MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 55353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017342	ATCTAT	2	12	264459	264470	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384866139
5002	NC_017342	GAT	2	6	264474	264479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866139
5003	NC_017342	GCA	2	6	264484	264489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866139
5004	NC_017342	CAA	2	6	264593	264598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866139
5005	NC_017342	TGC	2	6	264618	264623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866139
5006	NC_017342	AAC	2	6	264721	264726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866139
5007	NC_017342	ACA	2	6	264847	264852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866139
5008	NC_017342	T	7	7	264899	264905	0 %	100 %	0 %	0 %	384866139
5009	NC_017342	T	6	6	265076	265081	0 %	100 %	0 %	0 %	384866140
5010	NC_017342	TTAC	2	8	265128	265135	25 %	50 %	0 %	25 %	384866140
5011	NC_017342	TC	3	6	265217	265222	0 %	50 %	0 %	50 %	384866140
5012	NC_017342	AT	3	6	265317	265322	50 %	50 %	0 %	0 %	384866141
5013	NC_017342	CTA	2	6	265405	265410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866141
5014	NC_017342	CAA	2	6	265412	265417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866141
5015	NC_017342	T	6	6	265500	265505	0 %	100 %	0 %	0 %	384866141
5016	NC_017342	TGC	2	6	265530	265535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866141
5017	NC_017342	CAA	3	9	265556	265564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866141
5018	NC_017342	TGTT	2	8	265614	265621	0 %	75 %	25 %	0 %	384866141
5019	NC_017342	ATG	2	6	265809	265814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866141
5020	NC_017342	ATG	2	6	265872	265877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866141
5021	NC_017342	TTC	2	6	265884	265889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866141
5022	NC_017342	CTTTA	2	10	266178	266187	20 %	60 %	0 %	20 %	384866141
5023	NC_017342	CTT	2	6	266207	266212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866141
5024	NC_017342	AAG	2	6	266217	266222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866141
5025	NC_017342	CAC	2	6	266265	266270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866141
5026	NC_017342	AGATA	2	10	266311	266320	60 %	20 %	20 %	0 %	384866142
5027	NC_017342	ACC	2	6	266333	266338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866142
5028	NC_017342	AT	3	6	266433	266438	50 %	50 %	0 %	0 %	384866142
5029	NC_017342	GAAT	2	8	266475	266482	50 %	25 %	25 %	0 %	384866142
5030	NC_017342	TGC	2	6	266495	266500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866142
5031	NC_017342	CAA	2	6	266503	266508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866142
5032	NC_017342	ACA	2	6	266517	266522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866142
5033	NC_017342	TAA	2	6	266582	266587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866142
5034	NC_017342	ATCCA	2	10	266654	266663	40 %	20 %	0 %	40 %	384866142
5035	NC_017342	TTTA	2	8	266690	266697	25 %	75 %	0 %	0 %	384866142
5036	NC_017342	ATG	2	6	266802	266807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866142
5037	NC_017342	AC	3	6	266830	266835	50 %	0 %	0 %	50 %	384866142
5038	NC_017342	ACCTAA	2	12	266840	266851	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866142
5039	NC_017342	ACTC	2	8	267028	267035	25 %	25 %	0 %	50 %	384866142
5040	NC_017342	ATC	2	6	267036	267041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866142
5041	NC_017342	CTG	2	6	267088	267093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866142
5042	NC_017342	TAA	2	6	267095	267100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866142
5043	NC_017342	TGC	2	6	267137	267142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866142
5044	NC_017342	AAT	2	6	267239	267244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866142
5045	NC_017342	TGC	2	6	267248	267253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866142
5046	NC_017342	GAT	2	6	267258	267263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866142
5047	NC_017342	GAT	2	6	267276	267281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866142
5048	NC_017342	ATCA	2	8	267299	267306	50 %	25 %	0 %	25 %	384866142
5049	NC_017342	TGC	2	6	267344	267349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866142
5050	NC_017342	TAA	2	6	267368	267373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866142
5051	NC_017342	CAAG	2	8	267463	267470	50 %	0 %	25 %	25 %	384866142
5052	NC_017342	TGT	2	6	267796	267801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866143
5053	NC_017342	CAATAC	2	12	267812	267823	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866143
5054	NC_017342	TTCT	2	8	267864	267871	0 %	75 %	0 %	25 %	384866143
5055	NC_017342	TAA	2	6	267891	267896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866143
5056	NC_017342	ATT	2	6	267990	267995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866143
5057	NC_017342	TAC	2	6	267996	268001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866143
5058	NC_017342	CAC	2	6	268022	268027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866143
5059	NC_017342	CTA	2	6	268031	268036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866143
5060	NC_017342	AAT	2	6	268086	268091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866144
5061	NC_017342	TCGT	2	8	268125	268132	0 %	50 %	25 %	25 %	384866144
5062	NC_017342	TTC	2	6	268150	268155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866144
5063	NC_017342	TGT	2	6	268178	268183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866144
5064	NC_017342	ATC	2	6	268198	268203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866144
5065	NC_017342	TCTG	2	8	268241	268248	0 %	50 %	25 %	25 %	384866144
5066	NC_017342	CTT	2	6	268281	268286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866144
5067	NC_017342	CCAT	2	8	268536	268543	25 %	25 %	0 %	50 %	384866144
5068	NC_017342	CTT	2	6	268553	268558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866145
5069	NC_017342	AAT	2	6	268565	268570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866145
5070	NC_017342	T	6	6	268570	268575	0 %	100 %	0 %	0 %	384866145
5071	NC_017342	ATG	2	6	268612	268617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866145
5072	NC_017342	TC	3	6	268648	268653	0 %	50 %	0 %	50 %	384866145
5073	NC_017342	GTA	2	6	268658	268663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866145
5074	NC_017342	GT	3	6	268674	268679	0 %	50 %	50 %	0 %	384866145
5075	NC_017342	CAG	2	6	268691	268696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866145
5076	NC_017342	AAT	2	6	268707	268712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866145
5077	NC_017342	ATC	2	6	268842	268847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866145
5078	NC_017342	AT	3	6	268870	268875	50 %	50 %	0 %	0 %	384866145
5079	NC_017342	TCA	2	6	268930	268935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866145
5080	NC_017342	ATG	2	6	268947	268952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866145
5081	NC_017342	TG	3	6	269008	269013	0 %	50 %	50 %	0 %	384866145
5082	NC_017342	TCT	2	6	269062	269067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866145
5083	NC_017342	TTA	2	6	269164	269169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866145
5084	NC_017342	TCA	2	6	269177	269182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866145
5085	NC_017342	CTT	2	6	269183	269188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866145
5086	NC_017342	ATAA	2	8	269233	269240	75 %	25 %	0 %	0 %	384866145
5087	NC_017342	T	6	6	269241	269246	0 %	100 %	0 %	0 %	384866145
5088	NC_017342	AAT	2	6	269334	269339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866145
5089	NC_017342	CAT	2	6	269370	269375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866145
5090	NC_017342	AC	3	6	269400	269405	50 %	0 %	0 %	50 %	384866145
5091	NC_017342	ATA	2	6	269407	269412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866145
5092	NC_017342	ACA	2	6	269465	269470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866145
5093	NC_017342	TCA	2	6	269593	269598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866145
5094	NC_017342	TAA	2	6	269687	269692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866145
5095	NC_017342	TTG	2	6	269786	269791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866145
5096	NC_017342	AAGT	2	8	269793	269800	50 %	25 %	25 %	0 %	384866145
5097	NC_017342	TAAT	2	8	269899	269906	50 %	50 %	0 %	0 %	384866145
5098	NC_017342	CA	3	6	269952	269957	50 %	0 %	0 %	50 %	384866145
5099	NC_017342	ATCA	2	8	270117	270124	50 %	25 %	0 %	25 %	384866145
5100	NC_017342	GAA	2	6	270132	270137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866145
5101	NC_017342	TCA	2	6	270154	270159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866145
5102	NC_017342	CAA	2	6	270161	270166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866145
5103	NC_017342	ATA	2	6	270333	270338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866145
5104	NC_017342	ACG	2	6	270339	270344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866145
5105	NC_017342	TTG	2	6	270367	270372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866145
5106	NC_017342	TGC	2	6	270385	270390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866145
5107	NC_017342	T	6	6	270500	270505	0 %	100 %	0 %	0 %	384866145
5108	NC_017342	TAG	2	6	270569	270574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866145
5109	NC_017342	TCC	2	6	270627	270632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384866145
5110	NC_017342	TAT	3	9	270953	270961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866146
5111	NC_017342	CTT	2	6	270999	271004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866146
5112	NC_017342	CTG	2	6	271014	271019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866146
5113	NC_017342	CAT	2	6	271170	271175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866146
5114	NC_017342	ACC	2	6	271183	271188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866146
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5116	NC_017342	AAT	2	6	271232	271237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866146
5117	NC_017342	ACG	2	6	271241	271246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866146
5118	NC_017342	ATT	2	6	271261	271266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866146
5119	NC_017342	GCT	2	6	271370	271375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866146
5120	NC_017342	CTG	2	6	271401	271406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866146
5121	NC_017342	ACC	3	9	271429	271437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866146
5122	NC_017342	TCA	2	6	271548	271553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866146
5123	NC_017342	TAA	2	6	271560	271565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866146
5124	NC_017342	TTAA	2	8	271673	271680	50 %	50 %	0 %	0 %	384866146
5125	NC_017342	CTA	3	9	271701	271709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866146
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5233	NC_017342	ATCAT	2	10	278507	278516	40 %	40 %	0 %	20 %	384866153
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5235	NC_017342	CAAA	2	8	278619	278626	75 %	0 %	0 %	25 %	384866153
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5239	NC_017342	TGA	2	6	278793	278798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866153
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5241	NC_017342	A	6	6	278902	278907	100 %	0 %	0 %	0 %	384866153
5242	NC_017342	TAA	2	6	278919	278924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866153
5243	NC_017342	AAT	2	6	278935	278940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866153
5244	NC_017342	AAC	2	6	278941	278946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866153
5245	NC_017342	TGA	2	6	278949	278954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866153
5246	NC_017342	TAAT	2	8	278957	278964	50 %	50 %	0 %	0 %	384866153
5247	NC_017342	ATT	2	6	279016	279021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866153
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5260	NC_017342	TAA	2	6	279806	279811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866154
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5275	NC_017342	TCA	2	6	280440	280445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866154
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5279	NC_017342	TATG	2	8	280570	280577	25 %	50 %	25 %	0 %	384866154
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5340	NC_017342	CAAT	2	8	283425	283432	50 %	25 %	0 %	25 %	384866156
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5349	NC_017342	GGC	2	6	283721	283726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384866157
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5351	NC_017342	ATG	2	6	283859	283864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866157
5352	NC_017342	GCA	2	6	283927	283932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866157
5353	NC_017342	TTCAA	2	10	284032	284041	40 %	40 %	0 %	20 %	384866157
5354	NC_017342	TTC	2	6	284132	284137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866157
5355	NC_017342	GAA	2	6	284155	284160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866157
5356	NC_017342	TAT	2	6	284196	284201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866157
5357	NC_017342	TAT	2	6	284218	284223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866157
5358	NC_017342	ATC	2	6	284278	284283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866157
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5362	NC_017342	ATGGCT	2	12	284351	284362	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384866157
5363	NC_017342	TGTT	2	8	284441	284448	0 %	75 %	25 %	0 %	384866157
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5488	NC_017342	ATC	2	6	291811	291816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866161
5489	NC_017342	CAT	2	6	291817	291822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866161
5490	NC_017342	TTCTT	2	10	291823	291832	0 %	80 %	0 %	20 %	384866161
5491	NC_017342	TGC	2	6	291940	291945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866161
5492	NC_017342	CAAA	2	8	291965	291972	75 %	0 %	0 %	25 %	384866161
5493	NC_017342	AT	3	6	291976	291981	50 %	50 %	0 %	0 %	384866161
5494	NC_017342	TCA	2	6	292010	292015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866161
5495	NC_017342	TAA	2	6	292021	292026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866161
5496	NC_017342	TCACT	2	10	292053	292062	20 %	40 %	0 %	40 %	384866161
5497	NC_017342	TCA	2	6	292070	292075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866161
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5499	NC_017342	TGAT	2	8	292090	292097	25 %	50 %	25 %	0 %	384866161
5500	NC_017342	TTCT	2	8	292111	292118	0 %	75 %	0 %	25 %	384866161

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