MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017328	CGG	2	6	192140	192145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541750
3503	NC_017328	CGG	2	6	192201	192206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541750
3504	NC_017328	CAA	2	6	192327	192332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541750
3505	NC_017328	TGA	2	6	192359	192364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541750
3506	NC_017328	TGA	2	6	192369	192374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541750
3507	NC_017328	CAA	2	6	192415	192420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541750
3508	NC_017328	TTA	2	6	192491	192496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541751
3509	NC_017328	ACT	2	6	192534	192539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541751
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3511	NC_017328	GAA	2	6	192627	192632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541751
3512	NC_017328	GC	3	6	192644	192649	0 %	0 %	50 %	50 %	384541751
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3515	NC_017328	TAC	2	6	192801	192806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541751
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3517	NC_017328	A	6	6	192883	192888	100 %	0 %	0 %	0 %	384541751
3518	NC_017328	CGC	2	6	192891	192896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541751
3519	NC_017328	AGT	2	6	192938	192943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541751
3520	NC_017328	GAT	2	6	192956	192961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541751
3521	NC_017328	TGAT	2	8	192991	192998	25 %	50 %	25 %	0 %	384541752
3522	NC_017328	CA	3	6	193060	193065	50 %	0 %	0 %	50 %	384541752
3523	NC_017328	TGA	2	6	193339	193344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541752
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3525	NC_017328	CAA	2	6	193397	193402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541752
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3529	NC_017328	CAT	2	6	193478	193483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541752
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3532	NC_017328	CG	3	6	193759	193764	0 %	0 %	50 %	50 %	384541752
3533	NC_017328	TGAC	2	8	193779	193786	25 %	25 %	25 %	25 %	384541753
3534	NC_017328	TTG	2	6	193890	193895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541753
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3540	NC_017328	ATGCC	2	10	194286	194295	20 %	20 %	20 %	40 %	384541753
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3544	NC_017328	CGC	2	6	194486	194491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541753
3545	NC_017328	TGGA	2	8	194547	194554	25 %	25 %	50 %	0 %	384541753
3546	NC_017328	ACT	2	6	194590	194595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541753
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3553	NC_017328	GTC	2	6	195001	195006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541754
3554	NC_017328	GC	3	6	195031	195036	0 %	0 %	50 %	50 %	384541754
3555	NC_017328	CG	3	6	195136	195141	0 %	0 %	50 %	50 %	384541754
3556	NC_017328	CGA	2	6	195156	195161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541754
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3559	NC_017328	GGC	2	6	195363	195368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541754
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3595	NC_017328	AGCCG	2	10	196983	196992	20 %	0 %	40 %	40 %	384541755
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3888	NC_017328	CAG	2	6	212480	212485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541771
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3984	NC_017328	TGC	2	6	224003	224008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541777
3985	NC_017328	GGT	2	6	224024	224029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541777
3986	NC_017328	CAC	2	6	224102	224107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541777
3987	NC_017328	ATG	2	6	224191	224196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541777
3988	NC_017328	GCA	2	6	224202	224207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541777
3989	NC_017328	GTGAA	2	10	224212	224221	40 %	20 %	40 %	0 %	384541777
3990	NC_017328	GAT	2	6	224246	224251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541777
3991	NC_017328	TAATT	2	10	224396	224405	40 %	60 %	0 %	0 %	384541777
3992	NC_017328	TAG	2	6	224467	224472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541777
3993	NC_017328	ATC	2	6	224559	224564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541777
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