MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	AC	3	6	305	310	50 %	0 %	0 %	50 %	387144421
2	NC_017352	TA	3	6	1205	1210	50 %	50 %	0 %	0 %	387144422
3	NC_017352	TA	3	6	1554	1559	50 %	50 %	0 %	0 %	387144423
4	NC_017352	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	387144423
5	NC_017352	AT	3	6	3400	3405	50 %	50 %	0 %	0 %	387144424
6	NC_017352	TA	3	6	5310	5315	50 %	50 %	0 %	0 %	387144426
7	NC_017352	TC	3	6	5801	5806	0 %	50 %	0 %	50 %	387144426
8	NC_017352	AT	3	6	5817	5822	50 %	50 %	0 %	0 %	387144426
9	NC_017352	CT	3	6	8237	8242	0 %	50 %	0 %	50 %	387144427
10	NC_017352	TA	3	6	8311	8316	50 %	50 %	0 %	0 %	387144427
11	NC_017352	AC	3	6	8379	8384	50 %	0 %	0 %	50 %	387144427
12	NC_017352	TA	3	6	8639	8644	50 %	50 %	0 %	0 %	387144428
13	NC_017352	CT	3	6	8905	8910	0 %	50 %	0 %	50 %	387144429
14	NC_017352	TA	3	6	11260	11265	50 %	50 %	0 %	0 %	387144430
15	NC_017352	AT	3	6	12274	12279	50 %	50 %	0 %	0 %	387144431
16	NC_017352	AT	3	6	12430	12435	50 %	50 %	0 %	0 %	387144431
17	NC_017352	AT	3	6	12533	12538	50 %	50 %	0 %	0 %	387144431
18	NC_017352	AG	3	6	12868	12873	50 %	0 %	50 %	0 %	387144431
19	NC_017352	AG	3	6	12896	12901	50 %	0 %	50 %	0 %	387144431
20	NC_017352	TC	3	6	13589	13594	0 %	50 %	0 %	50 %	387144432
21	NC_017352	AG	3	6	15400	15405	50 %	0 %	50 %	0 %	387144433
22	NC_017352	TA	3	6	15406	15411	50 %	50 %	0 %	0 %	387144433
23	NC_017352	CT	3	6	15450	15455	0 %	50 %	0 %	50 %	387144433
24	NC_017352	TA	3	6	16012	16017	50 %	50 %	0 %	0 %	387144434
25	NC_017352	AT	3	6	16136	16141	50 %	50 %	0 %	0 %	387144434
26	NC_017352	TC	3	6	16303	16308	0 %	50 %	0 %	50 %	387144434
27	NC_017352	TA	3	6	17417	17422	50 %	50 %	0 %	0 %	387144436
28	NC_017352	TC	3	6	17478	17483	0 %	50 %	0 %	50 %	387144436
29	NC_017352	AT	3	6	18225	18230	50 %	50 %	0 %	0 %	387144437
30	NC_017352	AT	3	6	18434	18439	50 %	50 %	0 %	0 %	387144437
31	NC_017352	TA	3	6	18531	18536	50 %	50 %	0 %	0 %	387144437
32	NC_017352	AT	3	6	18734	18739	50 %	50 %	0 %	0 %	387144437
33	NC_017352	TA	3	6	19373	19378	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
34	NC_017352	AT	3	6	19732	19737	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
35	NC_017352	GA	3	6	19843	19848	50 %	0 %	50 %	0 %	387144438
36	NC_017352	TA	3	6	20083	20088	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
37	NC_017352	TG	3	6	21360	21365	0 %	50 %	50 %	0 %	387144440
38	NC_017352	GT	3	6	22321	22326	0 %	50 %	50 %	0 %	387144441
39	NC_017352	GC	3	6	22505	22510	0 %	0 %	50 %	50 %	387144441
40	NC_017352	GT	3	6	22732	22737	0 %	50 %	50 %	0 %	387144441
41	NC_017352	TA	3	6	24044	24049	50 %	50 %	0 %	0 %	387144442
42	NC_017352	AT	3	6	24551	24556	50 %	50 %	0 %	0 %	387144442
43	NC_017352	AT	3	6	25860	25865	50 %	50 %	0 %	0 %	387144443
44	NC_017352	GA	3	6	25971	25976	50 %	0 %	50 %	0 %	387144443
45	NC_017352	TA	3	6	26349	26354	50 %	50 %	0 %	0 %	387144444
46	NC_017352	AG	3	6	27770	27775	50 %	0 %	50 %	0 %	387144446
47	NC_017352	AT	3	6	28397	28402	50 %	50 %	0 %	0 %	387144447
48	NC_017352	AT	3	6	29007	29012	50 %	50 %	0 %	0 %	387144447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.