MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 36729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017618	TGA	2	6	319266	319271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579287
5502	NC_017618	CA	3	6	319291	319296	50 %	0 %	0 %	50 %	386579287
5503	NC_017618	TGGT	2	8	319313	319320	0 %	50 %	50 %	0 %	386579287
5504	NC_017618	ATT	2	6	319376	319381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579287
5505	NC_017618	AC	3	6	319482	319487	50 %	0 %	0 %	50 %	386579287
5506	NC_017618	GAA	2	6	319552	319557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579287
5507	NC_017618	TTG	2	6	319592	319597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579287
5508	NC_017618	AAT	2	6	319720	319725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386579287
5509	NC_017618	TAAAA	2	10	319778	319787	80 %	20 %	0 %	0 %	386579287
5510	NC_017618	A	6	6	319814	319819	100 %	0 %	0 %	0 %	386579288
5511	NC_017618	GAA	2	6	319821	319826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5512	NC_017618	A	6	6	319825	319830	100 %	0 %	0 %	0 %	386579288
5513	NC_017618	GTT	2	6	319834	319839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579288
5514	NC_017618	GCC	2	6	319849	319854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386579288
5515	NC_017618	A	7	7	319916	319922	100 %	0 %	0 %	0 %	386579288
5516	NC_017618	GT	3	6	319925	319930	0 %	50 %	50 %	0 %	386579288
5517	NC_017618	ACT	2	6	320081	320086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579288
5518	NC_017618	CAT	2	6	320169	320174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579288
5519	NC_017618	CTATCT	2	12	320220	320231	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386579288
5520	NC_017618	AGA	2	6	320268	320273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5521	NC_017618	TCT	2	6	320296	320301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386579288
5522	NC_017618	GCA	2	6	320320	320325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579288
5523	NC_017618	ACAGA	2	10	320348	320357	60 %	0 %	20 %	20 %	386579288
5524	NC_017618	A	6	6	320449	320454	100 %	0 %	0 %	0 %	386579288
5525	NC_017618	GCT	2	6	320479	320484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579288
5526	NC_017618	ATA	2	6	320549	320554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386579288
5527	NC_017618	GGAT	2	8	320655	320662	25 %	25 %	50 %	0 %	386579288
5528	NC_017618	GAA	2	6	320688	320693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5529	NC_017618	GCA	2	6	320698	320703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579288
5530	NC_017618	AGA	2	6	320766	320771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5531	NC_017618	TCT	2	6	320812	320817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386579288
5532	NC_017618	CAAG	2	8	320824	320831	50 %	0 %	25 %	25 %	386579288
5533	NC_017618	TGA	2	6	321066	321071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579288
5534	NC_017618	AAG	2	6	321278	321283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5535	NC_017618	GTT	2	6	321343	321348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579288
5536	NC_017618	TGA	2	6	321404	321409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579288
5537	NC_017618	AGCC	2	8	321494	321501	25 %	0 %	25 %	50 %	386579288
5538	NC_017618	TAT	2	6	321570	321575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579288
5539	NC_017618	CA	3	6	321578	321583	50 %	0 %	0 %	50 %	386579288
5540	NC_017618	CA	3	6	321790	321795	50 %	0 %	0 %	50 %	386579288
5541	NC_017618	AGA	2	6	321798	321803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5542	NC_017618	ATG	2	6	321842	321847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579288
5543	NC_017618	TCT	2	6	321854	321859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386579288
5544	NC_017618	CGG	2	6	321860	321865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386579288
5545	NC_017618	AGG	2	6	321927	321932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386579288
5546	NC_017618	AAGA	2	8	321952	321959	75 %	0 %	25 %	0 %	386579288
5547	NC_017618	AGA	2	6	321969	321974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5548	NC_017618	CTT	2	6	321994	321999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386579288
5549	NC_017618	GAA	2	6	322015	322020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5550	NC_017618	CAG	2	6	322085	322090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579288
5551	NC_017618	GCA	2	6	322111	322116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579288
5552	NC_017618	ACA	2	6	322126	322131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579288
5553	NC_017618	CAG	2	6	322277	322282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579288
5554	NC_017618	TGG	2	6	322289	322294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386579288
5555	NC_017618	ACA	2	6	322369	322374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579288
5556	NC_017618	CAG	2	6	322406	322411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579288
5557	NC_017618	GAA	2	6	322437	322442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5558	NC_017618	ATCACT	2	12	322526	322537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579288
5559	NC_017618	AAG	2	6	322572	322577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5560	NC_017618	AGA	2	6	322596	322601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5561	NC_017618	TAC	2	6	322621	322626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579288
5562	NC_017618	AGA	2	6	322704	322709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5563	NC_017618	GAA	2	6	322720	322725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5564	NC_017618	TGA	2	6	322728	322733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579288
5565	NC_017618	ATT	2	6	322738	322743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579288
5566	NC_017618	GAA	2	6	322747	322752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5567	NC_017618	AGA	2	6	322776	322781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5568	NC_017618	AGA	2	6	322797	322802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579288
5569	NC_017618	ATG	2	6	322886	322891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579288
5570	NC_017618	AGCA	2	8	322893	322900	50 %	0 %	25 %	25 %	386579288
5571	NC_017618	GTT	2	6	322903	322908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579288
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5574	NC_017618	GAA	2	6	323173	323178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579289
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5581	NC_017618	ATG	2	6	323477	323482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579289
5582	NC_017618	ATC	2	6	323517	323522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579289
5583	NC_017618	GAT	2	6	323530	323535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579289
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5589	NC_017618	ACA	2	6	324142	324147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579290
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5591	NC_017618	CA	3	6	324221	324226	50 %	0 %	0 %	50 %	386579290
5592	NC_017618	TAC	2	6	324267	324272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579290
5593	NC_017618	TCA	3	9	324284	324292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579290
5594	NC_017618	GTGG	2	8	324298	324305	0 %	25 %	75 %	0 %	386579290
5595	NC_017618	ACA	2	6	324397	324402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579290
5596	NC_017618	AGC	2	6	324420	324425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579290
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5598	NC_017618	AGC	2	6	324515	324520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579290
5599	NC_017618	CTG	2	6	324521	324526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579290
5600	NC_017618	CAG	2	6	324686	324691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579290
5601	NC_017618	A	6	6	324739	324744	100 %	0 %	0 %	0 %	386579290
5602	NC_017618	ATG	2	6	324833	324838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579290
5603	NC_017618	CAG	2	6	324878	324883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579290
5604	NC_017618	TGG	2	6	324930	324935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386579290
5605	NC_017618	CACGT	2	10	325049	325058	20 %	20 %	20 %	40 %	386579290
5606	NC_017618	ATT	2	6	325114	325119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579290
5607	NC_017618	CAT	2	6	325122	325127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579290
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5609	NC_017618	CAAG	2	8	325184	325191	50 %	0 %	25 %	25 %	386579290
5610	NC_017618	GCT	2	6	325216	325221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579290
5611	NC_017618	AAG	2	6	325232	325237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579290
5612	NC_017618	CATCGT	2	12	325252	325263	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386579290
5613	NC_017618	TAA	2	6	325272	325277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386579290
5614	NC_017618	GTTTT	2	10	325307	325316	0 %	80 %	20 %	0 %	386579290
5615	NC_017618	TTG	2	6	325352	325357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579290
5616	NC_017618	TTC	2	6	325375	325380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386579290
5617	NC_017618	TGCC	2	8	325383	325390	0 %	25 %	25 %	50 %	386579290
5618	NC_017618	CAG	2	6	325454	325459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579290
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5985	NC_017618	TGG	2	6	353660	353665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386579311
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