MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 37228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	AAT	3	9	6686	6694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
2	NC_017342	TAA	2	6	6721	6726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
3	NC_017342	ACC	2	6	6757	6762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865887
4	NC_017342	TCA	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865887
5	NC_017342	CAA	2	6	6843	6848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865887
6	NC_017342	TTC	2	6	6971	6976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
7	NC_017342	TTC	2	6	7033	7038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
8	NC_017342	CTT	2	6	7128	7133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
9	NC_017342	CTT	2	6	7170	7175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
10	NC_017342	CAA	2	6	7185	7190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865887
11	NC_017342	ATG	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865887
12	NC_017342	AGC	2	6	7516	7521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865887
13	NC_017342	CCA	2	6	7526	7531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865887
14	NC_017342	CAT	2	6	7543	7548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865887
15	NC_017342	TAT	2	6	7575	7580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865887
16	NC_017342	AAT	2	6	7584	7589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
17	NC_017342	TAC	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865887
18	NC_017342	TAA	2	6	7620	7625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
19	NC_017342	TTC	2	6	7751	7756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
20	NC_017342	CTT	2	6	7983	7988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
21	NC_017342	TTC	2	6	7999	8004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
22	NC_017342	CTT	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
23	NC_017342	TTC	2	6	8140	8145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
24	NC_017342	TTG	2	6	8170	8175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865887
25	NC_017342	ATT	2	6	8689	8694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865888
26	NC_017342	TGC	2	6	8768	8773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865888
27	NC_017342	TCT	2	6	8856	8861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865888
28	NC_017342	ACA	2	6	8866	8871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865888
29	NC_017342	TTC	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865888
30	NC_017342	ACA	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865888
31	NC_017342	GTT	2	6	8976	8981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865888
32	NC_017342	GAA	2	6	9051	9056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384865888
33	NC_017342	CAT	2	6	9076	9081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865888
34	NC_017342	TAC	2	6	9136	9141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865888
35	NC_017342	CAT	2	6	9198	9203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865889
36	NC_017342	ATA	2	6	9615	9620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865890
37	NC_017342	CAT	2	6	9680	9685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865890
38	NC_017342	TAA	2	6	9716	9721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865890
39	NC_017342	CAA	2	6	9739	9744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865890
40	NC_017342	CTT	2	6	9772	9777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865890
41	NC_017342	TTC	2	6	9884	9889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865890
42	NC_017342	TCA	2	6	9900	9905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865890
43	NC_017342	GAT	2	6	9973	9978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865890
44	NC_017342	TAA	2	6	10003	10008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865890
45	NC_017342	CAA	2	6	10096	10101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865890
46	NC_017342	CTT	2	6	10123	10128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865890
47	NC_017342	CTG	2	6	10222	10227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865890
48	NC_017342	ATT	2	6	10235	10240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865890
49	NC_017342	CCA	2	6	10248	10253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865890
50	NC_017342	TAC	2	6	10588	10593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865891
51	NC_017342	GCA	2	6	10631	10636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
52	NC_017342	GCA	2	6	10643	10648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
53	NC_017342	TGA	2	6	10651	10656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865891
54	NC_017342	CGA	2	6	10691	10696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
55	NC_017342	TAA	2	6	10728	10733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865891
56	NC_017342	CAC	2	6	10812	10817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865891
57	NC_017342	CAA	2	6	10851	10856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865891
58	NC_017342	TTG	2	6	10960	10965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865891
59	NC_017342	TAA	2	6	10966	10971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865891
60	NC_017342	TTG	2	6	11023	11028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865891
61	NC_017342	TTC	2	6	11047	11052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865891
62	NC_017342	TAA	2	6	11134	11139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865891
63	NC_017342	ACG	2	6	11143	11148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
64	NC_017342	AGC	2	6	11197	11202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865891
65	NC_017342	ACC	2	6	11329	11334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865891
66	NC_017342	CTG	2	6	11367	11372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865891
67	NC_017342	CTA	2	6	11382	11387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865891
68	NC_017342	AAT	2	6	11419	11424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865891
69	NC_017342	TTC	3	9	11666	11674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865892
70	NC_017342	TCT	2	6	11727	11732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865892
71	NC_017342	TCC	2	6	11990	11995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384865892
72	NC_017342	TGC	2	6	11996	12001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865892
73	NC_017342	TAT	2	6	12010	12015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865892
74	NC_017342	ATA	3	9	12071	12079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865892
75	NC_017342	AAC	2	6	12155	12160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865892
76	NC_017342	ATA	2	6	12162	12167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865892
77	NC_017342	AAT	2	6	12284	12289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865892
78	NC_017342	CAT	2	6	12356	12361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865892
79	NC_017342	TTC	2	6	12379	12384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865892
80	NC_017342	GCA	2	6	12390	12395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865892
81	NC_017342	CTT	2	6	12430	12435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865892
82	NC_017342	AGC	2	6	12455	12460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865892
83	NC_017342	ATT	2	6	12516	12521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865892
84	NC_017342	ATT	2	6	12629	12634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865893
85	NC_017342	ATT	2	6	12636	12641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865893
86	NC_017342	TCG	2	6	12691	12696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865893
87	NC_017342	ACT	2	6	12806	12811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865893
88	NC_017342	ATT	2	6	12930	12935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865894
89	NC_017342	TCA	2	6	13007	13012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
90	NC_017342	CTT	2	6	13023	13028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
91	NC_017342	TCT	2	6	13052	13057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
92	NC_017342	TCT	2	6	13088	13093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
93	NC_017342	CAT	2	6	13137	13142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
94	NC_017342	AAC	2	6	13165	13170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865894
95	NC_017342	CAT	2	6	13179	13184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
96	NC_017342	AAT	2	6	13214	13219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
97	NC_017342	TCT	2	6	13247	13252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
98	NC_017342	TAA	2	6	13255	13260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
99	NC_017342	TAA	2	6	13297	13302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
100	NC_017342	CTT	2	6	13347	13352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
101	NC_017342	AAT	2	6	13380	13385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
102	NC_017342	TCT	2	6	13556	13561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
103	NC_017342	CCA	2	6	13571	13576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865894
104	NC_017342	TAA	2	6	13597	13602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
105	NC_017342	CAT	2	6	13642	13647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
106	NC_017342	ACC	2	6	13654	13659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865894
107	NC_017342	ACT	2	6	13694	13699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
108	NC_017342	TCA	2	6	13706	13711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
109	NC_017342	TGA	2	6	13745	13750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865894
110	NC_017342	CAA	2	6	13752	13757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865894
111	NC_017342	TAA	2	6	13891	13896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
112	NC_017342	TCA	2	6	13961	13966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
113	NC_017342	GAC	2	6	14022	14027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865894
114	NC_017342	TAA	2	6	14062	14067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
115	NC_017342	AGC	2	6	14098	14103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865894
116	NC_017342	TAA	2	6	14149	14154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
117	NC_017342	TCA	2	6	14177	14182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
118	NC_017342	CCA	2	6	14189	14194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865894
119	NC_017342	CAC	2	6	14202	14207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865894
120	NC_017342	GAC	2	6	14211	14216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865894
121	NC_017342	GAT	2	6	14242	14247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865894
122	NC_017342	AGA	2	6	14343	14348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384865894
123	NC_017342	CAA	2	6	14412	14417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865894
124	NC_017342	CAA	2	6	14481	14486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865894
125	NC_017342	TTC	2	6	14506	14511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
126	NC_017342	ACG	2	6	14542	14547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865894
127	NC_017342	TAT	3	9	14550	14558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865894
128	NC_017342	TCA	2	6	14589	14594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865894
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133	NC_017342	TGA	2	6	14800	14805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865894
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252	NC_017342	CTT	2	6	22238	22243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
253	NC_017342	GGC	2	6	22300	22305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384865902
254	NC_017342	GTT	2	6	22442	22447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865902
255	NC_017342	CAA	2	6	22514	22519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865902
256	NC_017342	CAA	2	6	22526	22531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865902
257	NC_017342	TGC	2	6	22713	22718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865902
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260	NC_017342	TTG	2	6	22962	22967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865902
261	NC_017342	ATG	2	6	23175	23180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865902
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269	NC_017342	TTC	2	6	23745	23750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
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285	NC_017342	ATC	2	6	24574	24579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865902
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292	NC_017342	ATC	2	6	24989	24994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865903
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303	NC_017342	ACT	2	6	25693	25698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865904
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322	NC_017342	TCA	2	6	26704	26709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865905
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327	NC_017342	ATA	2	6	27047	27052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865905
328	NC_017342	TGC	2	6	27074	27079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865905
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330	NC_017342	AAT	2	6	27155	27160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865905
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343	NC_017342	AAC	2	6	27970	27975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865906
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347	NC_017342	GCC	2	6	28213	28218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384865906
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353	NC_017342	TGA	2	6	28524	28529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865906
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363	NC_017342	TCT	2	6	29201	29206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865908
364	NC_017342	TAC	2	6	29227	29232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865908
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370	NC_017342	ATA	2	6	29938	29943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865909
371	NC_017342	CTT	2	6	30069	30074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865910
372	NC_017342	CCA	2	6	30152	30157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865910
373	NC_017342	ATC	2	6	30169	30174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865910
374	NC_017342	TTG	2	6	30290	30295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865910
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