MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 9169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017328	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	384541582
2	NC_017328	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	384541582
3	NC_017328	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	384541582
4	NC_017328	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	384541582
5	NC_017328	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	384541582
6	NC_017328	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	384541582
7	NC_017328	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	384541583
8	NC_017328	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	384541583
9	NC_017328	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	384541583
10	NC_017328	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	384541583
11	NC_017328	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	384541583
12	NC_017328	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	384541583
13	NC_017328	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	384541584
14	NC_017328	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	384541586
15	NC_017328	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	384541586
16	NC_017328	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	384541587
17	NC_017328	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	384541587
18	NC_017328	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	384541587
19	NC_017328	GGCG	2	8	8743	8750	0 %	0 %	75 %	25 %	384541587
20	NC_017328	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	384541587
21	NC_017328	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	384541589
22	NC_017328	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	384541589
23	NC_017328	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	384541590
24	NC_017328	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	384541590
25	NC_017328	CAGT	2	8	11496	11503	25 %	25 %	25 %	25 %	384541592
26	NC_017328	ATGG	2	8	12216	12223	25 %	25 %	50 %	0 %	384541593
27	NC_017328	TGGT	2	8	12307	12314	0 %	50 %	50 %	0 %	384541593
28	NC_017328	ACCG	2	8	12674	12681	25 %	0 %	25 %	50 %	384541593
29	NC_017328	CAAC	2	8	12820	12827	50 %	0 %	0 %	50 %	384541593
30	NC_017328	AAGA	2	8	12894	12901	75 %	0 %	25 %	0 %	384541593
31	NC_017328	CCAT	2	8	13471	13478	25 %	25 %	0 %	50 %	384541593
32	NC_017328	GGTT	2	8	16285	16292	0 %	50 %	50 %	0 %	384541596
33	NC_017328	GTGG	2	8	16909	16916	0 %	25 %	75 %	0 %	384541596
34	NC_017328	CGTT	2	8	17281	17288	0 %	50 %	25 %	25 %	384541596
35	NC_017328	TTTA	2	8	17453	17460	25 %	75 %	0 %	0 %	384541597
36	NC_017328	CCAC	2	8	17756	17763	25 %	0 %	0 %	75 %	384541597
37	NC_017328	GCCA	2	8	18877	18884	25 %	0 %	25 %	50 %	384541598
38	NC_017328	CAGC	2	8	19010	19017	25 %	0 %	25 %	50 %	384541598
39	NC_017328	AGGA	2	8	19350	19357	50 %	0 %	50 %	0 %	384541599
40	NC_017328	CATA	2	8	20377	20384	50 %	25 %	0 %	25 %	384541602
41	NC_017328	TGCG	2	8	20633	20640	0 %	25 %	50 %	25 %	384541602
42	NC_017328	GCTG	2	8	20875	20882	0 %	25 %	50 %	25 %	384541602
43	NC_017328	CCGC	2	8	21264	21271	0 %	0 %	25 %	75 %	384541602
44	NC_017328	CTGG	2	8	21621	21628	0 %	25 %	50 %	25 %	384541603
45	NC_017328	CTGC	2	8	22082	22089	0 %	25 %	25 %	50 %	384541603
46	NC_017328	TGCG	2	8	22632	22639	0 %	25 %	50 %	25 %	384541603
47	NC_017328	TGGT	2	8	23044	23051	0 %	50 %	50 %	0 %	384541603
48	NC_017328	GTGG	2	8	23837	23844	0 %	25 %	75 %	0 %	384541603
49	NC_017328	GCTG	2	8	24191	24198	0 %	25 %	50 %	25 %	384541604
50	NC_017328	ATGG	2	8	25050	25057	25 %	25 %	50 %	0 %	384541605
51	NC_017328	TTGA	2	8	25921	25928	25 %	50 %	25 %	0 %	384541606
52	NC_017328	TGGC	2	8	26464	26471	0 %	25 %	50 %	25 %	384541607
53	NC_017328	CTGG	2	8	26924	26931	0 %	25 %	50 %	25 %	384541607
54	NC_017328	GTGG	2	8	27089	27096	0 %	25 %	75 %	0 %	384541607
55	NC_017328	GCTG	2	8	27441	27448	0 %	25 %	50 %	25 %	384541608
56	NC_017328	CGTG	2	8	27918	27925	0 %	25 %	50 %	25 %	384541608
57	NC_017328	TCCT	2	8	28700	28707	0 %	50 %	0 %	50 %	384541609
58	NC_017328	CTTA	2	8	28728	28735	25 %	50 %	0 %	25 %	384541609
59	NC_017328	AGCC	2	8	29630	29637	25 %	0 %	25 %	50 %	384541609
60	NC_017328	GACC	2	8	29896	29903	25 %	0 %	25 %	50 %	384541610
61	NC_017328	GCTG	2	8	30196	30203	0 %	25 %	50 %	25 %	384541610
62	NC_017328	TGAT	2	8	30345	30352	25 %	50 %	25 %	0 %	384541610
63	NC_017328	CGCA	2	8	30896	30903	25 %	0 %	25 %	50 %	384541610
64	NC_017328	CTGT	2	8	31070	31077	0 %	50 %	25 %	25 %	384541610
65	NC_017328	GGCG	2	8	31246	31253	0 %	0 %	75 %	25 %	384541610
66	NC_017328	ACCG	2	8	31400	31407	25 %	0 %	25 %	50 %	384541610
67	NC_017328	CGTC	2	8	31874	31881	0 %	25 %	25 %	50 %	384541610
68	NC_017328	TGGC	2	8	32337	32344	0 %	25 %	50 %	25 %	384541610
69	NC_017328	GCTG	2	8	32350	32357	0 %	25 %	50 %	25 %	384541610
70	NC_017328	GCAC	2	8	32935	32942	25 %	0 %	25 %	50 %	384541610
71	NC_017328	GGTG	2	8	33282	33289	0 %	25 %	75 %	0 %	384541611
72	NC_017328	AAGA	2	8	33517	33524	75 %	0 %	25 %	0 %	384541611
73	NC_017328	CCAT	2	8	33970	33977	25 %	25 %	0 %	50 %	384541612
74	NC_017328	ATTT	2	8	35184	35191	25 %	75 %	0 %	0 %	384541613
75	NC_017328	TTCT	2	8	35196	35203	0 %	75 %	0 %	25 %	384541614
76	NC_017328	TTCA	2	8	35327	35334	25 %	50 %	0 %	25 %	384541614
77	NC_017328	AGCC	2	8	35541	35548	25 %	0 %	25 %	50 %	384541614
78	NC_017328	CCCG	2	8	35703	35710	0 %	0 %	25 %	75 %	384541614
79	NC_017328	TCGG	2	8	36175	36182	0 %	25 %	50 %	25 %	384541614
80	NC_017328	ACTC	2	8	36287	36294	25 %	25 %	0 %	50 %	384541614
81	NC_017328	GGCG	2	8	36454	36461	0 %	0 %	75 %	25 %	384541614
82	NC_017328	CCAT	2	8	36988	36995	25 %	25 %	0 %	50 %	384541615
83	NC_017328	TGAT	2	8	37010	37017	25 %	50 %	25 %	0 %	384541615
84	NC_017328	AGGC	2	8	37541	37548	25 %	0 %	50 %	25 %	384541615
85	NC_017328	CCGA	2	8	38627	38634	25 %	0 %	25 %	50 %	384541616
86	NC_017328	CCCG	2	8	39023	39030	0 %	0 %	25 %	75 %	384541616
87	NC_017328	TCCA	2	8	39075	39082	25 %	25 %	0 %	50 %	384541616
88	NC_017328	TTAA	2	8	39328	39335	50 %	50 %	0 %	0 %	384541617
89	NC_017328	CACC	2	8	39872	39879	25 %	0 %	0 %	75 %	384541617
90	NC_017328	AGCC	2	8	40439	40446	25 %	0 %	25 %	50 %	384541617
91	NC_017328	CCAG	2	8	40639	40646	25 %	0 %	25 %	50 %	384541617
92	NC_017328	AACC	2	8	40647	40654	50 %	0 %	0 %	50 %	384541617
93	NC_017328	GAAA	2	8	40798	40805	75 %	0 %	25 %	0 %	384541617
94	NC_017328	GTGC	2	8	41225	41232	0 %	25 %	50 %	25 %	384541618
95	NC_017328	TGAT	2	8	41461	41468	25 %	50 %	25 %	0 %	384541618
96	NC_017328	CTGC	2	8	41721	41728	0 %	25 %	25 %	50 %	384541618
97	NC_017328	GTTA	2	8	43071	43078	25 %	50 %	25 %	0 %	384541619
98	NC_017328	GGCG	2	8	43117	43124	0 %	0 %	75 %	25 %	384541619
99	NC_017328	CACC	2	8	43622	43629	25 %	0 %	0 %	75 %	384541619
100	NC_017328	ATTG	2	8	43869	43876	25 %	50 %	25 %	0 %	384541619
101	NC_017328	TTGT	2	8	45153	45160	0 %	75 %	25 %	0 %	384541621
102	NC_017328	TGTT	2	8	45344	45351	0 %	75 %	25 %	0 %	384541621
103	NC_017328	CTGG	2	8	45609	45616	0 %	25 %	50 %	25 %	384541621
104	NC_017328	TGCG	2	8	46817	46824	0 %	25 %	50 %	25 %	384541623
105	NC_017328	ATGA	2	8	46972	46979	50 %	25 %	25 %	0 %	384541623
106	NC_017328	GGCG	2	8	47313	47320	0 %	0 %	75 %	25 %	384541623
107	NC_017328	GGAT	2	8	47927	47934	25 %	25 %	50 %	0 %	384541623
108	NC_017328	AACC	2	8	47997	48004	50 %	0 %	0 %	50 %	384541623
109	NC_017328	CAGG	2	8	48094	48101	25 %	0 %	50 %	25 %	384541623
110	NC_017328	TGGC	2	8	48360	48367	0 %	25 %	50 %	25 %	384541623
111	NC_017328	CCTG	2	8	48694	48701	0 %	25 %	25 %	50 %	384541625
112	NC_017328	TAAA	2	8	48732	48739	75 %	25 %	0 %	0 %	384541625
113	NC_017328	AATC	2	8	48768	48775	50 %	25 %	0 %	25 %	384541625
114	NC_017328	GCAG	2	8	49257	49264	25 %	0 %	50 %	25 %	384541626
115	NC_017328	ACCC	2	8	49272	49279	25 %	0 %	0 %	75 %	384541626
116	NC_017328	AAGA	2	8	49570	49577	75 %	0 %	25 %	0 %	384541626
117	NC_017328	AATG	2	8	50034	50041	50 %	25 %	25 %	0 %	384541627
118	NC_017328	GGCA	2	8	51482	51489	25 %	0 %	50 %	25 %	384541629
119	NC_017328	CGGT	2	8	52083	52090	0 %	25 %	50 %	25 %	384541629
120	NC_017328	GTCA	2	8	52606	52613	25 %	25 %	25 %	25 %	384541630
121	NC_017328	GCTT	2	8	53775	53782	0 %	50 %	25 %	25 %	384541631
122	NC_017328	ACCT	2	8	53855	53862	25 %	25 %	0 %	50 %	384541631
123	NC_017328	CACC	2	8	55249	55256	25 %	0 %	0 %	75 %	384541631
124	NC_017328	CTAC	2	8	55359	55366	25 %	25 %	0 %	50 %	384541631
125	NC_017328	GTAC	2	8	55605	55612	25 %	25 %	25 %	25 %	384541631
126	NC_017328	GCCA	2	8	56404	56411	25 %	0 %	25 %	50 %	384541632
127	NC_017328	GATG	2	8	57445	57452	25 %	25 %	50 %	0 %	384541633
128	NC_017328	CTGC	2	8	57587	57594	0 %	25 %	25 %	50 %	384541633
129	NC_017328	AACC	2	8	57714	57721	50 %	0 %	0 %	50 %	384541633
130	NC_017328	CCTG	2	8	57816	57823	0 %	25 %	25 %	50 %	384541634
131	NC_017328	ATCA	2	8	57965	57972	50 %	25 %	0 %	25 %	384541634
132	NC_017328	TACC	2	8	58240	58247	25 %	25 %	0 %	50 %	384541634
133	NC_017328	TGAT	2	8	58488	58495	25 %	50 %	25 %	0 %	384541634
134	NC_017328	CAGC	2	8	60148	60155	25 %	0 %	25 %	50 %	384541634
135	NC_017328	TGCG	2	8	60541	60548	0 %	25 %	50 %	25 %	384541634
136	NC_017328	TCAA	2	8	61589	61596	50 %	25 %	0 %	25 %	384541635
137	NC_017328	GGCA	2	8	61793	61800	25 %	0 %	50 %	25 %	384541635
138	NC_017328	ATCA	2	8	61891	61898	50 %	25 %	0 %	25 %	384541635
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