MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 55845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017341	CGA	3	9	25409	25417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860701
502	NC_017341	AATC	2	8	25437	25444	50 %	25 %	0 %	25 %	384860701
503	NC_017341	GGT	2	6	25525	25530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860701
504	NC_017341	TA	3	6	25547	25552	50 %	50 %	0 %	0 %	384860701
505	NC_017341	ATA	2	6	25634	25639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860701
506	NC_017341	TTG	2	6	25655	25660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860701
507	NC_017341	ATT	2	6	25674	25679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860701
508	NC_017341	ACCAA	2	10	25720	25729	60 %	0 %	0 %	40 %	384860701
509	NC_017341	ATG	2	6	25802	25807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860701
510	NC_017341	TAA	2	6	25833	25838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860701
511	NC_017341	AAG	2	6	25856	25861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
512	NC_017341	TAT	2	6	25926	25931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860701
513	NC_017341	CGT	2	6	25942	25947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860701
514	NC_017341	CGTATT	2	12	25951	25962	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384860701
515	NC_017341	AGA	2	6	26001	26006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
516	NC_017341	CAT	2	6	26007	26012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860701
517	NC_017341	GAA	2	6	26062	26067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
518	NC_017341	AAT	2	6	26077	26082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860701
519	NC_017341	TTA	2	6	26092	26097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860701
520	NC_017341	GAA	3	9	26107	26115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
521	NC_017341	AAC	3	9	26204	26212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860701
522	NC_017341	CGT	2	6	26227	26232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860701
523	NC_017341	TTG	2	6	26237	26242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860701
524	NC_017341	GAA	2	6	26305	26310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
525	NC_017341	GAA	2	6	26362	26367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
526	NC_017341	ATCAA	2	10	26432	26441	60 %	20 %	0 %	20 %	384860701
527	NC_017341	TAA	2	6	26472	26477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860701
528	NC_017341	ATT	2	6	26479	26484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860701
529	NC_017341	ACA	2	6	26512	26517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860701
530	NC_017341	GGT	2	6	26779	26784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860701
531	NC_017341	ATCT	2	8	26871	26878	25 %	50 %	0 %	25 %	384860701
532	NC_017341	AAT	2	6	26924	26929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860701
533	NC_017341	TGA	2	6	26970	26975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860702
534	NC_017341	AT	3	6	26989	26994	50 %	50 %	0 %	0 %	384860702
535	NC_017341	AAG	2	6	27044	27049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860702
536	NC_017341	GAAAC	2	10	27053	27062	60 %	0 %	20 %	20 %	384860702
537	NC_017341	ATT	2	6	27116	27121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860702
538	NC_017341	ATC	2	6	27135	27140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860702
539	NC_017341	A	6	6	27193	27198	100 %	0 %	0 %	0 %	384860702
540	NC_017341	GAAGT	2	10	27203	27212	40 %	20 %	40 %	0 %	384860702
541	NC_017341	TCG	2	6	27226	27231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860702
542	NC_017341	TGA	2	6	27243	27248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860702
543	NC_017341	ATT	2	6	27274	27279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860702
544	NC_017341	ATTTCA	2	12	27354	27365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384860702
545	NC_017341	ATG	2	6	27384	27389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860702
546	NC_017341	TGA	2	6	27391	27396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860702
547	NC_017341	AAC	2	6	27448	27453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860702
548	NC_017341	T	6	6	27472	27477	0 %	100 %	0 %	0 %	384860702
549	NC_017341	A	6	6	27497	27502	100 %	0 %	0 %	0 %	384860702
550	NC_017341	ATC	2	6	27524	27529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860702
551	NC_017341	ACAA	2	8	27530	27537	75 %	0 %	0 %	25 %	384860702
552	NC_017341	ACG	2	6	27554	27559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860702
553	NC_017341	AATG	2	8	27634	27641	50 %	25 %	25 %	0 %	384860702
554	NC_017341	TCGT	2	8	27666	27673	0 %	50 %	25 %	25 %	384860702
555	NC_017341	GTG	2	6	27684	27689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860702
556	NC_017341	ACA	2	6	27699	27704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860702
557	NC_017341	ATA	2	6	27705	27710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860702
558	NC_017341	GAA	2	6	27794	27799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860702
559	NC_017341	TTA	2	6	27822	27827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860702
560	NC_017341	TGG	2	6	27835	27840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860702
561	NC_017341	AAT	2	6	27875	27880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860702
562	NC_017341	TAA	2	6	27931	27936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860702
563	NC_017341	TCG	2	6	27991	27996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860702
564	NC_017341	TGT	2	6	28015	28020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860702
565	NC_017341	ATA	2	6	28035	28040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860702
566	NC_017341	AACA	2	8	28111	28118	75 %	0 %	0 %	25 %	384860702
567	NC_017341	ATG	2	6	28212	28217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860702
568	NC_017341	TAA	2	6	28333	28338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860703
569	NC_017341	CA	3	6	28350	28355	50 %	0 %	0 %	50 %	384860703
570	NC_017341	CAA	2	6	28391	28396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860703
571	NC_017341	GAA	2	6	28397	28402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860703
572	NC_017341	TAAA	2	8	28425	28432	75 %	25 %	0 %	0 %	384860703
573	NC_017341	TGG	2	6	28525	28530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860703
574	NC_017341	ATT	2	6	28534	28539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860703
575	NC_017341	GT	3	6	28614	28619	0 %	50 %	50 %	0 %	384860703
576	NC_017341	GTTCTG	2	12	28653	28664	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384860703
577	NC_017341	AAT	2	6	28703	28708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860703
578	NC_017341	AGA	2	6	28735	28740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860703
579	NC_017341	TAA	2	6	28741	28746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860703
580	NC_017341	CAAT	2	8	28763	28770	50 %	25 %	0 %	25 %	384860703
581	NC_017341	GATG	2	8	28771	28778	25 %	25 %	50 %	0 %	384860703
582	NC_017341	AAG	2	6	28805	28810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860703
583	NC_017341	ATTAT	2	10	28846	28855	40 %	60 %	0 %	0 %	384860703
584	NC_017341	A	6	6	28868	28873	100 %	0 %	0 %	0 %	384860703
585	NC_017341	TGA	2	6	28876	28881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860703
586	NC_017341	TAC	2	6	28904	28909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860703
587	NC_017341	AACGA	2	10	28919	28928	60 %	0 %	20 %	20 %	384860703
588	NC_017341	TACT	2	8	28993	29000	25 %	50 %	0 %	25 %	384860703
589	NC_017341	ATA	2	6	29016	29021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860703
590	NC_017341	ATT	2	6	29030	29035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860703
591	NC_017341	GTA	2	6	29469	29474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860704
592	NC_017341	GAA	2	6	29549	29554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860704
593	NC_017341	GGCA	2	8	29691	29698	25 %	0 %	50 %	25 %	384860704
594	NC_017341	AAAG	2	8	29704	29711	75 %	0 %	25 %	0 %	384860704
595	NC_017341	ATG	2	6	29805	29810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860704
596	NC_017341	ATA	2	6	29838	29843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860704
597	NC_017341	AAG	2	6	29849	29854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860704
598	NC_017341	AAC	2	6	29988	29993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860704
599	NC_017341	ATA	2	6	30102	30107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860704
600	NC_017341	GAAC	2	8	30148	30155	50 %	0 %	25 %	25 %	384860704
601	NC_017341	AAG	2	6	30174	30179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860704
602	NC_017341	AT	3	6	30218	30223	50 %	50 %	0 %	0 %	384860704
603	NC_017341	TTA	2	6	30468	30473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860705
604	NC_017341	AAC	2	6	30575	30580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860705
605	NC_017341	CAA	2	6	30592	30597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860705
606	NC_017341	CAA	2	6	30606	30611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860705
607	NC_017341	CAA	2	6	30619	30624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860705
608	NC_017341	TCA	2	6	30635	30640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860705
609	NC_017341	GAA	2	6	30648	30653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860705
610	NC_017341	CAAC	2	8	30658	30665	50 %	0 %	0 %	50 %	384860705
611	NC_017341	ATCAGC	2	12	30668	30679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384860705
612	NC_017341	TGA	2	6	30692	30697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860705
613	NC_017341	ACAA	2	8	30699	30706	75 %	0 %	0 %	25 %	384860705
614	NC_017341	CAG	2	6	30745	30750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860705
615	NC_017341	CAA	2	6	30754	30759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860705
616	NC_017341	AAACG	2	10	30764	30773	60 %	0 %	20 %	20 %	384860705
617	NC_017341	CG	3	6	30772	30777	0 %	0 %	50 %	50 %	384860705
618	NC_017341	ACA	2	6	30788	30793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860705
619	NC_017341	CAC	2	6	30862	30867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384860705
620	NC_017341	ACA	3	9	30894	30902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860705
621	NC_017341	TACA	2	8	30913	30920	50 %	25 %	0 %	25 %	384860705
622	NC_017341	GAA	2	6	30945	30950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860705
623	NC_017341	GAA	2	6	31071	31076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860705
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625	NC_017341	ATT	2	6	31272	31277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860705
626	NC_017341	CAG	2	6	31363	31368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860705
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