MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 56183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017333	ATT	2	6	25547	25552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601309
502	NC_017333	TTA	2	6	25591	25596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601309
503	NC_017333	GTAC	2	8	25630	25637	25 %	25 %	25 %	25 %	387601309
504	NC_017333	TCG	2	6	25653	25658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601309
505	NC_017333	GAT	2	6	25678	25683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601309
506	NC_017333	TCC	2	6	25730	25735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387601309
507	NC_017333	AAC	2	6	25736	25741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601309
508	NC_017333	AAC	2	6	25775	25780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601310
509	NC_017333	GCT	2	6	25881	25886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601310
510	NC_017333	AAG	2	6	25897	25902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601310
511	NC_017333	TTA	2	6	25996	26001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601310
512	NC_017333	ATT	3	9	26059	26067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601310
513	NC_017333	CGA	3	9	26069	26077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601310
514	NC_017333	AATC	2	8	26097	26104	50 %	25 %	0 %	25 %	387601310
515	NC_017333	GGT	2	6	26185	26190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601310
516	NC_017333	TA	3	6	26207	26212	50 %	50 %	0 %	0 %	387601310
517	NC_017333	ATA	2	6	26294	26299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601310
518	NC_017333	TTG	2	6	26315	26320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601310
519	NC_017333	ATT	2	6	26334	26339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601310
520	NC_017333	ACCAA	2	10	26380	26389	60 %	0 %	0 %	40 %	387601310
521	NC_017333	ATG	2	6	26462	26467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601310
522	NC_017333	TAA	2	6	26493	26498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601310
523	NC_017333	AAG	2	6	26516	26521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601310
524	NC_017333	TAT	2	6	26586	26591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601310
525	NC_017333	CCG	2	6	26601	26606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387601310
526	NC_017333	AGA	2	6	26661	26666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601310
527	NC_017333	CAT	2	6	26667	26672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601310
528	NC_017333	TTA	2	6	26676	26681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601310
529	NC_017333	GAA	2	6	26722	26727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601310
530	NC_017333	AAT	2	6	26737	26742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601310
531	NC_017333	TTA	2	6	26752	26757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601310
532	NC_017333	GAA	3	9	26767	26775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601310
533	NC_017333	AAC	3	9	26864	26872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601310
534	NC_017333	CGT	2	6	26887	26892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601310
535	NC_017333	TTG	2	6	26897	26902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601310
536	NC_017333	GAA	2	6	26965	26970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601310
537	NC_017333	GAA	2	6	27022	27027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601310
538	NC_017333	ATCAA	2	10	27092	27101	60 %	20 %	0 %	20 %	387601310
539	NC_017333	TAA	2	6	27132	27137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601310
540	NC_017333	ATT	2	6	27139	27144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601310
541	NC_017333	ACA	2	6	27172	27177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601310
542	NC_017333	GGT	2	6	27439	27444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601310
543	NC_017333	ATCT	2	8	27531	27538	25 %	50 %	0 %	25 %	387601310
544	NC_017333	AAT	2	6	27584	27589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601310
545	NC_017333	TGA	2	6	27630	27635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601311
546	NC_017333	AT	3	6	27649	27654	50 %	50 %	0 %	0 %	387601311
547	NC_017333	AAG	2	6	27704	27709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601311
548	NC_017333	GAAAC	2	10	27713	27722	60 %	0 %	20 %	20 %	387601311
549	NC_017333	ATT	2	6	27776	27781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601311
550	NC_017333	ATC	2	6	27795	27800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601311
551	NC_017333	GAAGT	2	10	27863	27872	40 %	20 %	40 %	0 %	387601311
552	NC_017333	TCG	2	6	27886	27891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601311
553	NC_017333	TGA	2	6	27903	27908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601311
554	NC_017333	ATT	2	6	27934	27939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601311
555	NC_017333	ATTTCA	2	12	28014	28025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387601311
556	NC_017333	ATG	2	6	28044	28049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601311
557	NC_017333	TGA	2	6	28051	28056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601311
558	NC_017333	T	6	6	28132	28137	0 %	100 %	0 %	0 %	387601311
559	NC_017333	A	6	6	28157	28162	100 %	0 %	0 %	0 %	387601311
560	NC_017333	ATC	2	6	28184	28189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601311
561	NC_017333	ACAA	2	8	28190	28197	75 %	0 %	0 %	25 %	387601311
562	NC_017333	ACG	2	6	28214	28219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601311
563	NC_017333	AATG	2	8	28294	28301	50 %	25 %	25 %	0 %	387601311
564	NC_017333	TCGT	2	8	28326	28333	0 %	50 %	25 %	25 %	387601311
565	NC_017333	GTG	2	6	28344	28349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601311
566	NC_017333	ACA	2	6	28359	28364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601311
567	NC_017333	ATA	2	6	28365	28370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601311
568	NC_017333	GAA	2	6	28454	28459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601311
569	NC_017333	TTA	2	6	28482	28487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601311
570	NC_017333	TGG	2	6	28495	28500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601311
571	NC_017333	AAT	2	6	28535	28540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601311
572	NC_017333	TAA	2	6	28591	28596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601311
573	NC_017333	TCG	2	6	28651	28656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601311
574	NC_017333	TGT	2	6	28675	28680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601311
575	NC_017333	ATA	2	6	28695	28700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601311
576	NC_017333	ATG	2	6	28872	28877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601311
577	NC_017333	TAA	2	6	28993	28998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601312
578	NC_017333	CA	3	6	29010	29015	50 %	0 %	0 %	50 %	387601312
579	NC_017333	TAA	2	6	29032	29037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601312
580	NC_017333	AAG	2	6	29055	29060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601312
581	NC_017333	TAAA	2	8	29085	29092	75 %	25 %	0 %	0 %	387601312
582	NC_017333	ATT	2	6	29194	29199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601312
583	NC_017333	GT	3	6	29274	29279	0 %	50 %	50 %	0 %	387601312
584	NC_017333	GTTCTG	2	12	29313	29324	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387601312
585	NC_017333	AAT	2	6	29363	29368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601312
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587	NC_017333	CAAT	2	8	29423	29430	50 %	25 %	0 %	25 %	387601312
588	NC_017333	GATG	2	8	29431	29438	25 %	25 %	50 %	0 %	387601312
589	NC_017333	AAG	2	6	29465	29470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601312
590	NC_017333	ATTAT	2	10	29506	29515	40 %	60 %	0 %	0 %	387601312
591	NC_017333	A	6	6	29528	29533	100 %	0 %	0 %	0 %	387601312
592	NC_017333	TGA	2	6	29536	29541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601312
593	NC_017333	TAC	2	6	29564	29569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601312
594	NC_017333	AACGA	2	10	29579	29588	60 %	0 %	20 %	20 %	387601312
595	NC_017333	TACT	2	8	29653	29660	25 %	50 %	0 %	25 %	387601312
596	NC_017333	ATA	2	6	29676	29681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601312
597	NC_017333	ATT	2	6	29690	29695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601312
598	NC_017333	GTA	2	6	30129	30134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601313
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600	NC_017333	GGCA	2	8	30351	30358	25 %	0 %	50 %	25 %	387601313
601	NC_017333	AAAG	2	8	30364	30371	75 %	0 %	25 %	0 %	387601313
602	NC_017333	ATTT	2	8	30397	30404	25 %	75 %	0 %	0 %	387601313
603	NC_017333	ATG	2	6	30465	30470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601313
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605	NC_017333	AAG	2	6	30509	30514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601313
606	NC_017333	AAC	2	6	30648	30653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601313
607	NC_017333	ATA	2	6	30762	30767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601313
608	NC_017333	GAAC	2	8	30808	30815	50 %	0 %	25 %	25 %	387601313
609	NC_017333	AAG	2	6	30834	30839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601313
610	NC_017333	AT	3	6	30878	30883	50 %	50 %	0 %	0 %	387601313
611	NC_017333	TTA	2	6	31128	31133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601314
612	NC_017333	AGC	2	6	31204	31209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601314
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614	NC_017333	CAA	2	6	31266	31271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601314
615	NC_017333	CAA	2	6	31279	31284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601314
616	NC_017333	AGC	2	6	31289	31294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601314
617	NC_017333	TCA	2	6	31298	31303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601314
618	NC_017333	GAA	2	6	31311	31316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601314
619	NC_017333	CAAC	2	8	31321	31328	50 %	0 %	0 %	50 %	387601314
620	NC_017333	TGA	2	6	31355	31360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601314
621	NC_017333	ACAA	2	8	31362	31369	75 %	0 %	0 %	25 %	387601314
622	NC_017333	CAG	2	6	31408	31413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601314
623	NC_017333	CAA	2	6	31417	31422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601314
624	NC_017333	AAACG	2	10	31427	31436	60 %	0 %	20 %	20 %	387601314
625	NC_017333	CG	3	6	31435	31440	0 %	0 %	50 %	50 %	387601314
626	NC_017333	ACA	2	6	31451	31456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601314
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