MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 29921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017563	TTC	2	6	194271	194276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085894
3002	NC_017563	TTC	2	6	194351	194356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085894
3003	NC_017563	CTG	2	6	194362	194367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085894
3004	NC_017563	CAG	2	6	194371	194376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085894
3005	NC_017563	CAT	2	6	194414	194419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085894
3006	NC_017563	CTT	2	6	194424	194429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085894
3007	NC_017563	GAA	2	6	194514	194519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085894
3008	NC_017563	TTA	2	6	194552	194557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085895
3009	NC_017563	CAAGT	2	10	194660	194669	40 %	20 %	20 %	20 %	386085895
3010	NC_017563	CTG	2	6	194672	194677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085895
3011	NC_017563	ATG	2	6	194788	194793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085895
3012	NC_017563	TTGGT	2	10	194885	194894	0 %	60 %	40 %	0 %	386085895
3013	NC_017563	TGC	2	6	194994	194999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085895
3014	NC_017563	AGT	2	6	195063	195068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085895
3015	NC_017563	ATA	2	6	195171	195176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085896
3016	NC_017563	TTGT	2	8	195203	195210	0 %	75 %	25 %	0 %	386085896
3017	NC_017563	TTG	2	6	195219	195224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085896
3018	NC_017563	TGGA	2	8	195293	195300	25 %	25 %	50 %	0 %	386085896
3019	NC_017563	AGA	2	6	195301	195306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085896
3020	NC_017563	AAG	2	6	195375	195380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085896
3021	NC_017563	CCA	2	6	195454	195459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085896
3022	NC_017563	ACC	2	6	195549	195554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085896
3023	NC_017563	TGA	2	6	195622	195627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085896
3024	NC_017563	GAC	2	6	195667	195672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085896
3025	NC_017563	GTTGCT	2	12	195689	195700	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386085896
3026	NC_017563	TGG	2	6	195716	195721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085896
3027	NC_017563	AAG	2	6	195735	195740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085896
3028	NC_017563	TAT	2	6	195784	195789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085896
3029	NC_017563	TAA	2	6	195805	195810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085896
3030	NC_017563	CAG	2	6	195813	195818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085896
3031	NC_017563	A	6	6	195885	195890	100 %	0 %	0 %	0 %	386085896
3032	NC_017563	GAA	2	6	195941	195946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085896
3033	NC_017563	CAAT	2	8	196021	196028	50 %	25 %	0 %	25 %	386085896
3034	NC_017563	CAC	2	6	196233	196238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085897
3035	NC_017563	GCT	2	6	196379	196384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085897
3036	NC_017563	A	6	6	196386	196391	100 %	0 %	0 %	0 %	386085897
3037	NC_017563	AGA	2	6	196396	196401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085897
3038	NC_017563	GTT	2	6	196415	196420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085897
3039	NC_017563	ATCGGT	2	12	196421	196432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386085897
3040	NC_017563	AGC	2	6	196453	196458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085897
3041	NC_017563	CTT	2	6	196465	196470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085897
3042	NC_017563	CAAA	2	8	196493	196500	75 %	0 %	0 %	25 %	386085897
3043	NC_017563	AGA	2	6	196501	196506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085897
3044	NC_017563	CAC	2	6	196515	196520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085897
3045	NC_017563	TCA	2	6	196547	196552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085897
3046	NC_017563	CTTG	2	8	196567	196574	0 %	50 %	25 %	25 %	386085897
3047	NC_017563	AAC	3	9	196624	196632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085897
3048	NC_017563	CTT	2	6	196667	196672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085897
3049	NC_017563	AAG	3	9	196689	196697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085897
3050	NC_017563	CAA	2	6	196716	196721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085897
3051	NC_017563	TGT	2	6	196780	196785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085897
3052	NC_017563	GAT	2	6	196790	196795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085897
3053	NC_017563	GTG	2	6	197032	197037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085897
3054	NC_017563	CT	3	6	197119	197124	0 %	50 %	0 %	50 %	386085897
3055	NC_017563	AAG	2	6	197139	197144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085897
3056	NC_017563	TGT	2	6	197167	197172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085897
3057	NC_017563	GTT	2	6	197198	197203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085897
3058	NC_017563	TTC	2	6	197292	197297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085897
3059	NC_017563	ATC	2	6	197372	197377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085897
3060	NC_017563	CTT	2	6	197380	197385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085897
3061	NC_017563	AACC	2	8	197435	197442	50 %	0 %	0 %	50 %	386085897
3062	NC_017563	CTT	2	6	197477	197482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085897
3063	NC_017563	GAA	2	6	197498	197503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085897
3064	NC_017563	CGCT	2	8	197521	197528	0 %	25 %	25 %	50 %	386085897
3065	NC_017563	GCT	2	6	197817	197822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085898
3066	NC_017563	GTAC	2	8	198048	198055	25 %	25 %	25 %	25 %	386085898
3067	NC_017563	TGG	2	6	198071	198076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085898
3068	NC_017563	A	6	6	198117	198122	100 %	0 %	0 %	0 %	386085898
3069	NC_017563	AGA	2	6	198209	198214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085898
3070	NC_017563	GAT	3	9	198393	198401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085898
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3072	NC_017563	TTG	2	6	198578	198583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085899
3073	NC_017563	TTG	2	6	198603	198608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085899
3074	NC_017563	GCCGTC	2	12	198624	198635	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386085899
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3078	NC_017563	ATCGT	2	10	198741	198750	20 %	40 %	20 %	20 %	386085899
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3081	NC_017563	AAG	2	6	198864	198869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085899
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3089	NC_017563	CCTA	2	8	199371	199378	25 %	25 %	0 %	50 %	386085900
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3091	NC_017563	TGA	2	6	199542	199547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085900
3092	NC_017563	TGA	2	6	199568	199573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085900
3093	NC_017563	CAG	2	6	199714	199719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085900
3094	NC_017563	GGT	2	6	199768	199773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085900
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3099	NC_017563	TTGG	2	8	199876	199883	0 %	50 %	50 %	0 %	386085901
3100	NC_017563	TAG	2	6	199982	199987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085901
3101	NC_017563	ATT	2	6	200000	200005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085901
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3103	NC_017563	T	6	6	200055	200060	0 %	100 %	0 %	0 %	386085901
3104	NC_017563	TGA	2	6	200103	200108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085901
3105	NC_017563	TTGGTT	2	12	200141	200152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085901
3106	NC_017563	GCA	2	6	200167	200172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085901
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3108	NC_017563	A	7	7	200264	200270	100 %	0 %	0 %	0 %	386085901
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3111	NC_017563	TAT	2	6	200324	200329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085901
3112	NC_017563	ACT	2	6	200346	200351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085901
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3117	NC_017563	TG	3	6	200636	200641	0 %	50 %	50 %	0 %	386085902
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3121	NC_017563	GGT	2	6	200789	200794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085902
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3346	NC_017563	GATG	2	8	214444	214451	25 %	25 %	50 %	0 %	386085916
3347	NC_017563	GCA	2	6	214471	214476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085916
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3350	NC_017563	ACCT	2	8	214725	214732	25 %	25 %	0 %	50 %	386085916
3351	NC_017563	CAAC	2	8	214764	214771	50 %	0 %	0 %	50 %	386085916
3352	NC_017563	TGG	2	6	214774	214779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085916
3353	NC_017563	TGA	2	6	214789	214794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085916
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3355	NC_017563	GGT	3	9	214943	214951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085916
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3357	NC_017563	GTG	2	6	215052	215057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085916
3358	NC_017563	AAG	2	6	215078	215083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085916
3359	NC_017563	TAT	2	6	215092	215097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085916
3360	NC_017563	ATG	2	6	215129	215134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085916
3361	NC_017563	ACT	2	6	215319	215324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085916
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3363	NC_017563	GACA	2	8	215500	215507	50 %	0 %	25 %	25 %	386085916
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3487	NC_017563	GAT	2	6	223938	223943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085925
3488	NC_017563	ATCAA	2	10	223969	223978	60 %	20 %	0 %	20 %	386085925
3489	NC_017563	ATG	2	6	223980	223985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085925
3490	NC_017563	TAG	2	6	224293	224298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085925
3491	NC_017563	CTC	2	6	224380	224385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085925
3492	NC_017563	CGT	2	6	224403	224408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085925
3493	NC_017563	GATG	2	8	224417	224424	25 %	25 %	50 %	0 %	386085925
3494	NC_017563	TGG	2	6	224456	224461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085925
3495	NC_017563	CATGCC	2	12	224523	224534	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386085925
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