MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 37447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017582	GACA	2	8	269811	269818	50 %	0 %	25 %	25 %	414563214
4502	NC_017582	AGCT	2	8	269859	269866	25 %	25 %	25 %	25 %	414563214
4503	NC_017582	CAC	2	6	269911	269916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563214
4504	NC_017582	AAAG	2	8	270207	270214	75 %	0 %	25 %	0 %	414563214
4505	NC_017582	AGC	2	6	270258	270263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563215
4506	NC_017582	TGCT	2	8	270270	270277	0 %	50 %	25 %	25 %	414563215
4507	NC_017582	TGC	2	6	270279	270284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563215
4508	NC_017582	A	6	6	270302	270307	100 %	0 %	0 %	0 %	414563215
4509	NC_017582	TGT	2	6	270378	270383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563215
4510	NC_017582	GA	3	6	270445	270450	50 %	0 %	50 %	0 %	414563215
4511	NC_017582	CAGG	2	8	270469	270476	25 %	0 %	50 %	25 %	414563215
4512	NC_017582	TGGTG	2	10	270561	270570	0 %	40 %	60 %	0 %	414563215
4513	NC_017582	TTA	2	6	270607	270612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563215
4514	NC_017582	TAG	2	6	270617	270622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563215
4515	NC_017582	GA	3	6	270714	270719	50 %	0 %	50 %	0 %	414563215
4516	NC_017582	TGG	2	6	270753	270758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563215
4517	NC_017582	TGA	2	6	270762	270767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563215
4518	NC_017582	TGCT	2	8	270780	270787	0 %	50 %	25 %	25 %	414563215
4519	NC_017582	TGGC	2	8	270812	270819	0 %	25 %	50 %	25 %	414563215
4520	NC_017582	GGC	2	6	270870	270875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563215
4521	NC_017582	ATT	2	6	270939	270944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563216
4522	NC_017582	TTG	2	6	270945	270950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563216
4523	NC_017582	AGC	2	6	271033	271038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563216
4524	NC_017582	AGCA	2	8	271056	271063	50 %	0 %	25 %	25 %	414563216
4525	NC_017582	CTT	2	6	271067	271072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563216
4526	NC_017582	A	7	7	271089	271095	100 %	0 %	0 %	0 %	414563216
4527	NC_017582	CAGAGG	2	12	271143	271154	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	414563216
4528	NC_017582	TAGAC	2	10	271180	271189	40 %	20 %	20 %	20 %	414563216
4529	NC_017582	TTG	2	6	271193	271198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563216
4530	NC_017582	TCA	2	6	271275	271280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563216
4531	NC_017582	CTGG	2	8	271293	271300	0 %	25 %	50 %	25 %	414563216
4532	NC_017582	ATTTG	2	10	271384	271393	20 %	60 %	20 %	0 %	414563216
4533	NC_017582	ACG	2	6	271394	271399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563216
4534	NC_017582	ATT	3	9	271484	271492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563216
4535	NC_017582	TGC	2	6	271559	271564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563217
4536	NC_017582	GCAGA	2	10	271592	271601	40 %	0 %	40 %	20 %	414563217
4537	NC_017582	ATCAG	2	10	271637	271646	40 %	20 %	20 %	20 %	414563217
4538	NC_017582	GCT	2	6	271682	271687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563217
4539	NC_017582	TGA	2	6	271702	271707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563217
4540	NC_017582	CAG	2	6	271731	271736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563217
4541	NC_017582	GGA	2	6	271871	271876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563217
4542	NC_017582	GAA	2	6	271893	271898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563217
4543	NC_017582	CCT	2	6	271933	271938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563217
4544	NC_017582	AGC	2	6	271954	271959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563217
4545	NC_017582	ATT	2	6	272082	272087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563217
4546	NC_017582	CAT	2	6	272093	272098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563217
4547	NC_017582	AG	3	6	272118	272123	50 %	0 %	50 %	0 %	414563217
4548	NC_017582	GGA	2	6	272231	272236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563217
4549	NC_017582	TTA	2	6	272237	272242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563217
4550	NC_017582	GGA	2	6	272249	272254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563217
4551	NC_017582	CTT	2	6	272304	272309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563217
4552	NC_017582	GCG	2	6	272310	272315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563217
4553	NC_017582	AAC	2	6	272366	272371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563217
4554	NC_017582	GGT	2	6	272417	272422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563217
4555	NC_017582	CTTT	2	8	272434	272441	0 %	75 %	0 %	25 %	414563217
4556	NC_017582	TCG	2	6	272450	272455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563217
4557	NC_017582	TTG	2	6	272467	272472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563217
4558	NC_017582	A	7	7	272542	272548	100 %	0 %	0 %	0 %	414563217
4559	NC_017582	GGC	2	6	272604	272609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563217
4560	NC_017582	TGCT	2	8	272611	272618	0 %	50 %	25 %	25 %	414563217
4561	NC_017582	AGC	2	6	272629	272634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563217
4562	NC_017582	TTA	2	6	272742	272747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563217
4563	NC_017582	TTA	2	6	272757	272762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563217
4564	NC_017582	A	6	6	272794	272799	100 %	0 %	0 %	0 %	414563218
4565	NC_017582	CAG	2	6	272834	272839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563218
4566	NC_017582	GAT	2	6	272890	272895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563218
4567	NC_017582	GAA	2	6	272944	272949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563218
4568	NC_017582	CTC	2	6	273005	273010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563218
4569	NC_017582	TTC	2	6	273196	273201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563218
4570	NC_017582	CAG	2	6	273209	273214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563218
4571	NC_017582	TGC	2	6	273341	273346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563218
4572	NC_017582	GAA	2	6	273439	273444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563218
4573	NC_017582	TGA	2	6	273474	273479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563218
4574	NC_017582	AGA	2	6	273486	273491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563218
4575	NC_017582	TCA	2	6	273522	273527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563218
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4577	NC_017582	ACA	2	6	273596	273601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563218
4578	NC_017582	ATG	4	12	273613	273624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563218
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4580	NC_017582	AAC	2	6	273865	273870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563219
4581	NC_017582	GGC	2	6	273915	273920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563219
4582	NC_017582	ATC	2	6	273924	273929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563219
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4584	NC_017582	A	6	6	273955	273960	100 %	0 %	0 %	0 %	414563219
4585	NC_017582	GAA	2	6	273967	273972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563219
4586	NC_017582	GA	3	6	273983	273988	50 %	0 %	50 %	0 %	414563219
4587	NC_017582	GTG	3	9	274010	274018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563219
4588	NC_017582	CAGAGG	2	12	274040	274051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	414563219
4589	NC_017582	AGA	2	6	274065	274070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563219
4590	NC_017582	TGG	2	6	274110	274115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563219
4591	NC_017582	TATC	2	8	274119	274126	25 %	50 %	0 %	25 %	414563219
4592	NC_017582	TGA	2	6	274214	274219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563219
4593	NC_017582	TTGTAA	2	12	274280	274291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414563219
4594	NC_017582	TTG	2	6	274415	274420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563219
4595	NC_017582	T	6	6	274425	274430	0 %	100 %	0 %	0 %	414563219
4596	NC_017582	GTG	2	6	274436	274441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563219
4597	NC_017582	ATG	2	6	274456	274461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563219
4598	NC_017582	TGG	2	6	274490	274495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563219
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4600	NC_017582	GTT	2	6	274597	274602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563219
4601	NC_017582	ATAA	2	8	274622	274629	75 %	25 %	0 %	0 %	414563219
4602	NC_017582	GCTA	2	8	274824	274831	25 %	25 %	25 %	25 %	414563220
4603	NC_017582	AGA	2	6	274875	274880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563220
4604	NC_017582	A	6	6	274897	274902	100 %	0 %	0 %	0 %	414563220
4605	NC_017582	AGC	2	6	274950	274955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563220
4606	NC_017582	A	6	6	274969	274974	100 %	0 %	0 %	0 %	414563220
4607	NC_017582	GCAG	2	8	274977	274984	25 %	0 %	50 %	25 %	414563220
4608	NC_017582	TGAG	2	8	275030	275037	25 %	25 %	50 %	0 %	414563220
4609	NC_017582	CTG	2	6	275111	275116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563220
4610	NC_017582	AGGCAG	2	12	275129	275140	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	414563220
4611	NC_017582	AGC	2	6	275147	275152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563220
4612	NC_017582	GCA	2	6	275164	275169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563220
4613	NC_017582	AGCT	2	8	275189	275196	25 %	25 %	25 %	25 %	414563220
4614	NC_017582	AGC	3	9	275205	275213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563220
4615	NC_017582	AGCC	2	8	275248	275255	25 %	0 %	25 %	50 %	414563220
4616	NC_017582	AGA	2	6	275289	275294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563220
4617	NC_017582	TGA	2	6	275310	275315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563220
4618	NC_017582	CAGC	2	8	275364	275371	25 %	0 %	25 %	50 %	414563220
4619	NC_017582	AGC	2	6	275385	275390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563220
4620	NC_017582	GCT	2	6	275407	275412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563220
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4622	NC_017582	GAG	2	6	275512	275517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563220
4623	NC_017582	AGC	2	6	275529	275534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563220
4624	NC_017582	CAG	2	6	275552	275557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563220
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4642	NC_017582	TCCT	2	8	276342	276349	0 %	50 %	0 %	50 %	414563220
4643	NC_017582	TCAG	2	8	276383	276390	25 %	25 %	25 %	25 %	414563220
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4744	NC_017582	TGA	2	6	281778	281783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563225
4745	NC_017582	CAC	2	6	281826	281831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563225
4746	NC_017582	TGC	2	6	281860	281865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
4747	NC_017582	TGC	2	6	281896	281901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
4748	NC_017582	TGC	2	6	281950	281955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
4749	NC_017582	GTTCCA	2	12	281963	281974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414563225
4750	NC_017582	AAG	2	6	282012	282017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563225
4751	NC_017582	TGC	2	6	282037	282042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
4752	NC_017582	GCT	2	6	282050	282055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
4753	NC_017582	AAT	2	6	282264	282269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563225
4754	NC_017582	A	7	7	282821	282827	100 %	0 %	0 %	0 %	414563226
4755	NC_017582	GA	3	6	282888	282893	50 %	0 %	50 %	0 %	414563226
4756	NC_017582	A	6	6	282893	282898	100 %	0 %	0 %	0 %	414563226
4757	NC_017582	CAG	2	6	282998	283003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563226
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4762	NC_017582	ATA	2	6	283131	283136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563226
4763	NC_017582	CTT	2	6	283243	283248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563226
4764	NC_017582	AAG	2	6	283338	283343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563226
4765	NC_017582	GCAAG	2	10	283354	283363	40 %	0 %	40 %	20 %	414563226
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4772	NC_017582	GCA	2	6	283542	283547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563226
4773	NC_017582	ATC	2	6	283553	283558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563226
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4775	NC_017582	A	6	6	283914	283919	100 %	0 %	0 %	0 %	414563227
4776	NC_017582	TTA	2	6	283963	283968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563227
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4782	NC_017582	AAGG	2	8	284079	284086	50 %	0 %	50 %	0 %	414563227
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4802	NC_017582	GTTTT	2	10	285306	285315	0 %	80 %	20 %	0 %	414563228
4803	NC_017582	GCTT	2	8	285329	285336	0 %	50 %	25 %	25 %	414563228
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4814	NC_017582	GAAA	2	8	286093	286100	75 %	0 %	25 %	0 %	414563230
4815	NC_017582	ATCT	2	8	286158	286165	25 %	50 %	0 %	25 %	414563230
4816	NC_017582	GA	3	6	286211	286216	50 %	0 %	50 %	0 %	414563230
4817	NC_017582	GCAAAA	2	12	286348	286359	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414563230
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4819	NC_017582	ATG	2	6	286395	286400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563230
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4822	NC_017582	CAG	2	6	286509	286514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563231
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4830	NC_017582	CGT	2	6	287006	287011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563231
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4832	NC_017582	ATA	2	6	287127	287132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563231
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4838	NC_017582	TGA	2	6	287343	287348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563231
4839	NC_017582	GTG	2	6	287487	287492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563231
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4841	NC_017582	ATG	2	6	287630	287635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563231
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4847	NC_017582	GGC	2	6	288119	288124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563232
4848	NC_017582	TGC	2	6	288143	288148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563232
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4851	NC_017582	CT	3	6	288560	288565	0 %	50 %	0 %	50 %	414563232
4852	NC_017582	CAC	2	6	288616	288621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563232
4853	NC_017582	ACA	2	6	288702	288707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563232
4854	NC_017582	A	6	6	288782	288787	100 %	0 %	0 %	0 %	414563232
4855	NC_017582	CAAG	2	8	288875	288882	50 %	0 %	25 %	25 %	414563232
4856	NC_017582	GTT	2	6	288951	288956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563232
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4858	NC_017582	TA	3	6	288988	288993	50 %	50 %	0 %	0 %	414563232
4859	NC_017582	AGG	2	6	289198	289203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563232
4860	NC_017582	AAGG	2	8	289218	289225	50 %	0 %	50 %	0 %	414563232
4861	NC_017582	GCTGAT	2	12	289269	289280	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414563232
4862	NC_017582	CTG	2	6	289285	289290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563232
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4864	NC_017582	GTG	2	6	289432	289437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563232
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4978	NC_017582	AGAGCT	2	12	295850	295861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414563238
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4980	NC_017582	GCTT	2	8	295889	295896	0 %	50 %	25 %	25 %	414563238
4981	NC_017582	A	6	6	295901	295906	100 %	0 %	0 %	0 %	414563238
4982	NC_017582	CAA	2	6	295974	295979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563238
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4988	NC_017582	ACG	2	6	296345	296350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563239
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