MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 55353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017342	ATC	2	6	30169	30174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865910
502	NC_017342	TAAT	2	8	30257	30264	50 %	50 %	0 %	0 %	384865910
503	NC_017342	TTG	2	6	30290	30295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865910
504	NC_017342	ACT	3	9	30308	30316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865910
505	NC_017342	AAC	2	6	30376	30381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865910
506	NC_017342	TTC	2	6	30394	30399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865910
507	NC_017342	TAG	2	6	30436	30441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865910
508	NC_017342	TACC	2	8	30450	30457	25 %	25 %	0 %	50 %	384865910
509	NC_017342	AAAT	2	8	30469	30476	75 %	25 %	0 %	0 %	384865910
510	NC_017342	TTCT	2	8	30496	30503	0 %	75 %	0 %	25 %	384865910
511	NC_017342	AAC	2	6	30529	30534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865910
512	NC_017342	CTT	2	6	30546	30551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865910
513	NC_017342	TCA	2	6	30555	30560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865910
514	NC_017342	ACC	2	6	30577	30582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865910
515	NC_017342	CAG	2	6	30591	30596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865910
516	NC_017342	CTTTT	2	10	30616	30625	0 %	80 %	0 %	20 %	384865910
517	NC_017342	T	6	6	30635	30640	0 %	100 %	0 %	0 %	384865910
518	NC_017342	T	6	6	30685	30690	0 %	100 %	0 %	0 %	384865910
519	NC_017342	A	7	7	30694	30700	100 %	0 %	0 %	0 %	384865910
520	NC_017342	TCA	2	6	30729	30734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865910
521	NC_017342	TC	3	6	30757	30762	0 %	50 %	0 %	50 %	384865910
522	NC_017342	CTAA	2	8	30807	30814	50 %	25 %	0 %	25 %	384865911
523	NC_017342	ACA	2	6	30827	30832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865911
524	NC_017342	T	6	6	30855	30860	0 %	100 %	0 %	0 %	384865911
525	NC_017342	CTTT	2	8	30867	30874	0 %	75 %	0 %	25 %	384865911
526	NC_017342	CAC	2	6	30928	30933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865911
527	NC_017342	T	6	6	30948	30953	0 %	100 %	0 %	0 %	384865911
528	NC_017342	TTG	2	6	31022	31027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865911
529	NC_017342	CGT	2	6	31072	31077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865911
530	NC_017342	AT	3	6	31105	31110	50 %	50 %	0 %	0 %	384865911
531	NC_017342	TGA	2	6	31115	31120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865911
532	NC_017342	GGT	2	6	31161	31166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384865911
533	NC_017342	T	6	6	31183	31188	0 %	100 %	0 %	0 %	384865911
534	NC_017342	TAT	2	6	31216	31221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865911
535	NC_017342	TAG	2	6	31259	31264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865911
536	NC_017342	TTC	2	6	31271	31276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865911
537	NC_017342	TGC	3	9	31322	31330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865911
538	NC_017342	CAG	2	6	31354	31359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865911
539	NC_017342	AATA	2	8	31418	31425	75 %	25 %	0 %	0 %	384865911
540	NC_017342	CAA	2	6	31486	31491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865911
541	NC_017342	TCTTT	2	10	31503	31512	0 %	80 %	0 %	20 %	384865911
542	NC_017342	TGT	2	6	31544	31549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865911
543	NC_017342	CAT	2	6	31576	31581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865911
544	NC_017342	AATT	2	8	31609	31616	50 %	50 %	0 %	0 %	384865911
545	NC_017342	AT	3	6	31634	31639	50 %	50 %	0 %	0 %	384865911
546	NC_017342	TGA	2	6	31972	31977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865912
547	NC_017342	GTAT	2	8	32025	32032	25 %	50 %	25 %	0 %	384865912
548	NC_017342	CT	3	6	32039	32044	0 %	50 %	0 %	50 %	384865912
549	NC_017342	CAA	2	6	32072	32077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865912
550	NC_017342	CAAT	2	8	32176	32183	50 %	25 %	0 %	25 %	384865912
551	NC_017342	T	6	6	32337	32342	0 %	100 %	0 %	0 %	384865913
552	NC_017342	TTC	2	6	32346	32351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865913
553	NC_017342	ATAG	2	8	32374	32381	50 %	25 %	25 %	0 %	384865913
554	NC_017342	CTT	2	6	32438	32443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865913
555	NC_017342	TGT	2	6	32446	32451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865913
556	NC_017342	AAT	2	6	32465	32470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865913
557	NC_017342	TCTT	2	8	32492	32499	0 %	75 %	0 %	25 %	384865913
558	NC_017342	TGC	2	6	32511	32516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865913
559	NC_017342	GGT	2	6	32608	32613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384865913
560	NC_017342	CTT	2	6	32732	32737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865913
561	NC_017342	CAT	2	6	32742	32747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865913
562	NC_017342	CAC	2	6	32748	32753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865913
563	NC_017342	TTG	2	6	32775	32780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865913
564	NC_017342	TAA	2	6	32790	32795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865913
565	NC_017342	CGT	2	6	32802	32807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865913
566	NC_017342	CAA	2	6	32828	32833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865913
567	NC_017342	ATT	2	6	32836	32841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865913
568	NC_017342	T	6	6	32840	32845	0 %	100 %	0 %	0 %	384865913
569	NC_017342	CTT	2	6	32873	32878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865913
570	NC_017342	ATT	2	6	33087	33092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865913
571	NC_017342	T	7	7	33131	33137	0 %	100 %	0 %	0 %	384865913
572	NC_017342	AAC	2	6	33160	33165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865913
573	NC_017342	TAT	2	6	33197	33202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865913
574	NC_017342	TCAT	2	8	33220	33227	25 %	50 %	0 %	25 %	384865913
575	NC_017342	TCA	2	6	33413	33418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865914
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577	NC_017342	T	6	6	33490	33495	0 %	100 %	0 %	0 %	384865914
578	NC_017342	TTG	2	6	33616	33621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865914
579	NC_017342	ATC	2	6	33715	33720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865914
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581	NC_017342	GTT	2	6	33960	33965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865915
582	NC_017342	CTT	2	6	33976	33981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865915
583	NC_017342	ATAAG	2	10	33983	33992	60 %	20 %	20 %	0 %	384865915
584	NC_017342	CTA	2	6	34018	34023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865915
585	NC_017342	CAA	2	6	34093	34098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865915
586	NC_017342	CTT	2	6	34129	34134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865915
587	NC_017342	TTA	2	6	34194	34199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865915
588	NC_017342	CTC	2	6	34268	34273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384865915
589	NC_017342	ATGA	2	8	34313	34320	50 %	25 %	25 %	0 %	384865915
590	NC_017342	TAATC	2	10	34407	34416	40 %	40 %	0 %	20 %	384865915
591	NC_017342	ACCAAT	2	12	34424	34435	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384865915
592	NC_017342	TTC	2	6	34478	34483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865915
593	NC_017342	A	6	6	34530	34535	100 %	0 %	0 %	0 %	384865915
594	NC_017342	CG	3	6	34559	34564	0 %	0 %	50 %	50 %	384865915
595	NC_017342	TCACT	2	10	34633	34642	20 %	40 %	0 %	40 %	384865915
596	NC_017342	ATC	3	9	34646	34654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865915
597	NC_017342	TCA	2	6	34662	34667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865915
598	NC_017342	CAG	2	6	34795	34800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865916
599	NC_017342	ATA	2	6	34801	34806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865916
600	NC_017342	AAC	2	6	34856	34861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865916
601	NC_017342	T	6	6	34868	34873	0 %	100 %	0 %	0 %	384865916
602	NC_017342	AAT	2	6	34877	34882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865916
603	NC_017342	ATC	2	6	34883	34888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865916
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607	NC_017342	TCT	2	6	35064	35069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865916
608	NC_017342	AT	3	6	35109	35114	50 %	50 %	0 %	0 %	384865916
609	NC_017342	TAGGTT	2	12	35149	35160	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384865916
610	NC_017342	ACT	2	6	35207	35212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865916
611	NC_017342	AAT	2	6	35289	35294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865916
612	NC_017342	GTT	2	6	35385	35390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865916
613	NC_017342	CTA	2	6	35412	35417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865916
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615	NC_017342	TTA	2	6	35571	35576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865916
616	NC_017342	CAA	2	6	35641	35646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865916
617	NC_017342	ATA	2	6	35699	35704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865916
618	NC_017342	TCA	2	6	35788	35793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865916
619	NC_017342	T	6	6	35816	35821	0 %	100 %	0 %	0 %	384865916
620	NC_017342	AAT	2	6	35861	35866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865916
621	NC_017342	CTG	2	6	35908	35913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865916
622	NC_017342	TCA	2	6	35937	35942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865916
623	NC_017342	TAAC	2	8	35974	35981	50 %	25 %	0 %	25 %	384865916
624	NC_017342	ACA	2	6	36000	36005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865916
625	NC_017342	ATG	2	6	36043	36048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865916
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627	NC_017342	TCATT	2	10	36097	36106	20 %	60 %	0 %	20 %	384865916
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629	NC_017342	TGG	2	6	36116	36121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384865916
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754	NC_017342	T	6	6	42620	42625	0 %	100 %	0 %	0 %	384865926
755	NC_017342	AAAT	2	8	42665	42672	75 %	25 %	0 %	0 %	384865926
756	NC_017342	ATC	2	6	42677	42682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865926
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