MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius ED99 chromosome

Total Repeats: 30439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017568	ACT	2	6	296	301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318030
2	NC_017568	ACA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318030
3	NC_017568	TGA	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318030
4	NC_017568	GCA	2	6	371	376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318030
5	NC_017568	TAC	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318030
6	NC_017568	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318030
7	NC_017568	TGG	2	6	691	696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318030
8	NC_017568	AAT	2	6	752	757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318030
9	NC_017568	AAG	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
10	NC_017568	AAG	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
11	NC_017568	AGA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
12	NC_017568	ACC	2	6	1063	1068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318030
13	NC_017568	GAA	3	9	1109	1117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
14	NC_017568	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318030
15	NC_017568	GAA	2	6	1460	1465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
16	NC_017568	TGG	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318030
17	NC_017568	ACA	2	6	1484	1489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318030
18	NC_017568	GAT	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318031
19	NC_017568	ATT	2	6	1782	1787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
20	NC_017568	CGA	2	6	1869	1874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318031
21	NC_017568	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
22	NC_017568	CTT	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318031
23	NC_017568	ATT	2	6	2012	2017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
24	NC_017568	AAG	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
25	NC_017568	CAA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318031
26	NC_017568	TGA	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318031
27	NC_017568	CAT	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318031
28	NC_017568	ACA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318031
29	NC_017568	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
30	NC_017568	GAA	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
31	NC_017568	TCA	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318031
32	NC_017568	TTC	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318031
33	NC_017568	TAT	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
34	NC_017568	TTA	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
35	NC_017568	CGT	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318031
36	NC_017568	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318031
37	NC_017568	TCA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318031
38	NC_017568	TCT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318031
39	NC_017568	AGA	2	6	2692	2697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
40	NC_017568	ATG	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318031
41	NC_017568	GGC	2	6	2720	2725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318031
42	NC_017568	GAA	2	6	2786	2791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
43	NC_017568	GAC	2	6	2846	2851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318031
44	NC_017568	TTG	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318032
45	NC_017568	GAA	2	6	3262	3267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318032
46	NC_017568	GCA	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318032
47	NC_017568	GGA	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386318032
48	NC_017568	AGC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318032
49	NC_017568	TCA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318032
50	NC_017568	AAC	3	9	3570	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318032
51	NC_017568	GAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318032
52	NC_017568	AAG	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318032
53	NC_017568	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318033
54	NC_017568	GGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318033
55	NC_017568	TCT	2	6	4112	4117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318033
56	NC_017568	CGT	2	6	4138	4143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318033
57	NC_017568	CAT	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318033
58	NC_017568	TTA	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318034
59	NC_017568	ACG	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318034
60	NC_017568	ATG	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318034
61	NC_017568	GTC	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318034
62	NC_017568	CAC	2	6	4597	4602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318034
63	NC_017568	AAC	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318034
64	NC_017568	ATT	2	6	4702	4707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318034
65	NC_017568	ACG	2	6	4740	4745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318034
66	NC_017568	ATC	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318034
67	NC_017568	GCA	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318034
68	NC_017568	AGA	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318034
69	NC_017568	CAA	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318034
70	NC_017568	AGA	2	6	4955	4960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318034
71	NC_017568	CAA	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318034
72	NC_017568	TGA	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318034
73	NC_017568	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318034
74	NC_017568	AAC	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
75	NC_017568	CAT	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
76	NC_017568	AGT	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
77	NC_017568	TGG	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318035
78	NC_017568	CGG	3	9	5679	5687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318035
79	NC_017568	GGT	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318035
80	NC_017568	TCA	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
81	NC_017568	GTA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
82	NC_017568	TCA	3	9	5787	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
83	NC_017568	ACA	2	6	5902	5907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
84	NC_017568	GAA	2	6	5998	6003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318035
85	NC_017568	ATG	2	6	6086	6091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
86	NC_017568	TCA	2	6	6105	6110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
87	NC_017568	CAA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
88	NC_017568	AGA	2	6	6288	6293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318035
89	NC_017568	CAG	2	6	6335	6340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318035
90	NC_017568	TTG	2	6	6419	6424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318035
91	NC_017568	TCT	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318035
92	NC_017568	CAT	2	6	6483	6488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
93	NC_017568	TGC	2	6	6525	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318035
94	NC_017568	TAG	2	6	6641	6646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
95	NC_017568	ACA	2	6	6764	6769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
96	NC_017568	GGC	2	6	6811	6816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318035
97	NC_017568	GTT	2	6	6897	6902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318035
98	NC_017568	TTC	2	6	6910	6915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318035
99	NC_017568	ACC	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318035
100	NC_017568	TAT	2	6	7003	7008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318035
101	NC_017568	ACA	2	6	7123	7128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
102	NC_017568	GAT	2	6	7168	7173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
103	NC_017568	TCG	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318035
104	NC_017568	TCG	2	6	7451	7456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318036
105	NC_017568	ATT	2	6	7715	7720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318036
106	NC_017568	CAC	2	6	7864	7869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318036
107	NC_017568	ACA	2	6	7870	7875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318036
108	NC_017568	GTG	2	6	8068	8073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318036
109	NC_017568	TGA	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
110	NC_017568	CAT	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318036
111	NC_017568	AAG	2	6	8392	8397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
112	NC_017568	CGT	3	9	8403	8411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318036
113	NC_017568	TGA	2	6	8486	8491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
114	NC_017568	GAA	2	6	8697	8702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
115	NC_017568	GAA	2	6	8724	8729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
116	NC_017568	CGA	2	6	8756	8761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318036
117	NC_017568	TCG	2	6	8762	8767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318036
118	NC_017568	GGT	2	6	8784	8789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318036
119	NC_017568	AGA	2	6	8801	8806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
120	NC_017568	AGA	2	6	8822	8827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
121	NC_017568	AAC	2	6	8853	8858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318036
122	NC_017568	TGA	2	6	8936	8941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
123	NC_017568	GAC	2	6	8963	8968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318036
124	NC_017568	TGT	2	6	8986	8991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318036
125	NC_017568	GAT	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
126	NC_017568	GAA	2	6	9144	9149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
127	NC_017568	TGA	4	12	9251	9262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
128	NC_017568	TGC	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318036
129	NC_017568	TGA	2	6	9407	9412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
130	NC_017568	AGA	2	6	9500	9505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
131	NC_017568	CGA	2	6	9599	9604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318036
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133	NC_017568	GAA	2	6	9743	9748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
134	NC_017568	AGA	2	6	9755	9760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
135	NC_017568	TGA	2	6	9800	9805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
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159	NC_017568	ACG	2	6	12671	12676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318038
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252	NC_017568	ATC	2	6	19486	19491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318044
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254	NC_017568	AAC	2	6	19600	19605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318044
255	NC_017568	ATC	2	6	19644	19649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318044
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258	NC_017568	ATC	2	6	19858	19863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318044
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