MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017582	GAAG	2	8	211388	211395	50 %	0 %	50 %	0 %	414563149
3502	NC_017582	AAT	2	6	211612	211617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563150
3503	NC_017582	ATT	2	6	211635	211640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563150
3504	NC_017582	GGCT	2	8	211754	211761	0 %	25 %	50 %	25 %	414563150
3505	NC_017582	AGA	2	6	211786	211791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563150
3506	NC_017582	AGC	2	6	211810	211815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563150
3507	NC_017582	TTG	2	6	211845	211850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563150
3508	NC_017582	ATTGGT	2	12	211853	211864	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414563150
3509	NC_017582	CAC	2	6	211947	211952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563150
3510	NC_017582	TCA	2	6	211979	211984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563150
3511	NC_017582	ACA	3	9	212057	212065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563150
3512	NC_017582	AAG	2	6	212121	212126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563150
3513	NC_017582	CAA	2	6	212131	212136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563150
3514	NC_017582	TGT	2	6	212212	212217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563150
3515	NC_017582	TGG	2	6	212230	212235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563150
3516	NC_017582	GCA	2	6	212276	212281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563150
3517	NC_017582	TCA	2	6	212339	212344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563150
3518	NC_017582	CAT	2	6	212442	212447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563150
3519	NC_017582	TGG	2	6	212465	212470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563150
3520	NC_017582	CTGG	2	8	212477	212484	0 %	25 %	50 %	25 %	414563150
3521	NC_017582	AAGGA	2	10	212493	212502	60 %	0 %	40 %	0 %	414563150
3522	NC_017582	AAG	2	6	212571	212576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563150
3523	NC_017582	CTAC	2	8	212671	212678	25 %	25 %	0 %	50 %	414563150
3524	NC_017582	CAA	2	6	212701	212706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563150
3525	NC_017582	A	6	6	212705	212710	100 %	0 %	0 %	0 %	414563150
3526	NC_017582	CTT	2	6	212726	212731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563150
3527	NC_017582	TGG	2	6	212743	212748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563150
3528	NC_017582	CTT	2	6	212812	212817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563150
3529	NC_017582	CTT	2	6	212909	212914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563150
3530	NC_017582	AGC	2	6	212941	212946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563150
3531	NC_017582	ACGC	2	8	212952	212959	25 %	0 %	25 %	50 %	414563150
3532	NC_017582	TCA	2	6	213527	213532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563151
3533	NC_017582	TTG	2	6	213549	213554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563151
3534	NC_017582	TTG	2	6	213597	213602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563151
3535	NC_017582	ACGTC	2	10	213650	213659	20 %	20 %	20 %	40 %	414563151
3536	NC_017582	GGT	2	6	213685	213690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563151
3537	NC_017582	AAT	2	6	213722	213727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563151
3538	NC_017582	GA	3	6	213806	213811	50 %	0 %	50 %	0 %	414563151
3539	NC_017582	A	6	6	213878	213883	100 %	0 %	0 %	0 %	414563151
3540	NC_017582	ATT	2	6	213893	213898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563151
3541	NC_017582	ACA	2	6	214148	214153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563151
3542	NC_017582	TTG	2	6	214194	214199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563151
3543	NC_017582	TTA	2	6	214201	214206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563151
3544	NC_017582	TA	3	6	214205	214210	50 %	50 %	0 %	0 %	414563151
3545	NC_017582	ACA	2	6	214241	214246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563151
3546	NC_017582	GGT	2	6	214256	214261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563151
3547	NC_017582	GAG	2	6	214365	214370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563152
3548	NC_017582	AGC	2	6	214420	214425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563152
3549	NC_017582	CAA	2	6	214461	214466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563152
3550	NC_017582	TCT	2	6	214577	214582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563152
3551	NC_017582	CTG	2	6	214590	214595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
3552	NC_017582	CTC	2	6	214601	214606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563152
3553	NC_017582	TGA	2	6	214619	214624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
3554	NC_017582	TGA	2	6	214631	214636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
3555	NC_017582	GCA	2	6	214651	214656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563152
3556	NC_017582	GCT	2	6	214769	214774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
3557	NC_017582	TG	3	6	214816	214821	0 %	50 %	50 %	0 %	414563152
3558	NC_017582	T	6	6	214833	214838	0 %	100 %	0 %	0 %	414563152
3559	NC_017582	GGA	2	6	214994	214999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563152
3560	NC_017582	TTA	2	6	215059	215064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563152
3561	NC_017582	TTG	2	6	215206	215211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563152
3562	NC_017582	ATG	3	9	215409	215417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
3563	NC_017582	A	7	7	215451	215457	100 %	0 %	0 %	0 %	414563152
3564	NC_017582	GTC	2	6	215503	215508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
3565	NC_017582	TTG	2	6	215535	215540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563152
3566	NC_017582	GAG	2	6	215556	215561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563152
3567	NC_017582	TGA	2	6	215573	215578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
3568	NC_017582	CAC	2	6	215603	215608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563152
3569	NC_017582	TGT	2	6	215642	215647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563152
3570	NC_017582	TGA	2	6	215666	215671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
3571	NC_017582	AATG	2	8	215685	215692	50 %	25 %	25 %	0 %	414563152
3572	NC_017582	CAT	2	6	215703	215708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563152
3573	NC_017582	CTGA	2	8	215784	215791	25 %	25 %	25 %	25 %	414563152
3574	NC_017582	GCT	2	6	215801	215806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
3575	NC_017582	AGC	2	6	215815	215820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563152
3576	NC_017582	CTG	3	9	215937	215945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
3577	NC_017582	TGG	2	6	215983	215988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563152
3578	NC_017582	ATG	2	6	216058	216063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
3579	NC_017582	GAT	2	6	216084	216089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
3580	NC_017582	T	6	6	216160	216165	0 %	100 %	0 %	0 %	414563152
3581	NC_017582	GCT	2	6	216203	216208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563153
3582	NC_017582	ATT	2	6	216220	216225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563153
3583	NC_017582	GAC	2	6	216276	216281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563153
3584	NC_017582	TCAG	2	8	216352	216359	25 %	25 %	25 %	25 %	414563153
3585	NC_017582	ATT	2	6	216447	216452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563153
3586	NC_017582	TGC	2	6	216492	216497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563153
3587	NC_017582	AG	3	6	216518	216523	50 %	0 %	50 %	0 %	414563153
3588	NC_017582	TCT	2	6	216525	216530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563153
3589	NC_017582	AGC	2	6	216603	216608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563153
3590	NC_017582	GATT	2	8	216643	216650	25 %	50 %	25 %	0 %	414563154
3591	NC_017582	AGC	2	6	216692	216697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563154
3592	NC_017582	TAT	2	6	216698	216703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563154
3593	NC_017582	GCAG	2	8	216707	216714	25 %	0 %	50 %	25 %	414563154
3594	NC_017582	CTTG	2	8	216729	216736	0 %	50 %	25 %	25 %	414563154
3595	NC_017582	CAT	2	6	216743	216748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563154
3596	NC_017582	GAG	2	6	216751	216756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563154
3597	NC_017582	TTTA	2	8	216757	216764	25 %	75 %	0 %	0 %	414563155
3598	NC_017582	TGG	2	6	216814	216819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563155
3599	NC_017582	GGT	2	6	216856	216861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563155
3600	NC_017582	TGC	2	6	216867	216872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563155
3601	NC_017582	AATG	2	8	216880	216887	50 %	25 %	25 %	0 %	414563155
3602	NC_017582	TCAA	2	8	216918	216925	50 %	25 %	0 %	25 %	414563155
3603	NC_017582	CAAGC	2	10	217045	217054	40 %	0 %	20 %	40 %	414563155
3604	NC_017582	CA	3	6	217104	217109	50 %	0 %	0 %	50 %	414563155
3605	NC_017582	TTGT	2	8	217124	217131	0 %	75 %	25 %	0 %	414563155
3606	NC_017582	TTGG	2	8	217202	217209	0 %	50 %	50 %	0 %	414563155
3607	NC_017582	TGG	2	6	217228	217233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563155
3608	NC_017582	AGC	2	6	217269	217274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563155
3609	NC_017582	TAAG	2	8	217287	217294	50 %	25 %	25 %	0 %	414563155
3610	NC_017582	AGA	2	6	217308	217313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563155
3611	NC_017582	ATG	2	6	217322	217327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563156
3612	NC_017582	GTT	2	6	217346	217351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563156
3613	NC_017582	TGG	2	6	217369	217374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563156
3614	NC_017582	A	6	6	217435	217440	100 %	0 %	0 %	0 %	414563156
3615	NC_017582	TGA	3	9	217513	217521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563156
3616	NC_017582	GGC	2	6	217547	217552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563156
3617	NC_017582	A	6	6	217577	217582	100 %	0 %	0 %	0 %	414563156
3618	NC_017582	CTG	2	6	217662	217667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563156
3619	NC_017582	TCA	2	6	217727	217732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563156
3620	NC_017582	AGC	2	6	217745	217750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563156
3621	NC_017582	AGC	2	6	217776	217781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563156
3622	NC_017582	GC	3	6	217780	217785	0 %	0 %	50 %	50 %	414563156
3623	NC_017582	AGC	2	6	217790	217795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563156
3624	NC_017582	AGGTA	2	10	217822	217831	40 %	20 %	40 %	0 %	414563156
3625	NC_017582	GCG	2	6	217850	217855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563156
3626	NC_017582	TC	3	6	217908	217913	0 %	50 %	0 %	50 %	414563156
3627	NC_017582	TGGC	2	8	217952	217959	0 %	25 %	50 %	25 %	414563156
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3635	NC_017582	CAG	2	6	218556	218561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563157
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3639	NC_017582	GCTTA	2	10	218711	218720	20 %	40 %	20 %	20 %	414563157
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3643	NC_017582	ATC	2	6	218929	218934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563158
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3649	NC_017582	GCT	2	6	220092	220097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563159
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3651	NC_017582	AT	3	6	221073	221078	50 %	50 %	0 %	0 %	414563160
3652	NC_017582	ATA	2	6	221101	221106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563160
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3730	NC_017582	TAGA	2	8	225981	225988	50 %	25 %	25 %	0 %	414563166
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3734	NC_017582	TGA	2	6	226267	226272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563166
3735	NC_017582	CAG	2	6	226273	226278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563166
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3737	NC_017582	AGT	2	6	226396	226401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563166
3738	NC_017582	AGC	2	6	226430	226435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563166
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3740	NC_017582	GA	3	6	226566	226571	50 %	0 %	50 %	0 %	414563166
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3742	NC_017582	CAA	2	6	226681	226686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563166
3743	NC_017582	AGCATC	2	12	226694	226705	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414563166
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3856	NC_017582	ACT	2	6	233781	233786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563172
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3860	NC_017582	A	6	6	234186	234191	100 %	0 %	0 %	0 %	414563173
3861	NC_017582	CAGA	2	8	234242	234249	50 %	0 %	25 %	25 %	414563173
3862	NC_017582	ATGA	2	8	234251	234258	50 %	25 %	25 %	0 %	414563173
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3986	NC_017582	TCA	2	6	241815	241820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563180
3987	NC_017582	AAT	2	6	241825	241830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563180
3988	NC_017582	TGA	2	6	241844	241849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563180
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3990	NC_017582	CTA	2	6	241983	241988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563180
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