MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 37167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017621	CAG	2	6	38287	38292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585228
502	NC_017621	GGA	2	6	38297	38302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585228
503	NC_017621	GAG	2	6	38315	38320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585228
504	NC_017621	AAT	2	6	38329	38334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585228
505	NC_017621	TAA	2	6	38340	38345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585229
506	NC_017621	TGG	2	6	38361	38366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585229
507	NC_017621	ATCA	2	8	38383	38390	50 %	25 %	0 %	25 %	386585229
508	NC_017621	TGAGCC	2	12	38418	38429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386585229
509	NC_017621	AAG	2	6	38552	38557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585229
510	NC_017621	AAT	2	6	38566	38571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585229
511	NC_017621	T	8	8	38599	38606	0 %	100 %	0 %	0 %	386585229
512	NC_017621	AAT	2	6	38613	38618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585229
513	NC_017621	CGAT	2	8	38632	38639	25 %	25 %	25 %	25 %	386585229
514	NC_017621	GTG	3	9	38687	38695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585229
515	NC_017621	T	6	6	38761	38766	0 %	100 %	0 %	0 %	386585229
516	NC_017621	CTG	2	6	38888	38893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585229
517	NC_017621	CGTT	2	8	38930	38937	0 %	50 %	25 %	25 %	386585230
518	NC_017621	GGT	2	6	39017	39022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585230
519	NC_017621	GAT	2	6	39091	39096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585230
520	NC_017621	GGT	2	6	39134	39139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585230
521	NC_017621	AGC	2	6	39175	39180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585230
522	NC_017621	TTGA	2	8	39200	39207	25 %	50 %	25 %	0 %	386585230
523	NC_017621	ACATCG	2	12	39285	39296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386585230
524	NC_017621	GTCC	2	8	39300	39307	0 %	25 %	25 %	50 %	386585230
525	NC_017621	TTCG	2	8	39312	39319	0 %	50 %	25 %	25 %	386585230
526	NC_017621	TGG	2	6	39351	39356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585230
527	NC_017621	AGCAG	2	10	39391	39400	40 %	0 %	40 %	20 %	386585230
528	NC_017621	GAC	2	6	39406	39411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585230
529	NC_017621	ACT	2	6	39483	39488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585230
530	NC_017621	CAAG	2	8	39493	39500	50 %	0 %	25 %	25 %	386585230
531	NC_017621	CTATT	2	10	39616	39625	20 %	60 %	0 %	20 %	386585230
532	NC_017621	GCT	2	6	39629	39634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585230
533	NC_017621	CAA	2	6	39664	39669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585230
534	NC_017621	GATGCG	2	12	39677	39688	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386585230
535	NC_017621	TGT	2	6	39727	39732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585230
536	NC_017621	TCG	2	6	39837	39842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585230
537	NC_017621	TGC	2	6	39862	39867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585230
538	NC_017621	ATC	3	9	39902	39910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585230
539	NC_017621	GCTA	2	8	39934	39941	25 %	25 %	25 %	25 %	386585230
540	NC_017621	GCGA	2	8	40001	40008	25 %	0 %	50 %	25 %	386585230
541	NC_017621	CGG	2	6	40036	40041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585230
542	NC_017621	GTG	3	9	40064	40072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585230
543	NC_017621	GGT	2	6	40093	40098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585230
544	NC_017621	TCC	2	6	40154	40159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585230
545	NC_017621	CAT	3	9	40180	40188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585230
546	NC_017621	AACC	2	8	40228	40235	50 %	0 %	0 %	50 %	386585230
547	NC_017621	TCCG	2	8	40244	40251	0 %	25 %	25 %	50 %	386585230
548	NC_017621	CTT	2	6	40309	40314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585230
549	NC_017621	GGA	2	6	40333	40338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585230
550	NC_017621	GGCA	2	8	40348	40355	25 %	0 %	50 %	25 %	386585230
551	NC_017621	CAA	2	6	40414	40419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585230
552	NC_017621	GGT	2	6	40510	40515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585231
553	NC_017621	TTA	2	6	40579	40584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585231
554	NC_017621	GGA	3	9	40642	40650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585231
555	NC_017621	T	6	6	40657	40662	0 %	100 %	0 %	0 %	386585231
556	NC_017621	GAA	2	6	40702	40707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585231
557	NC_017621	GA	3	6	40775	40780	50 %	0 %	50 %	0 %	386585231
558	NC_017621	ATT	2	6	40796	40801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585231
559	NC_017621	GTTC	2	8	40807	40814	0 %	50 %	25 %	25 %	386585231
560	NC_017621	TAGAA	2	10	40830	40839	60 %	20 %	20 %	0 %	386585231
561	NC_017621	AGC	2	6	40860	40865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585231
562	NC_017621	TAG	2	6	40967	40972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585231
563	NC_017621	ATA	3	9	41012	41020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585231
564	NC_017621	CATG	2	8	41028	41035	25 %	25 %	25 %	25 %	386585231
565	NC_017621	GAA	2	6	41056	41061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585231
566	NC_017621	TCC	2	6	41091	41096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585231
567	NC_017621	CTA	2	6	41114	41119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585231
568	NC_017621	CTT	2	6	41129	41134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585231
569	NC_017621	GATCAG	2	12	41155	41166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386585231
570	NC_017621	TAATG	2	10	41211	41220	40 %	40 %	20 %	0 %	386585231
571	NC_017621	TTC	2	6	41229	41234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585231
572	NC_017621	AGT	2	6	41241	41246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585231
573	NC_017621	GAG	2	6	41248	41253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585231
574	NC_017621	ATT	2	6	41338	41343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585231
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576	NC_017621	T	6	6	41506	41511	0 %	100 %	0 %	0 %	386585232
577	NC_017621	GTT	2	6	41546	41551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585232
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580	NC_017621	AAG	2	6	41715	41720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585232
581	NC_017621	ATA	2	6	41736	41741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585232
582	NC_017621	AGA	2	6	41751	41756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585232
583	NC_017621	TTACT	2	10	41785	41794	20 %	60 %	0 %	20 %	386585232
584	NC_017621	GAT	2	6	41828	41833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585232
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590	NC_017621	A	7	7	41923	41929	100 %	0 %	0 %	0 %	386585232
591	NC_017621	ATT	2	6	41987	41992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585232
592	NC_017621	ACA	2	6	42047	42052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585232
593	NC_017621	GTT	2	6	42056	42061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585232
594	NC_017621	GAA	2	6	42075	42080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585232
595	NC_017621	ATT	2	6	42108	42113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585232
596	NC_017621	AAG	2	6	42152	42157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585232
597	NC_017621	ACT	2	6	42208	42213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585233
598	NC_017621	TAA	2	6	42236	42241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585233
599	NC_017621	ATGA	2	8	42243	42250	50 %	25 %	25 %	0 %	386585233
600	NC_017621	AT	3	6	42274	42279	50 %	50 %	0 %	0 %	386585233
601	NC_017621	A	7	7	42300	42306	100 %	0 %	0 %	0 %	386585233
602	NC_017621	GAG	2	6	42400	42405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585233
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609	NC_017621	ACT	2	6	42697	42702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585233
610	NC_017621	ATT	2	6	42734	42739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585233
611	NC_017621	AAT	2	6	42765	42770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585233
612	NC_017621	A	6	6	42783	42788	100 %	0 %	0 %	0 %	386585233
613	NC_017621	AAAT	2	8	42805	42812	75 %	25 %	0 %	0 %	386585233
614	NC_017621	TTTG	2	8	42930	42937	0 %	75 %	25 %	0 %	386585233
615	NC_017621	AGG	2	6	42982	42987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585233
616	NC_017621	TTA	2	6	43050	43055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585233
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619	NC_017621	A	7	7	43198	43204	100 %	0 %	0 %	0 %	386585234
620	NC_017621	ATT	2	6	43230	43235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585234
621	NC_017621	GAT	2	6	43247	43252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585234
622	NC_017621	AT	4	8	43251	43258	50 %	50 %	0 %	0 %	386585234
623	NC_017621	TAA	2	6	43279	43284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585234
624	NC_017621	TTA	2	6	43295	43300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585234
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