MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017328	ACG	2	6	137940	137945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541700
2502	NC_017328	GGC	2	6	138081	138086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541700
2503	NC_017328	GCT	2	6	138185	138190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541700
2504	NC_017328	CTT	2	6	138218	138223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541700
2505	NC_017328	GTG	2	6	138260	138265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541700
2506	NC_017328	ACC	2	6	138408	138413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541700
2507	NC_017328	CAG	2	6	138420	138425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541700
2508	NC_017328	ACC	2	6	138430	138435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541700
2509	NC_017328	GAA	2	6	138507	138512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541700
2510	NC_017328	AGC	2	6	138589	138594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541700
2511	NC_017328	GCGCG	2	10	138614	138623	0 %	0 %	60 %	40 %	384541700
2512	NC_017328	GTA	2	6	138678	138683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541700
2513	NC_017328	GCC	2	6	138690	138695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541700
2514	NC_017328	CCAG	2	8	138704	138711	25 %	0 %	25 %	50 %	384541700
2515	NC_017328	TCG	2	6	138777	138782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541700
2516	NC_017328	TTG	2	6	138949	138954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541701
2517	NC_017328	GTC	2	6	139076	139081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541701
2518	NC_017328	TGG	2	6	139124	139129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541701
2519	NC_017328	CTG	2	6	139132	139137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541701
2520	NC_017328	TTTATG	2	12	139147	139158	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384541701
2521	NC_017328	CCA	2	6	139235	139240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541701
2522	NC_017328	TTG	2	6	139301	139306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541701
2523	NC_017328	ATC	2	6	139312	139317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541701
2524	NC_017328	GCT	2	6	139392	139397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541701
2525	NC_017328	CCGTC	2	10	139405	139414	0 %	20 %	20 %	60 %	384541701
2526	NC_017328	GTGAA	2	10	139415	139424	40 %	20 %	40 %	0 %	384541701
2527	NC_017328	TGG	2	6	139469	139474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541701
2528	NC_017328	CTG	2	6	139534	139539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541701
2529	NC_017328	TGG	2	6	139663	139668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541702
2530	NC_017328	GCA	2	6	139687	139692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541702
2531	NC_017328	CGT	2	6	139696	139701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541702
2532	NC_017328	TGG	2	6	139765	139770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541702
2533	NC_017328	GTTCA	2	10	139802	139811	20 %	40 %	20 %	20 %	384541702
2534	NC_017328	CA	3	6	139810	139815	50 %	0 %	0 %	50 %	384541702
2535	NC_017328	GCA	2	6	139888	139893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541702
2536	NC_017328	GTT	2	6	139898	139903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541702
2537	NC_017328	CGG	2	6	139930	139935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541702
2538	NC_017328	CGC	3	9	139942	139950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541702
2539	NC_017328	ATA	2	6	139968	139973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541702
2540	NC_017328	ATCCA	2	10	140128	140137	40 %	20 %	0 %	40 %	384541702
2541	NC_017328	A	6	6	140174	140179	100 %	0 %	0 %	0 %	384541702
2542	NC_017328	CCA	2	6	140194	140199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541702
2543	NC_017328	TTG	2	6	140220	140225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541702
2544	NC_017328	TGA	2	6	140227	140232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541702
2545	NC_017328	A	8	8	140390	140397	100 %	0 %	0 %	0 %	384541703
2546	NC_017328	GGC	2	6	140405	140410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541703
2547	NC_017328	TAT	2	6	140506	140511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541703
2548	NC_017328	CT	3	6	140515	140520	0 %	50 %	0 %	50 %	384541703
2549	NC_017328	TAAA	2	8	140523	140530	75 %	25 %	0 %	0 %	384541703
2550	NC_017328	CGGG	2	8	140536	140543	0 %	0 %	75 %	25 %	384541703
2551	NC_017328	GCA	2	6	140644	140649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541703
2552	NC_017328	CAGG	2	8	140663	140670	25 %	0 %	50 %	25 %	384541703
2553	NC_017328	TAC	2	6	140672	140677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541703
2554	NC_017328	AGC	2	6	140724	140729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541703
2555	NC_017328	AACG	2	8	140750	140757	50 %	0 %	25 %	25 %	384541703
2556	NC_017328	ACT	2	6	140827	140832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541703
2557	NC_017328	CGA	2	6	140839	140844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541703
2558	NC_017328	ACCG	2	8	140845	140852	25 %	0 %	25 %	50 %	384541703
2559	NC_017328	CGC	2	6	140873	140878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541703
2560	NC_017328	CAC	2	6	140917	140922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541703
2561	NC_017328	CAT	2	6	140923	140928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541703
2562	NC_017328	CA	3	6	140935	140940	50 %	0 %	0 %	50 %	384541703
2563	NC_017328	GAA	2	6	140948	140953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541703
2564	NC_017328	ATT	2	6	140981	140986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541703
2565	NC_017328	TGG	2	6	141000	141005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541703
2566	NC_017328	GCT	2	6	141025	141030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541703
2567	NC_017328	TGTT	2	8	141243	141250	0 %	75 %	25 %	0 %	384541703
2568	NC_017328	ATG	2	6	141283	141288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541703
2569	NC_017328	GCC	2	6	141369	141374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541704
2570	NC_017328	TCA	2	6	141377	141382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541704
2571	NC_017328	CTTTA	2	10	141391	141400	20 %	60 %	0 %	20 %	384541704
2572	NC_017328	ATG	2	6	141484	141489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541704
2573	NC_017328	TCA	2	6	141523	141528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541704
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2575	NC_017328	GCT	2	6	141564	141569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541704
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2577	NC_017328	CGG	2	6	141612	141617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541704
2578	NC_017328	TGGCG	2	10	141618	141627	0 %	20 %	60 %	20 %	384541704
2579	NC_017328	TGTT	2	8	141635	141642	0 %	75 %	25 %	0 %	384541704
2580	NC_017328	T	6	6	141670	141675	0 %	100 %	0 %	0 %	384541704
2581	NC_017328	CGG	2	6	141728	141733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541704
2582	NC_017328	GCC	2	6	141864	141869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541704
2583	NC_017328	ATG	2	6	141947	141952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541704
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2585	NC_017328	ACGTGG	2	12	142029	142040	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384541704
2586	NC_017328	A	6	6	142221	142226	100 %	0 %	0 %	0 %	384541705
2587	NC_017328	CTT	2	6	142236	142241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541705
2588	NC_017328	ATG	2	6	142296	142301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541705
2589	NC_017328	TCT	2	6	142342	142347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541705
2590	NC_017328	ATT	2	6	142388	142393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541705
2591	NC_017328	GAT	2	6	142454	142459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541705
2592	NC_017328	TGGG	2	8	142513	142520	0 %	25 %	75 %	0 %	384541705
2593	NC_017328	AGT	2	6	142530	142535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541705
2594	NC_017328	CAA	3	9	142545	142553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541705
2595	NC_017328	A	7	7	142552	142558	100 %	0 %	0 %	0 %	384541705
2596	NC_017328	CTG	2	6	142686	142691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541706
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2600	NC_017328	CAA	2	6	142949	142954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541706
2601	NC_017328	GC	3	6	143140	143145	0 %	0 %	50 %	50 %	384541706
2602	NC_017328	CGA	2	6	143201	143206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541706
2603	NC_017328	CGA	2	6	143233	143238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541706
2604	NC_017328	GAA	2	6	143330	143335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541706
2605	NC_017328	GGT	2	6	143360	143365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541706
2606	NC_017328	TGA	2	6	143375	143380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541706
2607	NC_017328	T	6	6	143570	143575	0 %	100 %	0 %	0 %	384541706
2608	NC_017328	CGC	2	6	143655	143660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541706
2609	NC_017328	GGC	2	6	143709	143714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541706
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2611	NC_017328	GTT	2	6	143807	143812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541706
2612	NC_017328	TTTCA	2	10	143931	143940	20 %	60 %	0 %	20 %	384541707
2613	NC_017328	CTT	2	6	143984	143989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541707
2614	NC_017328	GAT	2	6	144015	144020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541707
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2617	NC_017328	GCA	2	6	144257	144262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541707
2618	NC_017328	TGA	2	6	144358	144363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541708
2619	NC_017328	CAG	2	6	144392	144397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541708
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2742	NC_017328	GCA	2	6	150912	150917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541716
2743	NC_017328	TGC	2	6	150941	150946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541716
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2745	NC_017328	ATG	2	6	150979	150984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541716
2746	NC_017328	CGT	2	6	151002	151007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541716
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2748	NC_017328	CGT	2	6	151101	151106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541716
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2750	NC_017328	CCAG	2	8	151227	151234	25 %	0 %	25 %	50 %	384541716
2751	NC_017328	GCG	2	6	151274	151279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541716
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2764	NC_017328	CTT	2	6	151863	151868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541717
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2843	NC_017328	CGT	3	9	156070	156078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541721
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2850	NC_017328	A	6	6	156263	156268	100 %	0 %	0 %	0 %	384541721
2851	NC_017328	GCT	2	6	156375	156380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541721
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2856	NC_017328	ATC	2	6	156530	156535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541721
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2983	NC_017328	ACG	2	6	162380	162385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541725
2984	NC_017328	CCG	2	6	162501	162506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541725
2985	NC_017328	ATCG	2	8	162512	162519	25 %	25 %	25 %	25 %	384541725
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2987	NC_017328	CAGT	2	8	162831	162838	25 %	25 %	25 %	25 %	384541726
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2991	NC_017328	GCT	2	6	162924	162929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541726
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