MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 1338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017618	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386578981
2	NC_017618	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386578981
3	NC_017618	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	386578983
4	NC_017618	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	386578987
5	NC_017618	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	386578987
6	NC_017618	GAGAT	2	10	6830	6839	40 %	20 %	40 %	0 %	386578988
7	NC_017618	TGAAA	2	10	9967	9976	60 %	20 %	20 %	0 %	386578989
8	NC_017618	CTATT	2	10	11204	11213	20 %	60 %	0 %	20 %	386578992
9	NC_017618	CTTTG	2	10	13433	13442	0 %	60 %	20 %	20 %	386578994
10	NC_017618	AACAG	2	10	13877	13886	60 %	0 %	20 %	20 %	386578995
11	NC_017618	CTTGT	2	10	15033	15042	0 %	60 %	20 %	20 %	386578995
12	NC_017618	TTTAT	2	10	24439	24448	20 %	80 %	0 %	0 %	386578998
13	NC_017618	AATGC	2	10	25405	25414	40 %	20 %	20 %	20 %	386578999
14	NC_017618	CTACG	2	10	30759	30768	20 %	20 %	20 %	40 %	386579005
15	NC_017618	GAACG	2	10	33045	33054	40 %	0 %	40 %	20 %	386579006
16	NC_017618	AAACC	2	10	33181	33190	60 %	0 %	0 %	40 %	386579006
17	NC_017618	ATTCT	2	10	34528	34537	20 %	60 %	0 %	20 %	386579006
18	NC_017618	GCCAT	2	10	35003	35012	20 %	20 %	20 %	40 %	386579006
19	NC_017618	AAATG	2	10	36089	36098	60 %	20 %	20 %	0 %	386579007
20	NC_017618	AGCAG	2	10	38720	38729	40 %	0 %	40 %	20 %	386579010
21	NC_017618	CTATT	2	10	38945	38954	20 %	60 %	0 %	20 %	386579010
22	NC_017618	CTATT	2	10	41507	41516	20 %	60 %	0 %	20 %	386579012
23	NC_017618	GAAGC	2	10	42685	42694	40 %	0 %	40 %	20 %	386579013
24	NC_017618	AGCGG	2	10	45791	45800	20 %	0 %	60 %	20 %	386579016
25	NC_017618	TTAGT	2	10	47407	47416	20 %	60 %	20 %	0 %	386579018
26	NC_017618	GAAGT	2	10	48054	48063	40 %	20 %	40 %	0 %	386579019
27	NC_017618	TTATC	2	10	48185	48194	20 %	60 %	0 %	20 %	386579019
28	NC_017618	TAATC	2	10	48293	48302	40 %	40 %	0 %	20 %	386579019
29	NC_017618	TCAAT	2	10	48552	48561	40 %	40 %	0 %	20 %	386579020
30	NC_017618	TTATT	2	10	48805	48814	20 %	80 %	0 %	0 %	386579020
31	NC_017618	GAGAA	2	10	52311	52320	60 %	0 %	40 %	0 %	386579024
32	NC_017618	GCAGA	2	10	53792	53801	40 %	0 %	40 %	20 %	386579026
33	NC_017618	GGGCT	2	10	54263	54272	0 %	20 %	60 %	20 %	386579026
34	NC_017618	TGAAT	2	10	55886	55895	40 %	40 %	20 %	0 %	386579028
35	NC_017618	AGCAG	2	10	60026	60035	40 %	0 %	40 %	20 %	386579031
36	NC_017618	GCCCT	2	10	62848	62857	0 %	20 %	20 %	60 %	386579035
37	NC_017618	GTTTT	2	10	65351	65360	0 %	80 %	20 %	0 %	386579037
38	NC_017618	TTGCT	2	10	65947	65956	0 %	60 %	20 %	20 %	386579038
39	NC_017618	GTATC	2	10	69234	69243	20 %	40 %	20 %	20 %	386579041
40	NC_017618	TGGAT	2	10	71228	71237	20 %	40 %	40 %	0 %	386579045
41	NC_017618	TTATG	2	10	71438	71447	20 %	60 %	20 %	0 %	386579046
42	NC_017618	AAATT	2	10	72330	72339	60 %	40 %	0 %	0 %	386579048
43	NC_017618	TGGCG	2	10	73337	73346	0 %	20 %	60 %	20 %	386579050
44	NC_017618	AAAAC	2	10	73897	73906	80 %	0 %	0 %	20 %	386579051
45	NC_017618	TACAC	2	10	74311	74320	40 %	20 %	0 %	40 %	386579052
46	NC_017618	GAAAA	2	10	75190	75199	80 %	0 %	20 %	0 %	386579053
47	NC_017618	GTCTT	2	10	75478	75487	0 %	60 %	20 %	20 %	386579054
48	NC_017618	TTTGG	2	10	75609	75618	0 %	60 %	40 %	0 %	386579054
49	NC_017618	TAAGA	2	10	78942	78951	60 %	20 %	20 %	0 %	386579062
50	NC_017618	AGAAT	2	10	83730	83739	60 %	20 %	20 %	0 %	386579069
51	NC_017618	GAAAA	2	10	86056	86065	80 %	0 %	20 %	0 %	386579074
52	NC_017618	TGACT	2	10	86451	86460	20 %	40 %	20 %	20 %	386579074
53	NC_017618	TGTGA	2	10	94570	94579	20 %	40 %	40 %	0 %	386579076
54	NC_017618	TGCTT	2	10	96132	96141	0 %	60 %	20 %	20 %	386579078
55	NC_017618	TTGTT	2	10	97303	97312	0 %	80 %	20 %	0 %	386579080
56	NC_017618	AATAT	2	10	98745	98754	60 %	40 %	0 %	0 %	386579081
57	NC_017618	TTTCA	2	10	99561	99570	20 %	60 %	0 %	20 %	386579083
58	NC_017618	CTTCG	2	10	99804	99813	0 %	40 %	20 %	40 %	386579083
59	NC_017618	TTTTC	2	10	100725	100734	0 %	80 %	0 %	20 %	386579084
60	NC_017618	TTTGG	2	10	103021	103030	0 %	60 %	40 %	0 %	386579088
61	NC_017618	ATTGC	2	10	103486	103495	20 %	40 %	20 %	20 %	386579088
62	NC_017618	GCTTT	2	10	103717	103726	0 %	60 %	20 %	20 %	386579089
63	NC_017618	AGAAA	2	10	104175	104184	80 %	0 %	20 %	0 %	386579089
64	NC_017618	GACTT	2	10	105754	105763	20 %	40 %	20 %	20 %	386579090
65	NC_017618	CTGGG	2	10	109974	109983	0 %	20 %	60 %	20 %	386579095
66	NC_017618	CCGTT	2	10	115669	115678	0 %	40 %	20 %	40 %	386579097
67	NC_017618	GGCCT	2	10	119209	119218	0 %	20 %	40 %	40 %	386579100
68	NC_017618	GTCAA	2	10	119306	119315	40 %	20 %	20 %	20 %	386579100
69	NC_017618	GCTTG	2	10	121157	121166	0 %	40 %	40 %	20 %	386579102
70	NC_017618	TGGTT	2	10	121285	121294	0 %	60 %	40 %	0 %	386579102
71	NC_017618	GGTCA	2	10	121584	121593	20 %	20 %	40 %	20 %	386579102
72	NC_017618	AAGGA	2	10	122674	122683	60 %	0 %	40 %	0 %	386579105
73	NC_017618	GGCAA	2	10	123232	123241	40 %	0 %	40 %	20 %	386579107
74	NC_017618	TTGGT	2	10	125620	125629	0 %	60 %	40 %	0 %	386579109
75	NC_017618	GGATG	2	10	125922	125931	20 %	20 %	60 %	0 %	386579110
76	NC_017618	GAAAA	2	10	126082	126091	80 %	0 %	20 %	0 %	386579111
77	NC_017618	CCTTG	2	10	126135	126144	0 %	40 %	20 %	40 %	386579111
78	NC_017618	CTGGA	2	10	127023	127032	20 %	20 %	40 %	20 %	386579112
79	NC_017618	AGCAG	2	10	127379	127388	40 %	0 %	40 %	20 %	386579112
80	NC_017618	GCTCA	2	10	127487	127496	20 %	20 %	20 %	40 %	386579112
81	NC_017618	AATCA	2	10	128001	128010	60 %	20 %	0 %	20 %	386579113
82	NC_017618	AGGTG	2	10	128689	128698	20 %	20 %	60 %	0 %	386579113
83	NC_017618	ACTTT	2	10	132395	132404	20 %	60 %	0 %	20 %	386579118
84	NC_017618	TAGCG	2	10	135493	135502	20 %	20 %	40 %	20 %	386579122
85	NC_017618	ATCAA	2	10	136654	136663	60 %	20 %	0 %	20 %	386579124
86	NC_017618	CGTAT	2	10	137926	137935	20 %	40 %	20 %	20 %	386579125
87	NC_017618	ATCCA	2	10	138017	138026	40 %	20 %	0 %	40 %	386579125
88	NC_017618	CAAGA	2	10	138793	138802	60 %	0 %	20 %	20 %	386579125
89	NC_017618	AAGCT	2	10	139223	139232	40 %	20 %	20 %	20 %	386579125
90	NC_017618	AAGAA	2	10	141483	141492	80 %	0 %	20 %	0 %	386579127
91	NC_017618	GCAGT	2	10	141773	141782	20 %	20 %	40 %	20 %	386579127
92	NC_017618	ATCCA	2	10	141884	141893	40 %	20 %	0 %	40 %	386579127
93	NC_017618	TACGA	2	10	142385	142394	40 %	20 %	20 %	20 %	386579127
94	NC_017618	GTTTA	2	10	146382	146391	20 %	60 %	20 %	0 %	386579130
95	NC_017618	GCATG	2	10	147904	147913	20 %	20 %	40 %	20 %	386579132
96	NC_017618	AAAAT	2	10	148317	148326	80 %	20 %	0 %	0 %	386579132
97	NC_017618	GGGTC	2	10	152939	152948	0 %	20 %	60 %	20 %	386579137
98	NC_017618	TTTCA	2	10	153909	153918	20 %	60 %	0 %	20 %	386579138
99	NC_017618	TGGTC	2	10	157095	157104	0 %	40 %	40 %	20 %	386579141
100	NC_017618	GTCTT	2	10	158050	158059	0 %	60 %	20 %	20 %	386579142
101	NC_017618	TTGGA	2	10	160566	160575	20 %	40 %	40 %	0 %	386579144
102	NC_017618	TCATC	2	10	161439	161448	20 %	40 %	0 %	40 %	386579146
103	NC_017618	CTTGG	2	10	161608	161617	0 %	40 %	40 %	20 %	386579146
104	NC_017618	AATTG	2	10	162268	162277	40 %	40 %	20 %	0 %	386579147
105	NC_017618	TTTTC	2	10	162627	162636	0 %	80 %	0 %	20 %	386579148
106	NC_017618	CACCT	2	10	163190	163199	20 %	20 %	0 %	60 %	386579148
107	NC_017618	AGACT	2	10	167976	167985	40 %	20 %	20 %	20 %	386579151
108	NC_017618	ATACA	2	10	173095	173104	60 %	20 %	0 %	20 %	386579156
109	NC_017618	GGTTT	2	10	175253	175262	0 %	60 %	40 %	0 %	386579157
110	NC_017618	TTATC	2	10	176129	176138	20 %	60 %	0 %	20 %	386579158
111	NC_017618	TCTGG	2	10	179564	179573	0 %	40 %	40 %	20 %	386579161
112	NC_017618	TTCAA	2	10	180104	180113	40 %	40 %	0 %	20 %	386579161
113	NC_017618	TGATT	2	10	184735	184744	20 %	60 %	20 %	0 %	386579165
114	NC_017618	GAAGC	2	10	186852	186861	40 %	0 %	40 %	20 %	386579166
115	NC_017618	GGAAA	2	10	192221	192230	60 %	0 %	40 %	0 %	386579169
116	NC_017618	CTGGT	2	10	192717	192726	0 %	40 %	40 %	20 %	386579170
117	NC_017618	CCAGA	2	10	192770	192779	40 %	0 %	20 %	40 %	386579170
118	NC_017618	AGCAG	2	10	194818	194827	40 %	0 %	40 %	20 %	386579172
119	NC_017618	TTTTG	2	10	196350	196359	0 %	80 %	20 %	0 %	386579175
120	NC_017618	GAACA	2	10	196385	196394	60 %	0 %	20 %	20 %	386579175
121	NC_017618	TTTTA	2	10	197572	197581	20 %	80 %	0 %	0 %	386579177
122	NC_017618	TGAAA	2	10	198736	198745	60 %	20 %	20 %	0 %	386579178
123	NC_017618	AAGGA	2	10	199388	199397	60 %	0 %	40 %	0 %	386579178
124	NC_017618	AGTAA	2	10	199859	199868	60 %	20 %	20 %	0 %	386579178
125	NC_017618	CAAGT	2	10	201617	201626	40 %	20 %	20 %	20 %	386579179
126	NC_017618	ATGGA	2	10	202287	202296	40 %	20 %	40 %	0 %	386579179
127	NC_017618	TTTGG	2	10	205404	205413	0 %	60 %	40 %	0 %	386579181
128	NC_017618	TCTAC	2	10	206184	206193	20 %	40 %	0 %	40 %	386579182
129	NC_017618	AATGT	2	10	206331	206340	40 %	40 %	20 %	0 %	386579182
130	NC_017618	AGCAG	2	10	210471	210480	40 %	0 %	40 %	20 %	386579187
131	NC_017618	GTTTT	2	10	214410	214419	0 %	80 %	20 %	0 %	386579188
132	NC_017618	CCATA	2	10	214512	214521	40 %	20 %	0 %	40 %	386579189
133	NC_017618	ATGAC	2	10	215900	215909	40 %	20 %	20 %	20 %	386579190
134	NC_017618	AGCTC	2	10	217582	217591	20 %	20 %	20 %	40 %	386579191
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