MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 29351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017327	AAG	2	6	300282	300287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540151
5002	NC_017327	CTG	2	6	300324	300329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540151
5003	NC_017327	GGCT	2	8	300354	300361	0 %	25 %	50 %	25 %	384540151
5004	NC_017327	TGATC	2	10	300392	300401	20 %	40 %	20 %	20 %	384540151
5005	NC_017327	GAG	2	6	300432	300437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540152
5006	NC_017327	GAT	2	6	300473	300478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540152
5007	NC_017327	CGGC	2	8	300546	300553	0 %	0 %	50 %	50 %	384540152
5008	NC_017327	CGG	2	6	300595	300600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540152
5009	NC_017327	GGC	2	6	300638	300643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540152
5010	NC_017327	AGC	2	6	300648	300653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5011	NC_017327	GC	3	6	300676	300681	0 %	0 %	50 %	50 %	384540152
5012	NC_017327	AGC	2	6	300684	300689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5013	NC_017327	GCT	2	6	300751	300756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5014	NC_017327	ACG	2	6	300759	300764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5015	NC_017327	CGA	2	6	300829	300834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5016	NC_017327	CAG	2	6	300884	300889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5017	NC_017327	GCGATG	2	12	300915	300926	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384540152
5018	NC_017327	CGC	2	6	300937	300942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540152
5019	NC_017327	GCT	2	6	300949	300954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5020	NC_017327	TCG	2	6	301020	301025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5021	NC_017327	GAT	2	6	301187	301192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540152
5022	NC_017327	GCGGG	2	10	301199	301208	0 %	0 %	80 %	20 %	384540152
5023	NC_017327	TCG	2	6	301234	301239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5024	NC_017327	CGA	2	6	301261	301266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5025	NC_017327	ACG	2	6	301311	301316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5026	NC_017327	GCT	2	6	301357	301362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5027	NC_017327	GCG	2	6	301453	301458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540152
5028	NC_017327	TGTGG	2	10	301521	301530	0 %	40 %	60 %	0 %	384540152
5029	NC_017327	CGG	2	6	301596	301601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540152
5030	NC_017327	GC	3	6	301619	301624	0 %	0 %	50 %	50 %	384540152
5031	NC_017327	CGT	2	6	301639	301644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5032	NC_017327	ATGG	2	8	301678	301685	25 %	25 %	50 %	0 %	384540152
5033	NC_017327	CGA	2	6	301723	301728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5034	NC_017327	AGC	2	6	301773	301778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5035	NC_017327	GT	3	6	301787	301792	0 %	50 %	50 %	0 %	384540152
5036	NC_017327	GAG	2	6	301835	301840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540152
5037	NC_017327	GAT	2	6	301844	301849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540152
5038	NC_017327	GGT	2	6	301877	301882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540152
5039	NC_017327	TCA	2	6	301887	301892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540152
5040	NC_017327	CAG	2	6	301898	301903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5041	NC_017327	GCT	3	9	301942	301950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5042	NC_017327	CCG	2	6	301953	301958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540152
5043	NC_017327	GCG	2	6	302024	302029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540152
5044	NC_017327	TG	3	6	302059	302064	0 %	50 %	50 %	0 %	384540152
5045	NC_017327	ATC	2	6	302070	302075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540152
5046	NC_017327	GTC	2	6	302118	302123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5047	NC_017327	GGC	2	6	302174	302179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540152
5048	NC_017327	ACG	2	6	302349	302354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540152
5049	NC_017327	AGGCCG	2	12	302504	302515	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384540153
5050	NC_017327	CAG	2	6	302545	302550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540153
5051	NC_017327	ATC	2	6	302567	302572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540153
5052	NC_017327	CGG	2	6	302590	302595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540153
5053	NC_017327	CGA	2	6	302667	302672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540153
5054	NC_017327	GCA	2	6	302673	302678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540153
5055	NC_017327	GGC	2	6	302683	302688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540153
5056	NC_017327	GGC	3	9	302779	302787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540153
5057	NC_017327	CGA	3	9	302826	302834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540153
5058	NC_017327	CGG	2	6	302871	302876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540153
5059	NC_017327	GAT	2	6	302878	302883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540153
5060	NC_017327	ATC	2	6	302918	302923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540153
5061	NC_017327	CGA	2	6	302928	302933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540153
5062	NC_017327	TCG	2	6	302948	302953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540153
5063	NC_017327	GCC	2	6	302959	302964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540153
5064	NC_017327	GA	3	6	302975	302980	50 %	0 %	50 %	0 %	384540153
5065	NC_017327	CCA	2	6	303000	303005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540153
5066	NC_017327	CATG	2	8	303054	303061	25 %	25 %	25 %	25 %	384540153
5067	NC_017327	CGA	2	6	303204	303209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540153
5068	NC_017327	CGCC	2	8	303244	303251	0 %	0 %	25 %	75 %	384540153
5069	NC_017327	CGGG	2	8	303281	303288	0 %	0 %	75 %	25 %	384540153
5070	NC_017327	TTG	2	6	303291	303296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540153
5071	NC_017327	AGC	2	6	303334	303339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5072	NC_017327	ATC	2	6	303391	303396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540154
5073	NC_017327	CAG	2	6	303444	303449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5074	NC_017327	CGA	2	6	303482	303487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5075	NC_017327	GAC	2	6	303489	303494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5076	NC_017327	ACC	2	6	303495	303500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540154
5077	NC_017327	ACAGC	2	10	303572	303581	40 %	0 %	20 %	40 %	384540154
5078	NC_017327	GCA	2	6	303629	303634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5079	NC_017327	GCA	2	6	303653	303658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5080	NC_017327	CAT	2	6	303678	303683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540154
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5082	NC_017327	GC	3	6	303715	303720	0 %	0 %	50 %	50 %	384540154
5083	NC_017327	TCG	2	6	303752	303757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5084	NC_017327	GCAG	2	8	303763	303770	25 %	0 %	50 %	25 %	384540154
5085	NC_017327	TCG	2	6	303806	303811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5086	NC_017327	CAG	2	6	303834	303839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5087	NC_017327	TGA	2	6	303848	303853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540154
5088	NC_017327	GAT	2	6	303858	303863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540154
5089	NC_017327	TCG	2	6	303887	303892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5090	NC_017327	GAT	2	6	303897	303902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540154
5091	NC_017327	AGC	2	6	303955	303960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540154
5092	NC_017327	CGGC	2	8	303996	304003	0 %	0 %	50 %	50 %	384540154
5093	NC_017327	GATCGA	2	12	304079	304090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384540154
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5095	NC_017327	CGAGA	2	10	304194	304203	40 %	0 %	40 %	20 %	384540154
5096	NC_017327	GAA	2	6	304278	304283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540155
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5099	NC_017327	AAG	2	6	304355	304360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540155
5100	NC_017327	CGG	2	6	304403	304408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540155
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5102	NC_017327	GTA	2	6	304487	304492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540155
5103	NC_017327	TCG	2	6	304497	304502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540155
5104	NC_017327	GTG	3	9	304508	304516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540155
5105	NC_017327	CGG	2	6	304586	304591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540155
5106	NC_017327	GCT	2	6	304643	304648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540155
5107	NC_017327	CGG	2	6	304649	304654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540155
5108	NC_017327	TGC	2	6	304672	304677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540155
5109	NC_017327	CGT	2	6	304763	304768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540155
5110	NC_017327	GGC	2	6	304838	304843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540155
5111	NC_017327	GGT	2	6	304904	304909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540155
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5113	NC_017327	CGA	2	6	305128	305133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540156
5114	NC_017327	CGTTG	2	10	305158	305167	0 %	40 %	40 %	20 %	384540156
5115	NC_017327	GAC	2	6	305195	305200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540156
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5119	NC_017327	TGA	2	6	305362	305367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540156
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5153	NC_017327	CGCC	2	8	307146	307153	0 %	0 %	25 %	75 %	384540157
5154	NC_017327	TCTG	2	8	307201	307208	0 %	50 %	25 %	25 %	384540157
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5230	NC_017327	ATG	2	6	310837	310842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540160
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5232	NC_017327	GGTG	2	8	311012	311019	0 %	25 %	75 %	0 %	384540160
5233	NC_017327	GAT	2	6	311025	311030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540160
5234	NC_017327	CTCA	2	8	311037	311044	25 %	25 %	0 %	50 %	384540160
5235	NC_017327	CGG	2	6	311063	311068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540160
5236	NC_017327	TGA	2	6	311071	311076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540160
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5240	NC_017327	TGG	2	6	311491	311496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540160
5241	NC_017327	GC	3	6	311500	311505	0 %	0 %	50 %	50 %	384540160
5242	NC_017327	GC	4	8	311874	311881	0 %	0 %	50 %	50 %	384540161
5243	NC_017327	GAA	2	6	311920	311925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540161
5244	NC_017327	GGC	2	6	311936	311941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540161
5245	NC_017327	GTC	2	6	311947	311952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540161
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5247	NC_017327	AT	3	6	311981	311986	50 %	50 %	0 %	0 %	384540161
5248	NC_017327	TCC	2	6	311999	312004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540161
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5250	NC_017327	AGCG	2	8	312028	312035	25 %	0 %	50 %	25 %	384540161
5251	NC_017327	TCC	2	6	312107	312112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540161
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5255	NC_017327	ACC	2	6	312233	312238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540161
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5257	NC_017327	TCACC	2	10	312288	312297	20 %	20 %	0 %	60 %	384540161
5258	NC_017327	CGG	2	6	312321	312326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540161
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5261	NC_017327	GAAA	2	8	312413	312420	75 %	0 %	25 %	0 %	384540161
5262	NC_017327	GCA	2	6	312450	312455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540161
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5265	NC_017327	ATTGTC	2	12	312725	312736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384540161
5266	NC_017327	AC	3	6	312872	312877	50 %	0 %	0 %	50 %	384540162
5267	NC_017327	CGC	3	9	312892	312900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540162
5268	NC_017327	TGC	2	6	312931	312936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540162
5269	NC_017327	CTC	2	6	312972	312977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540162
5270	NC_017327	TAC	2	6	313064	313069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540162
5271	NC_017327	GCT	2	6	313178	313183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540162
5272	NC_017327	CGG	2	6	313207	313212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540162
5273	NC_017327	CGA	2	6	313245	313250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540162
5274	NC_017327	TCG	2	6	313260	313265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540162
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5276	NC_017327	TCTT	2	8	313403	313410	0 %	75 %	0 %	25 %	384540162
5277	NC_017327	CCAG	2	8	313436	313443	25 %	0 %	25 %	50 %	384540163
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5313	NC_017327	ACG	2	6	316000	316005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540166
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5322	NC_017327	CGGT	2	8	316300	316307	0 %	25 %	50 %	25 %	384540166
5323	NC_017327	ATTTC	2	10	316316	316325	20 %	60 %	0 %	20 %	384540166
5324	NC_017327	AAG	2	6	316338	316343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540166
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5328	NC_017327	GCG	2	6	316837	316842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540167
5329	NC_017327	AAG	2	6	316899	316904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540167
5330	NC_017327	CAA	2	6	316940	316945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384540167
5331	NC_017327	CGA	2	6	316988	316993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540167
5332	NC_017327	TGG	2	6	317005	317010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540167
5333	NC_017327	ACGTGA	2	12	317011	317022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384540167
5334	NC_017327	ACG	2	6	317037	317042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540167
5335	NC_017327	GCC	2	6	317043	317048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540167
5336	NC_017327	GAT	2	6	317060	317065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540167
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5338	NC_017327	ATCAC	2	10	317260	317269	40 %	20 %	0 %	40 %	384540167
5339	NC_017327	CAG	2	6	317286	317291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540167
5340	NC_017327	CCTT	2	8	317317	317324	0 %	50 %	0 %	50 %	384540167
5341	NC_017327	ATGTCG	2	12	317377	317388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384540167
5342	NC_017327	TGA	2	6	317575	317580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540168
5343	NC_017327	ATG	2	6	317595	317600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540168
5344	NC_017327	CGC	2	6	317614	317619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540168
5345	NC_017327	TGA	2	6	317779	317784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540168
5346	NC_017327	GTC	2	6	317850	317855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540168
5347	NC_017327	CGA	2	6	317899	317904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540168
5348	NC_017327	ATG	2	6	317940	317945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540168
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5350	NC_017327	TCG	2	6	318162	318167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540169
5351	NC_017327	GGC	2	6	318176	318181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540169
5352	NC_017327	CCA	2	6	318231	318236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540169
5353	NC_017327	TCA	2	6	318243	318248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540169
5354	NC_017327	CAT	2	6	318343	318348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540169
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5356	NC_017327	GGC	2	6	318640	318645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540170
5357	NC_017327	CTG	2	6	318866	318871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540171
5358	NC_017327	TCC	2	6	318951	318956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540171
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5485	NC_017327	GGAA	2	8	324579	324586	50 %	0 %	50 %	0 %	384540179
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