MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 76636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017328	ACG	2	6	55112	55117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541631
1002	NC_017328	GCG	2	6	55129	55134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541631
1003	NC_017328	TGG	2	6	55138	55143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541631
1004	NC_017328	AGT	2	6	55192	55197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541631
1005	NC_017328	TGG	3	9	55198	55206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541631
1006	NC_017328	CACC	2	8	55249	55256	25 %	0 %	0 %	75 %	384541631
1007	NC_017328	TTC	2	6	55334	55339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541631
1008	NC_017328	AAT	2	6	55349	55354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541631
1009	NC_017328	CTAC	2	8	55359	55366	25 %	25 %	0 %	50 %	384541631
1010	NC_017328	AGG	2	6	55396	55401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541631
1011	NC_017328	GTT	2	6	55444	55449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541631
1012	NC_017328	TCA	2	6	55450	55455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541631
1013	NC_017328	CCA	2	6	55483	55488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541631
1014	NC_017328	TCG	2	6	55572	55577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541631
1015	NC_017328	GTAC	2	8	55605	55612	25 %	25 %	25 %	25 %	384541631
1016	NC_017328	TCG	2	6	55656	55661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541631
1017	NC_017328	TGG	2	6	55879	55884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541631
1018	NC_017328	T	6	6	55904	55909	0 %	100 %	0 %	0 %	384541631
1019	NC_017328	AT	3	6	56163	56168	50 %	50 %	0 %	0 %	384541632
1020	NC_017328	CGTGGC	2	12	56193	56204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384541632
1021	NC_017328	GCG	2	6	56216	56221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541632
1022	NC_017328	T	6	6	56326	56331	0 %	100 %	0 %	0 %	384541632
1023	NC_017328	CCA	2	6	56333	56338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541632
1024	NC_017328	GCCA	2	8	56404	56411	25 %	0 %	25 %	50 %	384541632
1025	NC_017328	GCG	2	6	56452	56457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541632
1026	NC_017328	GGC	2	6	56580	56585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541632
1027	NC_017328	GAA	2	6	56641	56646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541632
1028	NC_017328	ATG	2	6	56686	56691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541632
1029	NC_017328	GGC	2	6	56710	56715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541632
1030	NC_017328	CAG	2	6	56722	56727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541632
1031	NC_017328	GGT	2	6	56737	56742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541632
1032	NC_017328	GCA	2	6	56748	56753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541632
1033	NC_017328	GAT	2	6	56812	56817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541632
1034	NC_017328	ACC	2	6	56821	56826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541632
1035	NC_017328	TGA	2	6	56849	56854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541632
1036	NC_017328	TGG	2	6	56876	56881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541632
1037	NC_017328	GCC	2	6	56892	56897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541632
1038	NC_017328	GAT	2	6	56901	56906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541632
1039	NC_017328	CAG	2	6	56938	56943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541632
1040	NC_017328	AGC	2	6	56960	56965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541632
1041	NC_017328	CAA	2	6	57177	57182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541633
1042	NC_017328	CCG	2	6	57320	57325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541633
1043	NC_017328	CCA	2	6	57332	57337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541633
1044	NC_017328	CCA	2	6	57425	57430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541633
1045	NC_017328	GATG	2	8	57445	57452	25 %	25 %	50 %	0 %	384541633
1046	NC_017328	GCTCGC	2	12	57485	57496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384541633
1047	NC_017328	CGC	2	6	57551	57556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541633
1048	NC_017328	CTGC	2	8	57587	57594	0 %	25 %	25 %	50 %	384541633
1049	NC_017328	TCA	2	6	57617	57622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541633
1050	NC_017328	GAC	2	6	57644	57649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541633
1051	NC_017328	ACA	2	6	57659	57664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541633
1052	NC_017328	TTG	2	6	57676	57681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541633
1053	NC_017328	ACC	2	6	57682	57687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541633
1054	NC_017328	ATA	2	6	57688	57693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541633
1055	NC_017328	AACC	2	8	57714	57721	50 %	0 %	0 %	50 %	384541633
1056	NC_017328	CCTG	2	8	57816	57823	0 %	25 %	25 %	50 %	384541634
1057	NC_017328	CTG	2	6	57842	57847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1058	NC_017328	TCG	2	6	57873	57878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1059	NC_017328	TCG	2	6	57942	57947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1060	NC_017328	ATCA	2	8	57965	57972	50 %	25 %	0 %	25 %	384541634
1061	NC_017328	CTG	2	6	58031	58036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1062	NC_017328	TGC	2	6	58054	58059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1063	NC_017328	GCC	2	6	58116	58121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541634
1064	NC_017328	GTT	2	6	58124	58129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541634
1065	NC_017328	CAG	2	6	58142	58147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1066	NC_017328	CCA	2	6	58228	58233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541634
1067	NC_017328	TACC	2	8	58240	58247	25 %	25 %	0 %	50 %	384541634
1068	NC_017328	T	6	6	58260	58265	0 %	100 %	0 %	0 %	384541634
1069	NC_017328	TGC	2	6	58279	58284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1070	NC_017328	TAA	2	6	58345	58350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541634
1071	NC_017328	GGTGAT	2	12	58391	58402	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384541634
1072	NC_017328	TGT	2	6	58468	58473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541634
1073	NC_017328	CGC	2	6	58474	58479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541634
1074	NC_017328	TGAT	2	8	58488	58495	25 %	50 %	25 %	0 %	384541634
1075	NC_017328	ATA	2	6	58500	58505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541634
1076	NC_017328	CAG	2	6	58610	58615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1077	NC_017328	GAC	2	6	58888	58893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1078	NC_017328	GCT	2	6	58900	58905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1079	NC_017328	CAG	2	6	58994	58999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1080	NC_017328	TCT	2	6	59016	59021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541634
1081	NC_017328	GGC	2	6	59033	59038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541634
1082	NC_017328	CG	3	6	59206	59211	0 %	0 %	50 %	50 %	384541634
1083	NC_017328	CCA	2	6	59222	59227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541634
1084	NC_017328	TCGCTG	2	12	59496	59507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1085	NC_017328	TGC	2	6	59510	59515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1086	NC_017328	ATC	2	6	59547	59552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541634
1087	NC_017328	CAG	2	6	59597	59602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1088	NC_017328	CAG	2	6	59684	59689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1089	NC_017328	CAG	3	9	59741	59749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1090	NC_017328	GTT	2	6	59773	59778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541634
1091	NC_017328	ACC	2	6	59841	59846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541634
1092	NC_017328	ACG	2	6	59894	59899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1093	NC_017328	TCA	3	9	59979	59987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541634
1094	NC_017328	GCA	2	6	60016	60021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1095	NC_017328	CAG	2	6	60076	60081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1096	NC_017328	AG	3	6	60086	60091	50 %	0 %	50 %	0 %	384541634
1097	NC_017328	ATC	2	6	60108	60113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541634
1098	NC_017328	CAGC	2	8	60148	60155	25 %	0 %	25 %	50 %	384541634
1099	NC_017328	CG	3	6	60160	60165	0 %	0 %	50 %	50 %	384541634
1100	NC_017328	GGC	2	6	60172	60177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541634
1101	NC_017328	CAT	2	6	60184	60189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541634
1102	NC_017328	CG	4	8	60279	60286	0 %	0 %	50 %	50 %	384541634
1103	NC_017328	TCT	2	6	60447	60452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541634
1104	NC_017328	CTT	2	6	60457	60462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541634
1105	NC_017328	TGCG	2	8	60541	60548	0 %	25 %	50 %	25 %	384541634
1106	NC_017328	AAAGT	2	10	60577	60586	60 %	20 %	20 %	0 %	384541634
1107	NC_017328	GTG	2	6	60954	60959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541635
1108	NC_017328	TGG	2	6	60990	60995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541635
1109	NC_017328	TTC	2	6	61057	61062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541635
1110	NC_017328	GCG	2	6	61076	61081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541635
1111	NC_017328	CTG	2	6	61243	61248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541635
1112	NC_017328	CTG	2	6	61252	61257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541635
1113	NC_017328	GCG	2	6	61263	61268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541635
1114	NC_017328	GCT	2	6	61311	61316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541635
1115	NC_017328	CCT	2	6	61323	61328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541635
1116	NC_017328	GTT	2	6	61440	61445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541635
1117	NC_017328	CCA	2	6	61462	61467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541635
1118	NC_017328	TGC	2	6	61478	61483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541635
1119	NC_017328	CGC	2	6	61504	61509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541635
1120	NC_017328	CTT	2	6	61512	61517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541635
1121	NC_017328	AGTCG	2	10	61546	61555	20 %	20 %	40 %	20 %	384541635
1122	NC_017328	TCAA	2	8	61589	61596	50 %	25 %	0 %	25 %	384541635
1123	NC_017328	TGA	2	6	61619	61624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541635
1124	NC_017328	CGA	2	6	61639	61644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541635
1125	NC_017328	GAA	2	6	61660	61665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541635
1126	NC_017328	GGT	2	6	61675	61680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541635
1127	NC_017328	TTA	2	6	61736	61741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541635
1128	NC_017328	GGCA	2	8	61793	61800	25 %	0 %	50 %	25 %	384541635
1129	NC_017328	ATCA	2	8	61891	61898	50 %	25 %	0 %	25 %	384541635
1130	NC_017328	GAT	2	6	61909	61914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541635
1131	NC_017328	CCAGCA	2	12	61938	61949	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384541635
1132	NC_017328	GCC	2	6	61987	61992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541635
1133	NC_017328	GCG	2	6	62004	62009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541635
1134	NC_017328	CCG	2	6	62090	62095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541635
1135	NC_017328	CGG	2	6	62234	62239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541635
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1137	NC_017328	TAT	2	6	62442	62447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541635
1138	NC_017328	GCA	2	6	62493	62498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541635
1139	NC_017328	CAC	2	6	62515	62520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541635
1140	NC_017328	GAT	2	6	62530	62535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541635
1141	NC_017328	CAG	3	9	62578	62586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541635
1142	NC_017328	GGC	2	6	62589	62594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541635
1143	NC_017328	GAG	2	6	62624	62629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541635
1144	NC_017328	GGT	2	6	62713	62718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541635
1145	NC_017328	GCG	2	6	62745	62750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541635
1146	NC_017328	GGTGA	2	10	62825	62834	20 %	20 %	60 %	0 %	384541635
1147	NC_017328	GGCG	2	8	62861	62868	0 %	0 %	75 %	25 %	384541635
1148	NC_017328	TCA	2	6	62922	62927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541635
1149	NC_017328	GCCA	2	8	63116	63123	25 %	0 %	25 %	50 %	384541635
1150	NC_017328	CCTG	2	8	63179	63186	0 %	25 %	25 %	50 %	384541635
1151	NC_017328	CAG	2	6	63318	63323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541636
1152	NC_017328	TGC	2	6	63328	63333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541636
1153	NC_017328	GCG	2	6	63347	63352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541636
1154	NC_017328	GTGG	2	8	63609	63616	0 %	25 %	75 %	0 %	384541636
1155	NC_017328	TGG	2	6	63656	63661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541636
1156	NC_017328	GCC	2	6	63687	63692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541636
1157	NC_017328	AGC	2	6	63715	63720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541636
1158	NC_017328	GGA	2	6	63738	63743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541636
1159	NC_017328	CGC	2	6	63851	63856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541636
1160	NC_017328	CGA	2	6	64166	64171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541637
1161	NC_017328	ATCA	2	8	64234	64241	50 %	25 %	0 %	25 %	384541637
1162	NC_017328	GC	3	6	64320	64325	0 %	0 %	50 %	50 %	384541637
1163	NC_017328	CAG	2	6	64447	64452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541637
1164	NC_017328	ATCA	2	8	64471	64478	50 %	25 %	0 %	25 %	384541637
1165	NC_017328	ACC	2	6	64540	64545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541637
1166	NC_017328	TCT	2	6	64580	64585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541637
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1200	NC_017328	CAG	2	6	66098	66103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541638
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1209	NC_017328	CAC	2	6	66575	66580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541638
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1215	NC_017328	GCGG	2	8	66793	66800	0 %	0 %	75 %	25 %	384541638
1216	NC_017328	AATA	2	8	66922	66929	75 %	25 %	0 %	0 %	384541638
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1226	NC_017328	CGAC	2	8	67821	67828	25 %	0 %	25 %	50 %	384541639
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1228	NC_017328	GA	3	6	67943	67948	50 %	0 %	50 %	0 %	384541639
1229	NC_017328	TCA	2	6	67950	67955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541639
1230	NC_017328	CG	3	6	68012	68017	0 %	0 %	50 %	50 %	384541639
1231	NC_017328	TTTC	2	8	68067	68074	0 %	75 %	0 %	25 %	384541639
1232	NC_017328	GCT	2	6	68160	68165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541639
1233	NC_017328	GCG	2	6	68196	68201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541639
1234	NC_017328	TCCA	2	8	68225	68232	25 %	25 %	0 %	50 %	384541639
1235	NC_017328	CAG	2	6	68362	68367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541639
1236	NC_017328	GCT	2	6	68421	68426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541639
1237	NC_017328	CAC	2	6	68433	68438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541639
1238	NC_017328	GTCG	2	8	68458	68465	0 %	25 %	50 %	25 %	384541639
1239	NC_017328	A	6	6	68509	68514	100 %	0 %	0 %	0 %	384541639
1240	NC_017328	CGAG	2	8	68531	68538	25 %	0 %	50 %	25 %	384541639
1241	NC_017328	GAA	2	6	68554	68559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541639
1242	NC_017328	ATG	2	6	68567	68572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541639
1243	NC_017328	TTA	2	6	68700	68705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541640
1244	NC_017328	GGT	2	6	68734	68739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541640
1245	NC_017328	TGG	2	6	68742	68747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541640
1246	NC_017328	CGCTGG	2	12	68760	68771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384541640
1247	NC_017328	GCG	2	6	68829	68834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541640
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1500	NC_017328	TTA	2	6	81769	81774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541651

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