MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 1276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	CTTTAC	2	12	7926	7937	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384865887
2	NC_017342	CTTTCA	2	12	8731	8742	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384865888
3	NC_017342	TGTGCT	2	12	9855	9866	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384865890
4	NC_017342	TATATT	2	12	11677	11688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865892
5	NC_017342	AATGCT	2	12	12483	12494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384865892
6	NC_017342	AATTAA	2	12	13270	13281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
7	NC_017342	CATGAA	2	12	13983	13994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384865894
8	NC_017342	CACCAA	2	12	14298	14309	50 %	0 %	0 %	50 %	384865894
9	NC_017342	TTTTAA	2	12	16474	16485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865896
10	NC_017342	CATTTT	2	12	18119	18130	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384865898
11	NC_017342	TATAAA	2	12	20819	20830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865901
12	NC_017342	GTTTCG	2	12	23455	23466	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384865902
13	NC_017342	AATACG	2	12	24872	24883	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384865903
14	NC_017342	ACCGTA	2	12	26124	26135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384865904
15	NC_017342	TCTTGC	2	12	27520	27531	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384865906
16	NC_017342	ACCAAT	2	12	34424	34435	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384865915
17	NC_017342	TAGGTT	2	12	35149	35160	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384865916
18	NC_017342	TATAAA	2	12	38117	38128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865920
19	NC_017342	CAACTT	2	12	41424	41435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865924
20	NC_017342	ATCTTG	2	12	41668	41679	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384865924
21	NC_017342	TCATTT	2	12	41694	41705	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384865924
22	NC_017342	TTCTTG	2	12	51026	51037	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384865929
23	NC_017342	TTAAAT	2	12	54152	54163	50 %	50 %	0 %	0 %	384865932
24	NC_017342	TATCAA	2	12	59599	59610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384865936
25	NC_017342	CTTCAT	2	12	60378	60389	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384865937
26	NC_017342	TCAAAA	2	12	63485	63496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384865937
27	NC_017342	TTCACC	2	12	64543	64554	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384865937
28	NC_017342	TCACTT	2	12	68452	68463	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384865941
29	NC_017342	TGTTAA	2	12	68755	68766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384865942
30	NC_017342	TAAAAA	2	12	69164	69175	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384865943
31	NC_017342	TAATGA	2	12	70224	70235	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384865944
32	NC_017342	ATCTGA	2	12	71061	71072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384865945
33	NC_017342	ATATCA	2	12	71488	71499	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384865945
34	NC_017342	GAATAT	2	12	76854	76865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384865950
35	NC_017342	ATCTTT	2	12	80802	80813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384865955
36	NC_017342	CTGTTG	2	12	81645	81656	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384865955
37	NC_017342	AAATCG	2	12	83054	83065	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384865955
38	NC_017342	AAATCA	2	12	83411	83422	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384865956
39	NC_017342	TCAAAA	2	12	86726	86737	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384865958
40	NC_017342	TTTCTT	2	12	89008	89019	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384865962
41	NC_017342	TACCTT	2	12	95507	95518	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384865969
42	NC_017342	TCTTTT	2	12	95983	95994	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384865969
43	NC_017342	TATATT	2	12	97795	97806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865971
44	NC_017342	TGGTTT	2	12	99153	99164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865972
45	NC_017342	TGAACC	2	12	99731	99742	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384865972
46	NC_017342	CTAATG	2	12	101344	101355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384865973
47	NC_017342	CTAATG	2	12	102405	102416	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384865974
48	NC_017342	CTAATG	2	12	103440	103451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384865975
49	NC_017342	TTTCAT	2	12	108324	108335	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384865980
50	NC_017342	GTAATT	2	12	108733	108744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384865981
51	NC_017342	TTTATC	2	12	109032	109043	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384865981
52	NC_017342	ATTTCG	2	12	116476	116487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384865989
53	NC_017342	TCCTGT	2	12	119713	119724	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384865991
54	NC_017342	AGTAAA	2	12	121088	121099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384865993
55	NC_017342	AGAAAA	2	12	122534	122545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384865995
56	NC_017342	ACAAAC	2	12	125344	125355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865998
57	NC_017342	ACTTTC	2	12	127839	127850	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384866001
58	NC_017342	TTTGCA	2	12	137981	137992	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866014
59	NC_017342	GTCTTC	2	12	138471	138482	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384866015
60	NC_017342	TATCAT	2	12	139722	139733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384866018
61	NC_017342	GCTTTT	2	12	144470	144481	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384866022
62	NC_017342	TGTCCT	2	12	151333	151344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384866026
63	NC_017342	TTTAAT	2	12	155051	155062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866030
64	NC_017342	GTACTT	2	12	156539	156550	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866032
65	NC_017342	AAAATT	2	12	169658	169669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
66	NC_017342	ATTGCA	2	12	173101	173112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866050
67	NC_017342	TCTTAT	2	12	174662	174673	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384866052
68	NC_017342	CATTTT	2	12	177619	177630	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384866055
69	NC_017342	CCAATT	2	12	177681	177692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866055
70	NC_017342	GTCATT	2	12	179100	179111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866056
71	NC_017342	AATTTT	2	12	194528	194539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866069
72	NC_017342	CACCTG	2	12	194906	194917	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384866070
73	NC_017342	TGTTTC	2	12	195093	195104	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384866070
74	NC_017342	ATTGGA	2	12	196441	196452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866071
75	NC_017342	ATTCGT	2	12	196698	196709	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866071
76	NC_017342	AAAAAT	2	12	197173	197184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384866071
77	NC_017342	TTTTTC	2	12	197761	197772	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384866072
78	NC_017342	TTTAGC	2	12	199877	199888	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866074
79	NC_017342	ATTCAG	2	12	201956	201967	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866076
80	NC_017342	GAATAA	2	12	203699	203710	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384866078
81	NC_017342	ATAAAT	2	12	207737	207748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866084
82	NC_017342	ATCTTT	2	12	208486	208497	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384866086
83	NC_017342	AAAACA	2	12	211197	211208	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384866091
84	NC_017342	TAAAAA	2	12	211698	211709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384866092
85	NC_017342	TATATT	2	12	212898	212909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866094
86	NC_017342	CTTGAT	2	12	217093	217104	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866099
87	NC_017342	TCTTCA	2	12	217801	217812	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384866099
88	NC_017342	AATTTA	2	12	218062	218073	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
89	NC_017342	TTCTTT	2	12	218847	218858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384866099
90	NC_017342	GATAAT	2	12	219602	219613	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384866099
91	NC_017342	TGTCCT	2	12	220912	220923	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384866100
92	NC_017342	TCTTGT	2	12	221290	221301	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384866100
93	NC_017342	TAATTA	2	12	222130	222141	50 %	50 %	0 %	0 %	384866101
94	NC_017342	TTTTTC	2	12	225622	225633	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384866103
95	NC_017342	TATACT	2	12	226415	226426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384866105
96	NC_017342	CTTTAG	2	12	226776	226787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866105
97	NC_017342	AGATAA	2	12	227883	227894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384866106
98	NC_017342	TGAAGA	2	12	227979	227990	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384866106
99	NC_017342	GATGAA	2	12	230458	230469	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384866108
100	NC_017342	CCATTA	2	12	232350	232361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866110
101	NC_017342	GCATTT	2	12	232530	232541	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866110
102	NC_017342	TTAAAG	2	12	232849	232860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384866110
103	NC_017342	TTGCTG	2	12	233558	233569	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384866111
104	NC_017342	ATAATC	2	12	234078	234089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384866111
105	NC_017342	TATGAA	2	12	238486	238497	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384866116
106	NC_017342	GAAATC	2	12	239056	239067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384866117
107	NC_017342	AATGTC	2	12	240875	240886	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866119
108	NC_017342	CTTTAT	2	12	242574	242585	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384866121
109	NC_017342	AATTGT	2	12	243644	243655	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384866122
110	NC_017342	TTTCAT	2	12	243702	243713	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384866122
111	NC_017342	ATAATT	2	12	243932	243943	50 %	50 %	0 %	0 %	384866122
112	NC_017342	GCAATT	2	12	245287	245298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866124
113	NC_017342	AATTGC	2	12	245850	245861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866124
114	NC_017342	GATTCT	2	12	249726	249737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866128
115	NC_017342	CATCGT	2	12	257289	257300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384866133
116	NC_017342	ATCTAT	2	12	264459	264470	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384866139
117	NC_017342	ACCTAA	2	12	266840	266851	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866142
118	NC_017342	CAATAC	2	12	267812	267823	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866143
119	NC_017342	ATGGCT	2	12	284351	284362	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384866157
120	NC_017342	CATTAA	2	12	294590	294601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384866163
121	NC_017342	ACGTTC	2	12	298146	298157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384866166
122	NC_017342	CAAGAA	2	12	309497	309508	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384866177
123	NC_017342	AAATGT	2	12	314425	314436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384866181
124	NC_017342	GTCCTT	2	12	314762	314773	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384866181
125	NC_017342	AACAGA	2	12	315087	315098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384866182
126	NC_017342	GTCCTT	2	12	319066	319077	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384866184
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130	NC_017342	ATCAGG	2	12	322840	322851	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384866187
131	NC_017342	TCAGGG	2	12	323660	323671	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384866187
132	NC_017342	AAACTC	2	12	326168	326179	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866189
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145	NC_017342	TACCAA	2	12	358914	358925	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866211
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230	NC_017342	ACATCA	2	12	583951	583962	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866419
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232	NC_017342	AGAATC	2	12	585228	585239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384866419
233	NC_017342	TCGACA	2	12	585298	585309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384866419
234	NC_017342	TCAACA	2	12	585334	585345	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866419
235	NC_017342	TCAACA	2	12	585586	585597	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866419
236	NC_017342	TCAACA	2	12	585628	585639	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866419
237	NC_017342	GGTTTA	2	12	585907	585918	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384866419
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244	NC_017342	TAAAAT	2	12	605317	605328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866431
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258	NC_017342	TCAGAT	2	12	622180	622191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866445
259	NC_017342	GATTCA	2	12	622195	622206	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866445
260	NC_017342	TCAGAT	2	12	622234	622245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866445
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262	NC_017342	TCAGAT	2	12	622684	622695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866445
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342	NC_017342	CAATTT	2	12	833121	833132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384866644
343	NC_017342	CAAAAG	2	12	834628	834639	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384866645
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