 %	20 %	0 %	386585419
4024	NC_017621	GAGC	2	8	244950	244957	25 %	0 %	50 %	25 %	386585419
4025	NC_017621	GGA	2	6	245024	245029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585419
4026	NC_017621	TGAT	2	8	245053	245060	25 %	50 %	25 %	0 %	386585419
4027	NC_017621	TGG	2	6	245081	245086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585419
4028	NC_017621	GTC	2	6	245097	245102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585419
4029	NC_017621	ATT	2	6	245115	245120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585419
4030	NC_017621	GAT	2	6	245196	245201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585419
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4032	NC_017621	TGG	2	6	245393	245398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585419
4033	NC_017621	GAG	2	6	245488	245493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585419
4034	NC_017621	ATGG	2	8	245528	245535	25 %	25 %	50 %	0 %	386585420
4035	NC_017621	AG	3	6	245567	245572	50 %	0 %	50 %	0 %	386585420
4036	NC_017621	ATT	2	6	245659	245664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585420
4037	NC_017621	CAT	2	6	245734	245739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585420
4038	NC_017621	T	6	6	245782	245787	0 %	100 %	0 %	0 %	386585420
4039	NC_017621	ATGT	2	8	245805	245812	25 %	50 %	25 %	0 %	386585420
4040	NC_017621	TGT	2	6	245817	245822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585420
4041	NC_017621	GAC	2	6	245936	245941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585420
4042	NC_017621	GTC	2	6	246045	246050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585420
4043	NC_017621	AT	3	6	246084	246089	50 %	50 %	0 %	0 %	386585420
4044	NC_017621	GACA	2	8	246238	246245	50 %	0 %	25 %	25 %	386585420
4045	NC_017621	GT	3	6	246294	246299	0 %	50 %	50 %	0 %	386585420
4046	NC_017621	GAA	2	6	246311	246316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585420
4047	NC_017621	T	7	7	246372	246378	0 %	100 %	0 %	0 %	386585421
4048	NC_017621	CAG	2	6	246542	246547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585421
4049	NC_017621	GATA	2	8	246565	246572	50 %	25 %	25 %	0 %	386585421
4050	NC_017621	TCCAT	2	10	246736	246745	20 %	40 %	0 %	40 %	386585421
4051	NC_017621	GTT	2	6	246792	246797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585421
4052	NC_017621	GAG	3	9	246857	246865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585421
4053	NC_017621	TCAA	2	8	247053	247060	50 %	25 %	0 %	25 %	386585421
4054	NC_017621	GAA	2	6	247079	247084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585421
4055	NC_017621	CAT	2	6	247109	247114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585421
4056	NC_017621	TA	3	6	247129	247134	50 %	50 %	0 %	0 %	386585421
4057	NC_017621	AT	3	6	247146	247151	50 %	50 %	0 %	0 %	386585421
4058	NC_017621	TTC	2	6	247152	247157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585421
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4060	NC_017621	CTTGG	2	10	247188	247197	0 %	40 %	40 %	20 %	386585422
4061	NC_017621	GAG	2	6	247323	247328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585422
4062	NC_017621	A	6	6	247440	247445	100 %	0 %	0 %	0 %	386585422
4063	NC_017621	AAG	2	6	247450	247455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585422
4064	NC_017621	TGA	2	6	247552	247557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585422
4065	NC_017621	AG	3	6	247631	247636	50 %	0 %	50 %	0 %	386585422
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4070	NC_017621	GTA	2	6	247762	247767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585422
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4073	NC_017621	AGAA	2	8	247873	247880	75 %	0 %	25 %	0 %	386585422
4074	NC_017621	TCA	2	6	247901	247906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585422
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4080	NC_017621	CTT	2	6	248218	248223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585423
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4091	NC_017621	ATCAT	2	10	248912	248921	40 %	40 %	0 %	20 %	386585423
4092	NC_017621	TTA	2	6	249015	249020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585424
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4094	NC_017621	GAG	2	6	249039	249044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585424
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4102	NC_017621	TGT	3	9	249436	249444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585424
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4104	NC_017621	GTTC	2	8	249506	249513	0 %	50 %	25 %	25 %	386585424
4105	NC_017621	A	6	6	249687	249692	100 %	0 %	0 %	0 %	386585425
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4107	NC_017621	TA	3	6	249739	249744	50 %	50 %	0 %	0 %	386585425
4108	NC_017621	TCAA	2	8	249811	249818	50 %	25 %	0 %	25 %	386585425
4109	NC_017621	TGA	2	6	249860	249865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585425
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4111	NC_017621	ATA	2	6	249874	249879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585425
4112	NC_017621	AG	3	6	249884	249889	50 %	0 %	50 %	0 %	386585425
4113	NC_017621	GAA	2	6	249942	249947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585425
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4118	NC_017621	GCA	2	6	250194	250199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585425
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4481	NC_017621	GTCA	2	8	274580	274587	25 %	25 %	25 %	25 %	386585444
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4490	NC_017621	CAA	2	6	275075	275080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585444
4491	NC_017621	GGA	2	6	275089	275094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585444
4492	NC_017621	AAGA	2	8	275109	275116	75 %	0 %	25 %	0 %	386585444
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