MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 29921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017563	GAA	2	6	312807	312812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086017
5003	NC_017563	GAA	2	6	312909	312914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086017
5004	NC_017563	ACG	2	6	312958	312963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086017
5005	NC_017563	TCT	2	6	312974	312979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086017
5006	NC_017563	GAA	2	6	312992	312997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086017
5007	NC_017563	TGA	2	6	313086	313091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086017
5008	NC_017563	AAGTT	2	10	313103	313112	40 %	40 %	20 %	0 %	386086017
5009	NC_017563	T	6	6	313143	313148	0 %	100 %	0 %	0 %	386086017
5010	NC_017563	TCA	2	6	313154	313159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086017
5011	NC_017563	GT	3	6	313230	313235	0 %	50 %	50 %	0 %	386086017
5012	NC_017563	CTG	2	6	313242	313247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386086017
5013	NC_017563	GTA	2	6	313327	313332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086017
5014	NC_017563	TCT	2	6	313397	313402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086017
5015	NC_017563	CTT	2	6	313479	313484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086017
5016	NC_017563	CAC	2	6	313578	313583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386086017
5017	NC_017563	ACG	2	6	313666	313671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086017
5018	NC_017563	GT	3	6	313722	313727	0 %	50 %	50 %	0 %	386086017
5019	NC_017563	AGC	2	6	313768	313773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086017
5020	NC_017563	TCT	2	6	313841	313846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086017
5021	NC_017563	ATC	2	6	313870	313875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086017
5022	NC_017563	TTC	2	6	313903	313908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086017
5023	NC_017563	AAG	2	6	313918	313923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086017
5024	NC_017563	T	6	6	314258	314263	0 %	100 %	0 %	0 %	386086018
5025	NC_017563	AAC	2	6	314318	314323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386086018
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5027	NC_017563	AT	3	6	314487	314492	50 %	50 %	0 %	0 %	386086018
5028	NC_017563	TCC	2	6	314558	314563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386086018
5029	NC_017563	TGTA	2	8	314588	314595	25 %	50 %	25 %	0 %	386086018
5030	NC_017563	TGTTT	2	10	314603	314612	0 %	80 %	20 %	0 %	386086018
5031	NC_017563	GAA	2	6	314717	314722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086019
5032	NC_017563	CAA	2	6	314728	314733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386086019
5033	NC_017563	GAT	3	9	314753	314761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086019
5034	NC_017563	TCT	2	6	314779	314784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086019
5035	NC_017563	AAGCT	2	10	314883	314892	40 %	20 %	20 %	20 %	386086019
5036	NC_017563	TTGAC	2	10	314898	314907	20 %	40 %	20 %	20 %	386086019
5037	NC_017563	GAC	2	6	315005	315010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086019
5038	NC_017563	ACC	2	6	315089	315094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386086019
5039	NC_017563	AAG	2	6	315153	315158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086019
5040	NC_017563	CCAA	2	8	315176	315183	50 %	0 %	0 %	50 %	386086019
5041	NC_017563	GAA	2	6	315185	315190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086019
5042	NC_017563	ATG	2	6	315226	315231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086019
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5044	NC_017563	CAT	2	6	315302	315307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086019
5045	NC_017563	TCT	2	6	315363	315368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086019
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5048	NC_017563	T	6	6	315479	315484	0 %	100 %	0 %	0 %	386086019
5049	NC_017563	TGAG	2	8	315496	315503	25 %	25 %	50 %	0 %	386086019
5050	NC_017563	CCCAA	2	10	315508	315517	40 %	0 %	0 %	60 %	386086019
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5053	NC_017563	TAG	2	6	315632	315637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086020
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5055	NC_017563	CCA	2	6	315698	315703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386086020
5056	NC_017563	TGC	2	6	315793	315798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386086020
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5058	NC_017563	CAT	2	6	315844	315849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086020
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5061	NC_017563	AAG	3	9	315967	315975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086020
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5064	NC_017563	GA	4	8	316012	316019	50 %	0 %	50 %	0 %	386086020
5065	NC_017563	GTA	2	6	316021	316026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086020
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5102	NC_017563	AAT	3	9	317498	317506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386086021
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5104	NC_017563	CCCT	2	8	317988	317995	0 %	25 %	0 %	75 %	386086022
5105	NC_017563	AAG	2	6	318006	318011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086022
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5111	NC_017563	CAG	3	9	318447	318455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086022
5112	NC_017563	TGGTT	2	10	318460	318469	0 %	60 %	40 %	0 %	386086022
5113	NC_017563	TAC	2	6	318476	318481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086022
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5117	NC_017563	AATCA	2	10	318835	318844	60 %	20 %	0 %	20 %	386086023
5118	NC_017563	TAAG	2	8	318867	318874	50 %	25 %	25 %	0 %	386086023
5119	NC_017563	TTC	2	6	318958	318963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086023
5120	NC_017563	TCTT	2	8	318971	318978	0 %	75 %	0 %	25 %	386086023
5121	NC_017563	ATC	2	6	318982	318987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086023
5122	NC_017563	AAG	2	6	319024	319029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086023
5123	NC_017563	TCA	2	6	319184	319189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086023
5124	NC_017563	T	6	6	319216	319221	0 %	100 %	0 %	0 %	386086023
5125	NC_017563	TGA	2	6	319290	319295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086023
5126	NC_017563	GTG	2	6	319296	319301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386086023
5127	NC_017563	GAC	2	6	319347	319352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086023
5128	NC_017563	AAC	2	6	319363	319368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386086023
5129	NC_017563	T	6	6	319401	319406	0 %	100 %	0 %	0 %	386086023
5130	NC_017563	CAAT	2	8	319464	319471	50 %	25 %	0 %	25 %	386086023
5131	NC_017563	T	7	7	319471	319477	0 %	100 %	0 %	0 %	386086023
5132	NC_017563	CTTT	2	8	319761	319768	0 %	75 %	0 %	25 %	386086024
5133	NC_017563	CAA	2	6	319845	319850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386086024
5134	NC_017563	TGA	2	6	319875	319880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086024
5135	NC_017563	CTT	2	6	319936	319941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086024
5136	NC_017563	T	6	6	319956	319961	0 %	100 %	0 %	0 %	386086024
5137	NC_017563	ATC	2	6	320024	320029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086024
5138	NC_017563	GAT	2	6	320050	320055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086024
5139	NC_017563	CAG	2	6	320094	320099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086024
5140	NC_017563	TTGCGA	2	12	320292	320303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386086024
5141	NC_017563	AGCT	2	8	320416	320423	25 %	25 %	25 %	25 %	386086024
5142	NC_017563	CAT	2	6	320427	320432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086024
5143	NC_017563	GGGATT	2	12	320479	320490	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386086024
5144	NC_017563	AAC	2	6	320627	320632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386086024
5145	NC_017563	GCA	2	6	320732	320737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086024
5146	NC_017563	TGG	2	6	320749	320754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386086024
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5149	NC_017563	ATG	2	6	320876	320881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086024
5150	NC_017563	CT	3	6	320882	320887	0 %	50 %	0 %	50 %	386086024
5151	NC_017563	CTT	2	6	320935	320940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386086024
5152	NC_017563	CTTA	2	8	320999	321006	25 %	50 %	0 %	25 %	386086024
5153	NC_017563	GTC	2	6	321020	321025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386086024
5154	NC_017563	TAT	2	6	321052	321057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386086024
5155	NC_017563	TCA	2	6	321090	321095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086024
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5158	NC_017563	GAT	2	6	321648	321653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086025
5159	NC_017563	ACGGTG	2	12	321661	321672	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386086025
5160	NC_017563	ATT	2	6	321678	321683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386086025
5161	NC_017563	TCA	2	6	321743	321748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086025
5162	NC_017563	AGG	2	6	321805	321810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386086025
5163	NC_017563	AG	3	6	321856	321861	50 %	0 %	50 %	0 %	386086026
5164	NC_017563	T	6	6	321912	321917	0 %	100 %	0 %	0 %	386086026
5165	NC_017563	GAT	2	6	321925	321930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086026
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5173	NC_017563	AAACT	2	10	322698	322707	60 %	20 %	0 %	20 %	386086027
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5175	NC_017563	ACT	2	6	322777	322782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086027
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5177	NC_017563	TGG	2	6	322816	322821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386086027
5178	NC_017563	TGG	2	6	322829	322834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386086027
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5211	NC_017563	A	6	6	324602	324607	100 %	0 %	0 %	0 %	386086029
5212	NC_017563	ACG	2	6	324779	324784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086029
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5223	NC_017563	GAA	2	6	325378	325383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086029
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5229	NC_017563	AGA	2	6	325737	325742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086030
5230	NC_017563	GAA	2	6	325822	325827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086031
5231	NC_017563	TCA	2	6	325832	325837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386086031
5232	NC_017563	ATG	2	6	325880	325885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386086031
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5234	NC_017563	GAC	2	6	325908	325913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386086031
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5238	NC_017563	TTG	2	6	326132	326137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386086032
5239	NC_017563	CTC	2	6	326175	326180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386086032
5240	NC_017563	GAA	2	6	326188	326193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386086032
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5242	NC_017563	A	6	6	326386	326391	100 %	0 %	0 %	0 %	386086032
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