MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus salivarius 57.I chromosome

Total Repeats: 781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017594	CAGCTA	2	12	1355	1366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387760315
2	NC_017594	TTCTTT	2	12	2137	2148	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387760316
3	NC_017594	ACCTTG	2	12	9799	9810	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387760321
4	NC_017594	GCTGAA	2	12	13188	13199	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387760324
5	NC_017594	ATTTTG	2	12	20563	20574	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387760331
6	NC_017594	GTTTTG	2	12	20710	20721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387760331
7	NC_017594	GCTACA	2	12	21656	21667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387760332
8	NC_017594	CTTTGC	2	12	25539	25550	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387760336
9	NC_017594	TAAAGG	2	12	32175	32186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387760341
10	NC_017594	TTGAAC	2	12	32498	32509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387760341
11	NC_017594	TGCAGG	2	12	37309	37320	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387760348
12	NC_017594	GATAAG	2	12	38540	38551	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387760348
13	NC_017594	TTTACG	2	12	40689	40700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387760351
14	NC_017594	GCTTTT	2	12	43095	43106	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387760353
15	NC_017594	ACGTTT	2	12	54911	54922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387760366
16	NC_017594	AAAAGA	2	12	56971	56982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387760367
17	NC_017594	TGGTTT	2	12	57244	57255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387760367
18	NC_017594	AAACCG	2	12	64295	64306	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387760376
19	NC_017594	CTTTGA	2	12	69277	69288	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387760382
20	NC_017594	CAACTC	2	12	73418	73429	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387760386
21	NC_017594	GATTTT	2	12	78458	78469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387760391
22	NC_017594	ATATTG	2	12	78474	78485	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387760391
23	NC_017594	CGAACA	2	12	81675	81686	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387760393
24	NC_017594	AAAGGT	2	12	82752	82763	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387760395
25	NC_017594	CTGCAA	2	12	83599	83610	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387760396
26	NC_017594	AGCTGA	2	12	83971	83982	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387760397
27	NC_017594	GCAATC	2	12	85330	85341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387760400
28	NC_017594	GTATCA	2	12	88274	88285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387760407
29	NC_017594	AAAGGT	2	12	89826	89837	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387760410
30	NC_017594	AAATTA	2	12	90872	90883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387760413
31	NC_017594	ATTGAA	2	12	93833	93844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387760417
32	NC_017594	GTAAAG	2	12	94518	94529	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387760418
33	NC_017594	CTTGGA	2	12	95926	95937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387760420
34	NC_017594	AATCAT	2	12	96965	96976	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387760422
35	NC_017594	GTTAAC	2	12	99012	99023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387760423
36	NC_017594	AATATG	2	12	99610	99621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387760424
37	NC_017594	TTAGGT	2	12	99745	99756	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387760424
38	NC_017594	GAGCCA	2	12	101490	101501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387760427
39	NC_017594	CTCCAA	2	12	108772	108783	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387760431
40	NC_017594	TTGAAA	2	12	123308	123319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387760442
41	NC_017594	TGGAAT	2	12	127851	127862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387760445
42	NC_017594	GAAGTT	2	12	134924	134935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387760446
43	NC_017594	CTGATT	2	12	136863	136874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387760449
44	NC_017594	AGAAAT	2	12	139198	139209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387760454
45	NC_017594	GAAAAA	2	12	142672	142683	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387760459
46	NC_017594	GTAAAG	2	12	147094	147105	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387760466
47	NC_017594	CTCTTC	2	12	154761	154772	0 %	50 %	0 %	50 %	387760476
48	NC_017594	TCGCCT	2	12	157202	157213	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387760479
49	NC_017594	ATTTTT	2	12	157769	157780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387760480
50	NC_017594	GTTTTA	2	12	159501	159512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387760482
51	NC_017594	TTAAAG	2	12	160577	160588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387760483
52	NC_017594	TTGGTT	2	12	161082	161093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387760483
53	NC_017594	CTCTAT	2	12	162655	162666	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387760485
54	NC_017594	GATATT	2	12	177383	177394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387760499
55	NC_017594	TGTTTG	2	12	177630	177641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387760499
56	NC_017594	ATTTCT	2	12	178455	178466	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387760500
57	NC_017594	GTTCCA	2	12	180460	180471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387760501
58	NC_017594	GATTTT	2	12	184110	184121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387760504
59	NC_017594	ATTTTT	2	12	186241	186252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387760507
60	NC_017594	AAAAGC	2	12	188593	188604	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387760510
61	NC_017594	CTATTT	2	12	195221	195232	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387760511
62	NC_017594	CTACTT	2	12	195736	195747	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387760512
63	NC_017594	GAGATT	2	12	196619	196630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387760513
64	NC_017594	GCTTTT	2	12	198235	198246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387760514
65	NC_017594	CAAGAA	2	12	208764	208775	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387760528
66	NC_017594	ATCACA	2	12	208782	208793	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387760528
67	NC_017594	TTCGAA	2	12	210162	210173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387760528
68	NC_017594	GTGCTG	2	12	211476	211487	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387760529
69	NC_017594	GTTCCA	2	12	211580	211591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387760529
70	NC_017594	ATTATG	2	12	214696	214707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387760532
71	NC_017594	ACCAGA	2	12	215722	215733	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387760534
72	NC_017594	TCAAAT	2	12	217369	217380	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387760535
73	NC_017594	TACCAT	2	12	217929	217940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387760536
74	NC_017594	AAGAGC	2	12	218959	218970	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387760536
75	NC_017594	TTTTCA	2	12	221500	221511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387760540
76	NC_017594	CTAAGA	2	12	221627	221638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387760540
77	NC_017594	AGATGT	2	12	221733	221744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387760540
78	NC_017594	TTGGTC	2	12	224102	224113	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387760543
79	NC_017594	CTCTTG	2	12	225792	225803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387760544
80	NC_017594	AGCACC	2	12	226334	226345	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387760545
81	NC_017594	TACGGT	2	12	230122	230133	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387760548
82	NC_017594	AGTGGT	2	12	231059	231070	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387760549
83	NC_017594	CTTTCT	2	12	236678	236689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387760553
84	NC_017594	TTTTGC	2	12	237069	237080	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387760553
85	NC_017594	TATTGA	2	12	238084	238095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387760554
86	NC_017594	TTAAGG	2	12	239923	239934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387760555
87	NC_017594	AATTCA	2	12	246771	246782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387760562
88	NC_017594	TCCTCG	2	12	249374	249385	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387760566
89	NC_017594	TGTTCG	2	12	250822	250833	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387760567
90	NC_017594	GTCTAA	2	12	250876	250887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387760567
91	NC_017594	TGGATA	2	12	251283	251294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387760567
92	NC_017594	TTCCAT	2	12	251360	251371	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387760567
93	NC_017594	CTGGTG	2	12	251988	251999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387760567
94	NC_017594	TTCAGT	2	12	260721	260732	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387760577
95	NC_017594	GCCTTC	2	12	261645	261656	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387760578
96	NC_017594	GGAGCT	2	12	263643	263654	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387760579
97	NC_017594	ACTGGT	2	12	266787	266798	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387760582
98	NC_017594	ATAGTT	2	12	278131	278142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387760593
99	NC_017594	CAAGGC	2	12	278366	278377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387760594
100	NC_017594	GCCTTT	2	12	287876	287887	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387760603
101	NC_017594	TTTTAG	2	12	289793	289804	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387760606
102	NC_017594	AGGAGC	2	12	292569	292580	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387760608
103	NC_017594	AGGTCC	2	12	292995	293006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387760608
104	NC_017594	GCCAAG	2	12	298938	298949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387760611
105	NC_017594	ACTACC	2	12	301266	301277	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387760611
106	NC_017594	CCCAGG	2	12	302177	302188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387760612
107	NC_017594	AGAAAA	2	12	303976	303987	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387760614
108	NC_017594	TATAGT	2	12	307866	307877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387760617
109	NC_017594	CAACTT	2	12	309331	309342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387760620
110	NC_017594	TGAGCG	2	12	310778	310789	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387760622
111	NC_017594	TATCTT	2	12	311824	311835	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387760624
112	NC_017594	GAAATG	2	12	311970	311981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387760624
113	NC_017594	ATTTTA	2	12	315092	315103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387760626
114	NC_017594	AGCGTA	2	12	315917	315928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387760626
115	NC_017594	TGACCG	2	12	316212	316223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387760626
116	NC_017594	AAGGAA	2	12	318657	318668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387760628
117	NC_017594	TAGAGA	2	12	319238	319249	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387760629
118	NC_017594	ACAATG	2	12	320146	320157	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387760630
119	NC_017594	TGAGGA	2	12	322896	322907	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387760633
120	NC_017594	ATTTTG	2	12	323335	323346	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387760633
121	NC_017594	TCTCCT	2	12	324633	324644	0 %	50 %	0 %	50 %	387760634
122	NC_017594	CCATTG	2	12	325179	325190	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387760634
123	NC_017594	TTGGTT	2	12	335251	335262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387760645
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125	NC_017594	GACCTT	2	12	340210	340221	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387760651
126	NC_017594	CAGTAA	2	12	342520	342531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387760653
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132	NC_017594	TGGTAT	2	12	354708	354719	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387760665
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139	NC_017594	AGCTGC	2	12	371985	371996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387760682
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144	NC_017594	TCAGGC	2	12	405275	405286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387760719
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147	NC_017594	CCAGGT	2	12	412644	412655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387760727
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229	NC_017594	GTTCCA	2	12	622824	622835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387760918
230	NC_017594	AAAGTT	2	12	629907	629918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387760919
231	NC_017594	GTTCCA	2	12	631011	631022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387760919
232	NC_017594	CGAATT	2	12	631073	631084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387760919
233	NC_017594	GTTGAA	2	12	631104	631115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387760919
234	NC_017594	TGCAAC	2	12	632096	632107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387760919
235	NC_017594	GTTCCA	2	12	633966	633977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387760919
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251	NC_017594	CCAGTG	2	12	678789	678800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387760943
252	NC_017594	CGAGTG	2	12	679509	679520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387760943
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322	NC_017594	CCAGCT	2	12	835173	835184	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387761049
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333	NC_017594	CTCTGT	2	12	869911	869922	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387761083
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338	NC_017594	TGTTCT	2	12	898698	898709	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387761107
339	NC_017594	TGAAGA	2	12	903302	903313	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387761110
340	NC_017594	CTTTGA	2	12	904510	904521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387761111
341	NC_017594	TAACAA	2	12	910079	910090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387761118
342	NC_017594	ATCAGG	2	12	910236	910247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387761118
343	NC_017594	GTCACC	2	12	910937	910948	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387761119
344	NC_017594	CTTTTG	2	12	912942	912953	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387761121
345	NC_017594	CTGGTG	2	12	913883	913894	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387761122
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347	NC_017594	TCAACG	2	12	920088	920099	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387761128
348	NC_017594	AATCTT	2	12	921886	921897	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387761129
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350	NC_017594	GTTGAA	2	12	931080	931091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387761136
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352	NC_017594	GCTACA	2	12	941060	941071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387761145
353	NC_017594	CAAAAT	2	12	942566	942577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387761146
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355	NC_017594	GCTAAG	2	12	946083	946094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387761150
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358	NC_017594	ACTGGT	2	12	949282	949293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387761154
359	NC_017594	CTGATT	2	12	951484	951495	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387761156
360	NC_017594	TTCAGC	2	12	953827	953838	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387761158
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367	NC_017594	TAGCTG	2	12	974898	974909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387761179
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369	NC_017594	GGTATT	2	12	985456	985467	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387761190
370	NC_017594	GTCCTG	2	12	991748	991759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387761201
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437	NC_017594	ACGTTC	2	12	1210104	1210115	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387761400
438	NC_017594	TCTGGG	2	12	1211824	1211835	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387761402
439	NC_017594	GCTCTT	2	12	1212189	1212200	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387761402
440	NC_017594	TTAAGG	2	12	1212749	1212760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387761403
441	NC_017594	ATTATA	2	12	1218403	1218414	50 %	50 %	0 %	0 %	387761410
442	NC_017594	AAAATA	2	12	1220956	1220967	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387761412
443	NC_017594	GCCTCT	2	12	1231903	1231914	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387761422
444	NC_017594	CTTCTG	2	12	1232824	1232835	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387761424
445	NC_017594	GGTAAA	2	12	1236568	1236579	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387761428
446	NC_017594	ATCTTC	2	12	1238775	1238786	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387761431
447	NC_017594	TGTGAA	2	12	1238832	1238843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387761431
448	NC_017594	TCACCA	2	12	1238980	1238991	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387761431
449	NC_017594	TCTACA	2	12	1239061	1239072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387761431
450	NC_017594	AAGATA	2	12	1243245	1243256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387761435
451	NC_017594	AAGAGC	2	12	1243751	1243762	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387761436
452	NC_017594	TACTGC	2	12	1245006	1245017	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387761437
453	NC_017594	TTCAAC	2	12	1248256	1248267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387761441
454	NC_017594	CTGTTG	2	12	1249429	1249440	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387761442
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456	NC_017594	TCCCAT	2	12	1252177	1252188	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387761443
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460	NC_017594	TAGCAA	2	12	1258117	1258128	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387761447
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