MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 37167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017621	ATT	2	6	97983	97988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585297
1502	NC_017621	CGA	2	6	98111	98116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585297
1503	NC_017621	TTC	2	6	98137	98142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585297
1504	NC_017621	TTG	2	6	98295	98300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585297
1505	NC_017621	ATA	2	6	98466	98471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585297
1506	NC_017621	TTC	2	6	98561	98566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585297
1507	NC_017621	CTT	2	6	98628	98633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585297
1508	NC_017621	TCA	2	6	98654	98659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585297
1509	NC_017621	TGA	2	6	98718	98723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585297
1510	NC_017621	GATA	2	8	98730	98737	50 %	25 %	25 %	0 %	386585297
1511	NC_017621	TG	3	6	98741	98746	0 %	50 %	50 %	0 %	386585297
1512	NC_017621	ACG	2	6	98880	98885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585297
1513	NC_017621	CAG	2	6	98915	98920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585297
1514	NC_017621	CATAT	2	10	99039	99048	40 %	40 %	0 %	20 %	386585297
1515	NC_017621	TCA	2	6	99049	99054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585297
1516	NC_017621	GTGATA	2	12	99055	99066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585297
1517	NC_017621	GTT	2	6	99107	99112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585297
1518	NC_017621	TTGG	2	8	99399	99406	0 %	50 %	50 %	0 %	386585298
1519	NC_017621	TGG	2	6	99565	99570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585298
1520	NC_017621	GAT	2	6	99579	99584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585298
1521	NC_017621	GCT	2	6	99621	99626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585298
1522	NC_017621	TGC	2	6	99635	99640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585298
1523	NC_017621	TCA	3	9	99650	99658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585298
1524	NC_017621	AT	3	6	99773	99778	50 %	50 %	0 %	0 %	386585299
1525	NC_017621	TTA	2	6	99800	99805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585299
1526	NC_017621	ATT	2	6	99835	99840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585299
1527	NC_017621	GAA	2	6	99974	99979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585299
1528	NC_017621	GGTT	2	8	100080	100087	0 %	50 %	50 %	0 %	386585299
1529	NC_017621	TCG	2	6	100088	100093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585299
1530	NC_017621	ATG	2	6	100105	100110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585299
1531	NC_017621	GTG	2	6	100183	100188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585299
1532	NC_017621	AGC	2	6	100195	100200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585299
1533	NC_017621	GATG	2	8	100268	100275	25 %	25 %	50 %	0 %	386585299
1534	NC_017621	AAG	2	6	100320	100325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585299
1535	NC_017621	TGA	2	6	100342	100347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585299
1536	NC_017621	TGA	2	6	100361	100366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585299
1537	NC_017621	CAG	2	6	100410	100415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585299
1538	NC_017621	GTT	2	6	100426	100431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585299
1539	NC_017621	GAG	2	6	100452	100457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585299
1540	NC_017621	ATCT	2	8	100472	100479	25 %	50 %	0 %	25 %	386585299
1541	NC_017621	TTTGG	2	10	100627	100636	0 %	60 %	40 %	0 %	386585300
1542	NC_017621	TGG	2	6	100797	100802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585300
1543	NC_017621	TGA	2	6	100947	100952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585300
1544	NC_017621	CAA	2	6	101066	101071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585300
1545	NC_017621	ATTGC	2	10	101092	101101	20 %	40 %	20 %	20 %	386585300
1546	NC_017621	T	6	6	101152	101157	0 %	100 %	0 %	0 %	386585300
1547	NC_017621	CTT	2	6	101180	101185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585300
1548	NC_017621	TGT	2	6	101253	101258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585300
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1550	NC_017621	A	6	6	101290	101295	100 %	0 %	0 %	0 %	386585301
1551	NC_017621	TAT	2	6	101303	101308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585301
1552	NC_017621	TGTC	2	8	101312	101319	0 %	50 %	25 %	25 %	386585301
1553	NC_017621	GCTTT	2	10	101323	101332	0 %	60 %	20 %	20 %	386585301
1554	NC_017621	AAC	2	6	101385	101390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585301
1555	NC_017621	TGA	2	6	101430	101435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585301
1556	NC_017621	ATG	2	6	101567	101572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585301
1557	NC_017621	ACA	2	6	101590	101595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585301
1558	NC_017621	TGG	2	6	101640	101645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585301
1559	NC_017621	GAG	2	6	101647	101652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585301
1560	NC_017621	GAG	2	6	101677	101682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585301
1561	NC_017621	TGG	2	6	101765	101770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585301
1562	NC_017621	AGAAA	2	10	101781	101790	80 %	0 %	20 %	0 %	386585301
1563	NC_017621	CTG	2	6	101867	101872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585301
1564	NC_017621	TGC	2	6	101961	101966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585301
1565	NC_017621	TAA	2	6	102015	102020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585301
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1567	NC_017621	GAA	2	6	102046	102051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585301
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1569	NC_017621	AAG	2	6	102215	102220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585301
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1571	NC_017621	CTTG	2	8	102351	102358	0 %	50 %	25 %	25 %	386585301
1572	NC_017621	GGT	2	6	102403	102408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585301
1573	NC_017621	TTA	2	6	102432	102437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585301
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1575	NC_017621	AAGA	2	8	102511	102518	75 %	0 %	25 %	0 %	386585301
1576	NC_017621	A	6	6	102562	102567	100 %	0 %	0 %	0 %	386585301
1577	NC_017621	GTG	2	6	102575	102580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585301
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1579	NC_017621	AG	3	6	102696	102701	50 %	0 %	50 %	0 %	386585301
1580	NC_017621	TAC	2	6	102742	102747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585301
1581	NC_017621	TG	3	6	102898	102903	0 %	50 %	50 %	0 %	386585302
1582	NC_017621	CTG	2	6	102917	102922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585302
1583	NC_017621	ATT	2	6	102979	102984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585302
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1585	NC_017621	GGC	2	6	103040	103045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585302
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1587	NC_017621	TAT	2	6	103096	103101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585302
1588	NC_017621	GAA	3	9	103114	103122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585302
1589	NC_017621	A	7	7	103219	103225	100 %	0 %	0 %	0 %	386585302
1590	NC_017621	CAT	3	9	103321	103329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585302
1591	NC_017621	AACC	2	8	103340	103347	50 %	0 %	0 %	50 %	386585302
1592	NC_017621	GTT	2	6	103354	103359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585302
1593	NC_017621	GACTT	2	10	103360	103369	20 %	40 %	20 %	20 %	386585302
1594	NC_017621	CTA	2	6	103403	103408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585303
1595	NC_017621	AGT	2	6	103423	103428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585303
1596	NC_017621	A	6	6	103535	103540	100 %	0 %	0 %	0 %	386585303
1597	NC_017621	TATC	2	8	103670	103677	25 %	50 %	0 %	25 %	386585304
1598	NC_017621	CCT	2	6	103687	103692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585304
1599	NC_017621	TGG	2	6	103693	103698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585304
1600	NC_017621	GTA	2	6	103719	103724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585304
1601	NC_017621	CCA	2	6	103731	103736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585304
1602	NC_017621	CTT	3	9	103804	103812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585304
1603	NC_017621	GTC	2	6	103839	103844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585304
1604	NC_017621	GGC	2	6	103855	103860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585304
1605	NC_017621	TAA	2	6	103871	103876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585304
1606	NC_017621	GATT	2	8	103934	103941	25 %	50 %	25 %	0 %	386585304
1607	NC_017621	GGT	2	6	103980	103985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585304
1608	NC_017621	TTG	2	6	104185	104190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585304
1609	NC_017621	TCG	2	6	104324	104329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585304
1610	NC_017621	AAT	2	6	104356	104361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585304
1611	NC_017621	AG	3	6	104373	104378	50 %	0 %	50 %	0 %	386585304
1612	NC_017621	TAA	2	6	104429	104434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585304
1613	NC_017621	GTT	2	6	104451	104456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585304
1614	NC_017621	TCT	2	6	104525	104530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585304
1615	NC_017621	AAT	2	6	104565	104570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585304
1616	NC_017621	TTC	2	6	104608	104613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585304
1617	NC_017621	GTT	2	6	104646	104651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585304
1618	NC_017621	CCA	2	6	104652	104657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585304
1619	NC_017621	CTA	2	6	104814	104819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585304
1620	NC_017621	GTT	2	6	104849	104854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585304
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1622	NC_017621	TTGAAA	2	12	105301	105312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386585305
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1751	NC_017621	GAAG	2	8	112028	112035	50 %	0 %	50 %	0 %	386585310
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1982	NC_017621	GGTCA	2	10	126936	126945	20 %	20 %	40 %	20 %	386585317
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1984	NC_017621	TGC	2	6	127093	127098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585317
1985	NC_017621	A	6	6	127129	127134	100 %	0 %	0 %	0 %	386585318
1986	NC_017621	TGG	2	6	127166	127171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585318
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1988	NC_017621	CAAA	2	8	127233	127240	75 %	0 %	0 %	25 %	386585318
1989	NC_017621	TGT	2	6	127272	127277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585318
1990	NC_017621	AGT	2	6	127281	127286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585318
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1992	NC_017621	CAGG	2	8	127351	127358	25 %	0 %	50 %	25 %	386585318
1993	NC_017621	A	6	6	127399	127404	100 %	0 %	0 %	0 %	386585318
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2000	NC_017621	TGG	2	6	127690	127695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585319

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