MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 36708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017619	ATA	2	6	30447	30452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581071
502	NC_017619	GCA	2	6	30455	30460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581071
503	NC_017619	GGA	2	6	30496	30501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581071
504	NC_017619	TGC	2	6	30526	30531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581071
505	NC_017619	TTG	2	6	30561	30566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581071
506	NC_017619	TTTA	2	8	30569	30576	25 %	75 %	0 %	0 %	386581071
507	NC_017619	A	7	7	30586	30592	100 %	0 %	0 %	0 %	386581071
508	NC_017619	CTACG	2	10	30760	30769	20 %	20 %	20 %	40 %	386581072
509	NC_017619	TTG	2	6	30786	30791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581072
510	NC_017619	TGG	2	6	30823	30828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581072
511	NC_017619	AAGA	2	8	30830	30837	75 %	0 %	25 %	0 %	386581072
512	NC_017619	AAT	2	6	30863	30868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581072
513	NC_017619	TGAA	2	8	30897	30904	50 %	25 %	25 %	0 %	386581072
514	NC_017619	AAG	2	6	30959	30964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581072
515	NC_017619	ATT	2	6	30971	30976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581072
516	NC_017619	GTT	2	6	30986	30991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581072
517	NC_017619	GAA	2	6	31037	31042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581072
518	NC_017619	A	6	6	31082	31087	100 %	0 %	0 %	0 %	386581072
519	NC_017619	GAA	2	6	31172	31177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581072
520	NC_017619	TGG	2	6	31233	31238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581072
521	NC_017619	TCG	2	6	31357	31362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581072
522	NC_017619	GAA	2	6	31462	31467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581073
523	NC_017619	GCA	2	6	31469	31474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581073
524	NC_017619	GAG	2	6	31580	31585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581073
525	NC_017619	GAA	2	6	31652	31657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581073
526	NC_017619	CAG	2	6	31726	31731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581073
527	NC_017619	AGG	2	6	31734	31739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581073
528	NC_017619	GTC	2	6	31758	31763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581073
529	NC_017619	AGG	2	6	31764	31769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581073
530	NC_017619	GAA	3	9	31817	31825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581073
531	NC_017619	ATT	2	6	31842	31847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581073
532	NC_017619	TGG	2	6	31893	31898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581073
533	NC_017619	T	6	6	31943	31948	0 %	100 %	0 %	0 %	386581073
534	NC_017619	TGGAAG	2	12	32004	32015	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386581073
535	NC_017619	TTCA	2	8	32024	32031	25 %	50 %	0 %	25 %	386581073
536	NC_017619	TACT	2	8	32089	32096	25 %	50 %	0 %	25 %	386581073
537	NC_017619	GCC	2	6	32109	32114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386581073
538	NC_017619	CGA	2	6	32259	32264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581073
539	NC_017619	GTC	2	6	32292	32297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581073
540	NC_017619	GTGGAT	2	12	32351	32362	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386581073
541	NC_017619	CTC	2	6	32381	32386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386581073
542	NC_017619	GGT	2	6	32456	32461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581073
543	NC_017619	TTC	2	6	32608	32613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581073
544	NC_017619	GGT	2	6	32774	32779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581073
545	NC_017619	GAA	2	6	32885	32890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581073
546	NC_017619	A	6	6	32939	32944	100 %	0 %	0 %	0 %	386581073
547	NC_017619	AGG	2	6	32962	32967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581073
548	NC_017619	GAACG	2	10	33046	33055	40 %	0 %	40 %	20 %	386581073
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550	NC_017619	GTC	2	6	33135	33140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581073
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552	NC_017619	TTCC	2	8	33235	33242	0 %	50 %	0 %	50 %	386581073
553	NC_017619	GTG	3	9	33263	33271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581073
554	NC_017619	ACA	2	6	33317	33322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581073
555	NC_017619	ACC	2	6	33435	33440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386581073
556	NC_017619	GTC	2	6	33450	33455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581073
557	NC_017619	GAC	2	6	33511	33516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581073
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559	NC_017619	GCAG	2	8	33685	33692	25 %	0 %	50 %	25 %	386581073
560	NC_017619	ACA	2	6	33839	33844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581073
561	NC_017619	TACC	2	8	33902	33909	25 %	25 %	0 %	50 %	386581073
562	NC_017619	AGA	2	6	33925	33930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581073
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565	NC_017619	TGG	2	6	34120	34125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581073
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567	NC_017619	AGA	2	6	34258	34263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581073
568	NC_017619	CAG	2	6	34311	34316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581073
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570	NC_017619	ATTCT	2	10	34529	34538	20 %	60 %	0 %	20 %	386581073
571	NC_017619	A	6	6	34644	34649	100 %	0 %	0 %	0 %	386581073
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576	NC_017619	GCCAT	2	10	35004	35013	20 %	20 %	20 %	40 %	386581073
577	NC_017619	AAGA	2	8	35105	35112	75 %	0 %	25 %	0 %	386581073
578	NC_017619	AAAT	2	8	35153	35160	75 %	25 %	0 %	0 %	386581073
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588	NC_017619	TCT	4	12	35560	35571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581074
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595	NC_017619	TGA	2	6	35847	35852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581074
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599	NC_017619	AAATG	2	10	36090	36099	60 %	20 %	20 %	0 %	386581074
600	NC_017619	CAAC	2	8	36139	36146	50 %	0 %	0 %	50 %	386581074
601	NC_017619	GAC	2	6	36229	36234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581074
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612	NC_017619	GGT	2	6	36791	36796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581075
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617	NC_017619	GTA	2	6	37031	37036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581075
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