MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 32283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017596	AAG	2	6	100427	100432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361960
1503	NC_017596	AC	3	6	100469	100474	50 %	0 %	0 %	50 %	386361960
1504	NC_017596	TTG	2	6	100556	100561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361960
1505	NC_017596	GAA	2	6	100573	100578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361960
1506	NC_017596	TGC	2	6	100695	100700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361960
1507	NC_017596	GTG	2	6	100754	100759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361960
1508	NC_017596	GTC	2	6	100864	100869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361960
1509	NC_017596	GAA	2	6	100876	100881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361960
1510	NC_017596	CGA	2	6	100980	100985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361960
1511	NC_017596	CTT	2	6	101074	101079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361960
1512	NC_017596	CCT	2	6	101196	101201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361960
1513	NC_017596	TGG	2	6	101262	101267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361960
1514	NC_017596	CTT	2	6	101331	101336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361960
1515	NC_017596	AAC	2	6	101358	101363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361960
1516	NC_017596	TGC	2	6	101379	101384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361960
1517	NC_017596	AAGA	2	8	101395	101402	75 %	0 %	25 %	0 %	386361960
1518	NC_017596	ACTT	2	8	101405	101412	25 %	50 %	0 %	25 %	386361960
1519	NC_017596	ATC	2	6	101443	101448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361960
1520	NC_017596	CTGGTA	2	12	101453	101464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386361960
1521	NC_017596	GC	3	6	101467	101472	0 %	0 %	50 %	50 %	386361960
1522	NC_017596	ATGA	2	8	101497	101504	50 %	25 %	25 %	0 %	386361960
1523	NC_017596	TGAT	2	8	101513	101520	25 %	50 %	25 %	0 %	386361960
1524	NC_017596	CAG	2	6	101534	101539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361960
1525	NC_017596	AAT	2	6	101546	101551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361960
1526	NC_017596	TGG	2	6	101741	101746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361961
1527	NC_017596	GATG	2	8	101753	101760	25 %	25 %	50 %	0 %	386361961
1528	NC_017596	CAA	2	6	101783	101788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361961
1529	NC_017596	AAG	2	6	101802	101807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361961
1530	NC_017596	ATT	2	6	101814	101819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361961
1531	NC_017596	AGA	2	6	101902	101907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361961
1532	NC_017596	GCA	2	6	101941	101946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361961
1533	NC_017596	AAT	2	6	101993	101998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361961
1534	NC_017596	AAC	2	6	102015	102020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361961
1535	NC_017596	CAC	2	6	102030	102035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361961
1536	NC_017596	ATATTT	2	12	102218	102229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361962
1537	NC_017596	T	7	7	102254	102260	0 %	100 %	0 %	0 %	386361962
1538	NC_017596	CTC	2	6	102314	102319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361962
1539	NC_017596	TTA	2	6	102320	102325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361962
1540	NC_017596	TCA	3	9	102483	102491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361962
1541	NC_017596	ATT	2	6	102506	102511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361962
1542	NC_017596	TATT	2	8	102562	102569	25 %	75 %	0 %	0 %	386361962
1543	NC_017596	ATC	2	6	102626	102631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361962
1544	NC_017596	AAG	2	6	102632	102637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361962
1545	NC_017596	TTA	2	6	102644	102649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361962
1546	NC_017596	AGA	2	6	102654	102659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361962
1547	NC_017596	ATG	2	6	102704	102709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361962
1548	NC_017596	TTA	2	6	102812	102817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361962
1549	NC_017596	T	6	6	102842	102847	0 %	100 %	0 %	0 %	386361962
1550	NC_017596	GGA	2	6	102964	102969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361962
1551	NC_017596	ATTG	2	8	102972	102979	25 %	50 %	25 %	0 %	386361962
1552	NC_017596	ATT	2	6	103004	103009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361962
1553	NC_017596	CAA	2	6	103027	103032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361962
1554	NC_017596	CTT	2	6	103042	103047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361962
1555	NC_017596	CAAG	2	8	103068	103075	50 %	0 %	25 %	25 %	386361962
1556	NC_017596	A	6	6	103085	103090	100 %	0 %	0 %	0 %	386361962
1557	NC_017596	TTA	2	6	103232	103237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361963
1558	NC_017596	TGT	2	6	103260	103265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361963
1559	NC_017596	ACA	2	6	103334	103339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361963
1560	NC_017596	TAG	2	6	103341	103346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361963
1561	NC_017596	CTTTTT	2	12	103427	103438	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386361963
1562	NC_017596	TGA	2	6	103440	103445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361963
1563	NC_017596	ACTT	2	8	103499	103506	25 %	50 %	0 %	25 %	386361963
1564	NC_017596	CTT	2	6	103525	103530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361963
1565	NC_017596	TGT	2	6	103557	103562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361963
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1569	NC_017596	CTAC	2	8	103827	103834	25 %	25 %	0 %	50 %	386361963
1570	NC_017596	T	7	7	103837	103843	0 %	100 %	0 %	0 %	386361963
1571	NC_017596	A	6	6	103844	103849	100 %	0 %	0 %	0 %	386361963
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1573	NC_017596	T	6	6	103937	103942	0 %	100 %	0 %	0 %	386361963
1574	NC_017596	T	7	7	103983	103989	0 %	100 %	0 %	0 %	386361963
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1577	NC_017596	GAT	2	6	104069	104074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361964
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1580	NC_017596	TCA	2	6	104149	104154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361964
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1582	NC_017596	AAGC	2	8	104186	104193	50 %	0 %	25 %	25 %	386361964
1583	NC_017596	TGT	2	6	104228	104233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361964
1584	NC_017596	GTA	2	6	104314	104319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361964
1585	NC_017596	TAT	2	6	104352	104357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361964
1586	NC_017596	TGA	2	6	104435	104440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361965
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1588	NC_017596	T	6	6	104506	104511	0 %	100 %	0 %	0 %	386361965
1589	NC_017596	CAA	2	6	104591	104596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361965
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1591	NC_017596	GTTA	2	8	104661	104668	25 %	50 %	25 %	0 %	386361965
1592	NC_017596	ATT	2	6	104704	104709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361965
1593	NC_017596	A	6	6	104768	104773	100 %	0 %	0 %	0 %	386361965
1594	NC_017596	CAG	2	6	104858	104863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361966
1595	NC_017596	GCT	2	6	104870	104875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361966
1596	NC_017596	AGC	2	6	104892	104897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361966
1597	NC_017596	TACG	2	8	104979	104986	25 %	25 %	25 %	25 %	386361966
1598	NC_017596	GATA	2	8	104987	104994	50 %	25 %	25 %	0 %	386361966
1599	NC_017596	TGA	2	6	105024	105029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361966
1600	NC_017596	CCT	2	6	105140	105145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361967
1601	NC_017596	TCA	2	6	105200	105205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361967
1602	NC_017596	GAG	2	6	105213	105218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361967
1603	NC_017596	ATA	2	6	105250	105255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361967
1604	NC_017596	GAAA	2	8	105274	105281	75 %	0 %	25 %	0 %	386361967
1605	NC_017596	TAT	2	6	105447	105452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361967
1606	NC_017596	T	7	7	105512	105518	0 %	100 %	0 %	0 %	386361968
1607	NC_017596	T	6	6	105655	105660	0 %	100 %	0 %	0 %	386361968
1608	NC_017596	GGT	2	6	105664	105669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361968
1609	NC_017596	AG	3	6	105693	105698	50 %	0 %	50 %	0 %	386361968
1610	NC_017596	AATA	2	8	105773	105780	75 %	25 %	0 %	0 %	386361968
1611	NC_017596	A	6	6	105885	105890	100 %	0 %	0 %	0 %	386361969
1612	NC_017596	GAA	2	6	105893	105898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361969
1613	NC_017596	GCT	2	6	105907	105912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361969
1614	NC_017596	AT	3	6	105954	105959	50 %	50 %	0 %	0 %	386361969
1615	NC_017596	TTG	2	6	105969	105974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361969
1616	NC_017596	TTTA	2	8	105987	105994	25 %	75 %	0 %	0 %	386361969
1617	NC_017596	AGA	2	6	106063	106068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361969
1618	NC_017596	TTA	2	6	106095	106100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361969
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1620	NC_017596	CAA	2	6	106258	106263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361969
1621	NC_017596	TGA	2	6	106300	106305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361969
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1623	NC_017596	TTC	2	6	106348	106353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361969
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1992	NC_017596	TAA	2	6	125175	125180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361988
1993	NC_017596	GAA	2	6	125185	125190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361988
1994	NC_017596	GAA	2	6	125266	125271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361988
1995	NC_017596	GCA	2	6	125443	125448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361988
1996	NC_017596	TCAGG	2	10	125581	125590	20 %	20 %	40 %	20 %	386361988
1997	NC_017596	TATTGA	2	12	125592	125603	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386361988
1998	NC_017596	ACT	2	6	125641	125646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361988
1999	NC_017596	AGA	2	6	125652	125657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361988
2000	NC_017596	GTT	2	6	125698	125703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361988

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