MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 55353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017342	ACA	3	9	167414	167422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866045
3002	NC_017342	AT	4	8	167509	167516	50 %	50 %	0 %	0 %	384866045
3003	NC_017342	AC	3	6	167526	167531	50 %	0 %	0 %	50 %	384866045
3004	NC_017342	TTTA	2	8	167629	167636	25 %	75 %	0 %	0 %	384866045
3005	NC_017342	AT	3	6	167682	167687	50 %	50 %	0 %	0 %	384866045
3006	NC_017342	GAA	2	6	167741	167746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866045
3007	NC_017342	CTT	2	6	167782	167787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866045
3008	NC_017342	ATT	2	6	167815	167820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866045
3009	NC_017342	ATT	2	6	167842	167847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866045
3010	NC_017342	CTG	2	6	167865	167870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866045
3011	NC_017342	TCT	2	6	167874	167879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866045
3012	NC_017342	TCC	2	6	167923	167928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384866045
3013	NC_017342	AT	3	6	167978	167983	50 %	50 %	0 %	0 %	384866045
3014	NC_017342	A	6	6	168029	168034	100 %	0 %	0 %	0 %	384866045
3015	NC_017342	CAG	2	6	168045	168050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866045
3016	NC_017342	ATT	2	6	168064	168069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866045
3017	NC_017342	GGATG	2	10	168131	168140	20 %	20 %	60 %	0 %	384866045
3018	NC_017342	TTTTA	2	10	168145	168154	20 %	80 %	0 %	0 %	384866045
3019	NC_017342	GT	3	6	168168	168173	0 %	50 %	50 %	0 %	384866045
3020	NC_017342	TCA	2	6	168226	168231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866045
3021	NC_017342	A	7	7	168328	168334	100 %	0 %	0 %	0 %	384866046
3022	NC_017342	TGCTC	2	10	168359	168368	0 %	40 %	20 %	40 %	384866046
3023	NC_017342	AAT	2	6	168458	168463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866046
3024	NC_017342	TTC	2	6	168493	168498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866046
3025	NC_017342	TTC	2	6	168688	168693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866046
3026	NC_017342	TTC	2	6	168715	168720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866046
3027	NC_017342	AT	3	6	168728	168733	50 %	50 %	0 %	0 %	384866046
3028	NC_017342	TAA	2	6	168910	168915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3029	NC_017342	TGC	2	6	168931	168936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866047
3030	NC_017342	TAA	2	6	168961	168966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3031	NC_017342	CAAA	2	8	168990	168997	75 %	0 %	0 %	25 %	384866047
3032	NC_017342	ATA	2	6	169004	169009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3033	NC_017342	TAA	2	6	169117	169122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3034	NC_017342	ATG	2	6	169125	169130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866047
3035	NC_017342	AAAT	2	8	169146	169153	75 %	25 %	0 %	0 %	384866047
3036	NC_017342	CAA	2	6	169164	169169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866047
3037	NC_017342	AGT	2	6	169180	169185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866047
3038	NC_017342	ATG	2	6	169201	169206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866047
3039	NC_017342	CATA	2	8	169228	169235	50 %	25 %	0 %	25 %	384866047
3040	NC_017342	CAA	2	6	169236	169241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866047
3041	NC_017342	ACA	2	6	169328	169333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866047
3042	NC_017342	ATA	2	6	169352	169357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3043	NC_017342	AAAT	2	8	169429	169436	75 %	25 %	0 %	0 %	384866047
3044	NC_017342	TTA	2	6	169520	169525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866047
3045	NC_017342	ATAAA	2	10	169571	169580	80 %	20 %	0 %	0 %	384866047
3046	NC_017342	AGC	3	9	169594	169602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866047
3047	NC_017342	CAA	2	6	169635	169640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866047
3048	NC_017342	AAAATT	2	12	169658	169669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3049	NC_017342	ATA	2	6	169679	169684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3050	NC_017342	GAA	2	6	169762	169767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866047
3051	NC_017342	AAT	2	6	169806	169811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3052	NC_017342	TGC	2	6	169852	169857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866047
3053	NC_017342	ACC	2	6	169912	169917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866047
3054	NC_017342	ACT	2	6	169930	169935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866047
3055	NC_017342	TAA	2	6	169969	169974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3056	NC_017342	AAAT	2	8	170005	170012	75 %	25 %	0 %	0 %	384866047
3057	NC_017342	TCT	2	6	170078	170083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866047
3058	NC_017342	ATAA	2	8	170116	170123	75 %	25 %	0 %	0 %	384866047
3059	NC_017342	TAA	2	6	170128	170133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3060	NC_017342	ATC	2	6	170141	170146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866047
3061	NC_017342	CAT	2	6	170164	170169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866047
3062	NC_017342	ATA	2	6	170197	170202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866047
3063	NC_017342	TCT	2	6	170379	170384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866048
3064	NC_017342	TCA	2	6	170418	170423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866048
3065	NC_017342	AGTC	2	8	170465	170472	25 %	25 %	25 %	25 %	384866048
3066	NC_017342	TTCT	2	8	170478	170485	0 %	75 %	0 %	25 %	384866048
3067	NC_017342	TAA	2	6	170543	170548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866048
3068	NC_017342	TTG	2	6	170612	170617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866048
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3070	NC_017342	GTT	2	6	170957	170962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866049
3071	NC_017342	CAAT	2	8	171019	171026	50 %	25 %	0 %	25 %	384866049
3072	NC_017342	AT	3	6	171080	171085	50 %	50 %	0 %	0 %	384866049
3073	NC_017342	TAA	2	6	171125	171130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866049
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3081	NC_017342	AATC	2	8	171505	171512	50 %	25 %	0 %	25 %	384866049
3082	NC_017342	ATT	2	6	171531	171536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866049
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3087	NC_017342	AGCA	2	8	172035	172042	50 %	0 %	25 %	25 %	384866049
3088	NC_017342	TGC	2	6	172064	172069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866049
3089	NC_017342	ACAT	2	8	172095	172102	50 %	25 %	0 %	25 %	384866049
3090	NC_017342	CAAT	2	8	172149	172156	50 %	25 %	0 %	25 %	384866049
3091	NC_017342	ATC	2	6	172222	172227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866049
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3094	NC_017342	ATCA	2	8	172371	172378	50 %	25 %	0 %	25 %	384866049
3095	NC_017342	AAC	2	6	172423	172428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866049
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3098	NC_017342	ATG	2	6	172555	172560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866049
3099	NC_017342	AT	3	6	172619	172624	50 %	50 %	0 %	0 %	384866049
3100	NC_017342	CA	3	6	172636	172641	50 %	0 %	0 %	50 %	384866049
3101	NC_017342	ATT	2	6	172716	172721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866049
3102	NC_017342	GTA	2	6	172726	172731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866049
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3104	NC_017342	ACA	2	6	172877	172882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866049
3105	NC_017342	AGG	2	6	172903	172908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384866049
3106	NC_017342	TAA	2	6	172911	172916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866049
3107	NC_017342	CAA	2	6	172937	172942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866050
3108	NC_017342	CAT	2	6	172947	172952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866050
3109	NC_017342	TAC	2	6	173009	173014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866050
3110	NC_017342	ATT	2	6	173023	173028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866050
3111	NC_017342	TGAT	2	8	173051	173058	25 %	50 %	25 %	0 %	384866050
3112	NC_017342	ATTGCA	2	12	173101	173112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866050
3113	NC_017342	TGA	2	6	173187	173192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866050
3114	NC_017342	CAA	2	6	173315	173320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866050
3115	NC_017342	TAG	2	6	173373	173378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866051
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3117	NC_017342	AAG	2	6	173427	173432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866051
3118	NC_017342	ATA	2	6	173577	173582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866051
3119	NC_017342	ACA	2	6	173602	173607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866051
3120	NC_017342	ACA	2	6	173626	173631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866051
3121	NC_017342	GCAA	2	8	173664	173671	50 %	0 %	25 %	25 %	384866052
3122	NC_017342	TTG	2	6	173714	173719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866052
3123	NC_017342	A	6	6	173752	173757	100 %	0 %	0 %	0 %	384866052
3124	NC_017342	CAA	2	6	173765	173770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866052
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3131	NC_017342	TCA	2	6	174033	174038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866052
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3231	NC_017342	CTT	2	6	179204	179209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866057
3232	NC_017342	CAT	2	6	179216	179221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866057
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3240	NC_017342	ATCTT	2	10	179509	179518	20 %	60 %	0 %	20 %	384866057
3241	NC_017342	CTA	2	6	179612	179617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866058
3242	NC_017342	TCA	2	6	179623	179628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866058
3243	NC_017342	ATC	2	6	179649	179654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866058
3244	NC_017342	ATC	2	6	179713	179718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866058
3245	NC_017342	TAA	2	6	179802	179807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866058
3246	NC_017342	TGT	2	6	179824	179829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866058
3247	NC_017342	TGC	2	6	179832	179837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866058
3248	NC_017342	T	6	6	179922	179927	0 %	100 %	0 %	0 %	384866058
3249	NC_017342	CTA	2	6	180040	180045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866058
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3252	NC_017342	TAA	2	6	180138	180143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866058
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3276	NC_017342	TGCG	2	8	181475	181482	0 %	25 %	50 %	25 %	384866059
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3345	NC_017342	GAT	2	6	184980	184985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866061
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3348	NC_017342	T	7	7	185730	185736	0 %	100 %	0 %	0 %	384866062
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3351	NC_017342	CATTA	2	10	185940	185949	40 %	40 %	0 %	20 %	384866062
3352	NC_017342	ATGT	2	8	185980	185987	25 %	50 %	25 %	0 %	384866062
3353	NC_017342	TTTG	2	8	186036	186043	0 %	75 %	25 %	0 %	384866062
3354	NC_017342	ATG	2	6	186052	186057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866062
3355	NC_017342	CTTT	2	8	186094	186101	0 %	75 %	0 %	25 %	384866062
3356	NC_017342	TAG	2	6	186104	186109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866062
3357	NC_017342	TTA	2	6	186118	186123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866062
3358	NC_017342	TAT	2	6	186150	186155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866062
3359	NC_017342	ATT	2	6	186231	186236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866062
3360	NC_017342	ACA	2	6	186269	186274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866062
3361	NC_017342	ATT	2	6	186289	186294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866062
3362	NC_017342	TCA	2	6	186395	186400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866062
3363	NC_017342	AAG	2	6	186473	186478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866062
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3487	NC_017342	AAC	2	6	192998	193003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866068
3488	NC_017342	CTA	2	6	193011	193016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866068
3489	NC_017342	CATC	2	8	193035	193042	25 %	25 %	0 %	50 %	384866068
3490	NC_017342	ATC	2	6	193153	193158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866068
3491	NC_017342	GATT	2	8	193170	193177	25 %	50 %	25 %	0 %	384866068
3492	NC_017342	GAT	2	6	193186	193191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866068
3493	NC_017342	CTG	2	6	193218	193223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866068
3494	NC_017342	ATC	2	6	193244	193249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866068
3495	NC_017342	AT	3	6	193253	193258	50 %	50 %	0 %	0 %	384866068
3496	NC_017342	TA	3	6	193308	193313	50 %	50 %	0 %	0 %	384866068
3497	NC_017342	TTATT	2	10	193425	193434	20 %	80 %	0 %	0 %	384866068
3498	NC_017342	ATA	2	6	193457	193462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866068
3499	NC_017342	GCA	2	6	193521	193526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866068
3500	NC_017342	TTA	2	6	193605	193610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866068

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