MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017582	ATC	2	6	242963	242968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563181
4002	NC_017582	T	6	6	242976	242981	0 %	100 %	0 %	0 %	414563181
4003	NC_017582	AAG	2	6	243006	243011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563181
4004	NC_017582	AGCT	2	8	243020	243027	25 %	25 %	25 %	25 %	414563181
4005	NC_017582	ACG	2	6	243073	243078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563181
4006	NC_017582	GAG	2	6	243175	243180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563181
4007	NC_017582	GAT	2	6	243201	243206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563181
4008	NC_017582	AGA	2	6	243222	243227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563181
4009	NC_017582	TTTG	2	8	243234	243241	0 %	75 %	25 %	0 %	414563181
4010	NC_017582	TGCAAC	2	12	243291	243302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414563181
4011	NC_017582	TGT	2	6	243432	243437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563181
4012	NC_017582	TC	3	6	243494	243499	0 %	50 %	0 %	50 %	414563181
4013	NC_017582	TTTG	2	8	243775	243782	0 %	75 %	25 %	0 %	414563182
4014	NC_017582	T	6	6	243842	243847	0 %	100 %	0 %	0 %	414563182
4015	NC_017582	TGAT	2	8	243863	243870	25 %	50 %	25 %	0 %	414563182
4016	NC_017582	A	7	7	244038	244044	100 %	0 %	0 %	0 %	414563183
4017	NC_017582	GA	3	6	244060	244065	50 %	0 %	50 %	0 %	414563183
4018	NC_017582	GTT	2	6	244272	244277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563183
4019	NC_017582	CAAA	2	8	244319	244326	75 %	0 %	0 %	25 %	414563183
4020	NC_017582	CAT	2	6	244332	244337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563183
4021	NC_017582	A	7	7	244381	244387	100 %	0 %	0 %	0 %	414563183
4022	NC_017582	CAG	2	6	244397	244402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563184
4023	NC_017582	TAG	2	6	244427	244432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563184
4024	NC_017582	ATC	2	6	244461	244466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563184
4025	NC_017582	AGC	2	6	244468	244473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563184
4026	NC_017582	T	7	7	244491	244497	0 %	100 %	0 %	0 %	414563184
4027	NC_017582	TGGGAT	2	12	244536	244547	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414563184
4028	NC_017582	A	6	6	244657	244662	100 %	0 %	0 %	0 %	414563184
4029	NC_017582	CGC	2	6	244665	244670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563184
4030	NC_017582	AGCT	2	8	244694	244701	25 %	25 %	25 %	25 %	414563184
4031	NC_017582	GAA	2	6	244702	244707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563184
4032	NC_017582	CTT	2	6	244818	244823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563184
4033	NC_017582	ATC	2	6	244865	244870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563184
4034	NC_017582	TCT	2	6	244991	244996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563184
4035	NC_017582	GTG	2	6	245018	245023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563184
4036	NC_017582	GTT	2	6	245059	245064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563184
4037	NC_017582	TTG	2	6	245071	245076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563184
4038	NC_017582	TAA	2	6	245079	245084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563184
4039	NC_017582	GAA	2	6	245125	245130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563184
4040	NC_017582	AG	3	6	245165	245170	50 %	0 %	50 %	0 %	414563184
4041	NC_017582	GAAAA	2	10	245175	245184	80 %	0 %	20 %	0 %	414563184
4042	NC_017582	GAA	2	6	245226	245231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563185
4043	NC_017582	CA	3	6	245278	245283	50 %	0 %	0 %	50 %	414563185
4044	NC_017582	A	6	6	245304	245309	100 %	0 %	0 %	0 %	414563185
4045	NC_017582	A	6	6	245365	245370	100 %	0 %	0 %	0 %	414563185
4046	NC_017582	A	6	6	245388	245393	100 %	0 %	0 %	0 %	414563185
4047	NC_017582	GTG	2	6	245401	245406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563185
4048	NC_017582	GTT	2	6	245439	245444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563185
4049	NC_017582	TGA	2	6	245450	245455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563185
4050	NC_017582	GAG	2	6	245466	245471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563185
4051	NC_017582	GCT	2	6	245502	245507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563185
4052	NC_017582	TCA	2	6	245519	245524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563185
4053	NC_017582	TCAG	2	8	245549	245556	25 %	25 %	25 %	25 %	414563185
4054	NC_017582	GCT	2	6	245592	245597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563185
4055	NC_017582	AGG	2	6	245659	245664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563185
4056	NC_017582	CAA	2	6	245726	245731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563185
4057	NC_017582	TCG	2	6	245732	245737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563185
4058	NC_017582	AGCG	2	8	245988	245995	25 %	0 %	50 %	25 %	414563185
4059	NC_017582	GCC	2	6	246782	246787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563186
4060	NC_017582	CAA	2	6	246788	246793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563186
4061	NC_017582	TGAG	2	8	246916	246923	25 %	25 %	50 %	0 %	414563187
4062	NC_017582	CT	3	6	246934	246939	0 %	50 %	0 %	50 %	414563187
4063	NC_017582	TGA	2	6	246958	246963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563187
4064	NC_017582	CAGC	2	8	246973	246980	25 %	0 %	25 %	50 %	414563187
4065	NC_017582	TAC	2	6	247111	247116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563187
4066	NC_017582	ACT	2	6	247150	247155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563187
4067	NC_017582	GTCA	2	8	247161	247168	25 %	25 %	25 %	25 %	414563187
4068	NC_017582	GTG	2	6	247179	247184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563187
4069	NC_017582	CAT	2	6	247229	247234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563187
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4071	NC_017582	CAG	2	6	247319	247324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563187
4072	NC_017582	AGC	2	6	247583	247588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563187
4073	NC_017582	GTT	2	6	247599	247604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563187
4074	NC_017582	TGT	2	6	247613	247618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563187
4075	NC_017582	ACC	2	6	247759	247764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563187
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4080	NC_017582	TAG	2	6	247948	247953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563187
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4082	NC_017582	GCC	2	6	247974	247979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563187
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4084	NC_017582	GCC	2	6	248047	248052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563187
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4086	NC_017582	CAG	2	6	248078	248083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563187
4087	NC_017582	AAGA	2	8	248090	248097	75 %	0 %	25 %	0 %	414563187
4088	NC_017582	AGAA	2	8	248156	248163	75 %	0 %	25 %	0 %	414563187
4089	NC_017582	GATA	2	8	248361	248368	50 %	25 %	25 %	0 %	414563187
4090	NC_017582	GGA	2	6	248379	248384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563187
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4092	NC_017582	ATTT	2	8	248546	248553	25 %	75 %	0 %	0 %	414563187
4093	NC_017582	TGA	2	6	248563	248568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563187
4094	NC_017582	TGAT	2	8	248617	248624	25 %	50 %	25 %	0 %	414563187
4095	NC_017582	TGG	2	6	248639	248644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563187
4096	NC_017582	TTAA	2	8	248697	248704	50 %	50 %	0 %	0 %	414563187
4097	NC_017582	ATC	2	6	248731	248736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563188
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4099	NC_017582	AG	3	6	248807	248812	50 %	0 %	50 %	0 %	414563188
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4101	NC_017582	ATG	2	6	248842	248847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563188
4102	NC_017582	TGC	2	6	248927	248932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563188
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4104	NC_017582	AGA	2	6	248957	248962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563188
4105	NC_017582	TGA	2	6	248968	248973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563188
4106	NC_017582	TAAA	2	8	248974	248981	75 %	25 %	0 %	0 %	414563188
4107	NC_017582	CA	3	6	249058	249063	50 %	0 %	0 %	50 %	414563189
4108	NC_017582	AGC	2	6	249187	249192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563189
4109	NC_017582	AGT	2	6	249194	249199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563189
4110	NC_017582	ATTT	2	8	249217	249224	25 %	75 %	0 %	0 %	414563189
4111	NC_017582	ATT	2	6	249227	249232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563189
4112	NC_017582	GCC	2	6	249290	249295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563189
4113	NC_017582	AGG	2	6	249301	249306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563189
4114	NC_017582	AGA	2	6	249307	249312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563189
4115	NC_017582	GA	3	6	249311	249316	50 %	0 %	50 %	0 %	414563189
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4118	NC_017582	CAG	2	6	249721	249726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563190
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4122	NC_017582	TGG	2	6	249914	249919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563190
4123	NC_017582	CGG	2	6	250010	250015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563190
4124	NC_017582	GGC	2	6	250059	250064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563190
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4365	NC_017582	TGT	2	6	262158	262163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563205
4366	NC_017582	CGG	2	6	262186	262191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563205
4367	NC_017582	AG	3	6	262199	262204	50 %	0 %	50 %	0 %	414563205
4368	NC_017582	ATT	2	6	262323	262328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563205
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4370	NC_017582	ATT	2	6	262395	262400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563205
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4441	NC_017582	T	6	6	266329	266334	0 %	100 %	0 %	0 %	414563209
4442	NC_017582	AGAGGA	2	12	266683	266694	50 %	0 %	50 %	0 %	414563210
4443	NC_017582	CCTTA	2	10	266770	266779	20 %	40 %	0 %	40 %	414563210
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4450	NC_017582	TGGA	2	8	266927	266934	25 %	25 %	50 %	0 %	414563210
4451	NC_017582	AGG	2	6	266943	266948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563210
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4457	NC_017582	TGT	2	6	267304	267309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563210
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4464	NC_017582	TGA	2	6	267755	267760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563211
4465	NC_017582	CAGA	2	8	267783	267790	50 %	0 %	25 %	25 %	414563211
4466	NC_017582	AG	3	6	267837	267842	50 %	0 %	50 %	0 %	414563211
4467	NC_017582	AGC	2	6	267883	267888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563211
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4470	NC_017582	CT	3	6	268182	268187	0 %	50 %	0 %	50 %	414563212
4471	NC_017582	T	7	7	268239	268245	0 %	100 %	0 %	0 %	414563212
4472	NC_017582	A	6	6	268372	268377	100 %	0 %	0 %	0 %	414563213
4473	NC_017582	T	6	6	268392	268397	0 %	100 %	0 %	0 %	414563213
4474	NC_017582	AGA	2	6	268418	268423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563213
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4476	NC_017582	AGTC	2	8	268448	268455	25 %	25 %	25 %	25 %	414563213
4477	NC_017582	TGA	2	6	268539	268544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563213
4478	NC_017582	GGT	2	6	268596	268601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563213
4479	NC_017582	GGT	2	6	268674	268679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563213
4480	NC_017582	GTC	2	6	268756	268761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563213
4481	NC_017582	ATG	2	6	268762	268767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563213
4482	NC_017582	TAT	2	6	268843	268848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563213
4483	NC_017582	TGT	2	6	268869	268874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563213
4484	NC_017582	TCG	2	6	268932	268937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563213
4485	NC_017582	TTGA	2	8	268948	268955	25 %	50 %	25 %	0 %	414563213
4486	NC_017582	T	6	6	268975	268980	0 %	100 %	0 %	0 %	414563213
4487	NC_017582	AAGGC	2	10	269065	269074	40 %	0 %	40 %	20 %	414563213
4488	NC_017582	CTAGCT	2	12	269086	269097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414563213
4489	NC_017582	GAG	2	6	269117	269122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563213
4490	NC_017582	CTGG	2	8	269369	269376	0 %	25 %	50 %	25 %	414563214
4491	NC_017582	TAG	2	6	269469	269474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563214
4492	NC_017582	CTG	2	6	269481	269486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563214
4493	NC_017582	A	6	6	269527	269532	100 %	0 %	0 %	0 %	414563214
4494	NC_017582	TCC	2	6	269545	269550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563214
4495	NC_017582	AGC	2	6	269569	269574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563214
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4497	NC_017582	AGC	2	6	269694	269699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563214
4498	NC_017582	AG	3	6	269701	269706	50 %	0 %	50 %	0 %	414563214
4499	NC_017582	ATT	2	6	269779	269784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563214
4500	NC_017582	ACA	2	6	269795	269800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563214

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