MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 21305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017327	AGC	2	6	16	21	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539800
2	NC_017327	AAC	2	6	67	72	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539800
3	NC_017327	CTG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539800
4	NC_017327	GCC	2	6	181	186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
5	NC_017327	GAA	2	6	285	290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539800
6	NC_017327	CCG	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
7	NC_017327	GGC	2	6	355	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539800
8	NC_017327	CGA	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539800
9	NC_017327	CAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
10	NC_017327	GCG	2	6	642	647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539800
11	NC_017327	CAG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539800
12	NC_017327	TCG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539800
13	NC_017327	CCG	2	6	770	775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
14	NC_017327	TCA	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
15	NC_017327	CCG	2	6	884	889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
16	NC_017327	ATC	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
17	NC_017327	TGA	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539800
18	NC_017327	CTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539800
19	NC_017327	TCA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
20	NC_017327	TGC	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539800
21	NC_017327	TCT	2	6	1271	1276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539801
22	NC_017327	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539801
23	NC_017327	TCG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539801
24	NC_017327	CTC	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539801
25	NC_017327	CGA	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539801
26	NC_017327	AGG	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539801
27	NC_017327	CGC	2	6	1704	1709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539801
28	NC_017327	GCA	2	6	1773	1778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539801
29	NC_017327	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539801
30	NC_017327	CAA	2	6	2072	2077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539801
31	NC_017327	GAC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539802
32	NC_017327	GCG	2	6	2362	2367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539802
33	NC_017327	TTG	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539802
34	NC_017327	GTC	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539802
35	NC_017327	GCC	2	6	2642	2647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539802
36	NC_017327	TCG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539802
37	NC_017327	GTG	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539802
38	NC_017327	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539802
39	NC_017327	TAT	2	6	3115	3120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384539802
40	NC_017327	AGG	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539802
41	NC_017327	CTG	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539802
42	NC_017327	TGT	2	6	3528	3533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539802
43	NC_017327	TGA	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539803
44	NC_017327	CGA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539803
45	NC_017327	CGC	2	6	3941	3946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539803
46	NC_017327	AGC	2	6	3977	3982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539803
47	NC_017327	CGC	2	6	3987	3992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539803
48	NC_017327	GGC	2	6	4105	4110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539803
49	NC_017327	CGG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539804
50	NC_017327	CGG	2	6	4657	4662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539804
51	NC_017327	GCA	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539804
52	NC_017327	CGG	2	6	4756	4761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539804
53	NC_017327	AAT	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384539804
54	NC_017327	GCT	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539804
55	NC_017327	AGA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539804
56	NC_017327	CCG	2	6	5091	5096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539804
57	NC_017327	GAA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
58	NC_017327	TCC	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539805
59	NC_017327	GAA	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
60	NC_017327	AGC	2	6	5636	5641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
61	NC_017327	CGG	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
62	NC_017327	TCC	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539805
63	NC_017327	CGA	2	6	5712	5717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
64	NC_017327	CAA	2	6	5724	5729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539805
65	NC_017327	CTT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539805
66	NC_017327	GAA	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
67	NC_017327	CGG	2	6	5871	5876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
68	NC_017327	GGC	2	6	5895	5900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
69	NC_017327	GCG	2	6	5920	5925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
70	NC_017327	CAA	2	6	5926	5931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539805
71	NC_017327	AGA	2	6	5948	5953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
72	NC_017327	CCG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539805
73	NC_017327	GAA	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
74	NC_017327	TGC	2	6	6176	6181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
75	NC_017327	CGG	2	6	6254	6259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
76	NC_017327	TCT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539805
77	NC_017327	GCG	2	6	6461	6466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
78	NC_017327	GGC	2	6	6525	6530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
79	NC_017327	GCG	2	6	6587	6592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
80	NC_017327	TGC	2	6	6599	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
81	NC_017327	CGG	2	6	6627	6632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
82	NC_017327	GCT	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
83	NC_017327	CGA	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
84	NC_017327	GCT	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
85	NC_017327	TCG	3	9	6737	6745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
86	NC_017327	ACG	2	6	6752	6757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
87	NC_017327	CCT	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539805
88	NC_017327	GCT	2	6	7172	7177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539806
89	NC_017327	CGG	2	6	7251	7256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539806
90	NC_017327	CCG	2	6	7281	7286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539806
91	NC_017327	CAG	2	6	7302	7307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
92	NC_017327	ACG	2	6	7374	7379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
93	NC_017327	CGC	2	6	7390	7395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539806
94	NC_017327	TCG	2	6	7413	7418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539806
95	NC_017327	CGA	2	6	7438	7443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
96	NC_017327	CAG	3	9	7541	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
97	NC_017327	CAT	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539806
98	NC_017327	GTC	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539806
99	NC_017327	CGA	2	6	7954	7959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
100	NC_017327	ACC	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539806
101	NC_017327	TCA	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539806
102	NC_017327	CCA	2	6	8121	8126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539807
103	NC_017327	ACG	3	9	8238	8246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539807
104	NC_017327	CGA	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539807
105	NC_017327	CGG	2	6	8263	8268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539807
106	NC_017327	GCC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539807
107	NC_017327	GCA	2	6	8407	8412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539807
108	NC_017327	GGC	2	6	8506	8511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539807
109	NC_017327	TGA	2	6	8805	8810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539808
110	NC_017327	CAG	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539808
111	NC_017327	CTT	2	6	8919	8924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539808
112	NC_017327	TCG	2	6	8927	8932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539808
113	NC_017327	CCT	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539808
114	NC_017327	TCG	2	6	9224	9229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539808
115	NC_017327	CGA	2	6	9230	9235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539808
116	NC_017327	GAT	2	6	9343	9348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539808
117	NC_017327	GCC	2	6	9361	9366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539808
118	NC_017327	GTC	2	6	9392	9397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539808
119	NC_017327	GCC	2	6	9398	9403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539808
120	NC_017327	TGA	2	6	9558	9563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539808
121	NC_017327	TGA	2	6	9597	9602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539808
122	NC_017327	TGC	2	6	9609	9614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539808
123	NC_017327	CGC	2	6	9788	9793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539808
124	NC_017327	CGG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539808
125	NC_017327	CGA	2	6	10059	10064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539808
126	NC_017327	GGC	2	6	10251	10256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539809
127	NC_017327	GCC	2	6	10266	10271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539809
128	NC_017327	TCA	2	6	10287	10292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539809
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130	NC_017327	AGA	2	6	10322	10327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539809
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254	NC_017327	GTG	2	6	18440	18445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539816
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257	NC_017327	CGA	3	9	18519	18527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539816
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