MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017328	TGC	2	6	163346	163351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3002	NC_017328	TGA	2	6	163380	163385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541726
3003	NC_017328	TGGCG	2	10	163386	163395	0 %	20 %	60 %	20 %	384541726
3004	NC_017328	GGC	2	6	163431	163436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541726
3005	NC_017328	TCA	2	6	163454	163459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541726
3006	NC_017328	GCT	2	6	163464	163469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3007	NC_017328	GTT	2	6	163503	163508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541726
3008	NC_017328	CGC	2	6	163511	163516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541726
3009	NC_017328	GCG	2	6	163539	163544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541726
3010	NC_017328	CTG	2	6	163546	163551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3011	NC_017328	CGT	2	6	163568	163573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3012	NC_017328	ATC	2	6	163609	163614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541726
3013	NC_017328	TGGA	2	8	163633	163640	25 %	25 %	50 %	0 %	384541726
3014	NC_017328	GCT	2	6	163680	163685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3015	NC_017328	GCT	2	6	163692	163697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3016	NC_017328	GCA	2	6	163709	163714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3017	NC_017328	GC	3	6	163718	163723	0 %	0 %	50 %	50 %	384541726
3018	NC_017328	GCG	2	6	163790	163795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541726
3019	NC_017328	TGT	2	6	163799	163804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541726
3020	NC_017328	TGG	3	9	163814	163822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541726
3021	NC_017328	GGC	2	6	163914	163919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541726
3022	NC_017328	TAT	2	6	163956	163961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541726
3023	NC_017328	CGGCG	2	10	164016	164025	0 %	0 %	60 %	40 %	384541726
3024	NC_017328	TGGTG	2	10	164028	164037	0 %	40 %	60 %	0 %	384541726
3025	NC_017328	GTT	2	6	164076	164081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541726
3026	NC_017328	GCAG	2	8	164086	164093	25 %	0 %	50 %	25 %	384541726
3027	NC_017328	GCG	2	6	164101	164106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541726
3028	NC_017328	CGC	2	6	164130	164135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541726
3029	NC_017328	TGA	2	6	164210	164215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541726
3030	NC_017328	GTG	2	6	164228	164233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541726
3031	NC_017328	GCC	2	6	164351	164356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541726
3032	NC_017328	GCTG	2	8	164357	164364	0 %	25 %	50 %	25 %	384541726
3033	NC_017328	GTG	2	6	164381	164386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541726
3034	NC_017328	CG	3	6	164391	164396	0 %	0 %	50 %	50 %	384541726
3035	NC_017328	GCT	3	9	164433	164441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3036	NC_017328	CGA	2	6	164468	164473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3037	NC_017328	TTG	2	6	164495	164500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541726
3038	NC_017328	GAT	2	6	164526	164531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541726
3039	NC_017328	GACG	2	8	164540	164547	25 %	0 %	50 %	25 %	384541726
3040	NC_017328	CA	3	6	164552	164557	50 %	0 %	0 %	50 %	384541726
3041	NC_017328	TGG	2	6	164573	164578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541726
3042	NC_017328	CTG	2	6	164587	164592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3043	NC_017328	TTCCA	2	10	164627	164636	20 %	40 %	0 %	40 %	384541726
3044	NC_017328	CGG	2	6	164642	164647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541726
3045	NC_017328	GCT	2	6	164649	164654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
3046	NC_017328	GCA	2	6	164772	164777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541727
3047	NC_017328	CAT	2	6	164870	164875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541727
3048	NC_017328	GAA	2	6	164879	164884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541727
3049	NC_017328	AGA	2	6	164953	164958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541727
3050	NC_017328	ACC	2	6	164969	164974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541727
3051	NC_017328	CTT	2	6	165004	165009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541727
3052	NC_017328	CAG	2	6	165020	165025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541727
3053	NC_017328	TTCA	2	8	165086	165093	25 %	50 %	0 %	25 %	384541727
3054	NC_017328	ACG	2	6	165188	165193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541727
3055	NC_017328	ACC	2	6	165194	165199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541727
3056	NC_017328	CCG	2	6	165222	165227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541727
3057	NC_017328	AAT	2	6	165268	165273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541727
3058	NC_017328	TCA	2	6	165307	165312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541727
3059	NC_017328	GAT	2	6	165320	165325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541727
3060	NC_017328	TCG	2	6	165342	165347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541727
3061	NC_017328	GCG	2	6	165382	165387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541727
3062	NC_017328	TGCC	2	8	165403	165410	0 %	25 %	25 %	50 %	384541727
3063	NC_017328	CGA	2	6	165418	165423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541727
3064	NC_017328	TGGC	2	8	165539	165546	0 %	25 %	50 %	25 %	384541727
3065	NC_017328	CAG	2	6	165578	165583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541727
3066	NC_017328	AAC	2	6	165604	165609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541727
3067	NC_017328	TCG	2	6	165670	165675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541727
3068	NC_017328	TCGG	2	8	165759	165766	0 %	25 %	50 %	25 %	384541727
3069	NC_017328	CGG	2	6	165790	165795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541727
3070	NC_017328	GCC	2	6	165935	165940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541727
3071	NC_017328	CG	3	6	165991	165996	0 %	0 %	50 %	50 %	384541727
3072	NC_017328	CG	3	6	166290	166295	0 %	0 %	50 %	50 %	384541728
3073	NC_017328	CTT	2	6	166324	166329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541728
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3075	NC_017328	GTC	2	6	166372	166377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541728
3076	NC_017328	GCTG	2	8	166392	166399	0 %	25 %	50 %	25 %	384541728
3077	NC_017328	CTG	2	6	166463	166468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541728
3078	NC_017328	CGG	2	6	166508	166513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541728
3079	NC_017328	TGG	2	6	166621	166626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541728
3080	NC_017328	CGG	2	6	166668	166673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541728
3081	NC_017328	CGG	2	6	166713	166718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541728
3082	NC_017328	TGA	2	6	166761	166766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541728
3083	NC_017328	GCT	2	6	166779	166784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541728
3084	NC_017328	TGC	3	9	166794	166802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541728
3085	NC_017328	GCTG	2	8	166806	166813	0 %	25 %	50 %	25 %	384541728
3086	NC_017328	CGC	2	6	166826	166831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541728
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3088	NC_017328	TATT	2	8	166904	166911	25 %	75 %	0 %	0 %	384541728
3089	NC_017328	TTGA	2	8	166963	166970	25 %	50 %	25 %	0 %	384541728
3090	NC_017328	TAT	2	6	167028	167033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541728
3091	NC_017328	TAA	2	6	167058	167063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541728
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3093	NC_017328	CGG	2	6	167103	167108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541728
3094	NC_017328	G	8	8	167133	167140	0 %	0 %	100 %	0 %	384541728
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3100	NC_017328	GGC	2	6	167445	167450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541728
3101	NC_017328	CG	3	6	167458	167463	0 %	0 %	50 %	50 %	384541728
3102	NC_017328	TTCTGG	2	12	167480	167491	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384541728
3103	NC_017328	ATT	2	6	167527	167532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541728
3104	NC_017328	CGG	2	6	167568	167573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541728
3105	NC_017328	GC	3	6	167599	167604	0 %	0 %	50 %	50 %	384541728
3106	NC_017328	CAGC	2	8	167654	167661	25 %	0 %	25 %	50 %	384541728
3107	NC_017328	TGA	2	6	167760	167765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541729
3108	NC_017328	GCA	2	6	167794	167799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541729
3109	NC_017328	CAA	2	6	167802	167807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541729
3110	NC_017328	TGA	2	6	167907	167912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541729
3111	NC_017328	TGG	2	6	167960	167965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541729
3112	NC_017328	CGG	2	6	167994	167999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541729
3113	NC_017328	TGCGGT	2	12	168070	168081	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384541729
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3119	NC_017328	CGC	2	6	168379	168384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541730
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3121	NC_017328	TGT	2	6	168838	168843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541731
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3243	NC_017328	CAG	2	6	176597	176602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541737
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3343	NC_017328	GAA	2	6	181946	181951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541741
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3347	NC_017328	GCA	2	6	182103	182108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541741
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3350	NC_017328	TGG	2	6	182449	182454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541742
3351	NC_017328	TGCAC	2	10	182563	182572	20 %	20 %	20 %	40 %	384541742
3352	NC_017328	ACAGCT	2	12	182628	182639	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384541742
3353	NC_017328	CAA	2	6	182665	182670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541742
3354	NC_017328	GTG	2	6	182675	182680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541742
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3356	NC_017328	ACC	2	6	182714	182719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541742
3357	NC_017328	CAG	2	6	182724	182729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541742
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3359	NC_017328	TGCGC	2	10	182956	182965	0 %	20 %	40 %	40 %	384541742
3360	NC_017328	AAG	2	6	182985	182990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541742
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3362	NC_017328	CTG	2	6	183407	183412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541743
3363	NC_017328	ACGCCG	2	12	183440	183451	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384541743
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3463	NC_017328	CG	3	6	189316	189321	0 %	0 %	50 %	50 %	384541748
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3469	NC_017328	CAA	2	6	189872	189877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541748
3470	NC_017328	GACGT	2	10	189891	189900	20 %	20 %	40 %	20 %	384541748
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3472	NC_017328	TAC	2	6	190179	190184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541748
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3483	NC_017328	GGC	2	6	190968	190973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541749
3484	NC_017328	CAG	2	6	191011	191016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541749
3485	NC_017328	A	6	6	191116	191121	100 %	0 %	0 %	0 %	384541749
3486	NC_017328	CGT	2	6	191230	191235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541749
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3488	NC_017328	CTG	2	6	191276	191281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541749
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