MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus JIM 8232

Total Repeats: 32895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017581	T	8	8	118	125	0 %	100 %	0 %	0 %	386343609
2	NC_017581	AGA	2	6	151	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343609
3	NC_017581	ATT	2	6	177	182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343609
4	NC_017581	TCA	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343609
5	NC_017581	GAA	2	6	239	244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343609
6	NC_017581	TGA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343609
7	NC_017581	AAC	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343609
8	NC_017581	AGTA	2	8	449	456	50 %	25 %	25 %	0 %	386343609
9	NC_017581	AGC	2	6	502	507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343609
10	NC_017581	TAGCTG	2	12	513	524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386343609
11	NC_017581	TAA	2	6	607	612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343609
12	NC_017581	TTA	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343609
13	NC_017581	GTTT	2	8	676	683	0 %	75 %	25 %	0 %	386343609
14	NC_017581	TGA	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343609
15	NC_017581	ATA	3	9	831	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343609
16	NC_017581	TGAA	2	8	879	886	50 %	25 %	25 %	0 %	386343609
17	NC_017581	GGA	2	6	1352	1357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343609
18	NC_017581	TGCT	2	8	1404	1411	0 %	50 %	25 %	25 %	386343609
19	NC_017581	TAA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343610
20	NC_017581	A	6	6	1691	1696	100 %	0 %	0 %	0 %	386343610
21	NC_017581	AGA	2	6	1802	1807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343610
22	NC_017581	ATTA	2	8	1820	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	386343610
23	NC_017581	GTA	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343610
24	NC_017581	T	6	6	1859	1864	0 %	100 %	0 %	0 %	386343610
25	NC_017581	GTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343610
26	NC_017581	GAA	2	6	1908	1913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343610
27	NC_017581	AAAGG	2	10	1965	1974	60 %	0 %	40 %	0 %	386343610
28	NC_017581	AAG	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343610
29	NC_017581	GCA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343610
30	NC_017581	GTC	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343610
31	NC_017581	GTA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343610
32	NC_017581	CAG	2	6	2254	2259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343610
33	NC_017581	TCT	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343610
34	NC_017581	CAAAT	2	10	2302	2311	60 %	20 %	0 %	20 %	386343610
35	NC_017581	AC	3	6	2341	2346	50 %	0 %	0 %	50 %	386343610
36	NC_017581	ATC	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343610
37	NC_017581	TGAA	2	8	2551	2558	50 %	25 %	25 %	0 %	386343610
38	NC_017581	TGATT	2	10	2588	2597	20 %	60 %	20 %	0 %	386343610
39	NC_017581	ACTT	2	8	2613	2620	25 %	50 %	0 %	25 %	386343610
40	NC_017581	CAG	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343610
41	NC_017581	AATT	2	8	2728	2735	50 %	50 %	0 %	0 %	386343610
42	NC_017581	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343611
43	NC_017581	A	7	7	2872	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	386343611
44	NC_017581	ATG	2	6	2951	2956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343611
45	NC_017581	GTC	2	6	2958	2963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343611
46	NC_017581	AAG	2	6	2975	2980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343611
47	NC_017581	AAAT	3	12	3201	3212	75 %	25 %	0 %	0 %	386343612
48	NC_017581	CAG	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343612
49	NC_017581	GCT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343612
50	NC_017581	CAA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343612
51	NC_017581	TCGT	2	8	3518	3525	0 %	50 %	25 %	25 %	386343612
52	NC_017581	GAT	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
53	NC_017581	AAAGAT	2	12	3685	3696	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386343612
54	NC_017581	TTC	2	6	3716	3721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343612
55	NC_017581	AGA	2	6	3741	3746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
56	NC_017581	GAA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
57	NC_017581	A	6	6	3788	3793	100 %	0 %	0 %	0 %	386343612
58	NC_017581	ACA	2	6	3817	3822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343612
59	NC_017581	TGA	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
60	NC_017581	TGA	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
61	NC_017581	AGT	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
62	NC_017581	GAA	2	6	3958	3963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
63	NC_017581	GAT	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
64	NC_017581	GCA	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343612
65	NC_017581	AGC	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343612
66	NC_017581	AAG	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
67	NC_017581	GAA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
68	NC_017581	TGT	2	6	4281	4286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343612
69	NC_017581	AAT	2	6	4395	4400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343613
70	NC_017581	TAG	2	6	4409	4414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343613
71	NC_017581	CAA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343613
72	NC_017581	ATCT	2	8	4601	4608	25 %	50 %	0 %	25 %	386343613
73	NC_017581	TTA	2	6	4635	4640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343613
74	NC_017581	GGA	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343613
75	NC_017581	GAT	2	6	4675	4680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343613
76	NC_017581	CAG	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343613
77	NC_017581	TACT	2	8	4880	4887	25 %	50 %	0 %	25 %	386343613
78	NC_017581	ACT	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343613
79	NC_017581	GAA	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343614
80	NC_017581	TCA	2	6	4996	5001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
81	NC_017581	TAG	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
82	NC_017581	T	7	7	5203	5209	0 %	100 %	0 %	0 %	386343614
83	NC_017581	GAT	2	6	5213	5218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
84	NC_017581	GCT	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
85	NC_017581	A	6	6	5253	5258	100 %	0 %	0 %	0 %	386343614
86	NC_017581	GGAA	2	8	5397	5404	50 %	0 %	50 %	0 %	386343614
87	NC_017581	G	6	6	5493	5498	0 %	0 %	100 %	0 %	386343614
88	NC_017581	T	6	6	5549	5554	0 %	100 %	0 %	0 %	386343614
89	NC_017581	GAGAT	2	10	5556	5565	40 %	20 %	40 %	0 %	386343614
90	NC_017581	TGT	2	6	5623	5628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343614
91	NC_017581	CGG	2	6	5637	5642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386343614
92	NC_017581	AGA	2	6	5662	5667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343614
93	NC_017581	TC	3	6	5798	5803	0 %	50 %	0 %	50 %	386343614
94	NC_017581	TGA	2	6	5863	5868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
95	NC_017581	TCA	2	6	5938	5943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
96	NC_017581	ACT	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
97	NC_017581	CAGC	2	8	6005	6012	25 %	0 %	25 %	50 %	386343614
98	NC_017581	CTT	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343614
99	NC_017581	CA	3	6	6076	6081	50 %	0 %	0 %	50 %	386343614
100	NC_017581	TCG	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
101	NC_017581	TAG	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
102	NC_017581	GTT	2	6	6326	6331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343614
103	NC_017581	A	6	6	6359	6364	100 %	0 %	0 %	0 %	386343614
104	NC_017581	CGT	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
105	NC_017581	TGT	2	6	6445	6450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343614
106	NC_017581	ACT	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
107	NC_017581	TGC	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
108	NC_017581	TC	3	6	6583	6588	0 %	50 %	0 %	50 %	386343614
109	NC_017581	TAA	2	6	6625	6630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343614
110	NC_017581	ATG	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
111	NC_017581	CAAA	2	8	6658	6665	75 %	0 %	0 %	25 %	386343614
112	NC_017581	AAGC	2	8	6670	6677	50 %	0 %	25 %	25 %	386343614
113	NC_017581	GAT	3	9	6755	6763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
114	NC_017581	TTGG	2	8	6875	6882	0 %	50 %	50 %	0 %	386343614
115	NC_017581	TGC	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
116	NC_017581	ATG	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
117	NC_017581	A	6	6	7064	7069	100 %	0 %	0 %	0 %	386343614
118	NC_017581	ATT	3	9	7115	7123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343614
119	NC_017581	TTG	2	6	7136	7141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343614
120	NC_017581	TGA	2	6	7183	7188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
121	NC_017581	AAC	2	6	7191	7196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343614
122	NC_017581	ATT	2	6	7322	7327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343614
123	NC_017581	TTATG	2	10	7363	7372	20 %	60 %	20 %	0 %	386343614
124	NC_017581	T	6	6	7434	7439	0 %	100 %	0 %	0 %	386343614
125	NC_017581	CT	3	6	7557	7562	0 %	50 %	0 %	50 %	386343614
126	NC_017581	T	6	6	7567	7572	0 %	100 %	0 %	0 %	386343614
127	NC_017581	GTA	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
128	NC_017581	TGCCTA	2	12	7726	7737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386343614
129	NC_017581	ATC	2	6	7746	7751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
130	NC_017581	TCG	2	6	7975	7980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
131	NC_017581	CCTT	2	8	8020	8027	0 %	50 %	0 %	50 %	386343614
132	NC_017581	A	6	6	8052	8057	100 %	0 %	0 %	0 %	386343614
133	NC_017581	TTGA	2	8	8123	8130	25 %	50 %	25 %	0 %	386343614
134	NC_017581	TGC	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
135	NC_017581	ATC	2	6	8240	8245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
136	NC_017581	TC	3	6	8262	8267	0 %	50 %	0 %	50 %	386343614
137	NC_017581	TTC	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343614
138	NC_017581	ATT	2	6	8357	8362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343614
139	NC_017581	AAGA	2	8	8378	8385	75 %	0 %	25 %	0 %	386343614
140	NC_017581	A	6	6	8438	8443	100 %	0 %	0 %	0 %	386343614
141	NC_017581	A	8	8	8451	8458	100 %	0 %	0 %	0 %	386343614
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143	NC_017581	A	6	6	8854	8859	100 %	0 %	0 %	0 %	386343615
144	NC_017581	GCA	2	6	8866	8871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343615
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148	NC_017581	GAAG	2	8	9106	9113	50 %	0 %	50 %	0 %	386343616
149	NC_017581	TCAGA	2	10	9146	9155	40 %	20 %	20 %	20 %	386343616
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152	NC_017581	TTA	2	6	9272	9277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343616
153	NC_017581	T	7	7	9311	9317	0 %	100 %	0 %	0 %	386343617
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157	NC_017581	TCT	2	6	9450	9455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343618
158	NC_017581	TAGC	2	8	9535	9542	25 %	25 %	25 %	25 %	386343618
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160	NC_017581	ATTA	2	8	9740	9747	50 %	50 %	0 %	0 %	386343618
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162	NC_017581	TTA	2	6	9917	9922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343618
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165	NC_017581	A	6	6	10087	10092	100 %	0 %	0 %	0 %	386343618
166	NC_017581	TAT	2	6	10131	10136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343618
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171	NC_017581	A	6	6	10419	10424	100 %	0 %	0 %	0 %	386343618
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241	NC_017581	CCTT	2	8	13030	13037	0 %	50 %	0 %	50 %	386343621
242	NC_017581	T	7	7	13053	13059	0 %	100 %	0 %	0 %	386343621
243	NC_017581	ATG	2	6	13067	13072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343621
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247	NC_017581	TAG	2	6	13203	13208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343621
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249	NC_017581	CCT	2	6	13300	13305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386343621
250	NC_017581	TTG	2	6	13365	13370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343621
251	NC_017581	TGTCGG	2	12	13378	13389	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386343621
252	NC_017581	TAT	2	6	13441	13446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343621
253	NC_017581	TGA	2	6	13453	13458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343621
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259	NC_017581	TGC	2	6	13585	13590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343621
260	NC_017581	AACC	2	8	13591	13598	50 %	0 %	0 %	50 %	386343621
261	NC_017581	TTG	2	6	13656	13661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343621
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263	NC_017581	TTG	2	6	13770	13775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343621
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500	NC_017581	TTCA	2	8	34426	34433	25 %	50 %	0 %	25 %	386343636

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