MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus salivarius JIM8777

Total Repeats: 38132

< Previous12...65666768697071727374757677Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_017595	GTT	2	6	2203690	2203695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387785123
38002	NC_017595	TGA	2	6	2203722	2203727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785123
38003	NC_017595	ATG	2	6	2203733	2203738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785123
38004	NC_017595	GAA	2	6	2203753	2203758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785123
38005	NC_017595	A	6	6	2203853	2203858	100 %	0 %	0 %	0 %	387785124
38006	NC_017595	TAT	2	6	2203872	2203877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387785124
38007	NC_017595	GCT	2	6	2203886	2203891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387785124
38008	NC_017595	T	6	6	2203891	2203896	0 %	100 %	0 %	0 %	387785124
38009	NC_017595	A	6	6	2203935	2203940	100 %	0 %	0 %	0 %	387785124
38010	NC_017595	TCA	2	6	2203984	2203989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785124
38011	NC_017595	CTT	2	6	2204110	2204115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387785124
38012	NC_017595	TAT	2	6	2204165	2204170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387785124
38013	NC_017595	AAG	2	6	2204245	2204250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785124
38014	NC_017595	TGA	2	6	2204283	2204288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785124
38015	NC_017595	CAGT	2	8	2204299	2204306	25 %	25 %	25 %	25 %	387785124
38016	NC_017595	T	6	6	2204402	2204407	0 %	100 %	0 %	0 %	387785124
38017	NC_017595	ATG	2	6	2204450	2204455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785124
38018	NC_017595	TTC	2	6	2204520	2204525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387785124
38019	NC_017595	AGT	2	6	2204567	2204572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785124
38020	NC_017595	ACT	2	6	2204593	2204598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785124
38021	NC_017595	CA	3	6	2204608	2204613	50 %	0 %	0 %	50 %	387785124
38022	NC_017595	TTG	2	6	2204642	2204647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387785124
38023	NC_017595	TAT	2	6	2204660	2204665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387785124
38024	NC_017595	CTT	2	6	2204671	2204676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387785124
38025	NC_017595	TAC	2	6	2204704	2204709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785124
38026	NC_017595	TAG	2	6	2204779	2204784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785124
38027	NC_017595	TAG	2	6	2204823	2204828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785124
38028	NC_017595	CTTT	2	8	2204829	2204836	0 %	75 %	0 %	25 %	387785124
38029	NC_017595	ATGC	2	8	2204882	2204889	25 %	25 %	25 %	25 %	387785124
38030	NC_017595	TC	3	6	2204927	2204932	0 %	50 %	0 %	50 %	387785124
38031	NC_017595	CTTTT	2	10	2204977	2204986	0 %	80 %	0 %	20 %	387785124
38032	NC_017595	CTC	2	6	2204993	2204998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387785124
38033	NC_017595	TCTT	2	8	2205002	2205009	0 %	75 %	0 %	25 %	387785124
38034	NC_017595	CTTA	2	8	2205024	2205031	25 %	50 %	0 %	25 %	387785124
38035	NC_017595	TCT	2	6	2205100	2205105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387785124
38036	NC_017595	TATT	2	8	2205120	2205127	25 %	75 %	0 %	0 %	387785124
38037	NC_017595	CTT	2	6	2205175	2205180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387785124
38038	NC_017595	TACT	2	8	2205208	2205215	25 %	50 %	0 %	25 %	387785124
38039	NC_017595	TGT	2	6	2205217	2205222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387785124
38040	NC_017595	CTAC	2	8	2205265	2205272	25 %	25 %	0 %	50 %	387785124
38041	NC_017595	AAGC	2	8	2205311	2205318	50 %	0 %	25 %	25 %	387785124
38042	NC_017595	TAA	2	6	2205556	2205561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387785124
38043	NC_017595	ATA	2	6	2205612	2205617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387785124
38044	NC_017595	ACTTA	2	10	2205721	2205730	40 %	40 %	0 %	20 %	387785124
38045	NC_017595	CCA	2	6	2205857	2205862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387785124
38046	NC_017595	CT	3	6	2205919	2205924	0 %	50 %	0 %	50 %	387785124
38047	NC_017595	TTC	2	6	2205980	2205985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387785124
38048	NC_017595	ACG	2	6	2206142	2206147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387785124
38049	NC_017595	ATA	2	6	2206152	2206157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387785124
38050	NC_017595	TAG	2	6	2206174	2206179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785124
38051	NC_017595	TTC	2	6	2206199	2206204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387785124
38052	NC_017595	A	6	6	2206247	2206252	100 %	0 %	0 %	0 %	387785124
38053	NC_017595	GTT	2	6	2206316	2206321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387785124
38054	NC_017595	TTG	2	6	2206387	2206392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387785124
38055	NC_017595	TCA	2	6	2206404	2206409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785124
38056	NC_017595	TTTTG	2	10	2206997	2207006	0 %	80 %	20 %	0 %	387785125
38057	NC_017595	AAT	2	6	2207022	2207027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387785125
38058	NC_017595	TA	3	6	2207055	2207060	50 %	50 %	0 %	0 %	387785125
38059	NC_017595	GAT	2	6	2207125	2207130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785125
38060	NC_017595	TAG	2	6	2207133	2207138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785125
38061	NC_017595	AAG	2	6	2207142	2207147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785125
38062	NC_017595	TCA	2	6	2207223	2207228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785125
38063	NC_017595	GAAG	2	8	2207230	2207237	50 %	0 %	50 %	0 %	387785125
38064	NC_017595	AG	3	6	2207279	2207284	50 %	0 %	50 %	0 %	387785125
38065	NC_017595	AAG	2	6	2207288	2207293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785125
38066	NC_017595	TAG	2	6	2207313	2207318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785125
38067	NC_017595	TAA	2	6	2207334	2207339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387785125
38068	NC_017595	CTT	2	6	2207416	2207421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387785125
38069	NC_017595	A	8	8	2207425	2207432	100 %	0 %	0 %	0 %	387785125
38070	NC_017595	A	6	6	2207434	2207439	100 %	0 %	0 %	0 %	387785125
38071	NC_017595	A	7	7	2207456	2207462	100 %	0 %	0 %	0 %	387785125
38072	NC_017595	CAA	2	6	2207502	2207507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387785125
38073	NC_017595	CGTC	2	8	2207555	2207562	0 %	25 %	25 %	50 %	387785125
38074	NC_017595	TA	3	6	2207599	2207604	50 %	50 %	0 %	0 %	387785125
38075	NC_017595	T	6	6	2207653	2207658	0 %	100 %	0 %	0 %	387785125
38076	NC_017595	CTG	2	6	2207707	2207712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387785126
38077	NC_017595	CTA	2	6	2207739	2207744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785126
38078	NC_017595	TGA	2	6	2207762	2207767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785126
38079	NC_017595	TCA	2	6	2207790	2207795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785126
38080	NC_017595	GA	3	6	2207823	2207828	50 %	0 %	50 %	0 %	387785126
38081	NC_017595	TAA	2	6	2207847	2207852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387785126
38082	NC_017595	ACCT	2	8	2207962	2207969	25 %	25 %	0 %	50 %	387785126
38083	NC_017595	TTTC	2	8	2208126	2208133	0 %	75 %	0 %	25 %	387785126
38084	NC_017595	A	6	6	2208374	2208379	100 %	0 %	0 %	0 %	387785127
38085	NC_017595	A	7	7	2208389	2208395	100 %	0 %	0 %	0 %	387785127
38086	NC_017595	TAG	2	6	2208396	2208401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785127
38087	NC_017595	GGT	2	6	2208434	2208439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387785127
38088	NC_017595	CTA	2	6	2208458	2208463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785127
38089	NC_017595	CAG	3	9	2208465	2208473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387785127
38090	NC_017595	AAT	2	6	2208530	2208535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387785127
38091	NC_017595	ACA	2	6	2208536	2208541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387785127
38092	NC_017595	GTT	2	6	2208578	2208583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387785127
38093	NC_017595	TCA	2	6	2208588	2208593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785127
38094	NC_017595	AAG	2	6	2208600	2208605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785127
38095	NC_017595	TGG	2	6	2208649	2208654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387785127
38096	NC_017595	GAT	2	6	2208656	2208661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785127
38097	NC_017595	A	6	6	2208740	2208745	100 %	0 %	0 %	0 %	387785127
38098	NC_017595	CAA	2	6	2208772	2208777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387785127
38099	NC_017595	A	6	6	2208797	2208802	100 %	0 %	0 %	0 %	387785127
38100	NC_017595	TTG	2	6	2208846	2208851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387785127
38101	NC_017595	TACT	2	8	2208859	2208866	25 %	50 %	0 %	25 %	387785127
38102	NC_017595	TTC	2	6	2208889	2208894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387785127
38103	NC_017595	CT	3	6	2208934	2208939	0 %	50 %	0 %	50 %	387785127
38104	NC_017595	CAA	2	6	2209071	2209076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387785127
38105	NC_017595	TGC	2	6	2209093	2209098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387785127
38106	NC_017595	GGT	2	6	2209118	2209123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387785127
38107	NC_017595	TCA	2	6	2209175	2209180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785127
38108	NC_017595	CAG	2	6	2209185	2209190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387785127
38109	NC_017595	TGT	2	6	2209240	2209245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387785127
38110	NC_017595	ATC	2	6	2209250	2209255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387785127
38111	NC_017595	GAT	2	6	2209361	2209366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785127
38112	NC_017595	ATG	2	6	2209434	2209439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785127
38113	NC_017595	AGA	2	6	2209551	2209556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785127
38114	NC_017595	GAA	2	6	2209562	2209567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785127
38115	NC_017595	AGA	2	6	2209588	2209593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785127
38116	NC_017595	AAC	2	6	2209679	2209684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387785128
38117	NC_017595	TGA	2	6	2209746	2209751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387785128
38118	NC_017595	ATT	2	6	2209825	2209830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387785128
38119	NC_017595	AG	3	6	2209926	2209931	50 %	0 %	50 %	0 %	387785128
38120	NC_017595	TAT	2	6	2209944	2209949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387785128
38121	NC_017595	GAA	2	6	2209984	2209989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785128
38122	NC_017595	TAAT	2	8	2210009	2210016	50 %	50 %	0 %	0 %	387785128
38123	NC_017595	AGCT	2	8	2210018	2210025	25 %	25 %	25 %	25 %	387785128
38124	NC_017595	CTC	2	6	2210092	2210097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387785128
38125	NC_017595	A	6	6	2210184	2210189	100 %	0 %	0 %	0 %	387785128
38126	NC_017595	CTAT	2	8	2210198	2210205	25 %	50 %	0 %	25 %	387785128
38127	NC_017595	A	6	6	2210246	2210251	100 %	0 %	0 %	0 %	387785128
38128	NC_017595	A	7	7	2210268	2210274	100 %	0 %	0 %	0 %	387785128
38129	NC_017595	A	7	7	2210283	2210289	100 %	0 %	0 %	0 %	387785128
38130	NC_017595	AAAGAA	2	12	2210308	2210319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387785128
38131	NC_017595	GAA	2	6	2210401	2210406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387785128
38132	NC_017595	CAA	2	6	2210424	2210429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387785128

< Previous12...65666768697071727374757677Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.