MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis ATCC 12394 chromosome

Total Repeats: 647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017567	ATTGAA	2	12	1322	1333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386315973
2	NC_017567	GATTCA	2	12	6825	6836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386315979
3	NC_017567	ATTTTC	2	12	7071	7082	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386315979
4	NC_017567	CTTAAC	2	12	7584	7595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386315979
5	NC_017567	CATTAA	2	12	10083	10094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386315980
6	NC_017567	AAAGAG	2	12	15523	15534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386315987
7	NC_017567	GATATT	2	12	31545	31556	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386315994
8	NC_017567	AGTCAA	2	12	36631	36642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386315997
9	NC_017567	TTTCAG	2	12	41458	41469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386316002
10	NC_017567	TGACTT	2	12	42043	42054	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386316002
11	NC_017567	AGAGGC	2	12	49126	49137	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386316007
12	NC_017567	GAGGGA	2	12	53846	53857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386316014
13	NC_017567	TAACTC	2	12	55401	55412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386316015
14	NC_017567	CCAGAT	2	12	57672	57683	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386316017
15	NC_017567	GCCTTT	2	12	59902	59913	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386316018
16	NC_017567	TATGCT	2	12	60954	60965	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386316020
17	NC_017567	AAAGGT	2	12	66249	66260	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386316024
18	NC_017567	CTTGTT	2	12	67019	67030	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386316025
19	NC_017567	CGCAAT	2	12	68871	68882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386316029
20	NC_017567	ACATCA	2	12	69419	69430	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386316030
21	NC_017567	TAAAGG	2	12	73524	73535	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386316039
22	NC_017567	AAATTA	2	12	74586	74597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386316042
23	NC_017567	ATTGAA	2	12	77662	77673	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386316046
24	NC_017567	GTAAAG	2	12	78347	78358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386316048
25	NC_017567	TTTTAG	2	12	91089	91100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386316056
26	NC_017567	ACAAAA	2	12	91138	91149	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386316056
27	NC_017567	AGAACT	2	12	96352	96363	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386316059
28	NC_017567	TTGGCT	2	12	98017	98028	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386316060
29	NC_017567	ATGGTT	2	12	99695	99706	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386316062
30	NC_017567	CGAAGG	2	12	111664	111675	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386316069
31	NC_017567	CTGGTA	2	12	113661	113672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386316069
32	NC_017567	TCGTAT	2	12	117663	117674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386316076
33	NC_017567	TTTATT	2	12	118366	118377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386316078
34	NC_017567	TGATAG	2	12	121043	121054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386316081
35	NC_017567	GAAAAG	2	12	125403	125414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386316088
36	NC_017567	AACCTT	2	12	128736	128747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386316092
37	NC_017567	CAGCAA	2	12	129490	129501	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386316093
38	NC_017567	CACCAA	2	12	132733	132744	50 %	0 %	0 %	50 %	386316094
39	NC_017567	AAGGAA	2	12	155978	155989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386316112
40	NC_017567	TTGCCA	2	12	157353	157364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386316114
41	NC_017567	ATTTGA	2	12	171202	171213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386316129
42	NC_017567	AGATGA	2	12	172834	172845	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386316131
43	NC_017567	TTAATG	2	12	173709	173720	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386316131
44	NC_017567	GTAATG	2	12	178510	178521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386316136
45	NC_017567	TTGATA	2	12	179477	179488	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386316137
46	NC_017567	TATTTC	2	12	179928	179939	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386316137
47	NC_017567	CAAAAG	2	12	180056	180067	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386316137
48	NC_017567	GTACCA	2	12	180496	180507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386316137
49	NC_017567	TAGCAA	2	12	183203	183214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386316142
50	NC_017567	GATAAA	2	12	184866	184877	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386316144
51	NC_017567	AGCTAT	2	12	186507	186518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386316146
52	NC_017567	GAAAAT	2	12	187474	187485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386316146
53	NC_017567	CAATCA	2	12	188380	188391	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386316147
54	NC_017567	TTACCC	2	12	192262	192273	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386316150
55	NC_017567	GGGACA	2	12	192804	192815	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386316151
56	NC_017567	ATGTTT	2	12	196597	196608	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386316154
57	NC_017567	CAGTAG	2	12	204893	204904	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386316163
58	NC_017567	AGAAAA	2	12	206025	206036	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386316163
59	NC_017567	GAAGCA	2	12	206059	206070	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386316163
60	NC_017567	CAAGGA	2	12	208042	208053	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386316164
61	NC_017567	GCAGAA	2	12	210900	210911	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386316165
62	NC_017567	TGTCAT	2	12	212536	212547	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386316167
63	NC_017567	TAAATC	2	12	214786	214797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386316169
64	NC_017567	AGATCA	2	12	218923	218934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386316171
65	NC_017567	CAAGAC	2	12	221966	221977	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386316173
66	NC_017567	AGTAGC	2	12	223824	223835	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386316177
67	NC_017567	TGAAAA	2	12	223922	223933	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386316177
68	NC_017567	AGAAAC	2	12	225853	225864	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386316178
69	NC_017567	TTTGGC	2	12	229176	229187	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386316181
70	NC_017567	GGAAGT	2	12	231185	231196	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386316181
71	NC_017567	GCTTTT	2	12	253022	253033	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386316204
72	NC_017567	AAAGAT	2	12	255188	255199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386316207
73	NC_017567	TTTGAT	2	12	255487	255498	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386316207
74	NC_017567	AAGGGA	2	12	255792	255803	50 %	0 %	50 %	0 %	386316207
75	NC_017567	TCGTTA	2	12	260007	260018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386316213
76	NC_017567	GCACAA	2	12	260314	260325	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386316214
77	NC_017567	TAATAG	2	12	268390	268401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386316222
78	NC_017567	GGTAAA	2	12	268878	268889	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386316224
79	NC_017567	GGTTGC	2	12	270801	270812	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386316227
80	NC_017567	AGAATT	2	12	278259	278270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386316238
81	NC_017567	CATATG	2	12	282212	282223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386316242
82	NC_017567	TATCCT	2	12	302626	302637	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386316261
83	NC_017567	CCGACA	2	12	303810	303821	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386316263
84	NC_017567	GACTTG	2	12	311879	311890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386316270
85	NC_017567	CATCGT	2	12	313052	313063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386316270
86	NC_017567	AATTAG	2	12	314439	314450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386316271
87	NC_017567	TTAGTC	2	12	316123	316134	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386316273
88	NC_017567	TCCTAT	2	12	317340	317351	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386316275
89	NC_017567	AGGCTA	2	12	317913	317924	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386316275
90	NC_017567	GTTAAC	2	12	319261	319272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386316276
91	NC_017567	AAACCA	2	12	322832	322843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386316280
92	NC_017567	TAAAAT	2	12	323199	323210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386316280
93	NC_017567	TGGCAA	2	12	324175	324186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386316282
94	NC_017567	TTCTGC	2	12	324281	324292	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386316282
95	NC_017567	CCAGAA	2	12	324507	324518	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386316282
96	NC_017567	GGCGGA	2	12	328284	328295	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386316284
97	NC_017567	AAAAGC	2	12	342160	342171	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386316297
98	NC_017567	GAAACA	2	12	342341	342352	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386316297
99	NC_017567	CTTATT	2	12	344539	344550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386316299
100	NC_017567	TCAGGT	2	12	345536	345547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386316300
101	NC_017567	TAAAAA	2	12	357541	357552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386316307
102	NC_017567	TATGGA	2	12	366076	366087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386316319
103	NC_017567	TCAAGA	2	12	368437	368448	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386316321
104	NC_017567	CTAAAG	2	12	369483	369494	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386316322
105	NC_017567	ACCAAG	2	12	377386	377397	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386316328
106	NC_017567	ATCAAT	2	12	381978	381989	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386316333
107	NC_017567	CCAATT	2	12	388291	388302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386316339
108	NC_017567	GCTATT	2	12	388442	388453	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386316339
109	NC_017567	GATTAC	2	12	390913	390924	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386316341
110	NC_017567	GCCTTG	2	12	393933	393944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386316343
111	NC_017567	ACAGCA	2	12	401905	401916	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386316353
112	NC_017567	TATCGC	2	12	410136	410147	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386316364
113	NC_017567	GGACAA	2	12	413682	413693	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386316368
114	NC_017567	AAATTA	2	12	414202	414213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386316368
115	NC_017567	TGAGGT	2	12	415517	415528	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386316370
116	NC_017567	TTTCTT	2	12	419458	419469	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386316374
117	NC_017567	ACCATC	2	12	420153	420164	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386316375
118	NC_017567	TCGTTG	2	12	420299	420310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386316375
119	NC_017567	CCTTGA	2	12	430428	430439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386316385
120	NC_017567	TTTGGC	2	12	434610	434621	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386316390
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231	NC_017567	TAAGAG	2	12	804126	804137	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386316753
232	NC_017567	TGTGAT	2	12	804744	804755	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386316753
233	NC_017567	AAGCTG	2	12	809614	809625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386316758
234	NC_017567	AACTCA	2	12	809959	809970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386316758
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320	NC_017567	CCATTG	2	12	1111941	1111952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386317044
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322	NC_017567	GCTGAT	2	12	1121782	1121793	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386317055
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327	NC_017567	TCCAGT	2	12	1134975	1134986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386317068
328	NC_017567	AGGCTG	2	12	1139209	1139220	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386317071
329	NC_017567	TTTCTC	2	12	1140694	1140705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386317073
330	NC_017567	CAGCAA	2	12	1142169	1142180	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386317074
331	NC_017567	GATAAT	2	12	1144985	1144996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386317077
332	NC_017567	CTTTTG	2	12	1151265	1151276	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386317084
333	NC_017567	AGCATA	2	12	1152579	1152590	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386317084
334	NC_017567	CAGAAT	2	12	1155786	1155797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386317088
335	NC_017567	TATTAC	2	12	1156197	1156208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386317090
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339	NC_017567	ATTTCA	2	12	1167719	1167730	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386317101
340	NC_017567	AAGGCA	2	12	1169560	1169571	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386317102
341	NC_017567	CTACTT	2	12	1172015	1172026	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386317104
342	NC_017567	TCAATA	2	12	1175680	1175691	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386317106
343	NC_017567	AAAGCC	2	12	1177592	1177603	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386317108
344	NC_017567	TATTGC	2	12	1178053	1178064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386317109
345	NC_017567	GAAGTC	2	12	1182317	1182328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386317111
346	NC_017567	AAGTGA	2	12	1183165	1183176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386317112
347	NC_017567	AACTTC	2	12	1183213	1183224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386317112
348	NC_017567	CCAATC	2	12	1185255	1185266	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386317114
349	NC_017567	GATTTA	2	12	1186343	1186354	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386317115
350	NC_017567	TACCTT	2	12	1189609	1189620	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386317117
351	NC_017567	GCCATA	2	12	1197362	1197373	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386317122
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353	NC_017567	TCAAAG	2	12	1198812	1198823	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386317124
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355	NC_017567	GACTTC	2	12	1209519	1209530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386317137
356	NC_017567	GAAATC	2	12	1209942	1209953	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386317137
357	NC_017567	CTGGTC	2	12	1212168	1212179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386317138
358	NC_017567	TGACAT	2	12	1220454	1220465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386317145
359	NC_017567	GCTAAG	2	12	1221694	1221705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386317147
360	NC_017567	AAACGT	2	12	1225157	1225168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386317150
361	NC_017567	ACTTTG	2	12	1227705	1227716	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386317153
362	NC_017567	GCCATA	2	12	1228848	1228859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386317155
363	NC_017567	GGCCGT	2	12	1229138	1229149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386317155
364	NC_017567	TTTACG	2	12	1233327	1233338	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386317160
365	NC_017567	CACGCT	2	12	1234868	1234879	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386317160
366	NC_017567	TTCAAA	2	12	1239828	1239839	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386317166
367	NC_017567	GGTAGC	2	12	1244923	1244934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386317168
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369	NC_017567	CTTATC	2	12	1252304	1252315	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386317176
370	NC_017567	AAGGTT	2	12	1256878	1256889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386317180
371	NC_017567	TCTGGA	2	12	1261093	1261104	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386317184
372	NC_017567	CAATAA	2	12	1268401	1268412	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386317190
373	NC_017567	CGGTAA	2	12	1268896	1268907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386317190
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394	NC_017567	TCGCCA	2	12	1331289	1331300	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386317250
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403	NC_017567	CTTTTC	2	12	1375972	1375983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386317297
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439	NC_017567	CGCAAT	2	12	1519067	1519078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386317417
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441	NC_017567	AAAACA	2	12	1520926	1520937	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386317420
442	NC_017567	AAGACC	2	12	1526721	1526732	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386317423
443	NC_017567	CTTTTG	2	12	1527976	1527987	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386317424
444	NC_017567	CTTGGT	2	12	1529791	1529802	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386317427
445	NC_017567	ATCAAA	2	12	1530929	1530940	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386317429
446	NC_017567	CATCTT	2	12	1533102	1533113	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386317430
447	NC_017567	TTTCTT	2	12	1534691	1534702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386317432
448	NC_017567	ACCGAT	2	12	1542307	1542318	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386317440
449	NC_017567	GAAGGT	2	12	1543677	1543688	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386317442
450	NC_017567	AGCAAT	2	12	1546458	1546469	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386317446
451	NC_017567	AGAATT	2	12	1546555	1546566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386317446
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