MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 29351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017327	ATC	2	6	237410	237415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540082
4002	NC_017327	CCT	2	6	237445	237450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540082
4003	NC_017327	CG	3	6	237463	237468	0 %	0 %	50 %	50 %	384540082
4004	NC_017327	GCGG	2	8	237592	237599	0 %	0 %	75 %	25 %	384540082
4005	NC_017327	CAG	2	6	237608	237613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540082
4006	NC_017327	GCT	2	6	237621	237626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540082
4007	NC_017327	GAC	3	9	237674	237682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540082
4008	NC_017327	TCG	2	6	237742	237747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540082
4009	NC_017327	GTCG	2	8	237831	237838	0 %	25 %	50 %	25 %	384540082
4010	NC_017327	CATA	2	8	237889	237896	50 %	25 %	0 %	25 %	384540082
4011	NC_017327	CGG	2	6	238042	238047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540082
4012	NC_017327	GAT	2	6	238055	238060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540082
4013	NC_017327	AC	3	6	238243	238248	50 %	0 %	0 %	50 %	384540082
4014	NC_017327	CG	3	6	238331	238336	0 %	0 %	50 %	50 %	384540082
4015	NC_017327	CGAT	2	8	238341	238348	25 %	25 %	25 %	25 %	384540082
4016	NC_017327	CGG	2	6	238400	238405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540082
4017	NC_017327	TTC	2	6	238754	238759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540083
4018	NC_017327	GCT	2	6	238866	238871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540083
4019	NC_017327	CGA	2	6	238872	238877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540083
4020	NC_017327	CGA	3	9	238905	238913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540083
4021	NC_017327	ACG	2	6	239014	239019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540083
4022	NC_017327	CCG	2	6	239022	239027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540083
4023	NC_017327	TCG	2	6	239096	239101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540083
4024	NC_017327	TCG	2	6	239117	239122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540083
4025	NC_017327	AGC	2	6	239201	239206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540083
4026	NC_017327	GAT	2	6	239217	239222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540083
4027	NC_017327	GTT	2	6	239277	239282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540083
4028	NC_017327	ACT	2	6	239417	239422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540083
4029	NC_017327	ATCA	2	8	239512	239519	50 %	25 %	0 %	25 %	384540083
4030	NC_017327	AGC	2	6	239552	239557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540083
4031	NC_017327	CGG	2	6	240693	240698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540084
4032	NC_017327	CAG	2	6	240739	240744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540084
4033	NC_017327	CGTC	2	8	240765	240772	0 %	25 %	25 %	50 %	384540084
4034	NC_017327	CCG	2	6	240806	240811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540084
4035	NC_017327	CG	4	8	240851	240858	0 %	0 %	50 %	50 %	384540084
4036	NC_017327	GCC	2	6	240897	240902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540084
4037	NC_017327	CCG	2	6	241142	241147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540085
4038	NC_017327	TTG	2	6	241176	241181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540085
4039	NC_017327	GCG	2	6	241189	241194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540085
4040	NC_017327	GCG	3	9	241229	241237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540085
4041	NC_017327	GTC	2	6	241354	241359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540086
4042	NC_017327	GAC	2	6	241391	241396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540086
4043	NC_017327	GATAT	2	10	241408	241417	40 %	40 %	20 %	0 %	384540086
4044	NC_017327	CGAT	2	8	241506	241513	25 %	25 %	25 %	25 %	384540086
4045	NC_017327	ATC	2	6	241569	241574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540086
4046	NC_017327	GCA	2	6	241589	241594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540086
4047	NC_017327	A	6	6	241654	241659	100 %	0 %	0 %	0 %	384540086
4048	NC_017327	CTT	2	6	241682	241687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540086
4049	NC_017327	CAT	2	6	241742	241747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540086
4050	NC_017327	GCT	2	6	241783	241788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540086
4051	NC_017327	ACG	2	6	241837	241842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540086
4052	NC_017327	TCC	2	6	241939	241944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540086
4053	NC_017327	CGG	2	6	241951	241956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540086
4054	NC_017327	GTCG	2	8	241999	242006	0 %	25 %	50 %	25 %	384540086
4055	NC_017327	TCA	2	6	242035	242040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540086
4056	NC_017327	AT	3	6	242055	242060	50 %	50 %	0 %	0 %	384540086
4057	NC_017327	CGT	2	6	242079	242084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540086
4058	NC_017327	GCC	2	6	242208	242213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540086
4059	NC_017327	AC	3	6	242408	242413	50 %	0 %	0 %	50 %	384540086
4060	NC_017327	AAGGAG	2	12	242437	242448	50 %	0 %	50 %	0 %	384540086
4061	NC_017327	TGGAAA	2	12	242466	242477	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384540086
4062	NC_017327	TC	3	6	242550	242555	0 %	50 %	0 %	50 %	384540086
4063	NC_017327	GCG	2	6	242564	242569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540086
4064	NC_017327	CCAA	2	8	243241	243248	50 %	0 %	0 %	50 %	384540087
4065	NC_017327	CT	3	6	243249	243254	0 %	50 %	0 %	50 %	384540087
4066	NC_017327	ACG	2	6	243269	243274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540087
4067	NC_017327	CGC	2	6	243344	243349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540087
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4069	NC_017327	GCTC	2	8	243382	243389	0 %	25 %	25 %	50 %	384540087
4070	NC_017327	GA	3	6	243408	243413	50 %	0 %	50 %	0 %	384540087
4071	NC_017327	CCAA	2	8	243433	243440	50 %	0 %	0 %	50 %	384540087
4072	NC_017327	ATT	2	6	243486	243491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384540087
4073	NC_017327	TGT	2	6	243493	243498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540087
4074	NC_017327	GAA	2	6	243571	243576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540087
4075	NC_017327	CAT	2	6	243629	243634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540087
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4077	NC_017327	GTA	2	6	243683	243688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540087
4078	NC_017327	TTG	2	6	243693	243698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540087
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4080	NC_017327	TTC	2	6	243716	243721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540087
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4082	NC_017327	TCT	2	6	243835	243840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540087
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4085	NC_017327	CTT	2	6	244192	244197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540088
4086	NC_017327	CGTT	2	8	244220	244227	0 %	50 %	25 %	25 %	384540088
4087	NC_017327	CGA	2	6	244933	244938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
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4091	NC_017327	CAT	2	6	245065	245070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540089
4092	NC_017327	GCA	2	6	245131	245136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
4093	NC_017327	CGTCGC	2	12	245140	245151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384540089
4094	NC_017327	CGA	2	6	245197	245202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
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4096	NC_017327	TCG	2	6	245331	245336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540089
4097	NC_017327	GATC	2	8	245476	245483	25 %	25 %	25 %	25 %	384540089
4098	NC_017327	TCG	2	6	245613	245618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540089
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4101	NC_017327	GACC	2	8	245725	245732	25 %	0 %	25 %	50 %	384540089
4102	NC_017327	GGCA	2	8	245737	245744	25 %	0 %	50 %	25 %	384540089
4103	NC_017327	CGG	2	6	245760	245765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540089
4104	NC_017327	CGG	2	6	245827	245832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540089
4105	NC_017327	CA	3	6	245852	245857	50 %	0 %	0 %	50 %	384540089
4106	NC_017327	CGG	2	6	245889	245894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540089
4107	NC_017327	CAG	2	6	245897	245902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
4108	NC_017327	CGA	2	6	246052	246057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540089
4109	NC_017327	AAG	2	6	246230	246235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540089
4110	NC_017327	GGC	2	6	246298	246303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540089
4111	NC_017327	CTG	2	6	246344	246349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540089
4112	NC_017327	GAA	2	6	246350	246355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540089
4113	NC_017327	CTA	2	6	246373	246378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540089
4114	NC_017327	GAT	2	6	246415	246420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540089
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4116	NC_017327	GAC	2	6	246579	246584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540090
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4120	NC_017327	CTG	2	6	246744	246749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540090
4121	NC_017327	AGA	2	6	246792	246797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540090
4122	NC_017327	CCA	2	6	246857	246862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540090
4123	NC_017327	CGA	2	6	246876	246881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540090
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4125	NC_017327	GCC	2	6	246940	246945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540090
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4132	NC_017327	CTG	2	6	247180	247185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540090
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4142	NC_017327	CTGG	2	8	247785	247792	0 %	25 %	50 %	25 %	384540091
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4236	NC_017327	GGT	2	6	253803	253808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540100
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4239	NC_017327	CCGCGA	2	12	253931	253942	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384540100
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4363	NC_017327	CCAG	2	8	258682	258689	25 %	0 %	25 %	50 %	384540104
4364	NC_017327	GCC	2	6	258746	258751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540104
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4466	NC_017327	AG	3	6	264037	264042	50 %	0 %	50 %	0 %	384540109
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4475	NC_017327	CG	3	6	264466	264471	0 %	0 %	50 %	50 %	384540109
4476	NC_017327	CCAGC	2	10	264519	264528	20 %	0 %	20 %	60 %	384540109
4477	NC_017327	CGA	2	6	264559	264564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540109
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4481	NC_017327	CGG	2	6	264667	264672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540109
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