MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 55353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017342	A	7	7	193618	193624	100 %	0 %	0 %	0 %	384866068
3502	NC_017342	TCA	2	6	193665	193670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866068
3503	NC_017342	AATA	2	8	193693	193700	75 %	25 %	0 %	0 %	384866068
3504	NC_017342	ATT	2	6	193703	193708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866068
3505	NC_017342	CAA	2	6	193758	193763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866068
3506	NC_017342	AAT	2	6	193821	193826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866069
3507	NC_017342	TTA	2	6	193827	193832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866069
3508	NC_017342	CAA	2	6	193873	193878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866069
3509	NC_017342	TGC	2	6	193889	193894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866069
3510	NC_017342	T	6	6	193912	193917	0 %	100 %	0 %	0 %	384866069
3511	NC_017342	CAA	2	6	193981	193986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866069
3512	NC_017342	AT	3	6	194010	194015	50 %	50 %	0 %	0 %	384866069
3513	NC_017342	CAA	3	9	194053	194061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866069
3514	NC_017342	CTG	2	6	194081	194086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866069
3515	NC_017342	AATG	2	8	194095	194102	50 %	25 %	25 %	0 %	384866069
3516	NC_017342	TTAAC	2	10	194137	194146	40 %	40 %	0 %	20 %	384866069
3517	NC_017342	GAA	2	6	194162	194167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866069
3518	NC_017342	ATTC	2	8	194176	194183	25 %	50 %	0 %	25 %	384866069
3519	NC_017342	TTC	2	6	194297	194302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866069
3520	NC_017342	CTG	2	6	194308	194313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866069
3521	NC_017342	A	6	6	194369	194374	100 %	0 %	0 %	0 %	384866069
3522	NC_017342	GCA	2	6	194391	194396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866069
3523	NC_017342	ATC	2	6	194400	194405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866069
3524	NC_017342	GTC	2	6	194406	194411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866069
3525	NC_017342	AGT	2	6	194417	194422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866069
3526	NC_017342	CAA	2	6	194443	194448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866069
3527	NC_017342	AATTTT	2	12	194528	194539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866069
3528	NC_017342	ATT	2	6	194576	194581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866069
3529	NC_017342	TGT	2	6	194600	194605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866069
3530	NC_017342	TTG	2	6	194650	194655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866069
3531	NC_017342	TGCT	2	8	194690	194697	0 %	50 %	25 %	25 %	384866069
3532	NC_017342	TCC	2	6	194749	194754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384866070
3533	NC_017342	AT	3	6	194846	194851	50 %	50 %	0 %	0 %	384866070
3534	NC_017342	ACT	2	6	194884	194889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866070
3535	NC_017342	GCA	2	6	194890	194895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866070
3536	NC_017342	GAAT	2	8	194898	194905	50 %	25 %	25 %	0 %	384866070
3537	NC_017342	CACCTG	2	12	194906	194917	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384866070
3538	NC_017342	TGA	2	6	194954	194959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866070
3539	NC_017342	CAC	2	6	194969	194974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866070
3540	NC_017342	AGC	2	6	195045	195050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866070
3541	NC_017342	ATC	2	6	195060	195065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866070
3542	NC_017342	TGTTTC	2	12	195093	195104	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384866070
3543	NC_017342	CAAT	2	8	195124	195131	50 %	25 %	0 %	25 %	384866070
3544	NC_017342	GAA	2	6	195169	195174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866070
3545	NC_017342	GTG	2	6	195178	195183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866070
3546	NC_017342	ATTTG	2	10	195191	195200	20 %	60 %	20 %	0 %	384866070
3547	NC_017342	AAG	2	6	195223	195228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866070
3548	NC_017342	AAT	2	6	195261	195266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866070
3549	NC_017342	TTAA	2	8	195298	195305	50 %	50 %	0 %	0 %	384866070
3550	NC_017342	ATGTC	2	10	195353	195362	20 %	40 %	20 %	20 %	384866070
3551	NC_017342	CTT	2	6	195365	195370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866070
3552	NC_017342	TTG	2	6	195414	195419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866070
3553	NC_017342	A	6	6	195496	195501	100 %	0 %	0 %	0 %	384866070
3554	NC_017342	CCTA	2	8	195519	195526	25 %	25 %	0 %	50 %	384866070
3555	NC_017342	CCA	2	6	195553	195558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866070
3556	NC_017342	ACAA	2	8	195648	195655	75 %	0 %	0 %	25 %	384866070
3557	NC_017342	AAT	2	6	195720	195725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866070
3558	NC_017342	TTTC	2	8	195812	195819	0 %	75 %	0 %	25 %	384866070
3559	NC_017342	CTC	2	6	195841	195846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384866070
3560	NC_017342	T	6	6	196230	196235	0 %	100 %	0 %	0 %	384866071
3561	NC_017342	TAC	2	6	196284	196289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866071
3562	NC_017342	GAT	2	6	196313	196318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866071
3563	NC_017342	TTAA	2	8	196375	196382	50 %	50 %	0 %	0 %	384866071
3564	NC_017342	AAT	2	6	196395	196400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866071
3565	NC_017342	CAC	2	6	196415	196420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866071
3566	NC_017342	ATTGGA	2	12	196441	196452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866071
3567	NC_017342	TACT	2	8	196490	196497	25 %	50 %	0 %	25 %	384866071
3568	NC_017342	TGC	2	6	196569	196574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866071
3569	NC_017342	TAA	2	6	196611	196616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866071
3570	NC_017342	TAA	2	6	196661	196666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866071
3571	NC_017342	ACC	2	6	196668	196673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866071
3572	NC_017342	ATTCGT	2	12	196698	196709	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384866071
3573	NC_017342	ACT	2	6	196710	196715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866071
3574	NC_017342	ATA	2	6	196720	196725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866071
3575	NC_017342	ACT	2	6	196753	196758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866071
3576	NC_017342	TAA	2	6	196764	196769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866071
3577	NC_017342	TCA	2	6	196856	196861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866071
3578	NC_017342	TAA	2	6	196896	196901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866071
3579	NC_017342	ACC	2	6	196908	196913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866071
3580	NC_017342	GCT	2	6	196921	196926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866071
3581	NC_017342	AC	3	6	196949	196954	50 %	0 %	0 %	50 %	384866071
3582	NC_017342	ACC	2	6	196989	196994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866071
3583	NC_017342	CAC	2	6	197048	197053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866071
3584	NC_017342	TTA	2	6	197062	197067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866071
3585	NC_017342	TGC	2	6	197094	197099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866071
3586	NC_017342	GC	3	6	197119	197124	0 %	0 %	50 %	50 %	384866071
3587	NC_017342	AAT	2	6	197149	197154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866071
3588	NC_017342	AAAAAT	2	12	197173	197184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384866071
3589	NC_017342	TAA	2	6	197196	197201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866071
3590	NC_017342	ATATG	2	10	197458	197467	40 %	40 %	20 %	0 %	384866072
3591	NC_017342	TCA	2	6	197494	197499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866072
3592	NC_017342	AAT	2	6	197508	197513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866072
3593	NC_017342	CTTT	3	12	197519	197530	0 %	75 %	0 %	25 %	384866072
3594	NC_017342	T	7	7	197528	197534	0 %	100 %	0 %	0 %	384866072
3595	NC_017342	CGC	2	6	197586	197591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384866072
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3597	NC_017342	TA	3	6	197627	197632	50 %	50 %	0 %	0 %	384866072
3598	NC_017342	GTT	2	6	197654	197659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866072
3599	NC_017342	ACC	2	6	197664	197669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866072
3600	NC_017342	TTA	2	6	197689	197694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866072
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3602	NC_017342	TTTTTC	2	12	197761	197772	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384866072
3603	NC_017342	AAT	2	6	197773	197778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866072
3604	NC_017342	TTG	2	6	197784	197789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866072
3605	NC_017342	TAAAA	2	10	197826	197835	80 %	20 %	0 %	0 %	384866072
3606	NC_017342	TTTA	2	8	198003	198010	25 %	75 %	0 %	0 %	384866072
3607	NC_017342	CCT	2	6	198101	198106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384866073
3608	NC_017342	AAT	2	6	198292	198297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866073
3609	NC_017342	T	6	6	198383	198388	0 %	100 %	0 %	0 %	384866073
3610	NC_017342	T	6	6	198543	198548	0 %	100 %	0 %	0 %	384866073
3611	NC_017342	ACA	2	6	198571	198576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866073
3612	NC_017342	GATT	2	8	198608	198615	25 %	50 %	25 %	0 %	384866073
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3617	NC_017342	TCTT	2	8	198934	198941	0 %	75 %	0 %	25 %	384866073
3618	NC_017342	TTG	2	6	198954	198959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866073
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3620	NC_017342	CTT	2	6	199019	199024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866073
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3994	NC_017342	TCT	2	6	216382	216387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
3995	NC_017342	ATTG	2	8	216401	216408	25 %	50 %	25 %	0 %	384866099
3996	NC_017342	ATT	2	6	216420	216425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
3997	NC_017342	CTAAT	2	10	216497	216506	40 %	40 %	0 %	20 %	384866099
3998	NC_017342	AAT	2	6	216530	216535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
3999	NC_017342	TCT	2	6	216547	216552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
4000	NC_017342	TCT	2	6	216571	216576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099

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