MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 463

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	TCCG	2	8	80	87	0 %	25 %	25 %	50 %	387144421
2	NC_017352	CGG	2	6	137	142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387144421
3	NC_017352	TGA	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144421
4	NC_017352	GTC	2	6	220	225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144421
5	NC_017352	C	6	6	251	256	0 %	0 %	0 %	100 %	387144421
6	NC_017352	AC	3	6	305	310	50 %	0 %	0 %	50 %	387144421
7	NC_017352	GTCC	2	8	375	382	0 %	25 %	25 %	50 %	387144421
8	NC_017352	TCGGT	2	10	466	475	0 %	40 %	40 %	20 %	387144421
9	NC_017352	ACG	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144421
10	NC_017352	GAG	2	6	610	615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387144421
11	NC_017352	CTA	2	6	623	628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144421
12	NC_017352	TGT	2	6	637	642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144421
13	NC_017352	TAT	2	6	878	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144422
14	NC_017352	A	6	6	1027	1032	100 %	0 %	0 %	0 %	387144422
15	NC_017352	CAT	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144422
16	NC_017352	TA	3	6	1205	1210	50 %	50 %	0 %	0 %	387144422
17	NC_017352	TTG	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144422
18	NC_017352	TACT	2	8	1282	1289	25 %	50 %	0 %	25 %	387144422
19	NC_017352	GGT	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144422
20	NC_017352	CCT	2	6	1369	1374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387144422
21	NC_017352	ATG	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
22	NC_017352	TA	3	6	1554	1559	50 %	50 %	0 %	0 %	387144423
23	NC_017352	TCTT	2	8	1623	1630	0 %	75 %	0 %	25 %	387144423
24	NC_017352	GTTTAA	2	12	1698	1709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387144423
25	NC_017352	ATGT	2	8	1857	1864	25 %	50 %	25 %	0 %	387144423
26	NC_017352	TCA	2	6	1925	1930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144423
27	NC_017352	TAA	2	6	1943	1948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144423
28	NC_017352	T	6	6	1951	1956	0 %	100 %	0 %	0 %	387144423
29	NC_017352	TTC	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144423
30	NC_017352	ATG	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
31	NC_017352	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	387144423
32	NC_017352	TAG	2	6	2093	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
33	NC_017352	CTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
34	NC_017352	TCTT	2	8	3089	3096	0 %	75 %	0 %	25 %	387144424
35	NC_017352	T	7	7	3102	3108	0 %	100 %	0 %	0 %	387144424
36	NC_017352	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387144424
37	NC_017352	AAG	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144424
38	NC_017352	ATT	2	6	3261	3266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144424
39	NC_017352	GAA	2	6	3277	3282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144424
40	NC_017352	CTT	2	6	3293	3298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
41	NC_017352	CAT	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144424
42	NC_017352	TCA	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144424
43	NC_017352	AT	3	6	3400	3405	50 %	50 %	0 %	0 %	387144424
44	NC_017352	AAC	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144424
45	NC_017352	GCA	2	6	3478	3483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144424
46	NC_017352	ATA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144424
47	NC_017352	TAA	2	6	3545	3550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144424
48	NC_017352	A	7	7	3549	3555	100 %	0 %	0 %	0 %	387144424
49	NC_017352	TTC	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
50	NC_017352	A	6	6	3654	3659	100 %	0 %	0 %	0 %	387144425
51	NC_017352	AAT	3	9	3710	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
52	NC_017352	T	6	6	3753	3758	0 %	100 %	0 %	0 %	387144425
53	NC_017352	ATA	2	6	3762	3767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
54	NC_017352	TAA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
55	NC_017352	ATA	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
56	NC_017352	ATT	2	6	3863	3868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144425
57	NC_017352	ATTT	2	8	3890	3897	25 %	75 %	0 %	0 %	387144425
58	NC_017352	TAA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
59	NC_017352	TAT	2	6	3953	3958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144425
60	NC_017352	TAA	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
61	NC_017352	ACA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144425
62	NC_017352	TTTA	2	8	4082	4089	25 %	75 %	0 %	0 %	387144425
63	NC_017352	GAA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144425
64	NC_017352	A	6	6	4131	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	387144425
65	NC_017352	A	7	7	4138	4144	100 %	0 %	0 %	0 %	387144425
66	NC_017352	CTAG	2	8	5240	5247	25 %	25 %	25 %	25 %	387144426
67	NC_017352	ATG	2	6	5249	5254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
68	NC_017352	GAA	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144426
69	NC_017352	TA	3	6	5310	5315	50 %	50 %	0 %	0 %	387144426
70	NC_017352	GAT	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
71	NC_017352	ATT	2	6	5419	5424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144426
72	NC_017352	TAA	2	6	5547	5552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
73	NC_017352	TAA	2	6	5559	5564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
74	NC_017352	ATAA	2	8	5643	5650	75 %	25 %	0 %	0 %	387144426
75	NC_017352	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
76	NC_017352	GCTT	2	8	5705	5712	0 %	50 %	25 %	25 %	387144426
77	NC_017352	T	8	8	5714	5721	0 %	100 %	0 %	0 %	387144426
78	NC_017352	TTG	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144426
79	NC_017352	ATG	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
80	NC_017352	TC	3	6	5801	5806	0 %	50 %	0 %	50 %	387144426
81	NC_017352	AT	3	6	5817	5822	50 %	50 %	0 %	0 %	387144426
82	NC_017352	TAG	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
83	NC_017352	AAT	2	6	5901	5906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
84	NC_017352	CT	3	6	8237	8242	0 %	50 %	0 %	50 %	387144427
85	NC_017352	TAA	2	6	8257	8262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144427
86	NC_017352	AAT	2	6	8263	8268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144427
87	NC_017352	TA	3	6	8311	8316	50 %	50 %	0 %	0 %	387144427
88	NC_017352	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144427
89	NC_017352	AC	3	6	8379	8384	50 %	0 %	0 %	50 %	387144427
90	NC_017352	TCT	2	6	8391	8396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144427
91	NC_017352	ATA	2	6	8407	8412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144427
92	NC_017352	TCT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144427
93	NC_017352	T	6	6	8440	8445	0 %	100 %	0 %	0 %	387144427
94	NC_017352	ATC	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144427
95	NC_017352	A	6	6	8484	8489	100 %	0 %	0 %	0 %	387144427
96	NC_017352	ATCAC	2	10	8526	8535	40 %	20 %	0 %	40 %	387144427
97	NC_017352	AAT	3	9	8615	8623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144428
98	NC_017352	TA	3	6	8639	8644	50 %	50 %	0 %	0 %	387144428
99	NC_017352	AAT	2	6	8645	8650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144428
100	NC_017352	CAA	2	6	8677	8682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144428
101	NC_017352	AAG	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144428
102	NC_017352	AAAATT	2	12	8736	8747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144428
103	NC_017352	AGTA	2	8	8762	8769	50 %	25 %	25 %	0 %	387144428
104	NC_017352	TTCA	2	8	8885	8892	25 %	50 %	0 %	25 %	387144429
105	NC_017352	T	6	6	8897	8902	0 %	100 %	0 %	0 %	387144429
106	NC_017352	CT	3	6	8905	8910	0 %	50 %	0 %	50 %	387144429
107	NC_017352	ACTA	2	8	9028	9035	50 %	25 %	0 %	25 %	387144429
108	NC_017352	ATA	2	6	9044	9049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144429
109	NC_017352	T	6	6	9088	9093	0 %	100 %	0 %	0 %	387144429
110	NC_017352	A	6	6	9109	9114	100 %	0 %	0 %	0 %	387144429
111	NC_017352	TAA	2	6	9118	9123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144429
112	NC_017352	TAA	2	6	9130	9135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144429
113	NC_017352	AGC	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144429
114	NC_017352	CATA	2	8	9187	9194	50 %	25 %	0 %	25 %	387144429
115	NC_017352	ATT	2	6	10809	10814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
116	NC_017352	ATATT	2	10	10823	10832	40 %	60 %	0 %	0 %	387144430
117	NC_017352	TTC	2	6	10870	10875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144430
118	NC_017352	TCT	2	6	10991	10996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144430
119	NC_017352	ATA	2	6	11002	11007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
120	NC_017352	TAA	2	6	11058	11063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
121	NC_017352	GTT	2	6	11106	11111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144430
122	NC_017352	TTC	2	6	11119	11124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144430
123	NC_017352	ATT	2	6	11149	11154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
124	NC_017352	T	6	6	11163	11168	0 %	100 %	0 %	0 %	387144430
125	NC_017352	GAT	2	6	11169	11174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144430
126	NC_017352	ATG	2	6	11188	11193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144430
127	NC_017352	ATT	3	9	11194	11202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
128	NC_017352	ATA	2	6	11219	11224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
129	NC_017352	TCAT	2	8	11225	11232	25 %	50 %	0 %	25 %	387144430
130	NC_017352	TA	3	6	11260	11265	50 %	50 %	0 %	0 %	387144430
131	NC_017352	TAT	2	6	11271	11276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
132	NC_017352	TAA	2	6	11419	11424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
133	NC_017352	TTA	2	6	11441	11446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
134	NC_017352	TAA	2	6	11467	11472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144430
135	NC_017352	T	6	6	11491	11496	0 %	100 %	0 %	0 %	387144430
136	NC_017352	T	6	6	11508	11513	0 %	100 %	0 %	0 %	387144430
137	NC_017352	TTA	2	6	11546	11551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
138	NC_017352	TTA	2	6	11570	11575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
139	NC_017352	TCTA	2	8	11578	11585	25 %	50 %	0 %	25 %	387144430
140	NC_017352	CATT	2	8	11588	11595	25 %	50 %	0 %	25 %	387144430
141	NC_017352	TGGA	2	8	11597	11604	25 %	25 %	50 %	0 %	387144430
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151	NC_017352	A	6	6	12285	12290	100 %	0 %	0 %	0 %	387144431
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263	NC_017352	TCA	2	6	17635	17640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144436
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265	NC_017352	GAT	2	6	17824	17829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144436
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267	NC_017352	TCTA	2	8	18088	18095	25 %	50 %	0 %	25 %	387144437
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271	NC_017352	CGTCT	2	10	18235	18244	0 %	40 %	20 %	40 %	387144437
272	NC_017352	T	6	6	18310	18315	0 %	100 %	0 %	0 %	387144437
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277	NC_017352	TA	3	6	18531	18536	50 %	50 %	0 %	0 %	387144437
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