MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 60726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017583	GGT	2	6	116306	116311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345849
3002	NC_017583	GTAC	2	8	116354	116361	25 %	25 %	25 %	25 %	386345849
3003	NC_017583	CAT	2	6	116369	116374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345849
3004	NC_017583	TTC	2	6	116382	116387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345849
3005	NC_017583	TGG	2	6	116407	116412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345849
3006	NC_017583	CAC	2	6	116459	116464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345849
3007	NC_017583	C	6	6	116481	116486	0 %	0 %	0 %	100 %	386345849
3008	NC_017583	TGG	2	6	116527	116532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345849
3009	NC_017583	CAT	2	6	116534	116539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345849
3010	NC_017583	CCGC	2	8	116542	116549	0 %	0 %	25 %	75 %	386345849
3011	NC_017583	TA	3	6	116568	116573	50 %	50 %	0 %	0 %	386345849
3012	NC_017583	GCGAT	2	10	116575	116584	20 %	20 %	40 %	20 %	386345849
3013	NC_017583	CTT	2	6	116591	116596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345849
3014	NC_017583	GAC	2	6	116619	116624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345849
3015	NC_017583	GCTG	2	8	116639	116646	0 %	25 %	50 %	25 %	386345849
3016	NC_017583	GAG	2	6	116694	116699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345849
3017	NC_017583	GGGT	2	8	116722	116729	0 %	25 %	75 %	0 %	386345849
3018	NC_017583	GAA	2	6	116771	116776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345849
3019	NC_017583	ATC	2	6	116845	116850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345849
3020	NC_017583	CTC	2	6	116910	116915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345849
3021	NC_017583	G	6	6	116944	116949	0 %	0 %	100 %	0 %	386345849
3022	NC_017583	CAC	2	6	116980	116985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345849
3023	NC_017583	CTA	2	6	117029	117034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345849
3024	NC_017583	CGA	2	6	117047	117052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345849
3025	NC_017583	CCT	2	6	117150	117155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345849
3026	NC_017583	GTGAA	2	10	117186	117195	40 %	20 %	40 %	0 %	386345849
3027	NC_017583	CGA	2	6	117250	117255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345850
3028	NC_017583	CCG	2	6	117289	117294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345850
3029	NC_017583	GTG	2	6	117321	117326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345850
3030	NC_017583	GTG	2	6	117354	117359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345850
3031	NC_017583	TCG	2	6	117367	117372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345850
3032	NC_017583	GA	3	6	117386	117391	50 %	0 %	50 %	0 %	386345850
3033	NC_017583	GAT	2	6	117405	117410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345850
3034	NC_017583	CAC	2	6	117425	117430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345850
3035	NC_017583	GCG	2	6	117442	117447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345850
3036	NC_017583	GA	3	6	117490	117495	50 %	0 %	50 %	0 %	386345850
3037	NC_017583	GAG	2	6	117497	117502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345850
3038	NC_017583	GGC	2	6	117509	117514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345850
3039	NC_017583	GTG	2	6	117516	117521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345850
3040	NC_017583	CCT	2	6	117523	117528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345850
3041	NC_017583	GGA	2	6	117572	117577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345850
3042	NC_017583	GGT	2	6	117671	117676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345850
3043	NC_017583	GAG	2	6	117708	117713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345850
3044	NC_017583	GTG	2	6	117741	117746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345850
3045	NC_017583	AGG	2	6	117778	117783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345850
3046	NC_017583	GGT	2	6	117806	117811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345850
3047	NC_017583	GAG	2	6	117816	117821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345850
3048	NC_017583	GTG	3	9	117828	117836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345850
3049	NC_017583	ACA	2	6	117857	117862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386345850
3050	NC_017583	G	6	6	117983	117988	0 %	0 %	100 %	0 %	386345850
3051	NC_017583	GGT	2	6	117994	117999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345850
3052	NC_017583	GGT	3	9	118010	118018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345850
3053	NC_017583	TAG	3	9	118036	118044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345850
3054	NC_017583	TGGA	2	8	118086	118093	25 %	25 %	50 %	0 %	386345850
3055	NC_017583	TCGT	2	8	118116	118123	0 %	50 %	25 %	25 %	386345850
3056	NC_017583	CTA	2	6	118145	118150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345850
3057	NC_017583	GTGG	2	8	118175	118182	0 %	25 %	75 %	0 %	386345850
3058	NC_017583	GCAC	2	8	118206	118213	25 %	0 %	25 %	50 %	386345850
3059	NC_017583	TCC	2	6	118243	118248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345850
3060	NC_017583	GGA	2	6	118278	118283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345850
3061	NC_017583	TATGG	2	10	118336	118345	20 %	40 %	40 %	0 %	386345851
3062	NC_017583	GAG	2	6	118427	118432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345851
3063	NC_017583	GAA	2	6	118555	118560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345851
3064	NC_017583	GGT	2	6	118684	118689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345851
3065	NC_017583	GATC	2	8	118705	118712	25 %	25 %	25 %	25 %	386345851
3066	NC_017583	GAGG	3	12	118742	118753	25 %	0 %	75 %	0 %	386345851
3067	NC_017583	G	6	6	118761	118766	0 %	0 %	100 %	0 %	386345851
3068	NC_017583	G	6	6	118771	118776	0 %	0 %	100 %	0 %	386345851
3069	NC_017583	G	6	6	118800	118805	0 %	0 %	100 %	0 %	386345851
3070	NC_017583	CT	3	6	118813	118818	0 %	50 %	0 %	50 %	386345851
3071	NC_017583	GC	3	6	118943	118948	0 %	0 %	50 %	50 %	386345851
3072	NC_017583	ATCA	2	8	118977	118984	50 %	25 %	0 %	25 %	386345851
3073	NC_017583	CCCTT	2	10	119022	119031	0 %	40 %	0 %	60 %	386345851
3074	NC_017583	GAG	2	6	119063	119068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345851
3075	NC_017583	GAG	2	6	119090	119095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345851
3076	NC_017583	GTG	3	9	119251	119259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345851
3077	NC_017583	TCG	2	6	119271	119276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345852
3078	NC_017583	CT	3	6	119291	119296	0 %	50 %	0 %	50 %	386345852
3079	NC_017583	GCC	2	6	119371	119376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345852
3080	NC_017583	CCT	2	6	119408	119413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345852
3081	NC_017583	GTGG	2	8	119418	119425	0 %	25 %	75 %	0 %	386345852
3082	NC_017583	GAG	2	6	119431	119436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345852
3083	NC_017583	TCC	2	6	119448	119453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345852
3084	NC_017583	CGG	2	6	119489	119494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345852
3085	NC_017583	CTC	2	6	119497	119502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345852
3086	NC_017583	AGG	2	6	119555	119560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345852
3087	NC_017583	TTC	2	6	119592	119597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345852
3088	NC_017583	TGG	2	6	119603	119608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345852
3089	NC_017583	TCG	2	6	119705	119710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345852
3090	NC_017583	CTC	2	6	119731	119736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345852
3091	NC_017583	GAG	2	6	119770	119775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345852
3092	NC_017583	GTG	2	6	119815	119820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345852
3093	NC_017583	ACC	2	6	119842	119847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345852
3094	NC_017583	GAG	2	6	119848	119853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345852
3095	NC_017583	TGG	2	6	119855	119860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345852
3096	NC_017583	TGC	2	6	119864	119869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345852
3097	NC_017583	GAG	2	6	119878	119883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345852
3098	NC_017583	GGT	2	6	119979	119984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345852
3099	NC_017583	CGG	2	6	119999	120004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345852
3100	NC_017583	G	7	7	120007	120013	0 %	0 %	100 %	0 %	386345852
3101	NC_017583	ACC	2	6	120121	120126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345852
3102	NC_017583	GGA	2	6	120137	120142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345852
3103	NC_017583	TCC	2	6	120176	120181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345852
3104	NC_017583	CGAT	2	8	120209	120216	25 %	25 %	25 %	25 %	386345852
3105	NC_017583	TGG	3	9	120284	120292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345852
3106	NC_017583	GAA	2	6	120318	120323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345852
3107	NC_017583	TGT	2	6	120329	120334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386345852
3108	NC_017583	GGA	2	6	120369	120374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345852
3109	NC_017583	CCGG	2	8	120393	120400	0 %	0 %	50 %	50 %	386345852
3110	NC_017583	TGGG	2	8	120450	120457	0 %	25 %	75 %	0 %	386345853
3111	NC_017583	TC	3	6	120463	120468	0 %	50 %	0 %	50 %	386345853
3112	NC_017583	TG	3	6	120486	120491	0 %	50 %	50 %	0 %	386345853
3113	NC_017583	CCG	2	6	120495	120500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345853
3114	NC_017583	ACG	2	6	120502	120507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345853
3115	NC_017583	TCC	2	6	120514	120519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345853
3116	NC_017583	TCC	2	6	120591	120596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345853
3117	NC_017583	G	6	6	120640	120645	0 %	0 %	100 %	0 %	386345853
3118	NC_017583	TGA	2	6	120652	120657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345853
3119	NC_017583	CCA	2	6	120754	120759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345853
3120	NC_017583	GAG	2	6	120762	120767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345853
3121	NC_017583	CTC	2	6	120783	120788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345853
3122	NC_017583	TAC	2	6	120789	120794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345853
3123	NC_017583	GGA	3	9	120798	120806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345853
3124	NC_017583	TGG	2	6	120807	120812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345853
3125	NC_017583	GA	3	6	120823	120828	50 %	0 %	50 %	0 %	386345853
3126	NC_017583	CT	3	6	120867	120872	0 %	50 %	0 %	50 %	386345853
3127	NC_017583	TCT	2	6	120877	120882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345853
3128	NC_017583	CTC	2	6	120957	120962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345853
3129	NC_017583	CTA	2	6	120983	120988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345853
3130	NC_017583	GTTCG	2	10	121055	121064	0 %	40 %	40 %	20 %	386345853
3131	NC_017583	AT	3	6	121069	121074	50 %	50 %	0 %	0 %	386345853
3132	NC_017583	CT	3	6	121157	121162	0 %	50 %	0 %	50 %	386345853
3133	NC_017583	TG	3	6	121166	121171	0 %	50 %	50 %	0 %	386345853
3134	NC_017583	GAA	2	6	121179	121184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345853
3135	NC_017583	GAT	2	6	121200	121205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345853
3136	NC_017583	CCT	2	6	121250	121255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345853
3137	NC_017583	TTC	3	9	121377	121385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345853
3138	NC_017583	CTT	2	6	121427	121432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345853
3139	NC_017583	TCA	2	6	121465	121470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345854
3140	NC_017583	GAT	2	6	121495	121500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345854
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3142	NC_017583	TCC	2	6	121520	121525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345854
3143	NC_017583	CTC	2	6	121540	121545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345854
3144	NC_017583	CCA	2	6	121593	121598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345854
3145	NC_017583	GATC	2	8	121599	121606	25 %	25 %	25 %	25 %	386345854
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3147	NC_017583	GAG	2	6	121672	121677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345854
3148	NC_017583	CTG	2	6	121817	121822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345854
3149	NC_017583	TTC	2	6	121876	121881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345854
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3152	NC_017583	TCC	3	9	122015	122023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345854
3153	NC_017583	TTC	2	6	122062	122067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345854
3154	NC_017583	GGCG	2	8	122073	122080	0 %	0 %	75 %	25 %	386345854
3155	NC_017583	CT	4	8	122146	122153	0 %	50 %	0 %	50 %	386345854
3156	NC_017583	CCTG	2	8	122178	122185	0 %	25 %	25 %	50 %	386345854
3157	NC_017583	TGC	2	6	122199	122204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345854
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3159	NC_017583	GA	3	6	122246	122251	50 %	0 %	50 %	0 %	386345854
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3162	NC_017583	GAG	2	6	122395	122400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345854
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3164	NC_017583	CCT	2	6	122475	122480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345854
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3192	NC_017583	AGCG	2	8	123222	123229	25 %	0 %	50 %	25 %	386345854
3193	NC_017583	CTG	2	6	123247	123252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345854
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3212	NC_017583	TCC	3	9	123976	123984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345855
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3222	NC_017583	CTC	2	6	124221	124226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345855
3223	NC_017583	GGA	2	6	124248	124253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345855
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3225	NC_017583	GGT	2	6	124338	124343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345855
3226	NC_017583	TCG	2	6	124348	124353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345855
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3229	NC_017583	TCT	2	6	124493	124498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345855
3230	NC_017583	CGA	2	6	124523	124528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345855
3231	NC_017583	GGC	2	6	124560	124565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345855
3232	NC_017583	CGG	2	6	124571	124576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345855
3233	NC_017583	GTC	2	6	124611	124616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345855
3234	NC_017583	TTG	2	6	124624	124629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386345855
3235	NC_017583	GAG	2	6	124734	124739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345855
3236	NC_017583	GAT	2	6	124773	124778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345855
3237	NC_017583	TCC	2	6	124789	124794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345855
3238	NC_017583	GCTC	2	8	124829	124836	0 %	25 %	25 %	50 %	386345855
3239	NC_017583	CTGG	2	8	124854	124861	0 %	25 %	50 %	25 %	386345855
3240	NC_017583	AGG	2	6	124862	124867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345855
3241	NC_017583	GGC	2	6	124878	124883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345855
3242	NC_017583	GGA	2	6	124899	124904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345855
3243	NC_017583	GAG	2	6	124908	124913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345855
3244	NC_017583	TGC	2	6	124916	124921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345855
3245	NC_017583	GATGAG	2	12	125004	125015	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386345855
3246	NC_017583	CGT	2	6	125045	125050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345855
3247	NC_017583	GCCT	2	8	125169	125176	0 %	25 %	25 %	50 %	386345855
3248	NC_017583	AC	3	6	125181	125186	50 %	0 %	0 %	50 %	386345855
3249	NC_017583	CTT	2	6	125208	125213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345855
3250	NC_017583	GA	3	6	125236	125241	50 %	0 %	50 %	0 %	386345855
3251	NC_017583	TTC	2	6	125313	125318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345855
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3253	NC_017583	CTT	2	6	125366	125371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345855
3254	NC_017583	GAGGGA	2	12	125373	125384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345855
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3351	NC_017583	GGA	2	6	129720	129725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345858
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3353	NC_017583	TC	3	6	129757	129762	0 %	50 %	0 %	50 %	386345858
3354	NC_017583	GTGG	2	8	129763	129770	0 %	25 %	75 %	0 %	386345858
3355	NC_017583	GTTCCT	2	12	129772	129783	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386345858
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3362	NC_017583	GCTCTC	2	12	130048	130059	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386345858
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3365	NC_017583	GGT	2	6	130159	130164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345858
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3367	NC_017583	GAAC	2	8	130240	130247	50 %	0 %	25 %	25 %	386345858
3368	NC_017583	CCT	3	9	130255	130263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345858
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3400	NC_017583	CTC	2	6	131475	131480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345859
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3489	NC_017583	GGC	2	6	134192	134197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345861
3490	NC_017583	TCC	3	9	134250	134258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345861
3491	NC_017583	GAG	2	6	134267	134272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345861
3492	NC_017583	GAA	2	6	134285	134290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345861
3493	NC_017583	GTG	2	6	134291	134296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345861
3494	NC_017583	ACGA	2	8	134373	134380	50 %	0 %	25 %	25 %	386345862
3495	NC_017583	CTC	2	6	134449	134454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345862
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3497	NC_017583	TCC	2	6	134492	134497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345862
3498	NC_017583	CTC	3	9	134500	134508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345862
3499	NC_017583	GTG	2	6	134509	134514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345862
3500	NC_017583	TCC	2	6	134522	134527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345862

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