MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 37167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017621	TGA	2	6	303336	303341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585470
5003	NC_017621	CTGA	2	8	303352	303359	25 %	25 %	25 %	25 %	386585470
5004	NC_017621	CTT	2	6	303392	303397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585470
5005	NC_017621	ATG	2	6	303410	303415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585470
5006	NC_017621	ATG	2	6	303512	303517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585470
5007	NC_017621	GA	3	6	303525	303530	50 %	0 %	50 %	0 %	386585470
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5009	NC_017621	GAT	3	9	303580	303588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585470
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5011	NC_017621	TGA	2	6	303612	303617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585470
5012	NC_017621	AGGCA	2	10	303693	303702	40 %	0 %	40 %	20 %	386585470
5013	NC_017621	TA	3	6	303719	303724	50 %	50 %	0 %	0 %	386585470
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5021	NC_017621	GGT	2	6	304403	304408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585471
5022	NC_017621	GGT	2	6	304415	304420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585471
5023	NC_017621	TGG	2	6	304423	304428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585471
5024	NC_017621	CTT	2	6	304474	304479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585471
5025	NC_017621	GGT	2	6	304487	304492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585471
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5029	NC_017621	TGG	2	6	304906	304911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585471
5030	NC_017621	CGT	2	6	304930	304935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585471
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5042	NC_017621	GTG	2	6	306000	306005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585472
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5047	NC_017621	TCG	2	6	306189	306194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585472
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5051	NC_017621	TCAA	2	8	306309	306316	50 %	25 %	0 %	25 %	386585473
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5057	NC_017621	ACAG	2	8	306560	306567	50 %	0 %	25 %	25 %	386585473
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5070	NC_017621	TGA	2	6	307258	307263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585473
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5246	NC_017621	AGC	2	6	318050	318055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585486
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5248	NC_017621	CA	3	6	318060	318065	50 %	0 %	0 %	50 %	386585486
5249	NC_017621	GCA	2	6	318153	318158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585486
5250	NC_017621	ACA	2	6	318175	318180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585486
5251	NC_017621	ATTG	2	8	318203	318210	25 %	50 %	25 %	0 %	386585486
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5254	NC_017621	GTC	2	6	318313	318318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585486
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5256	NC_017621	CAT	2	6	318440	318445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585486
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5267	NC_017621	CATTT	2	10	318870	318879	20 %	60 %	0 %	20 %	386585486
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5273	NC_017621	AAT	2	6	319115	319120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585487
5274	NC_017621	GCTG	2	8	319228	319235	0 %	25 %	50 %	25 %	386585487
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5277	NC_017621	TCGT	2	8	319407	319414	0 %	50 %	25 %	25 %	386585487
5278	NC_017621	GTG	2	6	319464	319469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585487
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5354	NC_017621	CAG	2	6	323882	323887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585493
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5359	NC_017621	AGC	2	6	324061	324066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585493
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5363	NC_017621	GCG	2	6	324585	324590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585494
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5367	NC_017621	GAC	2	6	324737	324742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585494
5368	NC_017621	AGTCCA	2	12	324748	324759	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386585494
5369	NC_017621	GAA	2	6	324830	324835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585494
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5401	NC_017621	GCCA	2	8	326994	327001	25 %	0 %	25 %	50 %	386585498
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5469	NC_017621	GTGTG	2	10	330232	330241	0 %	40 %	60 %	0 %	386585503
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5475	NC_017621	ATC	2	6	330725	330730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585504
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5477	NC_017621	CGTC	2	8	330765	330772	0 %	25 %	25 %	50 %	386585504
5478	NC_017621	TGG	2	6	330804	330809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585504
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5480	NC_017621	T	6	6	330918	330923	0 %	100 %	0 %	0 %	386585504
5481	NC_017621	CAATC	2	10	330952	330961	40 %	20 %	0 %	40 %	386585504
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5485	NC_017621	A	7	7	331209	331215	100 %	0 %	0 %	0 %	386585504
5486	NC_017621	GTT	2	6	331319	331324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585504
5487	NC_017621	ATC	2	6	331349	331354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585504
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5489	NC_017621	ATTT	2	8	331454	331461	25 %	75 %	0 %	0 %	386585504
5490	NC_017621	GA	3	6	331589	331594	50 %	0 %	50 %	0 %	386585504
5491	NC_017621	AAAG	2	8	331733	331740	75 %	0 %	25 %	0 %	386585505
5492	NC_017621	TTG	2	6	331756	331761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585505
5493	NC_017621	GTTTT	2	10	331771	331780	0 %	80 %	20 %	0 %	386585505
5494	NC_017621	AGC	2	6	331781	331786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585505
5495	NC_017621	GAAG	2	8	331799	331806	50 %	0 %	50 %	0 %	386585505
5496	NC_017621	ATG	2	6	331891	331896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585505
5497	NC_017621	TATC	2	8	331982	331989	25 %	50 %	0 %	25 %	386585505
5498	NC_017621	AGA	2	6	332102	332107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585505
5499	NC_017621	TGA	2	6	332129	332134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585505
5500	NC_017621	CA	3	6	332154	332159	50 %	0 %	0 %	50 %	386585505

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