MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 55845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017341	AAG	2	6	178736	178741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860829
3503	NC_017341	GTG	2	6	178907	178912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860829
3504	NC_017341	TTA	2	6	178958	178963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860829
3505	NC_017341	GAT	2	6	179051	179056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860829
3506	NC_017341	TATT	2	8	179087	179094	25 %	75 %	0 %	0 %	384860829
3507	NC_017341	T	6	6	179134	179139	0 %	100 %	0 %	0 %	384860829
3508	NC_017341	ATC	2	6	179149	179154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860829
3509	NC_017341	AT	3	6	179227	179232	50 %	50 %	0 %	0 %	384860829
3510	NC_017341	TGT	2	6	179233	179238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860829
3511	NC_017341	GAT	2	6	179240	179245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860829
3512	NC_017341	TGT	2	6	179272	179277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860829
3513	NC_017341	AAG	2	6	179289	179294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860829
3514	NC_017341	AGCCA	2	10	179361	179370	40 %	0 %	20 %	40 %	384860829
3515	NC_017341	CAT	2	6	179426	179431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860829
3516	NC_017341	ATT	2	6	179432	179437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860829
3517	NC_017341	ATG	2	6	179439	179444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860829
3518	NC_017341	AATG	2	8	179464	179471	50 %	25 %	25 %	0 %	384860829
3519	NC_017341	ATT	2	6	179497	179502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860829
3520	NC_017341	ATG	2	6	179666	179671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860829
3521	NC_017341	CAA	2	6	179687	179692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860829
3522	NC_017341	GTT	2	6	179770	179775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860829
3523	NC_017341	GAT	2	6	179795	179800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860829
3524	NC_017341	GTT	2	6	179801	179806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860829
3525	NC_017341	TA	3	6	179880	179885	50 %	50 %	0 %	0 %	384860829
3526	NC_017341	ATCA	2	8	180003	180010	50 %	25 %	0 %	25 %	384860829
3527	NC_017341	ATG	2	6	180012	180017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860829
3528	NC_017341	ATT	2	6	180031	180036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860829
3529	NC_017341	TAC	2	6	180051	180056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860829
3530	NC_017341	AC	3	6	180101	180106	50 %	0 %	0 %	50 %	384860829
3531	NC_017341	TCA	2	6	180147	180152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860829
3532	NC_017341	GAA	2	6	180155	180160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860829
3533	NC_017341	CAAT	2	8	180177	180184	50 %	25 %	0 %	25 %	384860829
3534	NC_017341	TATGAT	2	12	180244	180255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860829
3535	NC_017341	GGA	2	6	180313	180318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384860829
3536	NC_017341	AAAT	2	8	180373	180380	75 %	25 %	0 %	0 %	384860829
3537	NC_017341	TGA	2	6	180397	180402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860829
3538	NC_017341	ATGA	2	8	180440	180447	50 %	25 %	25 %	0 %	384860829
3539	NC_017341	TAA	2	6	180543	180548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860829
3540	NC_017341	GCG	2	6	180572	180577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384860829
3541	NC_017341	TA	3	6	180608	180613	50 %	50 %	0 %	0 %	384860829
3542	NC_017341	GGA	2	6	180658	180663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384860829
3543	NC_017341	TTGAAA	2	12	180696	180707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860829
3544	NC_017341	TTG	2	6	180747	180752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860829
3545	NC_017341	ATG	2	6	180774	180779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860829
3546	NC_017341	TTG	2	6	180893	180898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860829
3547	NC_017341	TGCA	2	8	180906	180913	25 %	25 %	25 %	25 %	384860829
3548	NC_017341	TTG	2	6	181000	181005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860829
3549	NC_017341	AG	3	6	181040	181045	50 %	0 %	50 %	0 %	384860829
3550	NC_017341	ACA	2	6	181069	181074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860829
3551	NC_017341	TAA	2	6	181081	181086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860829
3552	NC_017341	AT	3	6	181198	181203	50 %	50 %	0 %	0 %	384860829
3553	NC_017341	TCA	2	6	181257	181262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860829
3554	NC_017341	TAT	2	6	181345	181350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860829
3555	NC_017341	AT	3	6	181423	181428	50 %	50 %	0 %	0 %	384860829
3556	NC_017341	AAT	2	6	181463	181468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860829
3557	NC_017341	GTG	2	6	181497	181502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860829
3558	NC_017341	GAA	2	6	181545	181550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860829
3559	NC_017341	TGA	2	6	181591	181596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860829
3560	NC_017341	TGT	2	6	181639	181644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860829
3561	NC_017341	AT	3	6	181671	181676	50 %	50 %	0 %	0 %	384860829
3562	NC_017341	TTA	2	6	181684	181689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860829
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3565	NC_017341	TAC	2	6	181816	181821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860829
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3569	NC_017341	TTG	2	6	181899	181904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860829
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3587	NC_017341	AGA	2	6	182617	182622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860829
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3594	NC_017341	GATA	2	8	183127	183134	50 %	25 %	25 %	0 %	384860829
3595	NC_017341	AAT	2	6	183151	183156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860829
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3602	NC_017341	GT	4	8	183551	183558	0 %	50 %	50 %	0 %	384860830
3603	NC_017341	AAAG	2	8	183698	183705	75 %	0 %	25 %	0 %	384860830
3604	NC_017341	ATTG	2	8	183715	183722	25 %	50 %	25 %	0 %	384860830
3605	NC_017341	TATGA	2	10	183752	183761	40 %	40 %	20 %	0 %	384860830
3606	NC_017341	ATCA	2	8	183777	183784	50 %	25 %	0 %	25 %	384860830
3607	NC_017341	GTGAA	2	10	183786	183795	40 %	20 %	40 %	0 %	384860830
3608	NC_017341	ATTT	2	8	183805	183812	25 %	75 %	0 %	0 %	384860830
3609	NC_017341	A	6	6	183866	183871	100 %	0 %	0 %	0 %	384860830
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3612	NC_017341	TGT	2	6	184258	184263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860831
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3614	NC_017341	CA	3	6	184339	184344	50 %	0 %	0 %	50 %	384860831
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3987	NC_017341	AAT	2	6	202769	202774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860844
3988	NC_017341	TTA	2	6	202839	202844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860844
3989	NC_017341	AAC	2	6	202884	202889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860844
3990	NC_017341	GAT	2	6	202931	202936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860844
3991	NC_017341	TAA	2	6	202996	203001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860844
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3997	NC_017341	CA	3	6	203406	203411	50 %	0 %	0 %	50 %	384860844
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3999	NC_017341	GAA	2	6	203432	203437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860844
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