MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 36708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017619	AAG	2	6	289599	289604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581319
5003	NC_017619	GGC	2	6	289622	289627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386581319
5004	NC_017619	TCAA	2	8	289656	289663	50 %	25 %	0 %	25 %	386581319
5005	NC_017619	GTG	2	6	289689	289694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581319
5006	NC_017619	A	6	6	289731	289736	100 %	0 %	0 %	0 %	386581319
5007	NC_017619	TA	3	6	289824	289829	50 %	50 %	0 %	0 %	386581320
5008	NC_017619	CGC	2	6	289890	289895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386581320
5009	NC_017619	AGGA	2	8	289911	289918	50 %	0 %	50 %	0 %	386581320
5010	NC_017619	GACCAT	2	12	290002	290013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386581320
5011	NC_017619	TTA	2	6	290050	290055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581320
5012	NC_017619	GCA	2	6	290186	290191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581320
5013	NC_017619	AAG	2	6	290199	290204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581320
5014	NC_017619	GCTG	2	8	290213	290220	0 %	25 %	50 %	25 %	386581320
5015	NC_017619	GTG	2	6	290370	290375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581320
5016	NC_017619	GAT	2	6	290821	290826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581321
5017	NC_017619	TTG	2	6	290859	290864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581321
5018	NC_017619	ATT	2	6	290866	290871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581321
5019	NC_017619	CAT	2	6	290879	290884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581321
5020	NC_017619	CA	3	6	290990	290995	50 %	0 %	0 %	50 %	386581321
5021	NC_017619	GAA	2	6	291071	291076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581321
5022	NC_017619	CTTTGA	2	12	291100	291111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386581321
5023	NC_017619	GAGC	2	8	291137	291144	25 %	0 %	50 %	25 %	386581321
5024	NC_017619	CAG	2	6	291209	291214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581321
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5026	NC_017619	TGA	2	6	291358	291363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581321
5027	NC_017619	CGGA	2	8	291407	291414	25 %	0 %	50 %	25 %	386581321
5028	NC_017619	GTG	2	6	291425	291430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581321
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5032	NC_017619	CAT	2	6	291778	291783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581321
5033	NC_017619	TAC	2	6	291815	291820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581321
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5037	NC_017619	AGA	2	6	291901	291906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581322
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5039	NC_017619	GC	3	6	291970	291975	0 %	0 %	50 %	50 %	386581322
5040	NC_017619	GAA	2	6	292043	292048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581322
5041	NC_017619	AGA	2	6	292147	292152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581322
5042	NC_017619	A	6	6	292157	292162	100 %	0 %	0 %	0 %	386581322
5043	NC_017619	AGA	2	6	292204	292209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581322
5044	NC_017619	GAA	2	6	292217	292222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581322
5045	NC_017619	CAG	2	6	292293	292298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581322
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5049	NC_017619	TGT	2	6	292591	292596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581323
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5052	NC_017619	CAT	2	6	292666	292671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581323
5053	NC_017619	ATCAA	2	10	292676	292685	60 %	20 %	0 %	20 %	386581323
5054	NC_017619	AC	3	6	292728	292733	50 %	0 %	0 %	50 %	386581323
5055	NC_017619	TTC	2	6	292755	292760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581323
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5057	NC_017619	GCA	2	6	292919	292924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581323
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5059	NC_017619	TGG	2	6	292984	292989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581323
5060	NC_017619	TATC	2	8	293004	293011	25 %	50 %	0 %	25 %	386581323
5061	NC_017619	CAG	2	6	293049	293054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581323
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5065	NC_017619	AAGA	2	8	293195	293202	75 %	0 %	25 %	0 %	386581323
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5487	NC_017619	ATC	2	6	318292	318297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581350
5488	NC_017619	TCC	2	6	318331	318336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386581350
5489	NC_017619	ATTT	2	8	318397	318404	25 %	75 %	0 %	0 %	386581350
5490	NC_017619	T	6	6	318455	318460	0 %	100 %	0 %	0 %	386581350
5491	NC_017619	AAAG	2	8	318677	318684	75 %	0 %	25 %	0 %	386581351
5492	NC_017619	TTG	2	6	318700	318705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581351
5493	NC_017619	GTTTT	2	10	318715	318724	0 %	80 %	20 %	0 %	386581351
5494	NC_017619	AGC	2	6	318725	318730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581351
5495	NC_017619	GAAG	2	8	318743	318750	50 %	0 %	50 %	0 %	386581351
5496	NC_017619	ATG	2	6	318835	318840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581351
5497	NC_017619	TATC	2	8	318926	318933	25 %	50 %	0 %	25 %	386581351
5498	NC_017619	AGA	2	6	319046	319051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581351
5499	NC_017619	TGA	2	6	319073	319078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581351
5500	NC_017619	CA	3	6	319098	319103	50 %	0 %	0 %	50 %	386581351

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