MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 55845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017341	ATA	2	6	203480	203485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860844
4003	NC_017341	GAGTTT	2	12	203507	203518	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384860844
4004	NC_017341	TGA	2	6	203524	203529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860844
4005	NC_017341	ATG	2	6	203660	203665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860844
4006	NC_017341	ATTAT	2	10	203688	203697	40 %	60 %	0 %	0 %	384860844
4007	NC_017341	AT	3	6	203700	203705	50 %	50 %	0 %	0 %	384860844
4008	NC_017341	AAC	2	6	203736	203741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860844
4009	NC_017341	GAT	2	6	203783	203788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860844
4010	NC_017341	TGT	2	6	203836	203841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860844
4011	NC_017341	CTT	2	6	203844	203849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860844
4012	NC_017341	GAT	2	6	203858	203863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860844
4013	NC_017341	A	6	6	203900	203905	100 %	0 %	0 %	0 %	384860844
4014	NC_017341	GA	4	8	203931	203938	50 %	0 %	50 %	0 %	384860844
4015	NC_017341	GTG	2	6	203988	203993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860844
4016	NC_017341	A	7	7	204014	204020	100 %	0 %	0 %	0 %	384860844
4017	NC_017341	GAAA	2	8	204040	204047	75 %	0 %	25 %	0 %	384860844
4018	NC_017341	AAC	2	6	204088	204093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860844
4019	NC_017341	GT	3	6	204105	204110	0 %	50 %	50 %	0 %	384860844
4020	NC_017341	ATA	2	6	204316	204321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860845
4021	NC_017341	TGT	2	6	204389	204394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860845
4022	NC_017341	TGA	2	6	204395	204400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860845
4023	NC_017341	TA	3	6	204414	204419	50 %	50 %	0 %	0 %	384860845
4024	NC_017341	TA	3	6	204463	204468	50 %	50 %	0 %	0 %	384860845
4025	NC_017341	TAA	2	6	204521	204526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860845
4026	NC_017341	ACT	2	6	204558	204563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860845
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4028	NC_017341	GTA	2	6	204711	204716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860845
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4030	NC_017341	AGA	2	6	204881	204886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860845
4031	NC_017341	ATG	2	6	204949	204954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860845
4032	NC_017341	A	7	7	205020	205026	100 %	0 %	0 %	0 %	384860845
4033	NC_017341	AGC	2	6	205061	205066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860845
4034	NC_017341	AAAG	2	8	205109	205116	75 %	0 %	25 %	0 %	384860845
4035	NC_017341	AAT	2	6	205152	205157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860845
4036	NC_017341	TTTA	2	8	205379	205386	25 %	75 %	0 %	0 %	384860846
4037	NC_017341	ATA	2	6	205444	205449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860846
4038	NC_017341	TCT	2	6	205450	205455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860846
4039	NC_017341	TTA	2	6	205459	205464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860846
4040	NC_017341	CATGT	2	10	205527	205536	20 %	40 %	20 %	20 %	384860846
4041	NC_017341	TGA	2	6	205538	205543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860846
4042	NC_017341	ATAA	2	8	205544	205551	75 %	25 %	0 %	0 %	384860846
4043	NC_017341	TAA	2	6	205581	205586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860846
4044	NC_017341	GAT	2	6	205590	205595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860846
4045	NC_017341	TTGAA	2	10	205602	205611	40 %	40 %	20 %	0 %	384860846
4046	NC_017341	TCG	2	6	205633	205638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860846
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4049	NC_017341	TAA	2	6	205778	205783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860846
4050	NC_017341	GTC	2	6	205785	205790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860846
4051	NC_017341	ATGA	2	8	205809	205816	50 %	25 %	25 %	0 %	384860846
4052	NC_017341	TCA	2	6	205918	205923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860846
4053	NC_017341	TAAA	2	8	205928	205935	75 %	25 %	0 %	0 %	384860846
4054	NC_017341	CGA	2	6	205988	205993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860846
4055	NC_017341	CCCTGA	2	12	206016	206027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384860846
4056	NC_017341	TAA	2	6	206142	206147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860846
4057	NC_017341	TGA	2	6	206182	206187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860846
4058	NC_017341	TGT	2	6	206227	206232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860846
4059	NC_017341	TCG	2	6	206299	206304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860846
4060	NC_017341	GTGA	2	8	206331	206338	25 %	25 %	50 %	0 %	384860846
4061	NC_017341	ATA	2	6	206344	206349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860846
4062	NC_017341	GTT	2	6	206422	206427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860846
4063	NC_017341	ACC	2	6	206496	206501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384860846
4064	NC_017341	TTTG	2	8	206633	206640	0 %	75 %	25 %	0 %	384860846
4065	NC_017341	AG	3	6	206667	206672	50 %	0 %	50 %	0 %	384860846
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4068	NC_017341	GTA	2	6	206798	206803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860846
4069	NC_017341	TCCTGA	2	12	206835	206846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384860846
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4087	NC_017341	TTAG	2	8	207469	207476	25 %	50 %	25 %	0 %	384860847
4088	NC_017341	AT	3	6	207477	207482	50 %	50 %	0 %	0 %	384860847
4089	NC_017341	TCA	2	6	207512	207517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860847
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4092	NC_017341	TCAAT	2	10	207615	207624	40 %	40 %	0 %	20 %	384860847
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4106	NC_017341	TCT	2	6	208179	208184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860847
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4110	NC_017341	TGGG	2	8	208295	208302	0 %	25 %	75 %	0 %	384860847
4111	NC_017341	TA	4	8	208307	208314	50 %	50 %	0 %	0 %	384860847
4112	NC_017341	ATT	2	6	208342	208347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860847
4113	NC_017341	AT	3	6	208349	208354	50 %	50 %	0 %	0 %	384860847
4114	NC_017341	ACA	2	6	208425	208430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860848
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4119	NC_017341	CAT	2	6	208614	208619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860848
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4248	NC_017341	CAA	2	6	215876	215881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860853
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4255	NC_017341	ATGG	2	8	216490	216497	25 %	25 %	50 %	0 %	384860853
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4265	NC_017341	A	6	6	216818	216823	100 %	0 %	0 %	0 %	384860853
4266	NC_017341	ATCGT	2	10	216830	216839	20 %	40 %	20 %	20 %	384860853
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4277	NC_017341	ATA	2	6	217328	217333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860854
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4352	NC_017341	A	6	6	220770	220775	100 %	0 %	0 %	0 %	384860857
4353	NC_017341	TA	3	6	220822	220827	50 %	50 %	0 %	0 %	384860857
4354	NC_017341	ATTT	2	8	220857	220864	25 %	75 %	0 %	0 %	384860857
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4360	NC_017341	TAAAT	2	10	221036	221045	60 %	40 %	0 %	0 %	384860857
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4363	NC_017341	GAA	2	6	221132	221137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860857
4364	NC_017341	CGA	2	6	221143	221148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860857
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