MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 36708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017619	GGAA	2	8	58626	58633	50 %	0 %	50 %	0 %	386581097
1003	NC_017619	TTC	2	6	58639	58644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581097
1004	NC_017619	AGCG	2	8	58767	58774	25 %	0 %	50 %	25 %	386581097
1005	NC_017619	CTTC	2	8	58794	58801	0 %	50 %	0 %	50 %	386581097
1006	NC_017619	AAT	2	6	58905	58910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581097
1007	NC_017619	TG	3	6	59035	59040	0 %	50 %	50 %	0 %	386581097
1008	NC_017619	GTT	2	6	59082	59087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581097
1009	NC_017619	GTTT	2	8	59099	59106	0 %	75 %	25 %	0 %	386581097
1010	NC_017619	TCA	2	6	59132	59137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581097
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1012	NC_017619	TTTC	2	8	59216	59223	0 %	75 %	0 %	25 %	386581097
1013	NC_017619	AGA	2	6	59290	59295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581097
1014	NC_017619	GCT	2	6	59318	59323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581097
1015	NC_017619	TCA	2	6	59327	59332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581097
1016	NC_017619	T	6	6	59368	59373	0 %	100 %	0 %	0 %	386581097
1017	NC_017619	TCAT	2	8	59703	59710	25 %	50 %	0 %	25 %	386581098
1018	NC_017619	C	6	6	59799	59804	0 %	0 %	0 %	100 %	386581098
1019	NC_017619	CAGC	2	8	59839	59846	25 %	0 %	25 %	50 %	386581098
1020	NC_017619	CAA	2	6	59978	59983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581098
1021	NC_017619	TAG	2	6	59997	60002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581098
1022	NC_017619	GGA	2	6	60014	60019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581098
1023	NC_017619	TTA	2	6	60092	60097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581098
1024	NC_017619	AGCAG	2	10	60118	60127	40 %	0 %	40 %	20 %	386581098
1025	NC_017619	GTC	2	6	60158	60163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581098
1026	NC_017619	CTGG	2	8	60314	60321	0 %	25 %	50 %	25 %	386581098
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1030	NC_017619	AAG	2	6	60540	60545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581098
1031	NC_017619	ATT	2	6	60604	60609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581098
1032	NC_017619	AGA	2	6	60610	60615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581098
1033	NC_017619	ATG	2	6	60657	60662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581098
1034	NC_017619	AGA	2	6	60724	60729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581098
1035	NC_017619	AGCA	2	8	60740	60747	50 %	0 %	25 %	25 %	386581098
1036	NC_017619	CT	4	8	60769	60776	0 %	50 %	0 %	50 %	386581098
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1039	NC_017619	ATGGCA	2	12	61245	61256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386581100
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1041	NC_017619	TACT	2	8	61308	61315	25 %	50 %	0 %	25 %	386581100
1042	NC_017619	GGA	2	6	61335	61340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581100
1043	NC_017619	TCC	2	6	61360	61365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386581100
1044	NC_017619	AGTC	2	8	61422	61429	25 %	25 %	25 %	25 %	386581100
1045	NC_017619	TATT	2	8	61468	61475	25 %	75 %	0 %	0 %	386581100
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1048	NC_017619	TATT	2	8	61672	61679	25 %	75 %	0 %	0 %	386581100
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1054	NC_017619	TTTC	2	8	61933	61940	0 %	75 %	0 %	25 %	386581100
1055	NC_017619	TAT	2	6	61975	61980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581100
1056	NC_017619	TAT	2	6	62006	62011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581100
1057	NC_017619	TTC	2	6	62044	62049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581100
1058	NC_017619	TGA	2	6	62090	62095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581100
1059	NC_017619	AGA	2	6	62102	62107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581100
1060	NC_017619	CGT	2	6	62124	62129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581100
1061	NC_017619	TTCT	2	8	62133	62140	0 %	75 %	0 %	25 %	386581100
1062	NC_017619	TAT	2	6	62162	62167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581100
1063	NC_017619	TGA	2	6	62240	62245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581100
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1065	NC_017619	ATA	2	6	62281	62286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581100
1066	NC_017619	ATCT	2	8	62295	62302	25 %	50 %	0 %	25 %	386581100
1067	NC_017619	CTG	2	6	62320	62325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581100
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1084	NC_017619	GTCA	2	8	62961	62968	25 %	25 %	25 %	25 %	386581102
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1102	NC_017619	AG	3	6	64064	64069	50 %	0 %	50 %	0 %	386581102
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1106	NC_017619	GAAG	2	8	64271	64278	50 %	0 %	50 %	0 %	386581102
1107	NC_017619	TCAA	2	8	64338	64345	50 %	25 %	0 %	25 %	386581102
1108	NC_017619	CAT	2	6	64367	64372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581102
1109	NC_017619	TCAA	2	8	64389	64396	50 %	25 %	0 %	25 %	386581102
1110	NC_017619	GAT	2	6	64413	64418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581102
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1112	NC_017619	A	6	6	64522	64527	100 %	0 %	0 %	0 %	386581102
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1119	NC_017619	TACC	2	8	64939	64946	25 %	25 %	0 %	50 %	386581103
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1122	NC_017619	CAA	2	6	65042	65047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581103
1123	NC_017619	GAA	2	6	65078	65083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581103
1124	NC_017619	TGA	2	6	65202	65207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581103
1125	NC_017619	TAA	2	6	65210	65215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581103
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1127	NC_017619	GTTTT	2	10	65443	65452	0 %	80 %	20 %	0 %	386581104
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1252	NC_017619	A	6	6	71893	71898	100 %	0 %	0 %	0 %	386581114
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