MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 55353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017342	CAT	2	6	61501	61506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1002	NC_017342	TTC	2	6	61549	61554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865937
1003	NC_017342	TAA	2	6	61594	61599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865937
1004	NC_017342	CTT	2	6	61628	61633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865937
1005	NC_017342	ACC	2	6	61729	61734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865937
1006	NC_017342	TGA	2	6	61746	61751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865937
1007	NC_017342	TCT	2	6	61880	61885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865937
1008	NC_017342	AATA	2	8	61890	61897	75 %	25 %	0 %	0 %	384865937
1009	NC_017342	ATG	2	6	61900	61905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865937
1010	NC_017342	GGT	2	6	61910	61915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384865937
1011	NC_017342	ACC	2	6	61990	61995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865937
1012	NC_017342	TGT	2	6	62045	62050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865937
1013	NC_017342	AAT	2	6	62052	62057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865937
1014	NC_017342	ACTT	2	8	62101	62108	25 %	50 %	0 %	25 %	384865937
1015	NC_017342	CAC	2	6	62160	62165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865937
1016	NC_017342	TGC	2	6	62414	62419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865937
1017	NC_017342	ATG	2	6	62449	62454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865937
1018	NC_017342	TTG	2	6	62461	62466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865937
1019	NC_017342	TAC	2	6	62481	62486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1020	NC_017342	ATC	2	6	62503	62508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1021	NC_017342	TTG	2	6	62512	62517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865937
1022	NC_017342	ATCA	2	8	62593	62600	50 %	25 %	0 %	25 %	384865937
1023	NC_017342	CAT	2	6	62601	62606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1024	NC_017342	TAA	2	6	62685	62690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865937
1025	NC_017342	GTT	2	6	62766	62771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865937
1026	NC_017342	ATG	2	6	62836	62841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865937
1027	NC_017342	TAA	2	6	62901	62906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865937
1028	NC_017342	ATC	2	6	62977	62982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1029	NC_017342	GCT	2	6	63113	63118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865937
1030	NC_017342	ATTC	2	8	63126	63133	25 %	50 %	0 %	25 %	384865937
1031	NC_017342	T	6	6	63231	63236	0 %	100 %	0 %	0 %	384865937
1032	NC_017342	TGG	2	6	63253	63258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384865937
1033	NC_017342	CAT	2	6	63336	63341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1034	NC_017342	CTT	2	6	63364	63369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865937
1035	NC_017342	TCT	2	6	63404	63409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865937
1036	NC_017342	TCAAAA	2	12	63485	63496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384865937
1037	NC_017342	ATT	2	6	63562	63567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865937
1038	NC_017342	CAA	2	6	63594	63599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865937
1039	NC_017342	GC	3	6	63744	63749	0 %	0 %	50 %	50 %	384865937
1040	NC_017342	CAT	2	6	63843	63848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1041	NC_017342	TA	3	6	63858	63863	50 %	50 %	0 %	0 %	384865937
1042	NC_017342	AAT	2	6	64004	64009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865937
1043	NC_017342	TGAT	2	8	64165	64172	25 %	50 %	25 %	0 %	384865937
1044	NC_017342	ATC	2	6	64177	64182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1045	NC_017342	T	6	6	64201	64206	0 %	100 %	0 %	0 %	384865937
1046	NC_017342	AACC	2	8	64223	64230	50 %	0 %	0 %	50 %	384865937
1047	NC_017342	TA	3	6	64233	64238	50 %	50 %	0 %	0 %	384865937
1048	NC_017342	TTG	2	6	64369	64374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865937
1049	NC_017342	TTA	2	6	64418	64423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865937
1050	NC_017342	T	6	6	64474	64479	0 %	100 %	0 %	0 %	384865937
1051	NC_017342	ACT	2	6	64484	64489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1052	NC_017342	A	7	7	64521	64527	100 %	0 %	0 %	0 %	384865937
1053	NC_017342	TTCACC	2	12	64543	64554	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384865937
1054	NC_017342	TGT	2	6	64577	64582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865937
1055	NC_017342	ATA	2	6	64610	64615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865937
1056	NC_017342	ATG	2	6	64697	64702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865937
1057	NC_017342	CAT	2	6	64752	64757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865937
1058	NC_017342	TAAT	2	8	64785	64792	50 %	50 %	0 %	0 %	384865937
1059	NC_017342	ATG	2	6	64805	64810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865937
1060	NC_017342	ATT	2	6	65097	65102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865938
1061	NC_017342	ATT	2	6	65124	65129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865938
1062	NC_017342	ATT	3	9	65172	65180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865938
1063	NC_017342	TAT	2	6	65196	65201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865938
1064	NC_017342	TAC	2	6	65303	65308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865938
1065	NC_017342	TTA	2	6	65359	65364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865938
1066	NC_017342	ACAA	2	8	65447	65454	75 %	0 %	0 %	25 %	384865938
1067	NC_017342	AC	3	6	65527	65532	50 %	0 %	0 %	50 %	384865938
1068	NC_017342	CCA	2	6	65533	65538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865938
1069	NC_017342	A	7	7	65595	65601	100 %	0 %	0 %	0 %	384865938
1070	NC_017342	AAG	2	6	65678	65683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384865938
1071	NC_017342	CAT	2	6	65688	65693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865938
1072	NC_017342	TCA	2	6	65695	65700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865938
1073	NC_017342	TTA	2	6	65821	65826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865938
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1075	NC_017342	GTTTT	2	10	65983	65992	0 %	80 %	20 %	0 %	384865939
1076	NC_017342	ATTT	2	8	66005	66012	25 %	75 %	0 %	0 %	384865939
1077	NC_017342	CATT	2	8	66053	66060	25 %	50 %	0 %	25 %	384865939
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1081	NC_017342	AAT	2	6	66166	66171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865939
1082	NC_017342	ACG	3	9	66235	66243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865939
1083	NC_017342	ATC	2	6	66248	66253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865939
1084	NC_017342	CA	3	6	66291	66296	50 %	0 %	0 %	50 %	384865939
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1086	NC_017342	TTATA	2	10	66339	66348	40 %	60 %	0 %	0 %	384865939
1087	NC_017342	AAG	2	6	66352	66357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384865939
1088	NC_017342	ATC	2	6	66376	66381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865939
1089	NC_017342	TTA	2	6	66394	66399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865939
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1091	NC_017342	TGGT	2	8	66410	66417	0 %	50 %	50 %	0 %	384865939
1092	NC_017342	CAA	2	6	66548	66553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865939
1093	NC_017342	T	6	6	66627	66632	0 %	100 %	0 %	0 %	384865939
1094	NC_017342	AT	4	8	66658	66665	50 %	50 %	0 %	0 %	384865939
1095	NC_017342	ACC	2	6	66714	66719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865939
1096	NC_017342	TAT	2	6	66765	66770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865939
1097	NC_017342	CGC	2	6	66821	66826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384865939
1098	NC_017342	GAG	2	6	66837	66842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384865939
1099	NC_017342	TTA	2	6	66901	66906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865939
1100	NC_017342	A	6	6	66951	66956	100 %	0 %	0 %	0 %	384865939
1101	NC_017342	GC	4	8	67006	67013	0 %	0 %	50 %	50 %	384865939
1102	NC_017342	AGG	2	6	67087	67092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384865939
1103	NC_017342	AATG	2	8	67100	67107	50 %	25 %	25 %	0 %	384865939
1104	NC_017342	CTC	2	6	67131	67136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384865940
1105	NC_017342	TGA	2	6	67141	67146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865940
1106	NC_017342	ATT	2	6	67212	67217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
1107	NC_017342	GTATT	2	10	67219	67228	20 %	60 %	20 %	0 %	384865940
1108	NC_017342	ATT	2	6	67230	67235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
1109	NC_017342	GTC	2	6	67254	67259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865940
1110	NC_017342	ATT	3	9	67275	67283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
1111	NC_017342	ACA	2	6	67356	67361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865940
1112	NC_017342	TTG	2	6	67365	67370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865940
1113	NC_017342	ATTT	2	8	67380	67387	25 %	75 %	0 %	0 %	384865940
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1118	NC_017342	TTTA	2	8	67688	67695	25 %	75 %	0 %	0 %	384865940
1119	NC_017342	ATTT	2	8	67760	67767	25 %	75 %	0 %	0 %	384865940
1120	NC_017342	TAT	2	6	67769	67774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
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1126	NC_017342	AT	3	6	68110	68115	50 %	50 %	0 %	0 %	384865941
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