MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 29921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017563	TCA	2	6	99780	99785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085791
1502	NC_017563	TAA	2	6	99805	99810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085791
1503	NC_017563	TCT	2	6	99811	99816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085791
1504	NC_017563	TCA	2	6	100113	100118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085791
1505	NC_017563	TGA	2	6	100126	100131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085791
1506	NC_017563	GAT	2	6	100166	100171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085791
1507	NC_017563	GTG	2	6	100258	100263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085792
1508	NC_017563	GAAA	2	8	100264	100271	75 %	0 %	25 %	0 %	386085792
1509	NC_017563	GGT	2	6	100568	100573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085792
1510	NC_017563	ATT	2	6	100643	100648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085792
1511	NC_017563	A	6	6	100666	100671	100 %	0 %	0 %	0 %	386085792
1512	NC_017563	AGGT	2	8	100677	100684	25 %	25 %	50 %	0 %	386085792
1513	NC_017563	GTT	2	6	100697	100702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085792
1514	NC_017563	AGA	2	6	100714	100719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085792
1515	NC_017563	GAA	2	6	100775	100780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085792
1516	NC_017563	AGA	2	6	100828	100833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085792
1517	NC_017563	TCT	2	6	100834	100839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085792
1518	NC_017563	AGC	2	6	100843	100848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085792
1519	NC_017563	TCA	2	6	100859	100864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085792
1520	NC_017563	ATGT	2	8	101327	101334	25 %	50 %	25 %	0 %	386085793
1521	NC_017563	TCG	2	6	101404	101409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085793
1522	NC_017563	GAT	2	6	101465	101470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085793
1523	NC_017563	GGC	2	6	101482	101487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085793
1524	NC_017563	TTA	2	6	101595	101600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085793
1525	NC_017563	TTGA	2	8	101636	101643	25 %	50 %	25 %	0 %	386085793
1526	NC_017563	CAA	2	6	101719	101724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085793
1527	NC_017563	GA	3	6	101829	101834	50 %	0 %	50 %	0 %	386085793
1528	NC_017563	TGG	2	6	101932	101937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085793
1529	NC_017563	GCTTC	2	10	102124	102133	0 %	40 %	20 %	40 %	386085793
1530	NC_017563	ACA	2	6	102145	102150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085793
1531	NC_017563	ATG	2	6	102189	102194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085793
1532	NC_017563	AGA	2	6	102244	102249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085793
1533	NC_017563	AAGCC	2	10	102253	102262	40 %	0 %	20 %	40 %	386085793
1534	NC_017563	GGC	2	6	102292	102297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085793
1535	NC_017563	GAT	2	6	102302	102307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085793
1536	NC_017563	CTGTT	2	10	102333	102342	0 %	60 %	20 %	20 %	386085793
1537	NC_017563	ATG	2	6	102375	102380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085793
1538	NC_017563	A	6	6	102402	102407	100 %	0 %	0 %	0 %	386085793
1539	NC_017563	GAA	3	9	102434	102442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085793
1540	NC_017563	TGA	2	6	102448	102453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085793
1541	NC_017563	AGC	2	6	102484	102489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085793
1542	NC_017563	CAA	2	6	102496	102501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085793
1543	NC_017563	CAG	2	6	102513	102518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085793
1544	NC_017563	TGA	2	6	102529	102534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085793
1545	NC_017563	GCT	2	6	102539	102544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085793
1546	NC_017563	CTT	2	6	102557	102562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085793
1547	NC_017563	AGG	2	6	102570	102575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085793
1548	NC_017563	TTA	2	6	102616	102621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085794
1549	NC_017563	A	6	6	102769	102774	100 %	0 %	0 %	0 %	386085794
1550	NC_017563	TTA	2	6	102868	102873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085794
1551	NC_017563	AGA	2	6	102944	102949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085794
1552	NC_017563	GTTG	2	8	102950	102957	0 %	50 %	50 %	0 %	386085794
1553	NC_017563	TGA	2	6	102968	102973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085794
1554	NC_017563	TGAA	2	8	103276	103283	50 %	25 %	25 %	0 %	386085795
1555	NC_017563	TGT	2	6	103316	103321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085795
1556	NC_017563	TGA	2	6	103382	103387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085795
1557	NC_017563	CTT	2	6	103539	103544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085796
1558	NC_017563	AGA	2	6	103604	103609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085796
1559	NC_017563	GAG	2	6	103660	103665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085796
1560	NC_017563	CAA	2	6	103829	103834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085797
1561	NC_017563	AGC	2	6	103860	103865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085797
1562	NC_017563	GCT	2	6	103945	103950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085797
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1564	NC_017563	TCT	2	6	103968	103973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085797
1565	NC_017563	ATTT	2	8	103998	104005	25 %	75 %	0 %	0 %	386085797
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1568	NC_017563	AAAC	2	8	104135	104142	75 %	0 %	0 %	25 %	386085798
1569	NC_017563	AAG	2	6	104205	104210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085798
1570	NC_017563	TCA	2	6	104267	104272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085798
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1573	NC_017563	TTA	2	6	104320	104325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085798
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1580	NC_017563	A	7	7	104804	104810	100 %	0 %	0 %	0 %	386085799
1581	NC_017563	GAAA	2	8	104851	104858	75 %	0 %	25 %	0 %	386085799
1582	NC_017563	ATCA	2	8	104876	104883	50 %	25 %	0 %	25 %	386085799
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1585	NC_017563	CAG	2	6	105069	105074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085799
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1589	NC_017563	AT	3	6	105321	105326	50 %	50 %	0 %	0 %	386085800
1590	NC_017563	CAG	2	6	105353	105358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085800
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1592	NC_017563	GAT	2	6	105421	105426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085800
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1595	NC_017563	TGA	2	6	105567	105572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085800
1596	NC_017563	TCA	2	6	105592	105597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085800
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1598	NC_017563	TC	3	6	105714	105719	0 %	50 %	0 %	50 %	386085800
1599	NC_017563	GGC	2	6	105726	105731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085800
1600	NC_017563	TGA	2	6	105819	105824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085800
1601	NC_017563	ATC	2	6	105830	105835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085800
1602	NC_017563	ATT	2	6	105871	105876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085800
1603	NC_017563	CTT	2	6	105901	105906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085800
1604	NC_017563	A	6	6	105958	105963	100 %	0 %	0 %	0 %	386085800
1605	NC_017563	GCT	2	6	106045	106050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085800
1606	NC_017563	TTA	2	6	106100	106105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085800
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1608	NC_017563	TGA	2	6	106524	106529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085801
1609	NC_017563	AAATG	2	10	106539	106548	60 %	20 %	20 %	0 %	386085801
1610	NC_017563	GAC	2	6	106554	106559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085801
1611	NC_017563	AAC	2	6	106561	106566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085801
1612	NC_017563	GAT	2	6	106684	106689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085801
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1614	NC_017563	CT	3	6	106722	106727	0 %	50 %	0 %	50 %	386085801
1615	NC_017563	CGA	2	6	106790	106795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085801
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1617	NC_017563	ATC	3	9	106835	106843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085801
1618	NC_017563	TAT	2	6	106846	106851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085801
1619	NC_017563	TGA	2	6	106863	106868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085801
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1993	NC_017563	CAA	2	6	128019	128024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085824
1994	NC_017563	TGA	2	6	128114	128119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085824
1995	NC_017563	A	6	6	128124	128129	100 %	0 %	0 %	0 %	386085824
1996	NC_017563	AGGA	2	8	128173	128180	50 %	0 %	50 %	0 %	386085824
1997	NC_017563	GAA	2	6	128184	128189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085824
1998	NC_017563	GCA	2	6	128193	128198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085824
1999	NC_017563	GAT	2	6	128250	128255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085824
2000	NC_017563	CGG	2	6	128263	128268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085824

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