MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017582	GCA	2	6	297252	297257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563240
5002	NC_017582	AGC	2	6	297277	297282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563240
5003	NC_017582	TGC	2	6	297340	297345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563240
5004	NC_017582	TGA	2	6	297349	297354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563240
5005	NC_017582	GAT	2	6	297381	297386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563241
5006	NC_017582	AGC	3	9	297402	297410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563241
5007	NC_017582	GCA	2	6	297480	297485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563241
5008	NC_017582	ATT	2	6	297497	297502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563241
5009	NC_017582	ATC	2	6	297512	297517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563241
5010	NC_017582	T	6	6	297534	297539	0 %	100 %	0 %	0 %	414563241
5011	NC_017582	CAGGGG	2	12	297601	297612	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	414563241
5012	NC_017582	GCA	2	6	297693	297698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563241
5013	NC_017582	GGT	2	6	297723	297728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563241
5014	NC_017582	ATT	2	6	297743	297748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563241
5015	NC_017582	AGC	2	6	297765	297770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563241
5016	NC_017582	GGAA	2	8	297786	297793	50 %	0 %	50 %	0 %	414563241
5017	NC_017582	AGAT	2	8	297802	297809	50 %	25 %	25 %	0 %	414563241
5018	NC_017582	TGA	2	6	297835	297840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563242
5019	NC_017582	A	6	6	297859	297864	100 %	0 %	0 %	0 %	414563242
5020	NC_017582	ATT	2	6	297887	297892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563242
5021	NC_017582	TGG	2	6	297922	297927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
5022	NC_017582	GGT	2	6	297928	297933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
5023	NC_017582	GTC	2	6	297948	297953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563242
5024	NC_017582	TGA	2	6	297982	297987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563242
5025	NC_017582	AGG	2	6	297996	298001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563242
5026	NC_017582	TGACT	2	10	298018	298027	20 %	40 %	20 %	20 %	414563242
5027	NC_017582	GCGGTT	2	12	298028	298039	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414563242
5028	NC_017582	TGG	2	6	298056	298061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
5029	NC_017582	AGC	3	9	298081	298089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563242
5030	NC_017582	GGC	2	6	298156	298161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563242
5031	NC_017582	CT	3	6	298197	298202	0 %	50 %	0 %	50 %	414563242
5032	NC_017582	TGG	2	6	298210	298215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
5033	NC_017582	TTG	2	6	298260	298265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563242
5034	NC_017582	TGA	2	6	298276	298281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563242
5035	NC_017582	CTG	2	6	298335	298340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563242
5036	NC_017582	GATC	2	8	298348	298355	25 %	25 %	25 %	25 %	414563242
5037	NC_017582	GCA	2	6	298474	298479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563242
5038	NC_017582	GAG	2	6	298487	298492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563242
5039	NC_017582	AT	3	6	298539	298544	50 %	50 %	0 %	0 %	414563242
5040	NC_017582	GTC	2	6	298595	298600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563242
5041	NC_017582	TGG	2	6	298603	298608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
5042	NC_017582	AGC	2	6	298612	298617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563242
5043	NC_017582	CCT	2	6	298676	298681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563242
5044	NC_017582	TG	3	6	298689	298694	0 %	50 %	50 %	0 %	414563242
5045	NC_017582	AGC	3	9	298720	298728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563242
5046	NC_017582	TCA	2	6	298801	298806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563242
5047	NC_017582	TATT	2	8	298841	298848	25 %	75 %	0 %	0 %	414563243
5048	NC_017582	CTT	2	6	298850	298855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563243
5049	NC_017582	GTG	2	6	298871	298876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563243
5050	NC_017582	TG	3	6	298956	298961	0 %	50 %	50 %	0 %	414563243
5051	NC_017582	T	6	6	298974	298979	0 %	100 %	0 %	0 %	414563243
5052	NC_017582	TCA	2	6	299106	299111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563243
5053	NC_017582	AG	3	6	299114	299119	50 %	0 %	50 %	0 %	414563243
5054	NC_017582	CTTTC	2	10	299123	299132	0 %	60 %	0 %	40 %	414563243
5055	NC_017582	TTGT	2	8	299165	299172	0 %	75 %	25 %	0 %	414563243
5056	NC_017582	CAG	2	6	299185	299190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563243
5057	NC_017582	AG	3	6	299200	299205	50 %	0 %	50 %	0 %	414563243
5058	NC_017582	ATTAT	2	10	299340	299349	40 %	60 %	0 %	0 %	414563243
5059	NC_017582	AGCC	2	8	299395	299402	25 %	0 %	25 %	50 %	414563243
5060	NC_017582	TAA	2	6	299407	299412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563243
5061	NC_017582	GCA	2	6	299442	299447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563243
5062	NC_017582	TGG	2	6	299461	299466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563243
5063	NC_017582	TGA	2	6	299476	299481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563243
5064	NC_017582	AT	3	6	299544	299549	50 %	50 %	0 %	0 %	414563243
5065	NC_017582	GCCTT	2	10	299684	299693	0 %	40 %	20 %	40 %	414563243
5066	NC_017582	AG	3	6	299747	299752	50 %	0 %	50 %	0 %	414563243
5067	NC_017582	TTG	2	6	299754	299759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563243
5068	NC_017582	AGC	2	6	299781	299786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563243
5069	NC_017582	TA	3	6	299819	299824	50 %	50 %	0 %	0 %	414563243
5070	NC_017582	GTG	2	6	299834	299839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563243
5071	NC_017582	TGC	2	6	299850	299855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563243
5072	NC_017582	AGCT	2	8	300298	300305	25 %	25 %	25 %	25 %	414563244
5073	NC_017582	GAC	2	6	300354	300359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563244
5074	NC_017582	GATTTG	2	12	300387	300398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414563244
5075	NC_017582	CGA	2	6	300452	300457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563244
5076	NC_017582	GCT	2	6	300486	300491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563244
5077	NC_017582	CTT	2	6	300514	300519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563244
5078	NC_017582	TAGCT	2	10	300715	300724	20 %	40 %	20 %	20 %	414563245
5079	NC_017582	CAGAG	2	10	300748	300757	40 %	0 %	40 %	20 %	414563245
5080	NC_017582	AAAGT	2	10	300815	300824	60 %	20 %	20 %	0 %	414563245
5081	NC_017582	GCC	2	6	300878	300883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563245
5082	NC_017582	TTG	2	6	300948	300953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563245
5083	NC_017582	TG	3	6	300969	300974	0 %	50 %	50 %	0 %	414563245
5084	NC_017582	GCT	2	6	300982	300987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563245
5085	NC_017582	T	6	6	301056	301061	0 %	100 %	0 %	0 %	414563245
5086	NC_017582	TGC	2	6	301077	301082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563245
5087	NC_017582	AGC	2	6	301095	301100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563245
5088	NC_017582	GCA	2	6	301120	301125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563245
5089	NC_017582	AGG	2	6	301159	301164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563245
5090	NC_017582	AGC	2	6	301175	301180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563245
5091	NC_017582	GTGA	2	8	301217	301224	25 %	25 %	50 %	0 %	414563245
5092	NC_017582	TAA	2	6	301298	301303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563245
5093	NC_017582	CCT	2	6	301401	301406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563245
5094	NC_017582	A	6	6	301459	301464	100 %	0 %	0 %	0 %	414563245
5095	NC_017582	T	6	6	301531	301536	0 %	100 %	0 %	0 %	414563245
5096	NC_017582	TGAT	2	8	301562	301569	25 %	50 %	25 %	0 %	414563245
5097	NC_017582	A	6	6	301628	301633	100 %	0 %	0 %	0 %	414563245
5098	NC_017582	ATG	2	6	301638	301643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563245
5099	NC_017582	TCA	2	6	301713	301718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563245
5100	NC_017582	TCC	3	9	301748	301756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563245
5101	NC_017582	AGCT	2	8	301763	301770	25 %	25 %	25 %	25 %	414563245
5102	NC_017582	TAG	2	6	301818	301823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563245
5103	NC_017582	CTA	2	6	301824	301829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563245
5104	NC_017582	CAT	2	6	301841	301846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563245
5105	NC_017582	CAG	2	6	301849	301854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563245
5106	NC_017582	ACC	2	6	301856	301861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563245
5107	NC_017582	AAT	3	9	301865	301873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563245
5108	NC_017582	AAT	2	6	302080	302085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563246
5109	NC_017582	AGG	2	6	302105	302110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563246
5110	NC_017582	TGA	3	9	302196	302204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563246
5111	NC_017582	AGC	2	6	302225	302230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563246
5112	NC_017582	A	7	7	302258	302264	100 %	0 %	0 %	0 %	414563246
5113	NC_017582	AGC	2	6	302288	302293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563246
5114	NC_017582	GCTG	2	8	302313	302320	0 %	25 %	50 %	25 %	414563246
5115	NC_017582	AGC	2	6	302372	302377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563246
5116	NC_017582	CAG	3	9	302383	302391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563246
5117	NC_017582	AGGCTG	2	12	302453	302464	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414563246
5118	NC_017582	A	6	6	302512	302517	100 %	0 %	0 %	0 %	414563246
5119	NC_017582	T	6	6	302520	302525	0 %	100 %	0 %	0 %	414563246
5120	NC_017582	AGG	2	6	302695	302700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563247
5121	NC_017582	CTG	2	6	302728	302733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563247
5122	NC_017582	TGA	2	6	302804	302809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563247
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5124	NC_017582	TTG	2	6	302833	302838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563247
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5243	NC_017582	T	6	6	308953	308958	0 %	100 %	0 %	0 %	414563254
5244	NC_017582	T	6	6	308979	308984	0 %	100 %	0 %	0 %	414563254
5245	NC_017582	T	6	6	309033	309038	0 %	100 %	0 %	0 %	414563254
5246	NC_017582	GTG	2	6	309055	309060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563254
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5272	NC_017582	AG	3	6	310292	310297	50 %	0 %	50 %	0 %	414563255
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5357	NC_017582	GCA	2	6	315076	315081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563261
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5363	NC_017582	GTT	2	6	315276	315281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563261
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5369	NC_017582	TGG	2	6	315556	315561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563261
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5486	NC_017582	GCT	2	6	322628	322633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563268
5487	NC_017582	TG	3	6	322656	322661	0 %	50 %	50 %	0 %	414563268
5488	NC_017582	A	7	7	322664	322670	100 %	0 %	0 %	0 %	414563268
5489	NC_017582	ACAG	2	8	322681	322688	50 %	0 %	25 %	25 %	414563268
5490	NC_017582	TAGC	2	8	322694	322701	25 %	25 %	25 %	25 %	414563268
5491	NC_017582	T	6	6	322786	322791	0 %	100 %	0 %	0 %	414563269
5492	NC_017582	CGT	2	6	322876	322881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563269
5493	NC_017582	ACC	2	6	322913	322918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563269
5494	NC_017582	AGT	2	6	323003	323008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563269
5495	NC_017582	CAGC	2	8	323069	323076	25 %	0 %	25 %	50 %	414563269
5496	NC_017582	GAA	2	6	323114	323119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563269
5497	NC_017582	AGTT	2	8	323134	323141	25 %	50 %	25 %	0 %	414563269
5498	NC_017582	GTGTA	2	10	323278	323287	20 %	40 %	40 %	0 %	414563269
5499	NC_017582	TCAA	2	8	323292	323299	50 %	25 %	0 %	25 %	414563269
5500	NC_017582	TGATG	2	10	323484	323493	20 %	40 %	40 %	0 %	414563269

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