MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017577	CGATT	2	10	8348	8357	20 %	40 %	20 %	20 %	386343413
2	NC_017577	GAGCA	2	10	8674	8683	40 %	0 %	40 %	20 %	386343413
3	NC_017577	TATTG	2	10	15623	15632	20 %	60 %	20 %	0 %	386343417
4	NC_017577	GTCTG	2	10	20686	20695	0 %	40 %	40 %	20 %	386343425
5	NC_017577	AATCG	2	10	21622	21631	40 %	20 %	20 %	20 %	386343425
6	NC_017577	AATTC	2	10	26383	26392	40 %	40 %	0 %	20 %	386343429
7	NC_017577	TCCTT	2	10	29834	29843	0 %	60 %	0 %	40 %	386343433
8	NC_017577	CGTCT	2	10	30062	30071	0 %	40 %	20 %	40 %	386343433
9	NC_017577	AATGC	2	10	31915	31924	40 %	20 %	20 %	20 %	386343436
10	NC_017577	TTTGT	2	10	33074	33083	0 %	80 %	20 %	0 %	386343438
11	NC_017577	GCAGC	2	10	34827	34836	20 %	0 %	40 %	40 %	386343439
12	NC_017577	TTTGA	2	10	35147	35156	20 %	60 %	20 %	0 %	386343439
13	NC_017577	TTAGC	2	10	39553	39562	20 %	40 %	20 %	20 %	386343442
14	NC_017577	GTTTG	2	10	40424	40433	0 %	60 %	40 %	0 %	386343443
15	NC_017577	TGAAT	2	10	41329	41338	40 %	40 %	20 %	0 %	386343445
16	NC_017577	TGATT	2	10	46993	47002	20 %	60 %	20 %	0 %	386343453
17	NC_017577	ATTTG	2	10	51325	51334	20 %	60 %	20 %	0 %	386343458
18	NC_017577	AATCA	2	10	51767	51776	60 %	20 %	0 %	20 %	386343458
19	NC_017577	ATCAA	2	10	62574	62583	60 %	20 %	0 %	20 %	386343465
20	NC_017577	AGTAA	2	10	64568	64577	60 %	20 %	20 %	0 %	386343466
21	NC_017577	ATCTA	2	10	64918	64927	40 %	40 %	0 %	20 %	386343466
22	NC_017577	GCCTT	2	10	66231	66240	0 %	40 %	20 %	40 %	386343468
23	NC_017577	TTGAT	2	10	67923	67932	20 %	60 %	20 %	0 %	386343469
24	NC_017577	GTCTG	2	10	70352	70361	0 %	40 %	40 %	20 %	386343473
25	NC_017577	TATTG	2	10	70452	70461	20 %	60 %	20 %	0 %	386343473
26	NC_017577	ACGCC	2	10	70790	70799	20 %	0 %	20 %	60 %	386343474
27	NC_017577	GGTGA	2	10	73244	73253	20 %	20 %	60 %	0 %	386343475
28	NC_017577	TAATG	2	10	73411	73420	40 %	40 %	20 %	0 %	386343476
29	NC_017577	GCAAC	2	10	73847	73856	40 %	0 %	20 %	40 %	386343476
30	NC_017577	TGGTC	2	10	83727	83736	0 %	40 %	40 %	20 %	386343487
31	NC_017577	TTGCA	2	10	84770	84779	20 %	40 %	20 %	20 %	386343488
32	NC_017577	AAAGC	2	10	90829	90838	60 %	0 %	20 %	20 %	386343493
33	NC_017577	ATTAT	2	10	91824	91833	40 %	60 %	0 %	0 %	386343494
34	NC_017577	AAGTT	2	10	92509	92518	40 %	40 %	20 %	0 %	386343494
35	NC_017577	TTGTT	2	10	92561	92570	0 %	80 %	20 %	0 %	386343494
36	NC_017577	CTTTT	2	10	92994	93003	0 %	80 %	0 %	20 %	386343495
37	NC_017577	TGCGT	2	10	95493	95502	0 %	40 %	40 %	20 %	386343499
38	NC_017577	GCCTT	2	10	97836	97845	0 %	40 %	20 %	40 %	386343501
39	NC_017577	CAATT	2	10	99017	99026	40 %	40 %	0 %	20 %	386343503
40	NC_017577	CCATT	2	10	103810	103819	20 %	40 %	0 %	40 %	386343511
41	NC_017577	CCCCA	2	10	109494	109503	20 %	0 %	0 %	80 %	386343522
42	NC_017577	TCTGT	2	10	110880	110889	0 %	60 %	20 %	20 %	386343524
43	NC_017577	CATCA	2	10	112287	112296	40 %	20 %	0 %	40 %	386343526
44	NC_017577	TTCAT	2	10	112897	112906	20 %	60 %	0 %	20 %	386343527
45	NC_017577	ATTTA	2	10	113247	113256	40 %	60 %	0 %	0 %	386343527
46	NC_017577	ATCCA	2	10	113976	113985	40 %	20 %	0 %	40 %	386343528
47	NC_017577	TGATT	2	10	115379	115388	20 %	60 %	20 %	0 %	386343529

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.