MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 1102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017596	GGTAA	2	10	2668	2677	40 %	20 %	40 %	0 %	386361883
2	NC_017596	TGAAA	2	10	2978	2987	60 %	20 %	20 %	0 %	386361884
3	NC_017596	TGGTA	2	10	3604	3613	20 %	40 %	40 %	0 %	386361885
4	NC_017596	GATTT	2	10	6170	6179	20 %	60 %	20 %	0 %	386361887
5	NC_017596	TCAAT	2	10	11678	11687	40 %	40 %	0 %	20 %	386361892
6	NC_017596	ATTAA	2	10	11999	12008	60 %	40 %	0 %	0 %	386361892
7	NC_017596	TACAC	2	10	15947	15956	40 %	20 %	0 %	40 %	386361895
8	NC_017596	TAAAT	2	10	15957	15966	60 %	40 %	0 %	0 %	386361895
9	NC_017596	AGTGA	2	10	33258	33267	40 %	20 %	40 %	0 %	386361897
10	NC_017596	ATTTT	2	10	33957	33966	20 %	80 %	0 %	0 %	386361898
11	NC_017596	TTGAT	2	10	34146	34155	20 %	60 %	20 %	0 %	386361898
12	NC_017596	AGCAG	2	10	43479	43488	40 %	0 %	40 %	20 %	386361905
13	NC_017596	GGTCA	2	10	43843	43852	20 %	20 %	40 %	20 %	386361905
14	NC_017596	TTGGG	2	10	44239	44248	0 %	40 %	60 %	0 %	386361906
15	NC_017596	CAACT	2	10	44738	44747	40 %	20 %	0 %	40 %	386361906
16	NC_017596	GCAGG	2	10	48320	48329	20 %	0 %	60 %	20 %	386361908
17	NC_017596	CTCAG	2	10	49677	49686	20 %	20 %	20 %	40 %	386361910
18	NC_017596	TACTA	2	10	51315	51324	40 %	40 %	0 %	20 %	386361911
19	NC_017596	AAATT	2	10	51608	51617	60 %	40 %	0 %	0 %	386361912
20	NC_017596	TGTAT	2	10	54146	54155	20 %	60 %	20 %	0 %	386361914
21	NC_017596	TATTT	2	10	54225	54234	20 %	80 %	0 %	0 %	386361914
22	NC_017596	TCGGA	2	10	54574	54583	20 %	20 %	40 %	20 %	386361915
23	NC_017596	TTTGC	2	10	57316	57325	0 %	60 %	20 %	20 %	386361918
24	NC_017596	TTTTC	2	10	57517	57526	0 %	80 %	0 %	20 %	386361918
25	NC_017596	AAACC	2	10	57582	57591	60 %	0 %	0 %	40 %	386361918
26	NC_017596	ATTCA	2	10	60039	60048	40 %	40 %	0 %	20 %	386361919
27	NC_017596	TTTTA	2	10	63811	63820	20 %	80 %	0 %	0 %	386361921
28	NC_017596	AAAGC	2	10	64004	64013	60 %	0 %	20 %	20 %	386361921
29	NC_017596	TTTGG	2	10	67998	68007	0 %	60 %	40 %	0 %	386361928
30	NC_017596	TTCAC	2	10	68354	68363	20 %	40 %	0 %	40 %	386361929
31	NC_017596	GAAAT	2	10	69435	69444	60 %	20 %	20 %	0 %	386361931
32	NC_017596	TCCAA	2	10	75135	75144	40 %	20 %	0 %	40 %	386361943
33	NC_017596	CTTGG	2	10	89345	89354	0 %	40 %	40 %	20 %	386361955
34	NC_017596	TCTTA	2	10	89763	89772	20 %	60 %	0 %	20 %	386361955
35	NC_017596	CACTC	2	10	91308	91317	20 %	20 %	0 %	60 %	386361957
36	NC_017596	GATTG	2	10	93569	93578	20 %	40 %	40 %	0 %	386361958
37	NC_017596	TTGAT	2	10	103710	103719	20 %	60 %	20 %	0 %	386361963
38	NC_017596	AAATC	2	10	103878	103887	60 %	20 %	0 %	20 %	386361963
39	NC_017596	TGAAG	2	10	109195	109204	40 %	20 %	40 %	0 %	386361972
40	NC_017596	TTTAG	2	10	111054	111063	20 %	60 %	20 %	0 %	386361974
41	NC_017596	GTGTT	2	10	115457	115466	0 %	60 %	40 %	0 %	386361980
42	NC_017596	TTGAA	2	10	115746	115755	40 %	40 %	20 %	0 %	386361981
43	NC_017596	AGGAG	2	10	124291	124300	40 %	0 %	60 %	0 %	386361988
44	NC_017596	TAATT	2	10	125118	125127	40 %	60 %	0 %	0 %	386361988
45	NC_017596	TCAGG	2	10	125581	125590	20 %	20 %	40 %	20 %	386361988
46	NC_017596	TTTTA	2	10	127370	127379	20 %	80 %	0 %	0 %	386361990
47	NC_017596	GCTTT	3	15	127946	127960	0 %	60 %	20 %	20 %	386361990
48	NC_017596	GTCAT	2	10	128265	128274	20 %	40 %	20 %	20 %	386361990
49	NC_017596	TAGTG	2	10	129210	129219	20 %	40 %	40 %	0 %	386361991
50	NC_017596	GTTAA	2	10	129613	129622	40 %	40 %	20 %	0 %	386361991
51	NC_017596	AATAA	2	10	129642	129651	80 %	20 %	0 %	0 %	386361991
52	NC_017596	TTGAT	2	10	130729	130738	20 %	60 %	20 %	0 %	386361992
53	NC_017596	TTGAC	2	10	131951	131960	20 %	40 %	20 %	20 %	386361994
54	NC_017596	TACCT	2	10	132132	132141	20 %	40 %	0 %	40 %	386361994
55	NC_017596	AATCA	2	10	132912	132921	60 %	20 %	0 %	20 %	386361995
56	NC_017596	TCATG	2	10	133519	133528	20 %	40 %	20 %	20 %	386361996
57	NC_017596	AACAA	2	10	134665	134674	80 %	0 %	0 %	20 %	386361997
58	NC_017596	CAAAA	2	10	135882	135891	80 %	0 %	0 %	20 %	386361999
59	NC_017596	TTTTA	2	10	136955	136964	20 %	80 %	0 %	0 %	386361999
60	NC_017596	AAAGC	2	10	138143	138152	60 %	0 %	20 %	20 %	386362001
61	NC_017596	AGTTC	2	10	138393	138402	20 %	40 %	20 %	20 %	386362001
62	NC_017596	GCTGA	2	10	138413	138422	20 %	20 %	40 %	20 %	386362001
63	NC_017596	ATCGC	2	10	141787	141796	20 %	20 %	20 %	40 %	386362005
64	NC_017596	TTGGG	2	10	143190	143199	0 %	40 %	60 %	0 %	386362006
65	NC_017596	GAAAA	2	10	148500	148509	80 %	0 %	20 %	0 %	386362011
66	NC_017596	GGATT	2	10	148617	148626	20 %	40 %	40 %	0 %	386362011
67	NC_017596	TTTTG	2	10	149137	149146	0 %	80 %	20 %	0 %	386362011
68	NC_017596	TCATG	2	10	150677	150686	20 %	40 %	20 %	20 %	386362013
69	NC_017596	GATGT	2	10	151311	151320	20 %	40 %	40 %	0 %	386362013
70	NC_017596	GTCGC	2	10	152376	152385	0 %	20 %	40 %	40 %	386362015
71	NC_017596	CTTGT	2	10	156976	156985	0 %	60 %	20 %	20 %	386362018
72	NC_017596	GCCTA	2	10	157692	157701	20 %	20 %	20 %	40 %	386362019
73	NC_017596	GCAAC	2	10	157909	157918	40 %	0 %	20 %	40 %	386362019
74	NC_017596	AAGGT	2	10	159591	159600	40 %	20 %	40 %	0 %	386362019
75	NC_017596	ATTTG	2	10	165875	165884	20 %	60 %	20 %	0 %	386362026
76	NC_017596	CAAGA	2	10	167797	167806	60 %	0 %	20 %	20 %	386362027
77	NC_017596	TTTGG	2	10	168965	168974	0 %	60 %	40 %	0 %	386362028
78	NC_017596	TGGAT	2	10	169914	169923	20 %	40 %	40 %	0 %	386362029
79	NC_017596	TGCCT	2	10	170290	170299	0 %	40 %	20 %	40 %	386362029
80	NC_017596	ACCTA	2	10	170986	170995	40 %	20 %	0 %	40 %	386362029
81	NC_017596	ATTTT	2	10	175850	175859	20 %	80 %	0 %	0 %	386362033
82	NC_017596	GTTTG	2	10	177378	177387	0 %	60 %	40 %	0 %	386362034
83	NC_017596	TGAAA	2	10	177553	177562	60 %	20 %	20 %	0 %	386362035
84	NC_017596	TTGAT	2	10	177801	177810	20 %	60 %	20 %	0 %	386362035
85	NC_017596	CCAAA	2	10	180147	180156	60 %	0 %	0 %	40 %	386362040
86	NC_017596	TCCCA	2	10	180349	180358	20 %	20 %	0 %	60 %	386362040
87	NC_017596	GCCAA	2	10	181196	181205	40 %	0 %	20 %	40 %	386362041
88	NC_017596	GGAAA	2	10	184115	184124	60 %	0 %	40 %	0 %	386362045
89	NC_017596	TAATC	2	10	186940	186949	40 %	40 %	0 %	20 %	386362049
90	NC_017596	TTTAC	2	10	191072	191081	20 %	60 %	0 %	20 %	386362053
91	NC_017596	CAAAC	2	10	193593	193602	60 %	0 %	0 %	40 %	386362057
92	NC_017596	AGATA	2	10	193707	193716	60 %	20 %	20 %	0 %	386362057
93	NC_017596	ATATA	2	10	194496	194505	60 %	40 %	0 %	0 %	386362057
94	NC_017596	GTTTT	2	10	196453	196462	0 %	80 %	20 %	0 %	386362061
95	NC_017596	TTTTG	2	10	198383	198392	0 %	80 %	20 %	0 %	386362062
96	NC_017596	ATCGC	2	10	199699	199708	20 %	20 %	20 %	40 %	386362064
97	NC_017596	TTTTA	2	10	200867	200876	20 %	80 %	0 %	0 %	386362065
98	NC_017596	CTAAT	2	10	201105	201114	40 %	40 %	0 %	20 %	386362065
99	NC_017596	GAATG	2	10	201628	201637	40 %	20 %	40 %	0 %	386362065
100	NC_017596	CCTTC	2	10	206055	206064	0 %	40 %	0 %	60 %	386362069
101	NC_017596	GCTAA	2	10	206098	206107	40 %	20 %	20 %	20 %	386362069
102	NC_017596	TGGAT	2	10	208189	208198	20 %	40 %	40 %	0 %	386362071
103	NC_017596	CTTTT	2	10	208359	208368	0 %	80 %	0 %	20 %	386362071
104	NC_017596	GAGAA	2	10	209730	209739	60 %	0 %	40 %	0 %	386362072
105	NC_017596	GTTAT	2	10	210755	210764	20 %	60 %	20 %	0 %	386362073
106	NC_017596	AAGAT	2	10	210841	210850	60 %	20 %	20 %	0 %	386362073
107	NC_017596	AAATG	2	10	212389	212398	60 %	20 %	20 %	0 %	386362074
108	NC_017596	CAAAT	2	10	213534	213543	60 %	20 %	0 %	20 %	386362076
109	NC_017596	CTCAT	2	10	217978	217987	20 %	40 %	0 %	40 %	386362082
110	NC_017596	TTTTC	2	10	218198	218207	0 %	80 %	0 %	20 %	386362082
111	NC_017596	TTGTC	2	10	219938	219947	0 %	60 %	20 %	20 %	386362084
112	NC_017596	GCAGC	2	10	224194	224203	20 %	0 %	40 %	40 %	386362088
113	NC_017596	ATTCC	2	10	225499	225508	20 %	40 %	0 %	40 %	386362090
114	NC_017596	AATCA	2	10	230042	230051	60 %	20 %	0 %	20 %	386362095
115	NC_017596	GAAAC	2	10	234162	234171	60 %	0 %	20 %	20 %	386362097
116	NC_017596	CCAAT	2	10	236534	236543	40 %	20 %	0 %	40 %	386362100
117	NC_017596	CAAGA	2	10	237308	237317	60 %	0 %	20 %	20 %	386362100
118	NC_017596	AAGCT	2	10	237738	237747	40 %	20 %	20 %	20 %	386362100
119	NC_017596	TTTGG	2	10	240288	240297	0 %	60 %	40 %	0 %	386362103
120	NC_017596	TTTTA	2	10	244792	244801	20 %	80 %	0 %	0 %	386362106
121	NC_017596	TGGTT	2	10	246730	246739	0 %	60 %	40 %	0 %	386362108
122	NC_017596	ATTAC	2	10	248125	248134	40 %	40 %	0 %	20 %	386362110
123	NC_017596	TGATT	2	10	249138	249147	20 %	60 %	20 %	0 %	386362111
124	NC_017596	CCAAT	2	10	249395	249404	40 %	20 %	0 %	40 %	386362111
125	NC_017596	GTGAT	2	10	250992	251001	20 %	40 %	40 %	0 %	386362113
126	NC_017596	GGTTC	2	10	255088	255097	0 %	40 %	40 %	20 %	386362116
127	NC_017596	ATAGT	2	10	255208	255217	40 %	40 %	20 %	0 %	386362116
128	NC_017596	CAAAA	2	10	256901	256910	80 %	0 %	0 %	20 %	386362117
129	NC_017596	GCTTG	2	10	271133	271142	0 %	40 %	40 %	20 %	386362125
130	NC_017596	TATCA	2	10	271482	271491	40 %	40 %	0 %	20 %	386362125
131	NC_017596	GCAGA	2	10	273707	273716	40 %	0 %	40 %	20 %	386362129
132	NC_017596	ATGGT	2	10	273924	273933	20 %	40 %	40 %	0 %	386362129
133	NC_017596	GATGA	2	10	276664	276673	40 %	20 %	40 %	0 %	386362132
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260	NC_017596	ATTTA	2	10	458332	458341	40 %	60 %	0 %	0 %	386362317
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