MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_017328	GGC	2	6	108991	108996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541676
2003	NC_017328	A	6	6	109052	109057	100 %	0 %	0 %	0 %	384541676
2004	NC_017328	GGTA	2	8	109167	109174	25 %	25 %	50 %	0 %	384541677
2005	NC_017328	GCA	2	6	109216	109221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541677
2006	NC_017328	CGG	2	6	109254	109259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541677
2007	NC_017328	GGT	2	6	109293	109298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541677
2008	NC_017328	CTGG	2	8	109398	109405	0 %	25 %	50 %	25 %	384541677
2009	NC_017328	G	6	6	109420	109425	0 %	0 %	100 %	0 %	384541677
2010	NC_017328	AAG	2	6	109436	109441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541677
2011	NC_017328	GGTC	2	8	109467	109474	0 %	25 %	50 %	25 %	384541677
2012	NC_017328	GAT	2	6	109483	109488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541677
2013	NC_017328	GCCA	2	8	109494	109501	25 %	0 %	25 %	50 %	384541677
2014	NC_017328	CGC	2	6	109554	109559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541678
2015	NC_017328	CTG	2	6	109685	109690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541678
2016	NC_017328	CAG	2	6	109707	109712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541679
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2018	NC_017328	GCA	2	6	109983	109988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541680
2019	NC_017328	GTTT	2	8	110033	110040	0 %	75 %	25 %	0 %	384541680
2020	NC_017328	GCC	2	6	110197	110202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541680
2021	NC_017328	CGCGG	2	10	110267	110276	0 %	0 %	60 %	40 %	384541680
2022	NC_017328	CCG	2	6	110292	110297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541680
2023	NC_017328	CTG	2	6	110305	110310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541680
2024	NC_017328	TGC	2	6	110375	110380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541680
2025	NC_017328	CGC	2	6	110415	110420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541680
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2028	NC_017328	T	6	6	110544	110549	0 %	100 %	0 %	0 %	384541680
2029	NC_017328	GTGC	2	8	110633	110640	0 %	25 %	50 %	25 %	384541681
2030	NC_017328	TTA	2	6	110680	110685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541681
2031	NC_017328	CG	3	6	110720	110725	0 %	0 %	50 %	50 %	384541681
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2039	NC_017328	CTG	2	6	111648	111653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541682
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2042	NC_017328	A	6	6	111762	111767	100 %	0 %	0 %	0 %	384541682
2043	NC_017328	TG	3	6	111921	111926	0 %	50 %	50 %	0 %	384541682
2044	NC_017328	GCG	2	6	112052	112057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541682
2045	NC_017328	GGC	2	6	112127	112132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541682
2046	NC_017328	GGC	2	6	112154	112159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541682
2047	NC_017328	AG	3	6	112177	112182	50 %	0 %	50 %	0 %	384541682
2048	NC_017328	CGG	2	6	112183	112188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541682
2049	NC_017328	GAG	2	6	112199	112204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541682
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2051	NC_017328	GCA	2	6	112289	112294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541682
2052	NC_017328	CG	3	6	112342	112347	0 %	0 %	50 %	50 %	384541682
2053	NC_017328	GGC	2	6	112358	112363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541682
2054	NC_017328	CAC	2	6	112420	112425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541682
2055	NC_017328	CAA	2	6	112462	112467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541682
2056	NC_017328	ATCCC	2	10	112511	112520	20 %	20 %	0 %	60 %	384541684
2057	NC_017328	CATCG	2	10	112524	112533	20 %	20 %	20 %	40 %	384541684
2058	NC_017328	CCA	3	9	112562	112570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541684
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2060	NC_017328	GAT	3	9	112658	112666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541684
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2062	NC_017328	GCCA	2	8	112765	112772	25 %	0 %	25 %	50 %	384541684
2063	NC_017328	CT	3	6	112855	112860	0 %	50 %	0 %	50 %	384541684
2064	NC_017328	A	6	6	112870	112875	100 %	0 %	0 %	0 %	384541684
2065	NC_017328	TCA	2	6	112937	112942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541684
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2088	NC_017328	GAC	2	6	114981	114986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541685
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2093	NC_017328	CGG	2	6	115142	115147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541685
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2123	NC_017328	ATC	2	6	117103	117108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541688
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2233	NC_017328	GCG	2	6	122509	122514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541691
2234	NC_017328	GAT	2	6	122541	122546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541691
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2236	NC_017328	CGG	2	6	122640	122645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541691
2237	NC_017328	ACC	2	6	122659	122664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541691
2238	NC_017328	GCA	2	6	122682	122687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2239	NC_017328	GCTTAC	2	12	122749	122760	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384541691
2240	NC_017328	TAC	3	9	122824	122832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541691
2241	NC_017328	GCT	2	6	122949	122954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2242	NC_017328	CCT	2	6	123044	123049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541691
2243	NC_017328	TGC	2	6	123095	123100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2244	NC_017328	CG	3	6	123116	123121	0 %	0 %	50 %	50 %	384541691
2245	NC_017328	TGA	2	6	123140	123145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541691
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2343	NC_017328	CCAG	2	8	129987	129994	25 %	0 %	25 %	50 %	384541694
2344	NC_017328	GTT	2	6	129997	130002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541694
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2348	NC_017328	TCT	2	6	130193	130198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541694
2349	NC_017328	CTG	2	6	130321	130326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541694
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2351	NC_017328	GTGC	2	8	130366	130373	0 %	25 %	50 %	25 %	384541694
2352	NC_017328	GGC	2	6	130375	130380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541694
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2354	NC_017328	ACC	2	6	130597	130602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541694
2355	NC_017328	TGA	2	6	130617	130622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541694
2356	NC_017328	CAC	2	6	130720	130725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541694
2357	NC_017328	GT	3	6	130757	130762	0 %	50 %	50 %	0 %	384541694
2358	NC_017328	TGC	3	9	130808	130816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541694
2359	NC_017328	GGT	2	6	130834	130839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541694
2360	NC_017328	CGG	2	6	130877	130882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541694
2361	NC_017328	TCTGG	2	10	130885	130894	0 %	40 %	40 %	20 %	384541694
2362	NC_017328	TGC	2	6	130902	130907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541694
2363	NC_017328	CTG	2	6	131035	131040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541694
2364	NC_017328	GAA	2	6	131049	131054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541694
2365	NC_017328	TCT	2	6	131069	131074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541694
2366	NC_017328	CCG	2	6	131147	131152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541694
2367	NC_017328	ATC	2	6	131197	131202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541694
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2385	NC_017328	GAAA	2	8	132219	132226	75 %	0 %	25 %	0 %	384541695
2386	NC_017328	CTTG	2	8	132234	132241	0 %	50 %	25 %	25 %	384541695
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2389	NC_017328	GGGCA	2	10	132296	132305	20 %	0 %	60 %	20 %	384541695
2390	NC_017328	TGGA	2	8	132319	132326	25 %	25 %	50 %	0 %	384541695
2391	NC_017328	ACT	2	6	132395	132400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541695
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2428	NC_017328	TCG	2	6	134022	134027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541697
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2439	NC_017328	CGA	2	6	134706	134711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541698
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2452	NC_017328	TGG	2	6	135294	135299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541699
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2456	NC_017328	TGA	2	6	135423	135428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541699
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2462	NC_017328	GAGC	2	8	135628	135635	25 %	0 %	50 %	25 %	384541699
2463	NC_017328	TGG	2	6	135669	135674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541699
2464	NC_017328	ACA	2	6	135684	135689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541699
2465	NC_017328	GCCT	2	8	135825	135832	0 %	25 %	25 %	50 %	384541699
2466	NC_017328	ATG	2	6	135899	135904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541699
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2470	NC_017328	GCG	3	9	136085	136093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541699
2471	NC_017328	ATG	2	6	136136	136141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541699
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2473	NC_017328	CTG	2	6	136322	136327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541699
2474	NC_017328	GAT	2	6	136345	136350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541699
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2477	NC_017328	ACC	2	6	136548	136553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541700
2478	NC_017328	TGT	2	6	136595	136600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541700
2479	NC_017328	GC	3	6	136603	136608	0 %	0 %	50 %	50 %	384541700
2480	NC_017328	GCG	2	6	136627	136632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541700
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2482	NC_017328	GCCC	2	8	136664	136671	0 %	0 %	25 %	75 %	384541700
2483	NC_017328	GCG	2	6	136733	136738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541700
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2486	NC_017328	GCT	2	6	136922	136927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541700
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