MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus JIM 8232

Total Repeats: 32895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017581	GTC	2	6	216043	216048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343814
3502	NC_017581	ATTG	2	8	216079	216086	25 %	50 %	25 %	0 %	386343814
3503	NC_017581	TGA	2	6	216138	216143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343815
3504	NC_017581	TTCA	2	8	216181	216188	25 %	50 %	0 %	25 %	386343815
3505	NC_017581	GAC	2	6	216207	216212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343815
3506	NC_017581	TAA	2	6	216272	216277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343815
3507	NC_017581	ATTA	2	8	216437	216444	50 %	50 %	0 %	0 %	386343816
3508	NC_017581	TCA	2	6	216537	216542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343816
3509	NC_017581	GCT	2	6	216585	216590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343816
3510	NC_017581	ATC	2	6	216651	216656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343816
3511	NC_017581	TAG	2	6	216742	216747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343816
3512	NC_017581	ATC	2	6	216780	216785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343816
3513	NC_017581	TCA	2	6	216813	216818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343816
3514	NC_017581	CTA	2	6	216857	216862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343816
3515	NC_017581	CTG	2	6	216889	216894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343816
3516	NC_017581	CTT	2	6	216909	216914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343816
3517	NC_017581	TGG	2	6	216941	216946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343816
3518	NC_017581	GAA	2	6	216981	216986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343816
3519	NC_017581	GCCA	2	8	217019	217026	25 %	0 %	25 %	50 %	386343816
3520	NC_017581	TGA	2	6	217046	217051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343816
3521	NC_017581	AGCTT	2	10	217117	217126	20 %	40 %	20 %	20 %	386343816
3522	NC_017581	GGA	2	6	217274	217279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343816
3523	NC_017581	TCA	2	6	217282	217287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343816
3524	NC_017581	GAT	2	6	217428	217433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343817
3525	NC_017581	AAT	2	6	217456	217461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343817
3526	NC_017581	TGA	2	6	217488	217493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343817
3527	NC_017581	GGT	2	6	217525	217530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343817
3528	NC_017581	GAA	2	6	217951	217956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343817
3529	NC_017581	TGG	2	6	217976	217981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343817
3530	NC_017581	AAT	2	6	217996	218001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343817
3531	NC_017581	ATCA	2	8	218020	218027	50 %	25 %	0 %	25 %	386343817
3532	NC_017581	CTT	2	6	218028	218033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343817
3533	NC_017581	GAG	2	6	218044	218049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343817
3534	NC_017581	AAG	2	6	218071	218076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343817
3535	NC_017581	GAT	2	6	218127	218132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343817
3536	NC_017581	CAG	2	6	218180	218185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343817
3537	NC_017581	AGC	2	6	218187	218192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343817
3538	NC_017581	ATT	3	9	218408	218416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343818
3539	NC_017581	TAA	2	6	218418	218423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343818
3540	NC_017581	GAG	2	6	218425	218430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343818
3541	NC_017581	AG	3	6	218429	218434	50 %	0 %	50 %	0 %	386343818
3542	NC_017581	AGG	2	6	218483	218488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343818
3543	NC_017581	ACC	2	6	218562	218567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386343819
3544	NC_017581	T	6	6	218757	218762	0 %	100 %	0 %	0 %	386343819
3545	NC_017581	TGG	2	6	218790	218795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343819
3546	NC_017581	ATT	2	6	218835	218840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343819
3547	NC_017581	TCG	2	6	218876	218881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343819
3548	NC_017581	GGT	2	6	218882	218887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343819
3549	NC_017581	GAG	2	6	218892	218897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343819
3550	NC_017581	CTG	2	6	218985	218990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343819
3551	NC_017581	CTT	2	6	219040	219045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343819
3552	NC_017581	CGA	2	6	219057	219062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343819
3553	NC_017581	TGA	2	6	219086	219091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343819
3554	NC_017581	AAC	2	6	219112	219117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343819
3555	NC_017581	TGA	2	6	219265	219270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343819
3556	NC_017581	CTTT	2	8	219352	219359	0 %	75 %	0 %	25 %	386343819
3557	NC_017581	TTG	2	6	219438	219443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343819
3558	NC_017581	TCTT	2	8	219500	219507	0 %	75 %	0 %	25 %	386343819
3559	NC_017581	TCCAA	2	10	219525	219534	40 %	20 %	0 %	40 %	386343819
3560	NC_017581	TCT	2	6	219553	219558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343819
3561	NC_017581	TTG	2	6	219562	219567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343819
3562	NC_017581	CT	3	6	219685	219690	0 %	50 %	0 %	50 %	386343819
3563	NC_017581	GGAA	2	8	219733	219740	50 %	0 %	50 %	0 %	386343819
3564	NC_017581	AGA	2	6	219878	219883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343820
3565	NC_017581	CTC	2	6	219939	219944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386343820
3566	NC_017581	GCT	2	6	220062	220067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343820
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3568	NC_017581	GAT	2	6	220128	220133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343820
3569	NC_017581	AAG	2	6	220162	220167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343820
3570	NC_017581	ACC	2	6	220198	220203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386343820
3571	NC_017581	ATC	2	6	220246	220251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343820
3572	NC_017581	A	6	6	220294	220299	100 %	0 %	0 %	0 %	386343820
3573	NC_017581	ATG	2	6	220349	220354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343821
3574	NC_017581	TTA	2	6	220445	220450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343821
3575	NC_017581	AAG	2	6	220477	220482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343821
3576	NC_017581	AAG	2	6	220519	220524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343821
3577	NC_017581	CGT	2	6	220633	220638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343821
3578	NC_017581	AACA	2	8	220642	220649	75 %	0 %	0 %	25 %	386343821
3579	NC_017581	TC	3	6	220722	220727	0 %	50 %	0 %	50 %	386343821
3580	NC_017581	GGT	2	6	220729	220734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343821
3581	NC_017581	GATG	2	8	220812	220819	25 %	25 %	50 %	0 %	386343821
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3583	NC_017581	GTCT	2	8	220878	220885	0 %	50 %	25 %	25 %	386343821
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3587	NC_017581	TTC	2	6	221109	221114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343822
3588	NC_017581	GTC	2	6	221115	221120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343822
3589	NC_017581	TGA	2	6	221127	221132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343822
3590	NC_017581	TTGTGG	2	12	221211	221222	0 %	50 %	50 %	0 %	386343822
3591	NC_017581	TGC	2	6	221227	221232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343822
3592	NC_017581	AGT	2	6	221348	221353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343822
3593	NC_017581	TAT	2	6	221383	221388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343822
3594	NC_017581	CT	3	6	221415	221420	0 %	50 %	0 %	50 %	386343822
3595	NC_017581	CTC	2	6	221537	221542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386343822
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3597	NC_017581	CAG	3	9	221583	221591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343822
3598	NC_017581	CAT	2	6	221611	221616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343822
3599	NC_017581	CAG	2	6	221625	221630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343822
3600	NC_017581	TTGGT	2	10	221688	221697	0 %	60 %	40 %	0 %	386343822
3601	NC_017581	CT	3	6	221705	221710	0 %	50 %	0 %	50 %	386343822
3602	NC_017581	TAT	2	6	221726	221731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343822
3603	NC_017581	CTT	2	6	221776	221781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343822
3604	NC_017581	CT	3	6	221805	221810	0 %	50 %	0 %	50 %	386343822
3605	NC_017581	TGA	2	6	222075	222080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343823
3606	NC_017581	TTGCC	2	10	222119	222128	0 %	40 %	20 %	40 %	386343823
3607	NC_017581	CAG	3	9	222164	222172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343823
3608	NC_017581	TTTG	2	8	222225	222232	0 %	75 %	25 %	0 %	386343823
3609	NC_017581	CAG	2	6	222242	222247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343823
3610	NC_017581	TCG	2	6	222276	222281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343823
3611	NC_017581	T	6	6	222301	222306	0 %	100 %	0 %	0 %	386343823
3612	NC_017581	T	6	6	222405	222410	0 %	100 %	0 %	0 %	386343823
3613	NC_017581	T	6	6	222491	222496	0 %	100 %	0 %	0 %	386343823
3614	NC_017581	TTA	2	6	222527	222532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343823
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3617	NC_017581	A	6	6	222667	222672	100 %	0 %	0 %	0 %	386343823
3618	NC_017581	TCC	2	6	222742	222747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386343823
3619	NC_017581	TGA	2	6	222758	222763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343823
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3984	NC_017581	GGA	2	6	243913	243918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343848
3985	NC_017581	TCC	2	6	243960	243965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386343848
3986	NC_017581	TGG	3	9	243991	243999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343848
3987	NC_017581	CA	3	6	244009	244014	50 %	0 %	0 %	50 %	386343848
3988	NC_017581	ACAG	2	8	244048	244055	50 %	0 %	25 %	25 %	386343848
3989	NC_017581	TTCT	3	12	244076	244087	0 %	75 %	0 %	25 %	386343848
3990	NC_017581	AGCA	2	8	244109	244116	50 %	0 %	25 %	25 %	386343848
3991	NC_017581	AAT	2	6	244139	244144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343848
3992	NC_017581	GCCA	2	8	244181	244188	25 %	0 %	25 %	50 %	386343848
3993	NC_017581	TGC	2	6	244207	244212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343848
3994	NC_017581	ATA	2	6	244284	244289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343848
3995	NC_017581	CAAC	2	8	244299	244306	50 %	0 %	0 %	50 %	386343848
3996	NC_017581	GAT	2	6	244337	244342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343848
3997	NC_017581	GCTGAT	2	12	244358	244369	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386343848
3998	NC_017581	TGA	2	6	244426	244431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343848
3999	NC_017581	GAA	2	6	244466	244471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343848
4000	NC_017581	CTA	2	6	244473	244478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343848

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