MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 29351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017327	GTT	2	6	78556	78561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539882
1503	NC_017327	TTG	2	6	78581	78586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539882
1504	NC_017327	CGC	2	6	78604	78609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539882
1505	NC_017327	CGT	2	6	78631	78636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539882
1506	NC_017327	GAC	2	6	78804	78809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539883
1507	NC_017327	GGA	2	6	78812	78817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539883
1508	NC_017327	GTC	2	6	78870	78875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539883
1509	NC_017327	GCA	2	6	78919	78924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539883
1510	NC_017327	CAA	2	6	78949	78954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539883
1511	NC_017327	GGAA	2	8	78955	78962	50 %	0 %	50 %	0 %	384539883
1512	NC_017327	GTA	2	6	78991	78996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539883
1513	NC_017327	GAA	2	6	79059	79064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539884
1514	NC_017327	CCAG	2	8	79166	79173	25 %	0 %	25 %	50 %	384539884
1515	NC_017327	GAAG	2	8	79193	79200	50 %	0 %	50 %	0 %	384539884
1516	NC_017327	GAT	2	6	79260	79265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539884
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1518	NC_017327	GCC	2	6	79405	79410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539884
1519	NC_017327	CTG	2	6	79440	79445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539884
1520	NC_017327	CAG	2	6	79485	79490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539884
1521	NC_017327	GCC	2	6	79497	79502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539884
1522	NC_017327	CGT	2	6	79532	79537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539884
1523	NC_017327	CTTAT	2	10	79541	79550	20 %	60 %	0 %	20 %	384539884
1524	NC_017327	AGC	2	6	79558	79563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539884
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1527	NC_017327	CGG	2	6	79760	79765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539884
1528	NC_017327	CGG	2	6	79816	79821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539884
1529	NC_017327	CAC	2	6	79839	79844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539884
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1533	NC_017327	GCTC	2	8	80429	80436	0 %	25 %	25 %	50 %	384539885
1534	NC_017327	AG	3	6	80492	80497	50 %	0 %	50 %	0 %	384539885
1535	NC_017327	GAA	2	6	81326	81331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539886
1536	NC_017327	AGG	2	6	81411	81416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539886
1537	NC_017327	CAA	2	6	81440	81445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539886
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1539	NC_017327	GCC	2	6	81518	81523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539886
1540	NC_017327	CGT	2	6	81566	81571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539886
1541	NC_017327	GCG	2	6	81573	81578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539886
1542	NC_017327	GCC	2	6	81593	81598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539886
1543	NC_017327	AGC	2	6	81606	81611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539886
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1545	NC_017327	CCA	2	6	81649	81654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539886
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1549	NC_017327	GCGCC	2	10	81772	81781	0 %	0 %	40 %	60 %	384539886
1550	NC_017327	CCG	2	6	81814	81819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539886
1551	NC_017327	CAG	2	6	81830	81835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539886
1552	NC_017327	CAGC	2	8	81850	81857	25 %	0 %	25 %	50 %	384539886
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1554	NC_017327	AGGA	2	8	81995	82002	50 %	0 %	50 %	0 %	384539887
1555	NC_017327	GGTC	2	8	82022	82029	0 %	25 %	50 %	25 %	384539887
1556	NC_017327	GCC	2	6	82054	82059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539887
1557	NC_017327	GGTG	2	8	82095	82102	0 %	25 %	75 %	0 %	384539887
1558	NC_017327	TGG	2	6	82105	82110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539887
1559	NC_017327	GC	3	6	82147	82152	0 %	0 %	50 %	50 %	384539887
1560	NC_017327	TGG	2	6	82160	82165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539887
1561	NC_017327	GCTG	2	8	82221	82228	0 %	25 %	50 %	25 %	384539887
1562	NC_017327	ACT	2	6	82463	82468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539888
1563	NC_017327	TCAA	2	8	82519	82526	50 %	25 %	0 %	25 %	384539888
1564	NC_017327	GAT	2	6	82533	82538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539888
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1566	NC_017327	TCC	2	6	82591	82596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539888
1567	NC_017327	GCC	2	6	82693	82698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539888
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1569	NC_017327	CAG	2	6	82806	82811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539888
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1572	NC_017327	CG	3	6	83158	83163	0 %	0 %	50 %	50 %	384539888
1573	NC_017327	GGAG	2	8	83193	83200	25 %	0 %	75 %	0 %	384539888
1574	NC_017327	GTCGGC	2	12	83211	83222	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384539888
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1580	NC_017327	CTCAGC	2	12	83571	83582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384539888
1581	NC_017327	TGT	2	6	83600	83605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539888
1582	NC_017327	GCC	2	6	83641	83646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539888
1583	NC_017327	GC	3	6	83655	83660	0 %	0 %	50 %	50 %	384539888
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1587	NC_017327	CCGAT	2	10	83842	83851	20 %	20 %	20 %	40 %	384539888
1588	NC_017327	TCA	2	6	83905	83910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539888
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1590	NC_017327	CGC	2	6	84117	84122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539888
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1592	NC_017327	CCT	2	6	84184	84189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539888
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1594	NC_017327	AGC	2	6	84309	84314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539888
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1597	NC_017327	CCCAT	2	10	84451	84460	20 %	20 %	0 %	60 %	384539888
1598	NC_017327	GAC	2	6	84502	84507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539888
1599	NC_017327	AGA	2	6	84868	84873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539888
1600	NC_017327	GGC	2	6	84883	84888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539888
1601	NC_017327	GCG	2	6	85010	85015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539888
1602	NC_017327	CGG	2	6	85016	85021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539888
1603	NC_017327	TC	3	6	85069	85074	0 %	50 %	0 %	50 %	384539888
1604	NC_017327	GTGC	2	8	85115	85122	0 %	25 %	50 %	25 %	384539888
1605	NC_017327	CAA	2	6	85157	85162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539888
1606	NC_017327	GCG	2	6	85164	85169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539888
1607	NC_017327	CCT	2	6	85399	85404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539888
1608	NC_017327	CGAAG	2	10	85423	85432	40 %	0 %	40 %	20 %	384539888
1609	NC_017327	GAA	2	6	85544	85549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539888
1610	NC_017327	GAAC	2	8	85588	85595	50 %	0 %	25 %	25 %	384539888
1611	NC_017327	TGCC	2	8	85662	85669	0 %	25 %	25 %	50 %	384539888
1612	NC_017327	GCT	2	6	85746	85751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539888
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1617	NC_017327	TCA	2	6	85918	85923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539888
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1620	NC_017327	TGC	2	6	86045	86050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539888
1621	NC_017327	GCG	2	6	86107	86112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539888
1622	NC_017327	GAT	2	6	86114	86119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539888
1623	NC_017327	CAG	2	6	86127	86132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539888
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1993	NC_017327	G	6	6	111430	111435	0 %	0 %	100 %	0 %	384539919
1994	NC_017327	GCC	2	6	111442	111447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539919
1995	NC_017327	TCGA	2	8	111472	111479	25 %	25 %	25 %	25 %	384539919
1996	NC_017327	GTC	2	6	111562	111567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539919
1997	NC_017327	TCA	2	6	111581	111586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539919
1998	NC_017327	CTA	2	6	111624	111629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539919
1999	NC_017327	GAT	2	6	111634	111639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539919
2000	NC_017327	ATC	2	6	111670	111675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539919

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