MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 56183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017333	TAA	2	6	246481	246486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601514
5002	NC_017333	T	6	6	246509	246514	0 %	100 %	0 %	0 %	387601514
5003	NC_017333	TCA	2	6	246522	246527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601514
5004	NC_017333	TAT	2	6	246634	246639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601514
5005	NC_017333	TTG	2	6	246651	246656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601514
5006	NC_017333	TACT	2	8	246785	246792	25 %	50 %	0 %	25 %	387601514
5007	NC_017333	ACAT	2	8	246898	246905	50 %	25 %	0 %	25 %	387601514
5008	NC_017333	GGTT	2	8	246913	246920	0 %	50 %	50 %	0 %	387601514
5009	NC_017333	TTA	2	6	246978	246983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601514
5010	NC_017333	TTG	2	6	247005	247010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601514
5011	NC_017333	ATT	2	6	247049	247054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601514
5012	NC_017333	GTC	2	6	247067	247072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601514
5013	NC_017333	CAT	2	6	247122	247127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601514
5014	NC_017333	ATG	2	6	247161	247166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601514
5015	NC_017333	ATAA	2	8	247178	247185	75 %	25 %	0 %	0 %	387601514
5016	NC_017333	AT	3	6	247188	247193	50 %	50 %	0 %	0 %	387601514
5017	NC_017333	TTA	2	6	247202	247207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601514
5018	NC_017333	TCA	2	6	247328	247333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601514
5019	NC_017333	AGC	2	6	247345	247350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601514
5020	NC_017333	ATGG	2	8	247355	247362	25 %	25 %	50 %	0 %	387601514
5021	NC_017333	AAT	2	6	247457	247462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601514
5022	NC_017333	TTAT	2	8	247470	247477	25 %	75 %	0 %	0 %	387601514
5023	NC_017333	TAA	2	6	247483	247488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601514
5024	NC_017333	GGT	2	6	247490	247495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601514
5025	NC_017333	CCA	2	6	247496	247501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387601514
5026	NC_017333	GTA	2	6	247521	247526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601514
5027	NC_017333	AAC	2	6	247571	247576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601514
5028	NC_017333	ATTA	2	8	247600	247607	50 %	50 %	0 %	0 %	387601514
5029	NC_017333	TTG	2	6	247617	247622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601514
5030	NC_017333	ATTCA	2	10	247637	247646	40 %	40 %	0 %	20 %	387601514
5031	NC_017333	GAGG	2	8	247670	247677	25 %	0 %	75 %	0 %	387601514
5032	NC_017333	AGA	2	6	247693	247698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601515
5033	NC_017333	GAT	2	6	247739	247744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601515
5034	NC_017333	TCA	2	6	247750	247755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601515
5035	NC_017333	ACT	2	6	247766	247771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601515
5036	NC_017333	AGT	2	6	247878	247883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601515
5037	NC_017333	TTG	2	6	247990	247995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601515
5038	NC_017333	ATT	2	6	248090	248095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601515
5039	NC_017333	TA	3	6	248122	248127	50 %	50 %	0 %	0 %	387601515
5040	NC_017333	TGG	2	6	248129	248134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601515
5041	NC_017333	TGA	2	6	248195	248200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601515
5042	NC_017333	GTT	2	6	248280	248285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601515
5043	NC_017333	AAG	2	6	248342	248347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601515
5044	NC_017333	TTA	2	6	248386	248391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601515
5045	NC_017333	AAT	2	6	248406	248411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601515
5046	NC_017333	GCA	2	6	248424	248429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601515
5047	NC_017333	TTCTTG	2	12	248466	248477	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387601515
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5049	NC_017333	ATG	2	6	248794	248799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601516
5050	NC_017333	GTG	2	6	248825	248830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601516
5051	NC_017333	AGC	2	6	248916	248921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601516
5052	NC_017333	ATG	2	6	248963	248968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601516
5053	NC_017333	ATGTG	2	10	249074	249083	20 %	40 %	40 %	0 %	387601516
5054	NC_017333	CAG	2	6	249107	249112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601516
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5056	NC_017333	GATA	2	8	249126	249133	50 %	25 %	25 %	0 %	387601516
5057	NC_017333	A	6	6	249151	249156	100 %	0 %	0 %	0 %	387601516
5058	NC_017333	TA	3	6	249203	249208	50 %	50 %	0 %	0 %	387601516
5059	NC_017333	ATTT	2	8	249238	249245	25 %	75 %	0 %	0 %	387601516
5060	NC_017333	TCG	3	9	249264	249272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601516
5061	NC_017333	GAA	2	6	249304	249309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601516
5062	NC_017333	GGA	2	6	249319	249324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387601516
5063	NC_017333	AC	3	6	249343	249348	50 %	0 %	0 %	50 %	387601516
5064	NC_017333	GAT	2	6	249369	249374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601516
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5066	NC_017333	AGC	2	6	249428	249433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601516
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5070	NC_017333	CGA	2	6	249524	249529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601516
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5091	NC_017333	AT	3	6	250726	250731	50 %	50 %	0 %	0 %	387601517
5092	NC_017333	AAAGC	2	10	250757	250766	60 %	0 %	20 %	20 %	387601517
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5104	NC_017333	TGCA	2	8	251498	251505	25 %	25 %	25 %	25 %	387601518
5105	NC_017333	TGG	2	6	251596	251601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601518
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5122	NC_017333	TAA	2	6	252492	252497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601519
5123	NC_017333	AAT	2	6	252518	252523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601519
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5230	NC_017333	ATA	2	6	258027	258032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601523
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5232	NC_017333	AGA	2	6	258833	258838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601524
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5239	NC_017333	A	6	6	259048	259053	100 %	0 %	0 %	0 %	387601524
5240	NC_017333	GGACGT	2	12	259164	259175	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387601524
5241	NC_017333	TCG	2	6	259190	259195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601524
5242	NC_017333	GAA	2	6	259227	259232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601524
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5488	NC_017333	GAT	2	6	272734	272739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601533
5489	NC_017333	ATA	2	6	272816	272821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601533
5490	NC_017333	TTC	2	6	272857	272862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601533
5491	NC_017333	GAA	2	6	272880	272885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601533
5492	NC_017333	TTGAA	2	10	272976	272985	40 %	40 %	20 %	0 %	387601533
5493	NC_017333	TGC	2	6	273085	273090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601533
5494	NC_017333	TCA	2	6	273152	273157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601533
5495	NC_017333	GTGA	2	8	273206	273213	25 %	25 %	50 %	0 %	387601533
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5497	NC_017333	GCC	2	6	273291	273296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387601533
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5499	NC_017333	ATA	2	6	273339	273344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601533
5500	NC_017333	T	6	6	273394	273399	0 %	100 %	0 %	0 %	387601533

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